Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

Q7S625

Protein Details
Accession Q7S625    Localization Confidence High Confidence Score 19.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
188-208YLGRVLRQKFQRRQRWAEKYHHydrophilic
308-346ERTLAEKEKKSRKKKEKVQRKRERRREARRLRRIAKMKEBasic
475-498EPTSASPAPKKRGRPKKVDFETLAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
313-368EKEKKSRKKKEKVQRKRERRREARRLRRIAKMKETLRQWRVRTQERKKKEGAERKK
483-491PKKRGRPKK
511-536KRRGRPQKAVTPTEEEAPKKRGRPRK
Subcellular Location(s) mito 17.5, cyto_mito 10, nucl 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017956  AT_hook_DNA-bd_motif  
IPR008011  Complex1_LYR_dom  
IPR046896  Cup1-like_N  
Gene Ontology GO:0003677  F:DNA binding  
KEGG ncr:NCU05635  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF02178  AT_hook  
PF05347  Complex1_LYR  
CDD cd20273  Complex1_LYR_unchar  
Amino Acid Sequences MPAFIKPGCDSRHRFACKALFRALLRTGYRVPLPHDVATALDEKQNPIRALIRNGFRRNSSETSLRLVNSALNKGYRFLELLTLARDESSPAHADVLRFLRENNERVLAIREKKRQEAEKFKKFAPNPDAIPLLTKIPSPNGKGPPTFVPTVRPLPLEKLSGGVRKLPTLDELGGHPFLRLRKPQSEYLGRVLRQKFQRRQRWAEKYHELVSEELADAEQEDAWDDMVEDMLQGEPQPWEEPGYYATDGAGRQRWTQSKQSARRARTSHGSYAHAVKLAMADIELKQKREWDEMIARGKALWKLVLEERTLAEKEKKSRKKKEKVQRKRERRREARRLRRIAKMKETLRQWRVRTQERKKKEGAERKKLQVEQDACQLEEAKSPELVTVEQEAGKVETEDNTPEEGRLRGSRALKATRQPKRTNVKTVADVKDTESPAVPVEPAKEPAATLEETSASLEEKESEADPVEVQLQEEPTSASPAPKKRGRPKKVDFETLATESSTEPDTTALKRRGRPQKAVTPTEEEAPKKRGRPRKAVAATEEEAAPRTSAQNAGALHAGGVARDTFPPTAIHPTGQNQIRILL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.6
2 0.61
3 0.66
4 0.64
5 0.63
6 0.6
7 0.56
8 0.51
9 0.55
10 0.52
11 0.5
12 0.43
13 0.43
14 0.4
15 0.37
16 0.39
17 0.36
18 0.37
19 0.38
20 0.41
21 0.37
22 0.35
23 0.32
24 0.29
25 0.29
26 0.26
27 0.19
28 0.19
29 0.19
30 0.21
31 0.26
32 0.32
33 0.3
34 0.31
35 0.36
36 0.36
37 0.43
38 0.47
39 0.51
40 0.54
41 0.59
42 0.61
43 0.58
44 0.57
45 0.56
46 0.54
47 0.51
48 0.47
49 0.42
50 0.43
51 0.43
52 0.39
53 0.33
54 0.28
55 0.27
56 0.25
57 0.27
58 0.25
59 0.25
60 0.25
61 0.27
62 0.28
63 0.25
64 0.22
65 0.18
66 0.19
67 0.18
68 0.19
69 0.19
70 0.18
71 0.17
72 0.16
73 0.16
74 0.13
75 0.12
76 0.14
77 0.14
78 0.14
79 0.17
80 0.18
81 0.18
82 0.22
83 0.24
84 0.23
85 0.22
86 0.22
87 0.27
88 0.31
89 0.33
90 0.31
91 0.3
92 0.28
93 0.28
94 0.34
95 0.33
96 0.37
97 0.43
98 0.48
99 0.5
100 0.56
101 0.62
102 0.65
103 0.68
104 0.71
105 0.73
106 0.75
107 0.74
108 0.71
109 0.73
110 0.66
111 0.66
112 0.6
113 0.56
114 0.48
115 0.47
116 0.45
117 0.36
118 0.36
119 0.28
120 0.24
121 0.19
122 0.18
123 0.15
124 0.2
125 0.25
126 0.27
127 0.33
128 0.38
129 0.42
130 0.41
131 0.43
132 0.42
133 0.42
134 0.39
135 0.32
136 0.3
137 0.31
138 0.35
139 0.33
140 0.3
141 0.27
142 0.3
143 0.32
144 0.29
145 0.24
146 0.22
147 0.24
148 0.27
149 0.26
150 0.26
151 0.24
152 0.23
153 0.24
154 0.22
155 0.2
156 0.19
157 0.18
158 0.14
159 0.14
160 0.17
161 0.17
162 0.16
163 0.15
164 0.14
165 0.17
166 0.22
167 0.26
168 0.29
169 0.34
170 0.39
171 0.44
172 0.49
173 0.53
174 0.51
175 0.53
176 0.54
177 0.47
178 0.51
179 0.47
180 0.47
181 0.49
182 0.56
183 0.57
184 0.62
185 0.7
186 0.72
187 0.79
188 0.83
189 0.84
190 0.8
191 0.79
192 0.75
193 0.69
194 0.64
195 0.56
196 0.47
197 0.37
198 0.31
199 0.24
200 0.18
201 0.13
