Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

Q7SEQ7

Protein Details
Accession Q7SEQ7    Localization Confidence High Confidence Score 22.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-21MGKSTKDSKKRSRTAEEDVNSHydrophilic
40-95KVETEAPKVKKDKKDKKEKKSKTETTEEPKEEKKEKKDKKKDKKEKKDKAAATEESBasic
100-129KTEESADKKSKKKDKKKNKDKTEEKKTEDGBasic
237-256KTAHRQDKIKEKNRKLNEERBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
46-123PKVKKDKKDKKEKKSKTETTEEPKEEKKEKKDKKKDKKEKKDKAAATEESKTEEKTEESADKKSKKKDKKKNKDKTEE
246-250KEKNR
333-369GGFGGRGRGRGGGRGRGGGRGGGGRGRGGGRGSYKKW
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto_nucl 14, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034228  Nop6_RRM  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0019843  F:rRNA binding  
GO:0042274  P:ribosomal small subunit biogenesis  
KEGG ncr:NCU02159  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12400  RRM_Nop6  
Amino Acid Sequences MGKSTKDSKKRSRTAEEDVNSIAVVKKSKLDESGNAEVTKVETEAPKVKKDKKDKKEKKSKTETTEEPKEEKKEKKDKKKDKKEKKDKAAATEESKTEEKTEESADKKSKKKDKKKNKDKTEEKKTEDGGEEATNEEEQSQANGAKGARFIIFVGNMPYSITADDIKEHFASVHPISVRLLTHRDNPTKSKGTAFVEFGRFDHMKTALEKFHHSEMLDDKGVPRKINVELSAGGGGKTAHRQDKIKEKNRKLNEERLNRQQNQEKAKQEKAAAKANGGDGDAAAAAPAPERNDEDAIHPSRRARVAYDGNPGGGDFDEEDSYGGGGGGGGGGGGFGGRGRGRGGGRGRGGGRGGGGRGRGGGRGSYKKW
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.82
2 0.82
3 0.74
4 0.66
5 0.58
6 0.49
7 0.39
8 0.33
9 0.26
10 0.19
11 0.19
12 0.17
13 0.21
14 0.23
15 0.27
16 0.31
17 0.32
18 0.36
19 0.41
20 0.47
21 0.46
22 0.43
23 0.4
24 0.35
25 0.32
26 0.26
27 0.19
28 0.14
29 0.12
30 0.17
31 0.25
32 0.28
33 0.35
34 0.43
35 0.51
36 0.59
37 0.69
38 0.75
39 0.77
40 0.85
41 0.88
42 0.91
43 0.94
44 0.94
45 0.94
46 0.94
47 0.92
48 0.88
49 0.86
50 0.84
51 0.81
52 0.81
53 0.74
54 0.68
55 0.65
56 0.64
57 0.64
58 0.63
59 0.64
60 0.66
61 0.72
62 0.78
63 0.84
64 0.88
65 0.91
66 0.95
67 0.96
68 0.96
69 0.97
70 0.97
71 0.97
72 0.96
73 0.94
74 0.88
75 0.84
76 0.81
77 0.74
78 0.68
79 0.62
80 0.52
81 0.46
82 0.42
83 0.34
84 0.28
85 0.24
86 0.2
87 0.17
88 0.2
89 0.22
90 0.23
91 0.29
92 0.35
93 0.42
94 0.47
95 0.55
96 0.61
97 0.67
98 0.75
99 0.8
100 0.84
101 0.88
102 0.93
103 0.94
104 0.95
105 0.95
106 0.95
107 0.94
108 0.94
109 0.91
110 0.85
111 0.79
112 0.7
113 0.62
114 0.52
115 0.42
116 0.33
117 0.25
118 0.2
119 0.15
120 0.14
121 0.1
122 0.09
123 0.08
124 0.06
125 0.06
126 0.06
127 0.07
128 0.07
129 0.07
130 0.09
131 0.09
132 0.1
133 0.1
134 0.11
135 0.1
136 0.09
137 0.09
138 0.09
139 0.09
140 0.09
141 0.1
142 0.09
143 0.09
144 0.09
145 0.08
146 0.07
147 0.07
148 0.07
149 0.06
150 0.06
151 0.08
152 0.08
153 0.1
154 0.09
155 0.09
156 0.09
157 0.08
158 0.12
159 0.11
160 0.13
161 0.11
162 0.12
163 0.12
164 0.13
165 0.13
166 0.11
167 0.14
168 0.13
169 0.2
170 0.26
171 0.3
172 0.32
173 0.35
174 0.39
175 0.4
176 0.39
177 0.33
178 0.31
179 0.3
180 0.3
181 0.29
182 0.26
183 0.25
184 0.24
185 0.22
186 0.23
187 0.2
188 0.18
189 0.18
190 0.16
191 0.14
192 0.16
193 0.19
194 0.16
195 0.18
196 0.19
197 0.2
198 0.21
199 0.21
200 0.19
201 0.18
202 0.18
203 0.2
204 0.19
205 0.16
206 0.16
207 0.21
208 0.23
209 0.21
210 0.2
211 0.19
212 0.21
213 0.24
214 0.24
215 0.19
216 0.18
217 0.19
218 0.2
219 0.17
220 0.14
221 0.11
222 0.1
223 0.09
224 0.12
225 0.15
226 0.18
227 0.21
228 0.24
229 0.28
230 0.39
231 0.49
232 0.56
233 0.62
234 0.66
235 0.73
236 0.79
237 0.84
238 0.79
239 0.79
240 0.79
241 0.78
242 0.75
243 0.76
244 0.78
245 0.7
246 0.71
247 0.68
248 0.65
249 0.63
250 0.64
251 0.62
252 0.59
253 0.61
254 0.58
255 0.56
256 0.55
257 0.52
258 0.53
259 0.46
260 0.41
261 0.38
262 0.35
263 0.31
264 0.25
265 0.2
266 0.11
267 0.1
268 0.09
269 0.06
270 0.05
271 0.04
272 0.04
273 0.04
274 0.06
275 0.06
276 0.08
277 0.11
278 0.14
279 0.15
280 0.16
281 0.19
282 0.25
283 0.28
284 0.29
285 0.29
286 0.28
287 0.32
288 0.35
289 0.34
290 0.29
291 0.33
292 0.39
293 0.41
294 0.47
295 0.43
296 0.4
297 0.38
298 0.35
299 0.28
300 0.19
301 0.16
302 0.08
303 0.09
304 0.1
305 0.1
306 0.1
307 0.09
308 0.09
309 0.08
310 0.07
311 0.05
312 0.04
313 0.04
314 0.03
315 0.03
316 0.03
317 0.02
318 0.02
319 0.02
320 0.02
321 0.02
322 0.02
323 0.06
324 0.07
325 0.08
326 0.1
327 0.15
328 0.17
329 0.25
330 0.31
331 0.35
332 0.38
333 0.43
334 0.43
335 0.42
336 0.42
337 0.35
338 0.32
339 0.27
340 0.26
341 0.23
342 0.23
343 0.2
344 0.22
345 0.22
346 0.22
347 0.21
348 0.24
349 0.29