Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

Q7SCX3

Protein Details
Accession Q7SCX3    Localization Confidence Low Confidence Score 9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
2-21SSSAVKPKRGPPSHTPSPRSHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 10.5, mito 6, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012337  RNaseH-like_sf  
IPR036397  RNaseH_sf  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0004523  F:RNA-DNA hybrid ribonuclease activity  
GO:0043137  P:DNA replication, removal of RNA primer  
GO:0090502  P:RNA phosphodiester bond hydrolysis, endonucleolytic  
KEGG ncr:NCU08107  -  
Amino Acid Sequences MSSSAVKPKRGPPSHTPSPRSDGNDPKRPKLDGHPVIDLTGDSEDDDAPATLRQRLLTPSLQSPLPAPDVQGDSNVDDSTLAAGASDLHEPLDIEDEAGETFAVRRATAVMRSSPLQPASIVQPPRSPSPELKAIEIVDLTGGDYEGRQRSPRSPTPSFDYRIALWTQETREFAGRLILEPPEHARFSAQEACRGPLWVDNVPRIIIFCDGSSKLTPLMTWEGTNGGYGVVLRNPWAAENDENGQGRVVPEAFEVCSWSIQKMYSSSQAELAAIAQSIDTSLRLREKHRHAPRFEVRIFTDSKECWHRLRKGLNQRPERFSFRHTEPILRAVVWLSHRLRVMGGDLEVRWNPRRCAIGPELADDAAGVHYRDVDPEVFNQRNVRLLERDGILGMVHEEISAIVRERVTPPPMPFPLPDWFGER
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.76
2 0.8
3 0.77
4 0.72
5 0.71
6 0.7
7 0.67
8 0.66
9 0.66
10 0.66
11 0.7
12 0.7
13 0.72
14 0.7
15 0.66
16 0.62
17 0.6
18 0.62
19 0.6
20 0.6
21 0.57
22 0.53
23 0.51
24 0.47
25 0.37
26 0.27
27 0.19
28 0.14
29 0.09
30 0.09
31 0.09
32 0.09
33 0.1
34 0.08
35 0.08
36 0.1
37 0.12
38 0.14
39 0.15
40 0.16
41 0.18
42 0.21
43 0.25
44 0.27
45 0.29
46 0.3
47 0.32
48 0.31
49 0.29
50 0.27
51 0.26
52 0.26
53 0.22
54 0.19
55 0.19
56 0.23
57 0.22
58 0.23
59 0.21
60 0.18
61 0.19
62 0.18
63 0.14
64 0.11
65 0.11
66 0.09
67 0.08
68 0.06
69 0.05
70 0.05
71 0.05
72 0.07
73 0.07
74 0.06
75 0.06
76 0.07
77 0.07
78 0.08
79 0.11
80 0.09
81 0.08
82 0.08
83 0.09
84 0.08
85 0.08
86 0.08
87 0.04
88 0.05
89 0.08
90 0.09
91 0.08
92 0.08
93 0.11
94 0.13
95 0.17
96 0.19
97 0.17
98 0.19
99 0.21
100 0.23
101 0.24
102 0.23
103 0.2
104 0.17
105 0.17
106 0.19
107 0.24
108 0.24
109 0.22
110 0.25
111 0.27
112 0.31
113 0.33
114 0.32
115 0.28
116 0.32
117 0.39
118 0.36
119 0.35
120 0.33
121 0.3
122 0.27
123 0.24
124 0.18
125 0.1
126 0.09
127 0.07
128 0.05
129 0.05
130 0.04
131 0.04
132 0.08
133 0.1
134 0.11
135 0.13
136 0.16
137 0.21
138 0.29
139 0.36
140 0.41
141 0.43
142 0.44
143 0.49
144 0.53
145 0.51
146 0.45
147 0.4
148 0.32
149 0.31
150 0.28
151 0.22
152 0.17
153 0.17
154 0.16
155 0.17
156 0.17
157 0.16
158 0.17
159 0.17
160 0.16
161 0.16
162 0.14
163 0.13
164 0.13
165 0.12
166 0.11
167 0.11
168 0.14
169 0.14
170 0.14
171 0.13
172 0.12
173 0.12
174 0.16
175 0.23
176 0.21
177 0.23
178 0.24
179 0.26
180 0.25
181 0.25
182 0.21
183 0.16
184 0.18
185 0.16
186 0.17
187 0.16
188 0.17
189 0.16
190 0.16
191 0.14
192 0.11
193 0.09
194 0.08
195 0.07
196 0.08
197 0.09
198 0.1
199 0.1
200 0.1
201 0.1
202 0.09
203 0.09
204 0.09
205 0.12
206 0.11
207 0.1
208 0.1
209 0.11
210 0.11
211 0.11
212 0.09
213 0.05
214 0.05
215 0.05
216 0.05
217 0.05
218 0.05
219 0.05
220 0.06
221 0.06
222 0.06
223 0.08
224 0.09
225 0.09
226 0.11
227 0.13
228 0.16
229 0.17
230 0.16
231 0.15
232 0.13
233 0.13
234 0.12
235 0.1
236 0.06
237 0.06
238 0.07
239 0.07
240 0.07
241 0.08
242 0.07
243 0.09
244 0.09
245 0.09
246 0.09
247 0.1
248 0.11
249 0.12
250 0.14
251 0.19
252 0.2
253 0.2
254 0.21
255 0.21
256 0.2
257 0.18
258 0.16
259 0.09
260 0.07
261 0.06
262 0.04
263 0.04
264 0.04
265 0.04
266 0.05
267 0.05
268 0.07
269 0.12
270 0.15
271 0.19
272 0.28
273 0.36
274 0.46
275 0.56
276 0.63
277 0.61
278 0.69
279 0.73
280 0.72
281 0.66
282 0.6
283 0.51
284 0.46
285 0.45
286 0.37
287 0.34
288 0.25
289 0.29
290 0.31
291 0.31
292 0.34
293 0.41
294 0.46
295 0.49
296 0.58
297 0.62
298 0.67
299 0.74
300 0.77
301 0.79
302 0.79
303 0.78
304 0.75
305 0.72
306 0.63
307 0.58
308 0.55
309 0.49
310 0.52
311 0.47
312 0.47
313 0.42
314 0.44
315 0.41
316 0.34
317 0.3
318 0.21
319 0.23
320 0.19
321 0.25
322 0.22
323 0.24
324 0.25
325 0.25
326 0.25
327 0.22
328 0.22
329 0.16
330 0.16
331 0.14
332 0.14
333 0.18
334 0.19
335 0.22
336 0.28
337 0.3
338 0.31
339 0.33
340 0.38
341 0.36
342 0.42
343 0.43
344 0.43
345 0.4
346 0.41
347 0.38
348 0.33
349 0.31
350 0.23
351 0.18
352 0.12
353 0.12
354 0.09
355 0.07
356 0.09
357 0.09
358 0.11
359 0.13
360 0.13
361 0.14
362 0.19
363 0.27
364 0.28
365 0.3
366 0.33
367 0.32
368 0.36
369 0.37
370 0.36
371 0.31
372 0.32
373 0.34
374 0.32
375 0.31
376 0.25
377 0.23
378 0.19
379 0.15
380 0.13
381 0.09
382 0.08
383 0.07
384 0.06
385 0.06
386 0.08
387 0.09
388 0.1
389 0.11
390 0.12
391 0.15
392 0.18
393 0.24
394 0.28
395 0.32
396 0.34
397 0.41
398 0.45
399 0.46
400 0.44
401 0.42
402 0.43
403 0.41