202 0.09
203 0.07
204 0.06
205 0.06
206 0.05
207 0.04
208 0.04
209 0.04
210 0.04
211 0.04
212 0.04
213 0.04
214 0.04
215 0.04
216 0.03
217 0.03
218 0.03
219 0.03
220 0.03
221 0.04
222 0.04
223 0.05
224 0.06
225 0.06
226 0.08
227 0.08
228 0.09
229 0.09
230 0.12
231 0.11
232 0.11
233 0.11
234 0.11
235 0.11
236 0.12
237 0.15
238 0.13
239 0.14
240 0.19
241 0.24
242 0.26
243 0.33
244 0.39
245 0.45
246 0.52
247 0.61
248 0.65
249 0.64
250 0.67
251 0.63
252 0.59
253 0.57
254 0.53
255 0.48
256 0.42
257 0.41
258 0.35
259 0.36
260 0.33
261 0.25
262 0.21
263 0.15
264 0.12
265 0.1
266 0.08
267 0.05
268 0.05
269 0.05
270 0.14
271 0.15
272 0.16
273 0.16
274 0.19
275 0.21
276 0.22
277 0.22
278 0.19
279 0.21
280 0.25
281 0.29
282 0.26
283 0.24
284 0.22
285 0.23
286 0.2
287 0.17
288 0.12
289 0.09
290 0.11
291 0.14
292 0.16
293 0.14
294 0.14
295 0.14
296 0.16
297 0.16
298 0.16
299 0.18
300 0.2
301 0.27
302 0.37
303 0.47
304 0.54
305 0.65
306 0.74
307 0.79
308 0.86
309 0.89
310 0.9
311 0.92
312 0.93
313 0.93
314 0.94
315 0.94
316 0.95
317 0.95
318 0.94
319 0.94
320 0.94
321 0.94
322 0.94
323 0.93
324 0.92
325 0.86
326 0.84
327 0.82
328 0.77
329 0.75
330 0.72
331 0.65
332 0.61
333 0.63
334 0.63
335 0.61
336 0.62
337 0.56
338 0.53
339 0.58
340 0.61
341 0.66
342 0.68
343 0.7
344 0.7
345 0.74
346 0.71
347 0.72
348 0.73
349 0.73
350 0.72
351 0.73
352 0.73
353 0.74
354 0.77
355 0.7
356 0.62
357 0.6
358 0.53
359 0.44
360 0.44
361 0.38
362 0.31
363 0.3
364 0.28
365 0.2
366 0.2
367 0.2
368 0.14
369 0.13
370 0.13
371 0.13
372 0.13
373 0.13
374 0.1
375 0.1
376 0.1
377 0.1
378 0.1
379 0.1
380 0.1
381 0.1
382 0.09
383 0.08
384 0.08
385 0.09
386 0.1
387 0.11
388 0.12
389 0.12
390 0.12
391 0.14
392 0.13
393 0.14
394 0.15
395 0.17
396 0.2
397 0.23
398 0.27
399 0.31
400 0.36
401 0.38
402 0.45
403 0.52
404 0.55
405 0.61
406 0.62
407 0.66
408 0.71
409 0.73
410 0.75
411 0.72
412 0.67
413 0.66
414 0.69
415 0.64
416 0.55
417 0.49
418 0.42
419 0.41
420 0.38
421 0.31
422 0.23
423 0.2
424 0.18
425 0.17
426 0.15
427 0.1
428 0.12
429 0.14
430 0.16
431 0.16
432 0.15
433 0.15
434 0.16
435 0.18
436 0.15
437 0.13
438 0.12
439 0.11
440 0.11
441 0.12
442 0.11
443 0.09
444 0.08
445 0.08
446 0.08
447 0.08
448 0.1
449 0.09
450 0.1
451 0.1
452 0.11
453 0.11
454 0.1
455 0.12
456 0.11
457 0.11
458 0.12
459 0.12
460 0.12
461 0.12
462 0.13
463 0.11
464 0.15
465 0.15
466 0.18
467 0.24
468 0.31
469 0.39
470 0.44
471 0.54
472 0.61
473 0.72
474 0.76
475 0.8
476 0.82
477 0.85
478 0.86
479 0.84
480 0.77
481 0.7
482 0.67
483 0.58
484 0.49
485 0.38
486 0.31
487 0.22
488 0.21
489 0.18
490 0.12
491 0.1
492 0.11
493 0.14
494 0.17
495 0.26
496 0.32
497 0.37
498 0.43
499 0.53
500 0.63
501 0.68
502 0.74
503 0.74
504 0.76
505 0.79
506 0.79
507 0.73
508 0.69
509 0.62
510 0.59
511 0.56
512 0.5
513 0.46
514 0.47
515 0.49
516 0.49
517 0.57
518 0.61
519 0.64
520 0.71
521 0.73
522 0.77
523 0.8
524 0.79
525 0.75
526 0.72
527 0.65
528 0.56
529 0.49
530 0.38
531 0.32
532 0.26
533 0.21
534 0.14
535 0.14
536 0.14
537 0.15
538 0.16
539 0.19
540 0.18
541 0.2
542 0.2
543 0.18
544 0.16
545 0.16
546 0.15
547 0.1
548 0.11
549 0.1
550 0.1
551 0.11
552 0.14
553 0.13
554 0.14
555 0.16
556 0.18
557 0.25
558 0.26
559 0.27
560 0.28
561 0.32
562 0.4
563 0.43
564 0.43