Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

Q01408

Protein Details
Accession Q01408    Localization Confidence High Confidence Score 23
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
93-117LARMERRLQRATKRQKKQLEEDGIPHydrophilic
475-518IANTWKRKGIKQKMHYSEPCDGAVTPRDRRKHRPRVMTLPPCPPHydrophilic
558-588DENRPAPPVKAPKKKKGGKRKRTTDEEAAEPBasic
626-650LGCEEWLKPKKREVKKGKVPEEVEDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
563-579APPVKAPKKKKGGKRKR
633-643KPKKREVKKGK
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR004601  UvdE  
IPR036237  Xyl_isomerase-like_sf  
Gene Ontology GO:0005739  C:mitochondrion  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0004519  F:endonuclease activity  
GO:0043504  P:mitochondrial DNA repair  
GO:0006289  P:nucleotide-excision repair  
GO:0009411  P:response to UV  
KEGG ncr:NCU08850  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF03851  UvdE  
Amino Acid Sequences MPSRKSKAAALDTPQSESSTFSSTLDSSAPSPARNLRRSGRNILQPSSEKDRDHEKRSGEELAGRMMGKDANGHCLREGKEQEEGVKMAIEGLARMERRLQRATKRQKKQLEEDGIPVPSVVSRFPTAPYHHKSTNAEEREAKEPVLKTHSKDVEREAEIGVDDVVKMEPAATNIIEPEDAQDAAERGAARPPAVNSSYLPLPWKGRLGYACLNTYLRNAKPPIFSSRTCRMASIVDHRHPLQFEDEPEHHLKNKPDKSKEPQDELGHKFVQELGLANARDIVKMLCWNEKYGIRFLRLSSEMFPFASHPVHGYKLAPFASEVLAEAGRVAAELGHRLTTHPGQFTQLGSPRKEVVESAIRDLEYHDELLSLLKLPEQQNRDAVMIIHMGGQFGDKAATLERFKRNYARLSQSCKNRLVLENDDVGWTVHDLLPVCEELNIPMVLDYHHHNICFDPAHLREGTLDISDPKLQERIANTWKRKGIKQKMHYSEPCDGAVTPRDRRKHRPRVMTLPPCPPDMDLMIEAKDKEQAVFELMRTFKLPGFEKINDMVPYDRDDENRPAPPVKAPKKKKGGKRKRTTDEEAAEPEEVDTAADDVKDAPEGPKEVPEEERAMGGPYNRVYWPLGCEEWLKPKKREVKKGKVPEEVEDEGEFDG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.5
2 0.42
3 0.34
4 0.31
5 0.27
6 0.23
7 0.22
8 0.19
9 0.21
10 0.19
11 0.21
12 0.19
13 0.18
14 0.15
15 0.22
16 0.22
17 0.2
18 0.25
19 0.32
20 0.4
21 0.43
22 0.49
23 0.5
24 0.59
25 0.65
26 0.7
27 0.69
28 0.7
29 0.71
30 0.67
31 0.66
32 0.6
33 0.6
34 0.61
35 0.57
36 0.49
37 0.46
38 0.54
39 0.54
40 0.56
41 0.56
42 0.5
43 0.51
44 0.54
45 0.54
46 0.45
47 0.42
48 0.36
49 0.33
50 0.31
51 0.26
52 0.22
53 0.19
54 0.18
55 0.14
56 0.19
57 0.17
58 0.24
59 0.26
60 0.27
61 0.27
62 0.32
63 0.35
64 0.37
65 0.4
66 0.33
67 0.37
68 0.37
69 0.38
70 0.35
71 0.33
72 0.24
73 0.21
74 0.19
75 0.14
76 0.14
77 0.11
78 0.08
79 0.09
80 0.14
81 0.14
82 0.15
83 0.22
84 0.25
85 0.31
86 0.38
87 0.43
88 0.48
89 0.59
90 0.7
91 0.73
92 0.79
93 0.83
94 0.85
95 0.86
96 0.84
97 0.84
