Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

Q1K612

Protein Details
Accession Q1K612    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
21-44TRSATSSSKKQSRDKKSVKYTIPEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
145-152KIKKRGRP
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto_nucl 12, cyto 6, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016197  Chromo-like_dom_sf  
IPR000953  Chromo/chromo_shadow_dom  
IPR023780  Chromo_domain  
IPR008251  Chromo_shadow_dom  
IPR023779  Chromodomain_CS  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0005721  C:pericentric heterochromatin  
GO:0003682  F:chromatin binding  
GO:1901363  F:heterocyclic compound binding  
GO:0035064  F:methylated histone binding  
GO:0097159  F:organic cyclic compound binding  
GO:0006325  P:chromatin organization  
GO:0006338  P:chromatin remodeling  
GO:0000122  P:negative regulation of transcription by RNA polymerase II  
KEGG ncr:NCU04017  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00385  Chromo  
PF01393  Chromo_shadow  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00598  CHROMO_1  
PS50013  CHROMO_2  
CDD cd00024  CD_CSD  
cd18657  CSD_Swi6  
Amino Acid Sequences MPYDPSALSDEEAASSVELDTRSATSSSKKQSRDKKSVKYTIPEPEDFEDEEQNGDGADEGGEDDEEGDEEEEDVYVVEKILDHMLNDDNEPLFLVKWEGYEKKSDQTWEPEDTLIEGASERLKEYFTKIGGREKIFEASAAAQKIKKRGRPSSNSGTPQASSNKRSRKNGDHPLNSEEPQTAKNAAWKPPAGSWEEHIAQLDACEDEDTHKLMVYLTWKNGHKTQHTTDVIYKRCPQKMLQFYERHVRIIKRDPDSEDREGSVSQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.09
2 0.09
3 0.08
4 0.09
5 0.09
6 0.09
7 0.1
8 0.1
9 0.12
10 0.13
11 0.14
12 0.18
13 0.26
14 0.36
15 0.42
16 0.49
17 0.56
18 0.66
19 0.74
20 0.79
21 0.81
22 0.81
23 0.84
24 0.86
25 0.83
26 0.79
27 0.75
28 0.73
29 0.69
30 0.6
31 0.54
32 0.47
33 0.44
34 0.39
35 0.35
36 0.27
37 0.21
38 0.2
39 0.17
40 0.13
41 0.1
42 0.09
43 0.07
44 0.05
45 0.05
46 0.04
47 0.04
48 0.04
49 0.04
50 0.04
51 0.04
52 0.04
53 0.04
54 0.05
55 0.05
56 0.05
57 0.05
58 0.05
59 0.05
60 0.05
61 0.04
62 0.05
63 0.04
64 0.04
65 0.04
66 0.04
67 0.05
68 0.07
69 0.08
70 0.07
71 0.09
72 0.11
73 0.12
74 0.12
75 0.12
76 0.1
77 0.1
78 0.1
79 0.08
80 0.06
81 0.06
82 0.07
83 0.06
84 0.07
85 0.11
86 0.13
87 0.14
88 0.18
89 0.19
90 0.21
91 0.23
92 0.24
93 0.23
94 0.27
95 0.29
96 0.28
97 0.27
98 0.24
99 0.22
100 0.21
101 0.19
102 0.12
103 0.08
104 0.05
105 0.05
106 0.06
107 0.06
108 0.06
109 0.06
110 0.07
111 0.07
112 0.1
113 0.12
114 0.13
115 0.16
116 0.17
117 0.23
118 0.27
119 0.27
120 0.27
121 0.25
122 0.25
123 0.21
124 0.2
125 0.14
126 0.12
127 0.13
128 0.13
129 0.13
130 0.13
131 0.15
132 0.23
133 0.28
134 0.31
135 0.36
136 0.44
137 0.53
138 0.57
139 0.63
140 0.65
141 0.68
142 0.66
143 0.61
144 0.53
145 0.44
146 0.41
147 0.4
148 0.35
149 0.32
150 0.37
151 0.43
152 0.48
153 0.55
154 0.58
155 0.61
156 0.66
157 0.72
158 0.74
159 0.71
160 0.68
161 0.67
162 0.63
163 0.54
164 0.45
165 0.36
166 0.27
167 0.22
168 0.2
169 0.16
170 0.13
171 0.2
172 0.23
173 0.27
174 0.3
175 0.3
176 0.3
177 0.31
178 0.33
179 0.29
180 0.26
181 0.23
182 0.25
183 0.25
184 0.24
185 0.22
186 0.19
187 0.16
188 0.15
189 0.14
190 0.08
191 0.07
192 0.07
193 0.06
194 0.08
195 0.1
196 0.11
197 0.11
198 0.11
199 0.11
200 0.1
201 0.12
202 0.16
203 0.18
204 0.2
205 0.27
206 0.29
207 0.33
208 0.38
209 0.42
210 0.43
211 0.47
212 0.48
213 0.52
214 0.52
215 0.52
216 0.55
217 0.57
218 0.54
219 0.53
220 0.55
221 0.53
222 0.55
223 0.54
224 0.51
225 0.53
226 0.59
227 0.62
228 0.64
229 0.61
230 0.61
231 0.69
232 0.65
233 0.59
234 0.55
235 0.5
236 0.48
237 0.53
238 0.58
239 0.54
240 0.57
241 0.6
242 0.63
243 0.66
244 0.63
245 0.56
246 0.49