Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2T3A0R6

Protein Details
Accession A0A2T3A0R6    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
14-36SLETDLSRKKRPKGSSKIVIEWFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
22-26KKRPK
Subcellular Location(s) nucl 13, cyto 10.5, cyto_mito 6.5, mito 1.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012310  DNA_ligase_ATP-dep_cent  
IPR012308  DNA_ligase_ATP-dep_N  
IPR036599  DNA_ligase_N_sf  
IPR029710  LIG4  
IPR012340  NA-bd_OB-fold  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003910  F:DNA ligase (ATP) activity  
GO:0051103  P:DNA ligation involved in DNA repair  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006260  P:DNA replication  
Pfam View protein in Pfam  
PF01068  DNA_ligase_A_M  
PF04675  DNA_ligase_A_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50160  DNA_LIGASE_A3  
Amino Acid Sequences MPFSFGAICDLLQSLETDLSRKKRPKGSSKIVIEWFAGHRNVLVGANVDQTALLSTLLPERRTDRVYNIQHTRLESIVSKACGLGRSRQSALARWREQGSGTDLAECVEAILEAAPNGATRDITVEEVDGVLHQLAAWSAFSSPAVRSSLSSVSLQSKIASRQQLRLEDLFRQLTPRDAKWLCRLVLKNFLPVVVPEHLVYAQCHPLLPTILKIHNDFAVAISLLEQQVCNDSGMRLDLDEADIPRLIKPKVGVKVGRQTWLKVRSIQQCISMGHGLMSCEEKVDGEYCQVHIDLVGPRRIQIFSKSGKDSTADRVNLHSAIRSSLDLGSAKCRFKNNCILEGELVVWSDTEKRILGFEEIRRHVSRSGRFMGTAIAGRPPASERLMIVYYDLLSVDNQSLLNVRYFERCRRLAALAKCEEGRSALVQRTIINFSSRLAALELREAFATCIVQRQEGLVLKSDSPYFDFETNKSRHGSCVLKLKKAYLKNLGEVGDLAVVGARYDSTAAKVLALPNIQYTHFYVGCAINKDEVTRFEHAKPAFIIVAEVELNATMAAYFQQYVFTRSVEPAQNTEYDLHLSQGIVQGRQLSVVFLDPAVFEITCFAFHHDTNSDFWSPRFPYVSKIHADRSWKDCLGFEELQKIASTEQGCPEYADSQELAQWIKALEKIEPRRIENAVEQDSGNTHDSCTTGLSWDDAWPRIASQQATVLAATCEVGHIASNAVSNPPDSPTAQAPTPELKCCGNGSGSVVGLSARKRGREAFPVSPPVPRQKRHTSSHLVVQGSHPDSPLRESYRSLGQVTPRVLSESEQLPSAISQGTNTRRLRNASEPLTSPVSFSSLPLGKSAARRNNTSEPVDLSSGGPLRAVPGLDLKLTKHASLICCYAGESCALHGCTVLLAPCVAHFPWLTDDLLPSHGIAAVFKDVASWLASAATLPSPARRQPRVVLVERRRSEATKKFLASLQAEPLKDREGKRQILIVYDWHLLEDITHAEKVHRRSSMSSARQKTGTGALAKELWRKHYIGLC
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.1
2 0.12
3 0.13
4 0.15
5 0.22
6 0.28
7 0.38
8 0.45
9 0.52
10 0.58
11 0.68
12 0.76
13 0.8
14 0.84
15 0.84
16 0.84
17 0.83
18 0.78
19 0.71
20 0.61
21 0.53
22 0.46
23 0.41
24 0.34
25 0.26
26 0.22
27 0.2
28 0.21
29 0.19
30 0.16
31 0.13
32 0.13
33 0.16
34 0.15
35 0.14
36 0.12
37 0.11
38 0.12
39 0.1
40 0.09
41 0.06
42 0.08
43 0.15
44 0.19
45 0.2
46 0.22
47 0.25
48 0.3
49 0.35
50 0.37
51 0.38
52 0.44
53 0.51
54 0.58
55 0.62
56 0.61
57 0.6
58 0.6
59 0.55
60 0.45
61 0.4
62 0.32
63 0.3
64 0.3
65 0.27
66 0.25
67 0.24
68 0.25
69 0.27
70 0.27
71 0.31
72 0.33
73 0.38
74 0.39
75 0.45
76 0.45
77 0.48
78 0.55
79 0.56
80 0.53
81 0.51
82 0.52
83 0.46
84 0.45
85 0.41
86 0.37
87 0.31
88 0.28
89 0.25
90 0.23
91 0.22
92 0.2
93 0.17
