Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

Q7SHQ6

Protein Details
Accession Q7SHQ6    Localization Confidence High Confidence Score 17.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-28MVKPLTFKGDKKAKKRKRTTTDQNDDDVHydrophilic
256-275EDEVKKLKRARREGNYHEVMBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
9-18GDKKAKKRKR
224-267RFKPRIKASKEEKAREKISRRELEEAVGRRLEEDEVKKLKRARR
Subcellular Location(s) nucl 17, mito 5.5, cyto_mito 5.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR008999  Actin-crosslinking  
IPR010414  FRG1  
Gene Ontology GO:0071013  C:catalytic step 2 spliceosome  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0051015  F:actin filament binding  
KEGG ncr:NCU02559  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF06229  FRG1  
Amino Acid Sequences MVKPLTFKGDKKAKKRKRTTTDQNDDDVPERQKKQFKASATSSDITTTAATASNEEIEGEEHDDSWVSADTPSDVSGPIMFVLPTEPPTALACDVTGKVFTLPIENIVDGNPATAEPHDVRQVWVANKIVGTENHRFKGHHGKYLSCDKIGLFTANSDAITSLESFTIIPTFDTPGTFQIQTLRDTFLTVRASNSSKANAAPEVRGDATEISFDSTLRIRMQARFKPRIKASKEEKAREKISRRELEEAVGRRLEEDEVKKLKRARREGNYHEVMLDLKVKGKHDKYG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.82
2 0.9
3 0.91
4 0.9
5 0.93
6 0.93
7 0.93
8 0.93
9 0.86
10 0.79
11 0.7
12 0.63
13 0.55
14 0.49
15 0.44
16 0.41
17 0.41
18 0.45
19 0.5
20 0.52
21 0.58
22 0.59
23 0.58
24 0.58
25 0.59
26 0.59
27 0.57
28 0.54
29 0.45
30 0.4
31 0.35
32 0.28
33 0.22
34 0.15
35 0.1
36 0.11
37 0.1
38 0.1
39 0.11
40 0.1
41 0.1
42 0.1
43 0.1
44 0.08
45 0.09
46 0.11
47 0.1
48 0.09
49 0.09
50 0.09
51 0.09
52 0.09
53 0.08
54 0.07
55 0.07
56 0.07
57 0.08
58 0.08
59 0.09
60 0.08
61 0.08
62 0.08
63 0.08
64 0.08
65 0.07
66 0.07
67 0.06
68 0.05
69 0.06
70 0.07
71 0.08
72 0.09
73 0.08
74 0.09
75 0.1
76 0.12
77 0.11
78 0.1
79 0.09
80 0.1
81 0.1
82 0.09
83 0.09
84 0.08
85 0.07
86 0.08
87 0.08
88 0.08
89 0.08
90 0.1
91 0.11
92 0.1
93 0.1
94 0.1
95 0.1
96 0.08
97 0.08
98 0.06
99 0.05
100 0.05
101 0.05
102 0.08
103 0.08
104 0.1
105 0.12
106 0.13
107 0.13
108 0.15
109 0.18
110 0.17
111 0.19
112 0.18
113 0.16
114 0.15
115 0.16
116 0.15
117 0.14
118 0.18
119 0.21
120 0.25
121 0.26
122 0.27
123 0.27
124 0.28
125 0.38
126 0.35
127 0.34
128 0.32
129 0.31
130 0.34
131 0.42
132 0.4
133 0.29
134 0.27
135 0.21
136 0.21
137 0.2
138 0.17
139 0.09
140 0.08
141 0.09
142 0.09
143 0.09
144 0.07
145 0.06
146 0.06
147 0.06
148 0.06
149 0.06
150 0.05
151 0.05
152 0.05
153 0.05
154 0.06
155 0.05
156 0.05
157 0.05
158 0.07
159 0.07
160 0.08
161 0.08
162 0.1
163 0.13
164 0.12
165 0.12
166 0.16
167 0.17
168 0.18
169 0.19
170 0.19
171 0.16
172 0.17
173 0.17
174 0.17
175 0.18
176 0.17
177 0.17
178 0.18
179 0.2
180 0.21
181 0.23
182 0.2
183 0.18
184 0.18
185 0.19
186 0.19
187 0.18
188 0.17
189 0.16
190 0.17
191 0.16
192 0.16
193 0.15
194 0.12
195 0.11
196 0.11
197 0.1
198 0.09
199 0.09
200 0.09
201 0.1
202 0.1
203 0.12
204 0.12
205 0.16
206 0.17
207 0.23
208 0.32
209 0.37
210 0.46
211 0.53
212 0.56
213 0.62
214 0.67
215 0.71
216 0.67
217 0.7
218 0.69
219 0.69
220 0.75
221 0.75
222 0.75
223 0.73
224 0.75
225 0.74
226 0.74
227 0.72
228 0.74
229 0.73
230 0.68
231 0.66
232 0.6
233 0.56
234 0.55
235 0.5
236 0.44
237 0.37
238 0.33
239 0.28
240 0.28
241 0.26
242 0.25
243 0.25
244 0.3
245 0.37
246 0.38
247 0.43
248 0.49
249 0.53
250 0.56
251 0.62
252 0.64
253 0.66
254 0.75
255 0.77
256 0.81
257 0.8
258 0.7
259 0.6
260 0.5
261 0.41
262 0.32
263 0.28
264 0.19
265 0.2
266 0.22
267 0.26
268 0.35