Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2T3B2Z6

Protein Details
Accession A0A2T3B2Z6    Localization Confidence High Confidence Score 16.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
81-101HEPVAAARRKRKKEYVNGEDEBasic
103-124GGRAVRASKKPKPAREPRANTAHydrophilic
372-396YISNGQEKFKKSKKKADDHEEEEEDAcidic
NLS Segment(s)
PositionSequence
88-94RRKRKKE
103-119GGRAVRASKKPKPAREP
Subcellular Location(s) cyto 18.5, cyto_nucl 13.5, nucl 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR034393  TatSF1-like  
IPR034392  TatSF1-like_RRM1  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12281  RRM1_TatSF1_like  
cd12285  RRM3_RBM39_like  
Amino Acid Sequences METTILSSREAAASGFPTNPEEFDADERISFSKLDGKFLLVQDDGAEFEFDEALRRWVPVLDEALLEEQQRAYRVSGVDEHEPVAAARRKRKKEYVNGEDEEGGRAVRASKKPKPAREPRANTAVYVTGLPADATVDEVASVFSRKCGVIAEEIDSGRPRIKLYTDEHGAFKGDALIVFFKPPSVDMAIMLLDDTPLRIDDGPEAPRMRVQAADASYKKVQHGAGEEGGQPTTAEGERERERQRTSAREKQKIIRKTQKLDARLADWSDDEPATMMGESSSGGGGSSRWDKVVILKHMFTLEELAEDPAAILDIKEDIREECSKLGEVTNVVLFDLEAEGVASVRFTSAEAARACVRLMDGRSFAGQKVEAYISNGQEKFKKSKKKADDHEEEEEDKV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.15
3 0.15
4 0.18
5 0.18
6 0.19
7 0.19
8 0.18
9 0.18
10 0.21
11 0.23
12 0.21
13 0.2
14 0.21
15 0.2
16 0.2
17 0.18
18 0.15
19 0.19
20 0.19
21 0.24
22 0.23
23 0.25
24 0.29
25 0.3
26 0.32
27 0.24
28 0.24
29 0.2
30 0.2
31 0.17
32 0.13
33 0.12
34 0.08
35 0.08
36 0.09
37 0.08
38 0.11
39 0.11
40 0.13
41 0.14
42 0.14
43 0.14
44 0.15
45 0.17
46 0.16
47 0.18
48 0.16
49 0.16
50 0.16
51 0.18
52 0.17
53 0.16
54 0.13
55 0.12
56 0.12
57 0.14
58 0.14
59 0.13
60 0.16
61 0.16
62 0.18
63 0.22
64 0.24
65 0.25
66 0.25
67 0.24
68 0.21
69 0.2
70 0.18
71 0.21
72 0.23
73 0.26
74 0.35
75 0.44
76 0.52
77 0.6
78 0.69
79 0.71
80 0.76
81 0.82
82 0.81
83 0.8
84 0.74
85 0.68
86 0.6
87 0.51
88 0.41
89 0.3
90 0.2
91 0.12
92 0.1
93 0.11
94 0.17
95 0.23
96 0.31
97 0.37
98 0.49
99 0.57
100 0.66
101 0.74
102 0.77
103 0.81
104 0.84
105 0.84
106 0.79
107 0.79
108 0.7
109 0.6
110 0.51
111 0.41
112 0.31
113 0.23
114 0.18
115 0.09
116 0.09
117 0.08
118 0.06
119 0.05
120 0.04
121 0.05
122 0.05
123 0.04
124 0.04
125 0.04
126 0.05
127 0.05
128 0.06
129 0.05
130 0.06
131 0.07
132 0.07
133 0.08
134 0.08
135 0.09
136 0.12
137 0.13
138 0.15
139 0.16
140 0.16
141 0.16
142 0.16
143 0.15
144 0.14
145 0.14
146 0.12
147 0.11
148 0.12
149 0.17
150 0.2
151 0.26
152 0.28
153 0.29
154 0.29
155 0.28
156 0.27
157 0.21
158 0.17
159 0.12
160 0.08
161 0.06
162 0.07
163 0.08
164 0.07
165 0.08
166 0.07
167 0.07
168 0.07
169 0.07
170 0.08
171 0.08
172 0.08
173 0.07
174 0.08
175 0.08
176 0.08
177 0.07
178 0.05
179 0.04
180 0.04
181 0.04
182 0.03
183 0.03
184 0.04
185 0.04
186 0.05
187 0.06
188 0.09
189 0.11
190 0.14
191 0.14
192 0.14
193 0.15
194 0.15
195 0.14
196 0.12
197 0.11
198 0.12
199 0.13
200 0.19
201 0.19
202 0.22
203 0.23
204 0.23
205 0.23
206 0.22
207 0.2
208 0.16
209 0.18
210 0.17
211 0.17
212 0.17
213 0.18
214 0.15
215 0.15
216 0.13
217 0.1
218 0.07
219 0.08
220 0.07
221 0.07
222 0.07
223 0.12
224 0.15
225 0.22
226 0.25
227 0.28
228 0.3
229 0.35
230 0.4
231 0.44
232 0.5
233 0.53
234 0.59
235 0.62
236 0.65
237 0.68
238 0.72
239 0.69
240 0.71
241 0.72
242 0.7
243 0.68
244 0.71
245 0.7
246 0.65
247 0.62
248 0.54
249 0.46
250 0.41
251 0.36
252 0.29
253 0.22
254 0.19
255 0.16
256 0.14
257 0.11
258 0.09
259 0.08
260 0.08
261 0.07
262 0.06
263 0.04
264 0.04
265 0.05
266 0.05
267 0.05
268 0.04
269 0.04
270 0.04
271 0.04
272 0.08
273 0.11
274 0.11
275 0.11
276 0.12
277 0.13
278 0.18
279 0.26
280 0.3
281 0.3
282 0.3
283 0.31
284 0.31
285 0.31
286 0.25
287 0.2
288 0.13
289 0.1
290 0.1
291 0.1
292 0.09
293 0.09
294 0.08
295 0.06
296 0.06
297 0.05
298 0.04
299 0.04
300 0.06
301 0.06
302 0.07
303 0.08
304 0.08
305 0.13
306 0.15
307 0.17
308 0.17
309 0.18
310 0.19
311 0.19
312 0.2
313 0.17
314 0.15
315 0.15
316 0.15
317 0.13
318 0.12
319 0.11
320 0.1
321 0.08
322 0.08
323 0.06
324 0.04
325 0.04
326 0.04
327 0.05
328 0.05
329 0.04
330 0.04
331 0.04
332 0.05
333 0.05
334 0.09
335 0.1
336 0.16
337 0.16
338 0.2
339 0.22
340 0.22
341 0.22
342 0.19
343 0.19
344 0.19
345 0.21
346 0.23
347 0.22
348 0.23
349 0.26
350 0.27
351 0.26
352 0.25
353 0.23
354 0.19
355 0.21
356 0.21
357 0.19
358 0.22
359 0.26
360 0.26
361 0.33
362 0.34
363 0.33
364 0.37
365 0.41
366 0.47
367 0.51
368 0.59
369 0.6
370 0.69
371 0.77
372 0.82
373 0.87
374 0.88
375 0.89
376 0.85
377 0.85
378 0.79