98 0.81
99 0.73
100 0.67
101 0.61
102 0.52
103 0.43
104 0.34
105 0.24
106 0.16
107 0.15
108 0.11
109 0.11
110 0.12
111 0.13
112 0.16
113 0.21
114 0.25
115 0.34
116 0.39
117 0.43
118 0.44
119 0.49
120 0.5
121 0.52
122 0.57
123 0.52
124 0.5
125 0.47
126 0.48
127 0.47
128 0.45
129 0.37
130 0.32
131 0.29
132 0.29
133 0.33
134 0.32
135 0.31
136 0.39
137 0.46
138 0.43
139 0.44
140 0.45
141 0.44
142 0.43
143 0.41
144 0.32
145 0.25
146 0.23
147 0.21
148 0.16
149 0.09
150 0.07
151 0.06
152 0.06
153 0.05
154 0.05
155 0.05
156 0.05
157 0.06
158 0.08
159 0.07
160 0.08
161 0.08
162 0.09
163 0.09
164 0.08
165 0.09
166 0.08
167 0.08
168 0.08
169 0.09
170 0.08
171 0.09
172 0.11
173 0.09
174 0.08
175 0.12
176 0.13
177 0.12
178 0.14
179 0.15
180 0.18
181 0.19
182 0.19
183 0.16
184 0.19
185 0.2
186 0.18
187 0.2
188 0.17
189 0.19
190 0.19
191 0.22
192 0.19
193 0.21
194 0.22
195 0.25
196 0.28
197 0.29
198 0.28
199 0.27
200 0.27
201 0.24
202 0.26
203 0.27
204 0.22
205 0.24
206 0.26
207 0.27
208 0.3
209 0.32
210 0.37
211 0.36
212 0.37
213 0.39
214 0.44
215 0.46
216 0.43
217 0.4
218 0.33
219 0.31
220 0.33
221 0.35
222 0.35
223 0.32
224 0.34
225 0.35
226 0.35
227 0.33
228 0.31
229 0.25
230 0.2
231 0.19
232 0.22
233 0.22
234 0.25
235 0.27
236 0.27
237 0.26
238 0.28
239 0.33
240 0.37
241 0.44
242 0.48
243 0.51
244 0.57
245 0.63
246 0.69
247 0.69
248 0.65
249 0.63
250 0.6
251 0.61
252 0.57
253 0.53
254 0.43
255 0.37
256 0.31
257 0.25
258 0.21
259 0.14
260 0.11
261 0.08
262 0.12
263 0.12
264 0.12
265 0.14
266 0.14
267 0.13
268 0.13
269 0.11
270 0.08
271 0.11
272 0.13
273 0.15
274 0.15
275 0.16
276 0.19
277 0.21
278 0.23
279 0.25
280 0.26
281 0.23
282 0.24
283 0.23
284 0.25
285 0.23
286 0.23
287 0.19
288 0.19
289 0.17
290 0.16
291 0.16
292 0.12
293 0.13
294 0.12
295 0.1
296 0.09
297 0.1
298 0.11
299 0.12
300 0.12
301 0.11
302 0.14
303 0.14
304 0.12
305 0.11
306 0.11
307 0.1
308 0.09
309 0.09
310 0.06
311 0.06
312 0.06
313 0.05
314 0.04
315 0.04
316 0.04
317 0.03
318 0.03
319 0.03
320 0.04
321 0.05
322 0.05
323 0.06
324 0.06
325 0.09
326 0.12
327 0.13
328 0.13
329 0.13
330 0.15
331 0.16
332 0.16
333 0.17
334 0.2
335 0.23
336 0.23
337 0.24
338 0.23
339 0.23
340 0.22
341 0.18
342 0.16
343 0.19
344 0.19
345 0.2
346 0.2
347 0.19
348 0.19
349 0.2
350 0.18
351 0.11
352 0.11
353 0.09
354 0.07
355 0.08
356 0.08
357 0.08
358 0.06
359 0.05
360 0.06
361 0.1
362 0.12
363 0.18
364 0.2
365 0.21
366 0.24
367 0.25