94 0.11
95 0.07
96 0.06
97 0.05
98 0.05
99 0.05
100 0.05
101 0.05
102 0.05
103 0.06
104 0.07
105 0.07
106 0.07
107 0.07
108 0.1
109 0.11
110 0.12
111 0.12
112 0.11
113 0.11
114 0.11
115 0.11
116 0.08
117 0.08
118 0.06
119 0.06
120 0.05
121 0.05
122 0.05
123 0.06
124 0.06
125 0.06
126 0.06
127 0.07
128 0.08
129 0.09
130 0.1
131 0.12
132 0.14
133 0.14
134 0.15
135 0.18
136 0.2
137 0.2
138 0.21
139 0.2
140 0.23
141 0.24
142 0.23
143 0.21
144 0.22
145 0.24
146 0.3
147 0.36
148 0.35
149 0.4
150 0.46
151 0.5
152 0.51
153 0.51
154 0.47
155 0.42
156 0.44
157 0.4
158 0.33
159 0.31
160 0.27
161 0.31
162 0.33
163 0.3
164 0.34
165 0.34
166 0.38
167 0.43
168 0.49
169 0.43
170 0.46
171 0.49
172 0.44
173 0.52
174 0.49
175 0.47
176 0.4
177 0.39
178 0.32
179 0.28
180 0.28
181 0.2
182 0.2
183 0.14
184 0.15
185 0.16
186 0.16
187 0.17
188 0.16
189 0.17
190 0.16
191 0.16
192 0.15
193 0.16
194 0.18
195 0.18
196 0.18
197 0.2
198 0.23
199 0.26
200 0.27
201 0.27
202 0.25
203 0.25
204 0.21
205 0.17
206 0.15
207 0.12
208 0.1
209 0.1
210 0.1
211 0.1
212 0.1
213 0.09
214 0.08
215 0.1
216 0.11
217 0.1
218 0.09
219 0.09
220 0.1
221 0.11
222 0.11
223 0.08
224 0.08
225 0.08
226 0.09
227 0.11
228 0.11
229 0.11
230 0.12
231 0.12
232 0.14
233 0.18
234 0.16
235 0.16
236 0.19
237 0.25
238 0.3
239 0.36
240 0.37
241 0.39
242 0.49
243 0.5
244 0.54
245 0.48
246 0.45
247 0.46
248 0.49
249 0.46
250 0.41
251 0.46
252 0.48
253 0.53
254 0.51
255 0.47
256 0.44
257 0.42
258 0.41
259 0.34
260 0.25
261 0.2
262 0.19
263 0.15
264 0.12
265 0.14
266 0.1
267 0.1
268 0.1
269 0.09
270 0.09
271 0.1
272 0.09
273 0.1
274 0.11
275 0.11
276 0.12
277 0.12
278 0.1
279 0.1
280 0.12
281 0.13
282 0.16
283 0.2
284 0.19
285 0.2
286 0.22
287 0.23
288 0.22
289 0.22
290 0.25
291 0.26
292 0.32
293 0.34
294 0.33
295 0.33
296 0.33
297 0.31
298 0.32
299 0.34
300 0.3
301 0.28
302 0.29
303 0.3
304 0.3
305 0.28
306 0.22
307 0.15
308 0.15
309 0.15
310 0.13
311 0.12
312 0.11
313 0.13
314 0.13
315 0.13
316 0.18
317 0.22
318 0.24
319 0.25
320 0.31
321 0.32
322 0.36
323 0.46
324 0.43
325 0.45
326 0.44
327 0.43
328 0.37
329 0.35
330 0.3
331 0.2
332 0.16
333 0.09
334 0.07
335 0.06
336 0.08
337 0.07
338 0.08
339 0.08
340 0.08
341 0.09
342 0.1
343 0.12
344 0.15
345 0.2
346 0.27
347 0.29
348 0.33
349 0.33
350 0.34
351 0.36
352 0.38
353 0.38
354 0.35
355 0.38
356 0.34
357 0.34
358 0.32
359 0.29
360 0.23
361 0.2
362 0.14
363 0.11
364 0.11
365 0.11
366 0.11
367 0.11
368 0.12
369 0.12
370 0.12
371 0.11
372 0.14
373 0.15
374 0.14
375 0.13
376 0.11
377 0.09
378 0.09
379 0.09
380 0.06
381 0.05
382 0.06
383 0.06
384 0.06
385 0.06
386 0.06
387 0.07
388 0.08
389 0.09
390 0.09
391 0.1
392 0.15
393 0.19
394 0.24
395 0.29
396 0.3
397 0.31
398 0.33
399 0.35
400 0.37
