Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2T3ALF3

Protein Details
Accession A0A2T3ALF3    Localization Confidence High Confidence Score 19.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
173-246EAPKREKGDRHRSHRHRSSRHRDEDDSRRRRRDDKRDRSRSPRSPRRHQDDSDYERHQKRRKRSYSRERTTDSRBasic
265-285DYNAKRRRDRSGDRRHGPSRRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
175-221PKREKGDRHRSHRHRSSRHRDEDDSRRRRRDDKRDRSRSPRSPRRHQ
228-238RHQKRRKRSYS
268-306AKRRRDRSGDRRHGPSRRDYSDRRRSDNGLERRPRRWEG
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto_nucl 14, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019339  CIR_N_dom  
IPR022209  CWC25  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
Pfam View protein in Pfam  
PF10197  Cir_N  
PF12542  CWC25  
Amino Acid Sequences MGGNDLNLKKSWHPQLMVNQRRVYDAEQSALQERKITEARIEEIRRERQIEETQKQLEASGGPKRVDRVDWMYQGPNDGGRDEFSSEAFLLGKRRIDSILRGDDAKKVEKTAGPTGEAAGPMPIVASVRDTAAKIREDPLVAIKRQEQEAYQAMMKDPSKRRQLLAQMGITEEAPKREKGDRHRSHRHRSSRHRDEDDSRRRRRDDKRDRSRSPRSPRRHQDDSDYERHQKRRKRSYSRERTTDSRRNDPDGRTDSRRRDHSDDDYNAKRRRDRSGDRRHGPSRRDYSDRRRSDNGLERRPRRWEGSRRNDSSAQLQNGDEAEERARKLAAMQSDATDLEKAREARLAAMTEKEQAEREADDRARAQSQKYGGRDFANRLHNTVGNESLADRLGRGRQGLQRDQD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.48
2 0.57
3 0.65
4 0.7
5 0.69
6 0.64
7 0.58
8 0.58
9 0.54
10 0.47
11 0.44
12 0.37
13 0.32
14 0.3
15 0.32
16 0.35
17 0.35
18 0.32
19 0.27
20 0.25
21 0.29
22 0.31
23 0.3
24 0.28
25 0.29
26 0.33
27 0.38
28 0.4
29 0.4
30 0.45
31 0.51
32 0.51
33 0.51
34 0.48
35 0.46
36 0.54
37 0.56
38 0.52
39 0.52
40 0.49
41 0.48
42 0.47
43 0.4
44 0.31
45 0.23
46 0.24
47 0.24
48 0.26
49 0.26
50 0.28
51 0.3
52 0.31
53 0.31
54 0.32
55 0.32
56 0.34
57 0.37
58 0.39
59 0.4
60 0.37
61 0.38
62 0.33
63 0.28
64 0.22
65 0.19
66 0.17
67 0.15
68 0.16
69 0.16
70 0.16
71 0.13
72 0.14
73 0.13
74 0.13
75 0.12
76 0.11
77 0.13
78 0.16
79 0.19
80 0.18
81 0.19
82 0.21
83 0.22
84 0.25
85 0.3
86 0.32
87 0.3
88 0.32
89 0.31
90 0.33
91 0.35
92 0.35
93 0.28
94 0.24
95 0.26
96 0.26
97 0.3
98 0.32
99 0.31
100 0.27
101 0.27
102 0.27
103 0.25
104 0.23
105 0.18
106 0.11
107 0.09
108 0.07
109 0.07
110 0.05
111 0.04
112 0.04
113 0.06
114 0.06
115 0.07
116 0.08
117 0.09
118 0.11
119 0.14
120 0.16
121 0.15
122 0.17
123 0.18
124 0.18
125 0.18
126 0.24
127 0.25
128 0.24
129 0.24
130 0.26
131 0.27
132 0.28
133 0.28
134 0.2
135 0.2
136 0.22
137 0.22
138 0.2
139 0.18
140 0.17
141 0.21
142 0.21
143 0.25
144 0.29
145 0.34
146 0.41
147 0.42
148 0.43
149 0.45
150 0.51
151 0.5
152 0.49
153 0.43
154 0.35
155 0.34
156 0.33
157 0.27
158 0.22
159 0.15
160 0.12
161 0.13
162 0.13
163 0.16
164 0.2
165 0.26
166 0.33
167 0.44
168 0.51
169 0.58
170 0.69
171 0.74
172 0.8
173 0.84
174 0.84
175 0.82
176 0.84
177 0.86
178 0.85
179 0.85
180 0.8
181 0.74
182 0.71
183 0.72
184 0.72
185 0.71
186 0.68
187 0.65
188 0.63
189 0.68
190 0.71
191 0.72
192 0.72
193 0.74
194 0.78
195 0.83
196 0.86
197 0.87
198 0.87
199 0.85
200 0.84
201 0.83
202 0.81
203 0.81
204 0.84
205 0.83
206 0.8
207 0.72
208 0.69
209 0.68
210 0.66
211 0.62
212 0.57
213 0.56
214 0.55
215 0.61
216 0.6
217 0.57
218 0.61
219 0.66
220 0.72
221 0.75
222 0.81
223 0.85
224 0.89
225 0.9
226 0.87
227 0.81
228 0.77
229 0.76
230 0.73
231 0.67
232 0.65
233 0.59
234 0.58
235 0.59
236 0.53
237 0.52
238 0.49
239 0.5
240 0.48
241 0.52
242 0.53
243 0.55
244 0.59
245 0.58
246 0.57
247 0.57
248 0.57
249 0.58
250 0.55
251 0.55
252 0.56
253 0.58
254 0.58
255 0.56
256 0.55
257 0.5
258 0.54
259 0.57
260 0.61
261 0.63
262 0.69
263 0.76
264 0.77
265 0.82
266 0.81
267 0.78
268 0.72
269 0.71
270 0.67
271 0.63
272 0.64
273 0.64
274 0.67
275 0.7
276 0.72
277 0.69
278 0.65
279 0.62
280 0.64
281 0.66
282 0.65
283 0.64
284 0.68
285 0.67
286 0.68
287 0.71
288 0.67
289 0.64
290 0.64
291 0.65
292 0.66
293 0.72
294 0.77
295 0.75
296 0.76
297 0.72
298 0.64
299 0.61
300 0.58
301 0.49
302 0.41
303 0.36
304 0.32
305 0.29
306 0.28
307 0.21
308 0.14
309 0.16
310 0.17
311 0.17
312 0.17
313 0.17
314 0.15
315 0.16
316 0.19
317 0.19
318 0.2
319 0.2
320 0.21
321 0.22
322 0.22
323 0.21
324 0.18
325 0.15
326 0.13
327 0.18
328 0.17
329 0.17
330 0.2
331 0.19
332 0.21
333 0.24
334 0.24
335 0.21
336 0.23
337 0.23
338 0.25
339 0.25
340 0.24
341 0.22
342 0.2
343 0.21
344 0.2
345 0.2
346 0.23
347 0.23
348 0.26
349 0.27
350 0.29
351 0.33
352 0.34
353 0.35
354 0.34
355 0.39
356 0.44
357 0.46
358 0.47
359 0.44
360 0.46
361 0.49
362 0.48
363 0.49
364 0.5
365 0.47
366 0.45
367 0.45
368 0.44
369 0.42
370 0.4
371 0.35
372 0.26
373 0.25
374 0.24
375 0.21
376 0.2
377 0.16
378 0.14
379 0.15
380 0.19
381 0.22
382 0.24
383 0.29
384 0.33
385 0.42