368 0.25
369 0.21
370 0.19
371 0.15
372 0.12
373 0.11
374 0.1
375 0.08
376 0.08
377 0.07
378 0.07
379 0.06
380 0.06
381 0.06
382 0.04
383 0.04
384 0.06
385 0.09
386 0.11
387 0.18
388 0.24
389 0.26
390 0.28
391 0.34
392 0.37
393 0.39
394 0.43
395 0.47
396 0.46
397 0.52
398 0.57
399 0.6
400 0.61
401 0.58
402 0.54
403 0.48
404 0.45
405 0.43
406 0.41
407 0.35
408 0.31
409 0.28
410 0.26
411 0.23
412 0.19
413 0.14
414 0.1
415 0.08
416 0.07
417 0.08
418 0.09
419 0.09
420 0.1
421 0.1
422 0.1
423 0.09
424 0.08
425 0.07
426 0.09
427 0.09
428 0.08
429 0.07
430 0.07
431 0.07
432 0.09
433 0.11
434 0.13
435 0.15
436 0.15
437 0.15
438 0.15
439 0.18
440 0.18
441 0.15
442 0.15
443 0.15
444 0.19
445 0.18
446 0.18
447 0.16
448 0.16
449 0.17
450 0.12
451 0.12
452 0.09
453 0.12
454 0.13
455 0.13
456 0.13
457 0.14
458 0.14
459 0.16
460 0.18
461 0.23
462 0.31
463 0.4
464 0.43
465 0.48
466 0.54
467 0.55
468 0.58
469 0.62
470 0.63
471 0.65
472 0.7
473 0.74
474 0.75
475 0.81
476 0.78
477 0.73
478 0.68
479 0.6
480 0.51
481 0.41
482 0.34
483 0.27
484 0.31
485 0.3
486 0.32
487 0.37
488 0.45
489 0.5
490 0.61
491 0.69
492 0.73
493 0.77
494 0.8
495 0.81
496 0.83
497 0.87
498 0.87
499 0.81
500 0.79
501 0.72
502 0.63
503 0.55
504 0.46
505 0.37
506 0.28
507 0.25
508 0.17
509 0.17
510 0.17
511 0.18
512 0.18
513 0.16
514 0.17
515 0.15
516 0.14
517 0.14
518 0.13
519 0.15
520 0.16
521 0.16
522 0.19
523 0.19
524 0.2
525 0.2
526 0.21
527 0.19
528 0.24
529 0.26
530 0.25
531 0.32
532 0.32
533 0.34
534 0.35
535 0.38
536 0.33
537 0.32
538 0.28
539 0.22
540 0.25
541 0.25
542 0.25
543 0.22
544 0.27
545 0.31
546 0.35
547 0.37
548 0.37
549 0.36
550 0.35
551 0.41
552 0.47
553 0.51
554 0.56
555 0.62
556 0.69
557 0.77
558 0.85
559 0.87
560 0.88
561 0.89
562 0.89
563 0.91
564 0.92
565 0.91
566 0.91
567 0.89
568 0.87
569 0.81
570 0.75
571 0.67
572 0.59
573 0.49
574 0.4
575 0.32
576 0.23
577 0.17
578 0.12
579 0.08
580 0.07
581 0.07
582 0.06
583 0.07
584 0.07
585 0.08
586 0.09
587 0.09
588 0.1
589 0.14
590 0.16
591 0.17
592 0.21
593 0.23
594 0.25
595 0.27
596 0.29
597 0.29
598 0.27
599 0.27
600 0.22
601 0.22
602 0.22
603 0.21
604 0.22
605 0.2
606 0.22
607 0.21
608 0.23
609 0.24
610 0.23
611 0.26
612 0.26
613 0.26
614 0.24
615 0.28
616 0.29
617 0.38
618 0.45
619 0.48
620 0.47
621 0.56
622 0.64
623 0.71
624 0.78
625 0.78
626 0.81
627 0.84
628 0.91
629 0.91
630 0.9
631 0.82
632 0.77
633 0.73
634 0.64
635 0.56
636 0.45