FuNGI

A0A2T3ABV7

Protein Details

Accession

A0A2T3ABV7

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
412-439	DEQEQAHKREKKNRKRGKGKPNKGGDND	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
418-437	HKREKKNRKRGKGKPNKGGD
501-524	GRHGELGGRGRGGRGRGFNGRGRG

Subcellular Location(s)

cyto_nucl 13, nucl 12.5, cyto 10.5, extr 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR038664 Gar1/Naf1_Cbf5-bd_sf IPR007504 H/ACA_rnp_Gar1/Naf1 IPR040309 Naf1 IPR009000 Transl_B-barrel_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0005732 C:sno(s)RNA-containing ribonucleoprotein complex GO:0003723 F:RNA binding GO:0000493 P:box H/ACA snoRNP assembly GO:0001522 P:pseudouridine synthesis GO:0042254 P:ribosome biogenesis
Pfam	View protein in Pfam PF04410 Gar1

Amino Acid Sequences

MNSNIAIPGLGQLDNNNSNNPPTSDHESEQTQAPAAVETTTDAEMLNVDFERHDAQAVLDTNANAFEEIPTAENQACEPTAVSEQHDEPRVNEDGAENVNMQQDGHEAPATELNILDTAVSTQDSQMTGSEDHIAQSMDVSESQPPSPRVTDALEAALNGLLGPAETSTEVASKVDGKAQAENPQSQEQPPVISTANEGAAADHPEWEVDSSPYESSSDSSDDSSDDESDVEESKLGIEETARLLMEADGGSDDEIDGARAAKQAAGVRTKNEQPDEPAPKPDIVIQPEEPIVPLGIVQHIVEGTQVVIEGLQNGVAATIVDLGTPLCKEDRTVLGTVHDTIATVHKPMYILKFKNEDDVKTAGLERGSQIWYPKSLANFVFPAQLRQEKGSDASNLHDEEVGPDEMEYSDDEQEQAHKREKKNRKRGKGKPNKGGDNDKRGPNSNSNGDGNLRYDEDDDGPYKPLSRPANFGMGLPPMPTPGATGFSPAGNNHRGGPHQGRHGELGGRGRGGRGRGFNGRGRGGSGGGQGHNSHHNQPAAQPQNGYQPAVPFPTNQVPAPGQWPFPMPSMPQFTGIAPNAGYALPAWGGNQAAPFPFPPVPPPVGNWPNAAQQPQQPQQQQPPQQQQASYSPQTGGYNVPAPYPPHGAANGSAPAPNAYQYPNYYSGGQAQNGQSQHHWG