401 0.39
402 0.41
403 0.36
404 0.36
405 0.35
406 0.32
407 0.28
408 0.22
409 0.18
410 0.12
411 0.13
412 0.13
413 0.14
414 0.15
415 0.16
416 0.17
417 0.18
418 0.17
419 0.15
420 0.14
421 0.13
422 0.14
423 0.13
424 0.11
425 0.1
426 0.1
427 0.09
428 0.12
429 0.12
430 0.11
431 0.11
432 0.1
433 0.1
434 0.09
435 0.09
436 0.06
437 0.1
438 0.1
439 0.1
440 0.1
441 0.1
442 0.13
443 0.15
444 0.15
445 0.14
446 0.14
447 0.14
448 0.15
449 0.15
450 0.12
451 0.12
452 0.13
453 0.12
454 0.14
455 0.15
456 0.15
457 0.23
458 0.24
459 0.25
460 0.25
461 0.23
462 0.22
463 0.25
464 0.26
465 0.21
466 0.3
467 0.31
468 0.33
469 0.33
470 0.36
471 0.38
472 0.4
473 0.41
474 0.4
475 0.38
476 0.36
477 0.38
478 0.34
479 0.28
480 0.24
481 0.2
482 0.11
483 0.09
484 0.07
485 0.04
486 0.03
487 0.03
488 0.03
489 0.03
490 0.03
491 0.04
492 0.04
493 0.05
494 0.07
495 0.07
496 0.07
497 0.08
498 0.09
499 0.1
500 0.1
501 0.09
502 0.09
503 0.1
504 0.1
505 0.1
506 0.1
507 0.12
508 0.11
509 0.11
510 0.12
511 0.13
512 0.14
513 0.15
514 0.15
515 0.13
516 0.13
517 0.14
518 0.13
519 0.13
520 0.15
521 0.15
522 0.18
523 0.17
524 0.23
525 0.22
526 0.22
527 0.21
528 0.18
529 0.16
530 0.13
531 0.12
532 0.07
533 0.08
534 0.06
535 0.06
536 0.04
537 0.04
538 0.04
539 0.04
540 0.03
541 0.02
542 0.02
543 0.03
544 0.03
545 0.04
546 0.04
547 0.07
548 0.08
549 0.1
550 0.11
551 0.12
552 0.12
553 0.13
554 0.17
555 0.17
556 0.17
557 0.16
558 0.17
559 0.17
560 0.17
561 0.17
562 0.13
563 0.12
564 0.11
565 0.1
566 0.09
567 0.08
568 0.08
569 0.11
570 0.12
571 0.1
572 0.1
573 0.11
574 0.11
575 0.11
576 0.11
577 0.07
578 0.06
579 0.06
580 0.06
581 0.05
582 0.05
583 0.05
584 0.05
585 0.06
586 0.06
587 0.05
588 0.06
589 0.06
590 0.07
591 0.07
592 0.09
593 0.1
594 0.1
595 0.13
596 0.14
597 0.15
598 0.15
599 0.18
600 0.18
601 0.16
602 0.16
603 0.19
604 0.19
605 0.2
606 0.22
607 0.19
608 0.23
609 0.27
610 0.31
611 0.28
612 0.3
613 0.31
614 0.31
615 0.36
616 0.34
617 0.34
618 0.35
619 0.33
620 0.31
621 0.29
622 0.28
623 0.3
624 0.27
625 0.23
626 0.23
627 0.22
628 0.22
629 0.2
630 0.19
631 0.12
632 0.14
633 0.15
634 0.11
635 0.14
636 0.15
637 0.15
638 0.15
639 0.16
640 0.13
641 0.13
642 0.13
643 0.1
644 0.09
645 0.1
646 0.1
647 0.1
648 0.08
649 0.09
650 0.08
651 0.08
652 0.1
653 0.1
654 0.12
655 0.2
656 0.26
657 0.33
658 0.36
659 0.37
660 0.39
661 0.39
662 0.39
663 0.34
664 0.35
665 0.3
666 0.28
667 0.26
668 0.22
669 0.22
670 0.22
671 0.2
672 0.14
673 0.11
674 0.11
675 0.11
676 0.12
677 0.12
678 0.09
679 0.08
680 0.08
681 0.09
682 0.09
683 0.12
684 0.14
685 0.13
686 0.15
687 0.14
688 0.14
689 0.15
690 0.17
691 0.14
692 0.13
693 0.15
694 0.15
695 0.15
696 0.15
697 0.14
698 0.11
699 0.1
700 0.09
701 0.06
702 0.05
703 0.04
704 0.04
705 0.04
