Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

Q7S8D3

Protein Details
Accession Q7S8D3    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
298-317HAKASSTSRKKNPQDAHRMVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
201-215EKKKKKKPSSGEEEK
Subcellular Location(s) nucl 23, mito_nucl 13.333, cyto_nucl 12.833
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039693  Rtr1/RPAP2  
IPR007308  Rtr1/RPAP2_dom  
IPR038534  Rtr1/RPAP2_sf  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0017018  F:myosin phosphatase activity  
GO:0043175  F:RNA polymerase core enzyme binding  
GO:0008420  F:RNA polymerase II CTD heptapeptide repeat phosphatase activity  
KEGG ncr:NCU07013  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04181  RPAP2_Rtr1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51479  ZF_RTR1  
Amino Acid Sequences MSSTSPPQQQQRDFISPGGPLPISFPDLSSLPTEQRLAHEQALLLQRLSQTELKPAIPLETIELLSSSFPTQRTTPPALHPLNHQPLSAANPHPEDARQFLKLVADFTPREYLELIEERNCLGACGYVLCPRKRRQYEGEYKIIMRTGNIAKTEDLNKWCSDACAVRALYVKVQLDNPSYMTDLETGKRVVKVELREEEEEKKKKKKPSSGEEEKAKDKATTSIKEAEDKVAADLARLDLNRKAEISDKAAQMQRDADALAVERGQGSGKLDRLLAGQGVEVTIREKPTTGPAKAPDHAKASSTSRKKNPQDAHRMVEGHKPRFGTDIRSQEAAKNDGSESESEDTDEDDDDINDYLSGRMQISM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.54
2 0.47
3 0.39
4 0.35
5 0.32
6 0.24
7 0.17
8 0.18
9 0.19
10 0.2
11 0.19
12 0.19
13 0.17
14 0.18
15 0.2
16 0.2
17 0.2
18 0.18
19 0.21
20 0.22
21 0.2
22 0.24
23 0.28
24 0.29
25 0.29
26 0.28
27 0.25
28 0.3
29 0.34
30 0.31
31 0.25
32 0.23
33 0.22
34 0.21
35 0.26
36 0.24
37 0.19
38 0.25
39 0.28
40 0.26
41 0.27
42 0.26
43 0.24
44 0.2
45 0.2
46 0.16
47 0.16
48 0.15
49 0.14
50 0.14
51 0.12
52 0.11
53 0.12
54 0.1
55 0.11
56 0.11
57 0.14
58 0.16
59 0.21
60 0.27
61 0.31
62 0.33
63 0.35
64 0.43
65 0.43
66 0.42
67 0.43
68 0.46
69 0.5
70 0.48
71 0.43
72 0.34
73 0.33
74 0.35
75 0.35
76 0.27
77 0.22
78 0.22
79 0.23
80 0.24
81 0.23
82 0.21
83 0.21
84 0.21
85 0.19
86 0.18
87 0.18
88 0.2
89 0.2
90 0.19
91 0.17
92 0.19
93 0.18
94 0.2
95 0.23
96 0.2
97 0.21
98 0.19
99 0.17
100 0.17
101 0.19
102 0.18
103 0.15
104 0.16
105 0.15
106 0.16
107 0.15
108 0.11
109 0.09
110 0.08
111 0.06
112 0.08
113 0.09
114 0.14
115 0.21
116 0.24
117 0.31
118 0.36
119 0.47
120 0.49
121 0.54
122 0.56
123 0.6
124 0.67
125 0.68
126 0.67
127 0.59
128 0.55
129 0.49
130 0.42
131 0.32
132 0.21
133 0.19
134 0.16
135 0.17
136 0.18
137 0.18
138 0.17
139 0.2
140 0.22
141 0.21
142 0.21
143 0.21
144 0.19
145 0.2
146 0.19
147 0.17
148 0.16
149 0.13
150 0.12
151 0.15
152 0.15
153 0.15
154 0.17
155 0.17
156 0.16
157 0.19
158 0.18
159 0.14
160 0.15
161 0.16
162 0.15
163 0.15
164 0.15
165 0.12
166 0.13
167 0.12
168 0.11
169 0.1
170 0.1
171 0.1
172 0.1
173 0.1
174 0.11
175 0.12
176 0.12
177 0.12
178 0.15
179 0.17
180 0.21
181 0.24
182 0.27
183 0.27
184 0.29
185 0.33
186 0.38
187 0.42
188 0.43
189 0.48
190 0.5
191 0.57
192 0.63
193 0.67
194 0.68
195 0.71
196 0.76
197 0.77
198 0.78
199 0.77
200 0.72
201 0.66
202 0.58
203 0.49
204 0.38
205 0.29
206 0.29
207 0.27
208 0.26
209 0.26
210 0.32
211 0.31
212 0.34
213 0.34
214 0.29
215 0.24
216 0.22
217 0.19
218 0.15
219 0.14
220 0.11
221 0.1
222 0.09
223 0.1
224 0.1
225 0.12
226 0.12
227 0.15
228 0.15
229 0.15
230 0.15
231 0.17
232 0.2
233 0.23
234 0.26
235 0.25
236 0.29
237 0.31
238 0.3
239 0.28
240 0.26
241 0.21
242 0.16
243 0.15
244 0.11
245 0.09
246 0.09
247 0.08
248 0.07
249 0.07
250 0.06
251 0.06
252 0.07
253 0.07
254 0.09
255 0.12
256 0.13
257 0.14
258 0.14
259 0.15
260 0.15
261 0.15
262 0.13
263 0.1
264 0.09
265 0.08
266 0.08
267 0.07
268 0.07
269 0.07
270 0.09
271 0.1
272 0.1
273 0.11
274 0.12
275 0.21
276 0.28
277 0.28
278 0.31
279 0.36
280 0.41
281 0.45
282 0.47
283 0.43
284 0.39
285 0.38
286 0.35
287 0.33
288 0.34
289 0.41
290 0.45
291 0.5
292 0.55
293 0.64
294 0.7
295 0.76
296 0.79
297 0.79
298 0.81
299 0.79
300 0.75
301 0.7
302 0.65
303 0.57
304 0.57
305 0.56
306 0.49
307 0.46
308 0.42
309 0.37
310 0.4
311 0.4
312 0.38
313 0.38
314 0.42
315 0.42
316 0.44
317 0.44
318 0.43
319 0.46
320 0.41
321 0.34
322 0.27
323 0.24
324 0.23
325 0.24
326 0.21
327 0.2
328 0.2
329 0.19
330 0.18
331 0.18
332 0.17
333 0.16
334 0.16
335 0.12
336 0.11
337 0.11
338 0.11
339 0.11
340 0.1
341 0.1
342 0.1
343 0.09
344 0.1
345 0.11