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.25
2	0.27
3	0.27
4	0.26
5	0.29
6	0.32
7	0.32
8	0.29
9	0.3
10	0.37
11	0.39
12	0.4
13	0.41
14	0.41
15	0.41
16	0.4
17	0.35
18	0.27
19	0.23
20	0.21
21	0.18
22	0.16
23	0.14
24	0.1
25	0.1
26	0.12
27	0.11
28	0.11
29	0.1
30	0.09
31	0.1
32	0.1
33	0.1
34	0.08
35	0.08
36	0.08
37	0.1
38	0.13
39	0.12
40	0.13
41	0.11
42	0.11
43	0.16
44	0.18
45	0.18
46	0.17
47	0.17
48	0.17
49	0.17
50	0.17
51	0.11
52	0.1
53	0.09
54	0.08
55	0.09
56	0.1
57	0.1
58	0.13
59	0.13
60	0.13
61	0.13
62	0.15
63	0.14
64	0.13
65	0.12
66	0.12
67	0.16
68	0.17
69	0.19
70	0.2
71	0.23
72	0.27
73	0.32
74	0.3
75	0.27
76	0.31
77	0.31
78	0.27
79	0.25
80	0.2
81	0.18
82	0.19
83	0.2
84	0.15
85	0.14
86	0.16
87	0.15
88	0.15
89	0.12
90	0.12
91	0.11
92	0.13
93	0.12
94	0.1
95	0.11
96	0.15
97	0.15
98	0.13
99	0.12
100	0.11
101	0.11
102	0.1
103	0.09
104	0.06
105	0.06
106	0.06
107	0.07
108	0.07
109	0.07
110	0.09
111	0.1
112	0.1
113	0.1
114	0.12
115	0.12
116	0.13
117	0.15
118	0.13
119	0.13
120	0.13
121	0.13
122	0.1
123	0.1
124	0.1
125	0.08
126	0.08
127	0.09
128	0.11
129	0.13
130	0.14
131	0.19
132	0.2
133	0.22
134	0.23
135	0.23
136	0.23
137	0.24
138	0.25
139	0.21
140	0.21
141	0.18
142	0.16
143	0.15
144	0.13
145	0.1
146	0.07
147	0.06
148	0.04
149	0.03
150	0.04
151	0.03
152	0.04
153	0.04
154	0.05
155	0.06
156	0.07
157	0.07
158	0.07
159	0.08
160	0.09
161	0.1
162	0.13
163	0.15
164	0.15
165	0.2
166	0.22
167	0.29
168	0.3
169	0.33
170	0.33
171	0.34
172	0.34
173	0.3
174	0.31
175	0.24
176	0.22
177	0.2
178	0.19
179	0.15
180	0.14
181	0.14
182	0.13
183	0.13
184	0.11
185	0.11
186	0.09
187	0.1
188	0.12
189	0.11
190	0.1
191	0.09
192	0.09
193	0.09
194	0.09
195	0.09
196	0.07
197	0.09
198	0.1
199	0.1
200	0.11
201	0.11
202	0.1
203	0.1
204	0.11
205	0.11
206	0.1
207	0.11
208	0.11
209	0.11
210	0.12
211	0.12
212	0.1
213	0.09
214	0.08
215	0.08
216	0.08
217	0.09
218	0.08
219	0.07
220	0.06
221	0.06
222	0.07
223	0.07
224	0.06
225	0.05
226	0.06
227	0.07
228	0.08
229	0.07
230	0.07
231	0.07
232	0.07
233	0.08
234	0.06
235	0.06
236	0.05
237	0.05
238	0.05
239	0.04
240	0.04
241	0.04
242	0.04
243	0.04
244	0.04
245	0.04
246	0.05
247	0.06
248	0.06
249	0.06
250	0.09
251	0.11
252	0.15
253	0.21
254	0.21
255	0.22
256	0.26
257	0.3
258	0.31
259	0.3
260	0.27
261	0.26
262	0.34
263	0.39
264	0.37
265	0.36
266	0.34
267	0.32
268	0.31
269	0.31
270	0.27
271	0.21
272	0.23
273	0.21
274	0.21
275	0.21
276	0.21
277	0.16
278	0.12
279	0.1
280	0.06
281	0.06
282	0.05
283	0.04
284	0.05
285	0.05
286	0.05
287	0.04
288	0.05
289	0.04
290	0.04
291	0.03
292	0.03
293	0.03
294	0.03
295	0.03
296	0.03
297	0.03
298	0.03
299	0.03
300	0.03
301	0.03
302	0.03
303	0.03
304	0.03
305	0.02
306	0.03
307	0.03
308	0.03
309	0.03
310	0.03
311	0.04
312	0.04
313	0.05
314	0.04
315	0.05
316	0.05
317	0.07
318	0.1
319	0.12
320	0.13
321	0.13
322	0.14
323	0.15
324	0.15
325	0.13
326	0.1
327	0.07
328	0.07
329	0.09
330	0.08
331	0.08
332	0.07
333	0.07
334	0.08
335	0.1
336	0.15
337	0.19
338	0.2