706 0.04
707 0.05
708 0.05
709 0.06
710 0.06
711 0.07
712 0.08
713 0.08
714 0.08
715 0.1
716 0.11
717 0.11
718 0.13
719 0.15
720 0.18
721 0.18
722 0.18
723 0.19
724 0.24
725 0.26
726 0.25
727 0.24
728 0.22
729 0.23
730 0.23
731 0.23
732 0.17
733 0.15
734 0.16
735 0.15
736 0.14
737 0.13
738 0.12
739 0.11
740 0.12
741 0.12
742 0.16
743 0.17
744 0.18
745 0.21
746 0.25
747 0.29
748 0.36
749 0.41
750 0.41
751 0.44
752 0.5
753 0.48
754 0.48
755 0.47
756 0.49
757 0.5
758 0.48
759 0.51
760 0.54
761 0.62
762 0.64
763 0.68
764 0.66
765 0.62
766 0.66
767 0.63
768 0.53
769 0.46
770 0.42
771 0.41
772 0.34
773 0.31
774 0.24
775 0.19
776 0.2
777 0.22
778 0.26
779 0.24
780 0.23
781 0.25
782 0.27
783 0.33
784 0.34
785 0.33
786 0.3
787 0.3
788 0.34
789 0.34
790 0.33
791 0.26
792 0.26
793 0.24
794 0.22
795 0.22
796 0.19
797 0.18
798 0.17
799 0.16
800 0.15
801 0.14
802 0.14
803 0.11
804 0.08
805 0.09
806 0.16
807 0.21
808 0.29
809 0.32
810 0.36
811 0.39
812 0.43
813 0.47
814 0.48
815 0.51
816 0.46
817 0.48
818 0.45
819 0.45
820 0.45
821 0.4
822 0.32
823 0.25
824 0.24
825 0.2
826 0.18
827 0.21
828 0.19
829 0.19
830 0.2
831 0.21
832 0.21
833 0.27
834 0.36
835 0.38
836 0.39
837 0.42
838 0.49
839 0.55
840 0.58
841 0.54
842 0.47
843 0.42
844 0.41
845 0.39
846 0.33
847 0.25
848 0.23
849 0.21
850 0.19
851 0.16
852 0.12
853 0.13
854 0.13
855 0.13
856 0.1
857 0.13
858 0.14
859 0.16
860 0.17
861 0.17
862 0.23
863 0.25
864 0.24
865 0.22
866 0.25
867 0.26
868 0.28
869 0.29
870 0.23
871 0.21
872 0.22
873 0.2
874 0.16
875 0.15
876 0.12
877 0.11
878 0.14
879 0.14
880 0.14
881 0.13
882 0.12
883 0.11
884 0.12
885 0.11
886 0.08
887 0.07
888 0.07
889 0.08
890 0.1
891 0.1
892 0.11
893 0.11
894 0.12
895 0.16
896 0.18
897 0.18
898 0.16
899 0.18
900 0.17
901 0.18
902 0.17
903 0.13
904 0.12
905 0.13
906 0.12
907 0.11
908 0.12
909 0.12
910 0.12
911 0.11
912 0.11
913 0.09
914 0.1
915 0.11
916 0.09
917 0.07
918 0.07
919 0.08
920 0.07
921 0.09
922 0.08
923 0.1
924 0.1
925 0.15
926 0.2
927 0.27
928 0.36
929 0.39
930 0.43
931 0.46
932 0.56
933 0.59
934 0.63
935 0.67
936 0.68
937 0.74
938 0.71
939 0.71
940 0.65
941 0.6
942 0.61
943 0.59
944 0.57
945 0.54
946 0.54
947 0.52
948 0.51
949 0.54
950 0.49
951 0.43
952 0.44
953 0.41
954 0.4
955 0.39
956 0.38
957 0.36
958 0.39
959 0.38
960 0.4
961 0.43
962 0.48
963 0.48
964 0.52
965 0.47
966 0.45
967 0.44
968 0.38
969 0.33
970 0.31
971 0.28
972 0.23
973 0.22
974 0.18
975 0.16
976 0.14
977 0.13
978 0.13
979 0.15
980 0.15
981 0.19
982 0.26
983 0.31
984 0.36
985 0.37
986 0.37
987 0.4
988 0.49
989 0.55
990 0.59
991 0.63
992 0.63
993 0.64
994 0.63
995 0.6
996 0.54
997 0.49
998 0.45
999 0.39
1000 0.33
1001 0.31
1002 0.34
1003 0.37
1004 0.41
1005 0.38
1006 0.38
1007 0.38
1008 0.38