339	0.23
340	0.28
341	0.28
342	0.35
343	0.34
344	0.3
345	0.26
346	0.26
347	0.23
348	0.19
349	0.19
350	0.13
351	0.12
352	0.11
353	0.08
354	0.09
355	0.1
356	0.11
357	0.12
358	0.12
359	0.13
360	0.14
361	0.15
362	0.14
363	0.16
364	0.15
365	0.16
366	0.16
367	0.15
368	0.18
369	0.17
370	0.18
371	0.18
372	0.2
373	0.19
374	0.2
375	0.2
376	0.16
377	0.17
378	0.18
379	0.17
380	0.14
381	0.15
382	0.16
383	0.15
384	0.15
385	0.13
386	0.11
387	0.1
388	0.13
389	0.11
390	0.08
391	0.08
392	0.08
393	0.08
394	0.08
395	0.08
396	0.07
397	0.07
398	0.08
399	0.08
400	0.08
401	0.12
402	0.16
403	0.19
404	0.25
405	0.31
406	0.37
407	0.47
408	0.58
409	0.65
410	0.72
411	0.79
412	0.82
413	0.86
414	0.91
415	0.92
416	0.93
417	0.92
418	0.9
419	0.88
420	0.85
421	0.79
422	0.8
423	0.75
424	0.74
425	0.69
426	0.64
427	0.58
428	0.55
429	0.53
430	0.48
431	0.46
432	0.4
433	0.38
434	0.35
435	0.33
436	0.31
437	0.28
438	0.24
439	0.2
440	0.17
441	0.14
442	0.14
443	0.14
444	0.13
445	0.14
446	0.14
447	0.13
448	0.15
449	0.14
450	0.15
451	0.15
452	0.21
453	0.25
454	0.25
455	0.29
456	0.29
457	0.35
458	0.33
459	0.33
460	0.28
461	0.23
462	0.22
463	0.18
464	0.16
465	0.11
466	0.1
467	0.1
468	0.09
469	0.08
470	0.11
471	0.1
472	0.13
473	0.13
474	0.13
475	0.15
476	0.14
477	0.18
478	0.18
479	0.19
480	0.18
481	0.19
482	0.2
483	0.25
484	0.32
485	0.31
486	0.36
487	0.37
488	0.37
489	0.37
490	0.38
491	0.33
492	0.29
493	0.29
494	0.23
495	0.23
496	0.21
497	0.21
498	0.21
499	0.22
500	0.24
501	0.22
502	0.26
503	0.31
504	0.36
505	0.39
506	0.42
507	0.42
508	0.37
509	0.35
510	0.32
511	0.26
512	0.23
513	0.21
514	0.19
515	0.17
516	0.18
517	0.18
518	0.19
519	0.23
520	0.24
521	0.25
522	0.27
523	0.28
524	0.26
525	0.29
526	0.37
527	0.37
528	0.36
529	0.33
530	0.3
531	0.38
532	0.39
533	0.38
534	0.28
535	0.25
536	0.26
537	0.28
538	0.27
539	0.19
540	0.22
541	0.28
542	0.3
543	0.27
544	0.29
545	0.26
546	0.27
547	0.31
548	0.28
549	0.22
550	0.2
551	0.23
552	0.21
553	0.22
554	0.23
555	0.2
556	0.24
557	0.3
558	0.3
559	0.3
560	0.29
561	0.28
562	0.32
563	0.31
564	0.27
565	0.19
566	0.18
567	0.17
568	0.15
569	0.14
570	0.08
571	0.08
572	0.07
573	0.07
574	0.08
575	0.08
576	0.09
577	0.09
578	0.1
579	0.1
580	0.1
581	0.12
582	0.12
583	0.15
584	0.17
585	0.17
586	0.19
587	0.23
588	0.27
589	0.27
590	0.3
591	0.35
592	0.38
593	0.39
594	0.39
595	0.36
596	0.39
597	0.41
598	0.41
599	0.34
600	0.36
601	0.43
602	0.47
603	0.53
604	0.51
605	0.55
606	0.62
607	0.68
608	0.71
609	0.71
610	0.75
611	0.75
612	0.73
613	0.68
614	0.63
615	0.6
616	0.6
617	0.53
618	0.44
619	0.37
620	0.36
621	0.36
622	0.32
623	0.27
624	0.23
625	0.25
626	0.23
627	0.24
628	0.25
629	0.26
630	0.28
631	0.31
632	0.28
633	0.26
634	0.27
635	0.27
636	0.25
637	0.27
638	0.25
639	0.21
640	0.21
641	0.18
642	0.19
643	0.18
644	0.18
645	0.16
646	0.16
647	0.2
648	0.22
649	0.27
650	0.29
651	0.31
652	0.3
653	0.3
654	0.35
655	0.35
656	0.34
657	0.34
658	0.33
659	0.36
660	0.37
661	0.38

A0A2T3ABV7

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer