Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

Q7SDH2

Protein Details
Accession Q7SDH2    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
23-52GWTNTNRRPERPPTKKRRTDQIRQKNDAEDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
32-39ERPPTKKR
Subcellular Location(s) nucl 9mito 9mito_nucl 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR033315  Fan1-like  
IPR011856  tRNA_endonuc-like_dom_sf  
IPR014883  VRR_NUC  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0008409  F:5'-3' exonuclease activity  
GO:0017108  F:5'-flap endonuclease activity  
GO:0070336  F:flap-structured DNA binding  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0004528  F:phosphodiesterase I activity  
GO:0036297  P:interstrand cross-link repair  
KEGG ncr:NCU03036  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08774  VRR_NUC  
CDD cd22326  FAN1-like  
Amino Acid Sequences MDRFVKRTRPSQTSNSPLTLTAGWTNTNRRPERPPTKKRRTDQIRQKNDAEDDEDDDSSAALNNDQKEDLFLADPNRNSPLRDGKTGSGDAEDADATETALAAQHHTALEDSLPEVKIDNDIIEEYEKLKSSQVEDGEVSAETRLQTRKWVRGQSSIYVDAFNLALDTVLQDEAHLFEEKENCVLENWRALSYEAQYLYVRLFLRKTASWHRLERLKHYSDISDIEKAIESLLEPRALPEGQSVKKSDEEFVAEPGHVFADTFAFADDSASHIKTVEQAAHLLSLDELKTLAKDAKVQGKNKPDLIKAFCRMCSQQSSLMSVGLRRSSTNASMHSLDSTSEEANTEGQDTNRKAHFLDKILAITGPLVRLSESVFKLFERVHLVFYRSTEWTEKSLTTIILAKISRRNFPEYVVCRSANIFPSRRYLLEFENSMRLQFEADTILEFSGPPGAEGNRKVVEMFESIAPRWRELLAEAQKMENTGYEFGEGGYLRRFNAGHAYTRIAHKAAEALGRLHRYQDEYDLLTELLSQQIFHLARRGAWYKRKALVEERYMWELQQPPTTTFSEAQKNLQKKRWRQIALATCETALQDPNCHLIYHYDLQKRLIRLEKQLNIPRRQQHNFDHARLRDPEEHTVDGIQLVREDAGRGQGSTKTIWLDELGDPDDKGNLMHVSVEEMCLSFYRTQGWKGYHSEGGILRTLFAYLFCDILFIFVPNVFQTAYQTCPLDLHTDAFYPARASEINHRLVDISNGGAVDLIRRVNEQHRERRTCIVGLNWDYEVEDLIQLVSCFESEALAAICKVIAQDYKARGGGVPDLILWRTTHELSDDRKEQSENGKGEVMFVEVKSANDRLSDTQRLWIHVLSAAGVRVVLCNAVAKEVKTID
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.72
2 0.66
3 0.58
4 0.51
5 0.47
6 0.38
7 0.31
8 0.26
9 0.23
10 0.23
11 0.26
12 0.34
13 0.37
14 0.47
15 0.48
16 0.49
17 0.56
18 0.63
19 0.7
20 0.74
21 0.78
22 0.79
23 0.87
24 0.92
25 0.91
26 0.91
27 0.9
28 0.9
29 0.9
30 0.9
31 0.89
32 0.86
33 0.82
34 0.78
35 0.71
36 0.64
37 0.57
38 0.48
39 0.41
40 0.37
41 0.33
42 0.27
43 0.23
44 0.19
45 0.14
46 0.14
47 0.1
48 0.1
49 0.14
50 0.15
51 0.18
52 0.18
53 0.18
54 0.19
55 0.19
56 0.19
57 0.16
58 0.17
59 0.19
60 0.24
61 0.25
62 0.26
63 0.3
64 0.29
65 0.29
66 0.33
67 0.39
68 0.38
69 0.43
70 0.45
71 0.43
72 0.48
73 0.48
74 0.42
75 0.33
76 0.28
77 0.22
78 0.2
79 0.16
80 0.1
81 0.1
82 0.09
83 0.08
84 0.07
85 0.07
86 0.05
87 0.08
88 0.07
89 0.08
90 0.08
91 0.1
92 0.1
93 0.11
94 0.11
95 0.1
96 0.1
97 0.09
98 0.1
99 0.12
100 0.12
101 0.12
102 0.12
103 0.12
104 0.13
105 0.13
106 0.12
107 0.1
108 0.1
109 0.11
110 0.12
111 0.12
112 0.12
113 0.14
114 0.15
115 0.14
116 0.16
117 0.17
118 0.19
119 0.24
120 0.23
121 0.24
122 0.23
123 0.23
124 0.22
125 0.2
126 0.17
127 0.12
128 0.12
129 0.09
130 0.13
131 0.15
132 0.14
133 0.24
134 0.3
135 0.39
136 0.46
137 0.54
138 0.53
139 0.6
140 0.63
141 0.6
142 0.59
143 0.53
144 0.46
145 0.38
146 0.34
147 0.26
148 0.22
149 0.15
150 0.1
151 0.06
152 0.05
153 0.04
154 0.05
155 0.05
156 0.05
157 0.05
158 0.05
159 0.06
160 0.07
161 0.09
162 0.1
163 0.09
164 0.12
165 0.15
166 0.16
167 0.18
168 0.17
169 0.15
170 0.15
171 0.18
172 0.17
173 0.19
174 0.2
175 0.19
176 0.19
177 0.2
178 0.21
179 0.2
180 0.23
181 0.18
182 0.19
183 0.18
184 0.18
185 0.17
186 0.19
187 0.18
188 0.15
189 0.16
190 0.16
191 0.2
192 0.22
193 0.27
194 0.33
195 0.4
196 0.44
197 0.47
198 0.52
199 0.54
200 0.55
201 0.57
202 0.56
203 0.52
204 0.48
205 0.46
206 0.41
207 0.36
208 0.37
209 0.31
210 0.25
211 0.22
212 0.2
213 0.18
214 0.17
215 0.14
216 0.11
217 0.08
218 0.09
219 0.1
220 0.1
221 0.1
222 0.11
223 0.14
224 0.13
225 0.13
226 0.15
227 0.21
228 0.22
229 0.26
230 0.27
231 0.27
232 0.3
233 0.31
234 0.28
235 0.23
236 0.24
237 0.22
238 0.23
239 0.21
240 0.18
241 0.16
242 0.15
243 0.13
244 0.09
245 0.08
246 0.06
247 0.06
248 0.06
249 0.06
250 0.06
251 0.06
252 0.06
253 0.06
254 0.06
255 0.07
256 0.09
257 0.1
258 0.1
259 0.1
260 0.1
261 0.12
262 0.13
263 0.13
264 0.11
265 0.11
266 0.12
267 0.12
268 0.12
269 0.1
270 0.08
271 0.08
272 0.07
273 0.06
274 0.06
275 0.06
276 0.06
277 0.07
278 0.09
279 0.08
280 0.12
281 0.16
282 0.26
283 0.32
284 0.36
285 0.41
286 0.48
287 0.51
288 0.52
289 0.52
290 0.45
291 0.45
292 0.47
293 0.47
294 0.43
295 0.42
296 0.39
297 0.39
298 0.37
299 0.35
300 0.34
301 0.3
302 0.3
303 0.28
304 0.3
305 0.27
306 0.26
307 0.23
308 0.2
309 0.19
310 0.16
311 0.15
312 0.12
313 0.14
314 0.15
315 0.19
316 0.2
317 0.2
318 0.21
319 0.22
320 0.22
321 0.2
322 0.18
323 0.15
324 0.13
325 0.13
326 0.1
327 0.09
328 0.09
329 0.08
330 0.09
331 0.09
332 0.09
333 0.08
334 0.09
335 0.15
336 0.16
337 0.2
338 0.2
339 0.2
340 0.19
341 0.23
342 0.26
343 0.23
344 0.24
345 0.21
346 0.2
347 0.2
348 0.2
349 0.15
350 0.12
351 0.1
352 0.07
353 0.06
354 0.06
355 0.05
356 0.06
357 0.07
358 0.12
359 0.12
360 0.13
361 0.13
362 0.13
363 0.15
364 0.15
365 0.15
366 0.16
367 0.16
368 0.18
369 0.18
370 0.21
371 0.2
372 0.21
373 0.21
374 0.16
375 0.17
376 0.17
377 0.17
378 0.17
379 0.18
380 0.17
381 0.15
382 0.15
383 0.13
384 0.12
385 0.14
386 0.12
387 0.14
388 0.14
389 0.15
390 0.2
391 0.22
392 0.25
393 0.25
394 0.3
395 0.26
396 0.28
397 0.35
398 0.32
399 0.37
400 0.36
401 0.33
402 0.29
403 0.3
404 0.3
405 0.26
406 0.27
407 0.23
408 0.21
409 0.25
410 0.26
411 0.25
412 0.25
413 0.22
414 0.2
415 0.2
416 0.2
417 0.17
418 0.21
419 0.2
420 0.18
421 0.16
422 0.14
423 0.12
424 0.1
425 0.1
426 0.06
427 0.06
428 0.06
429 0.06
430 0.06
431 0.05
432 0.05
433 0.05
434 0.06
435 0.06
436 0.05
437 0.06
438 0.07
439 0.09
440 0.11
441 0.14
442 0.12
443 0.13
444 0.13
445 0.12
446 0.12
447 0.11
448 0.11
449 0.1
450 0.1
451 0.1
452 0.16
453 0.17
454 0.15
455 0.16
456 0.15
457 0.13
458 0.13
459 0.21
460 0.2
461 0.22
462 0.22
463 0.22
464 0.22
465 0.22
466 0.21
467 0.13
468 0.09
469 0.08
470 0.08
471 0.08
472 0.08
473 0.07
474 0.09
475 0.08
476 0.08
477 0.08
478 0.09
479 0.08
480 0.1
481 0.1
482 0.09
483 0.16
484 0.17
485 0.18
486 0.19
487 0.22
488 0.22
489 0.23
490 0.24
491 0.18
492 0.16
493 0.13
494 0.13
495 0.12
496 0.12
497 0.11
498 0.12
499 0.14
500 0.16
501 0.16
502 0.16
503 0.16
504 0.16
505 0.16
506 0.17
507 0.16
508 0.15
509 0.16
510 0.15
511 0.14
512 0.11
513 0.11
514 0.08
515 0.07
516 0.06
517 0.06
518 0.05
519 0.11
520 0.11
521 0.11
522 0.15
523 0.14
524 0.15
525 0.2
526 0.24
527 0.25
528 0.33
529 0.38
530 0.39
531 0.45
532 0.47
533 0.45
534 0.48
535 0.49
536 0.47
537 0.46
538 0.43
539 0.4
540 0.38
541 0.35
542 0.31
543 0.28
544 0.24
545 0.24
546 0.23
547 0.22
548 0.25
549 0.26
550 0.25
551 0.23
552 0.25
553 0.28
554 0.28
555 0.32
556 0.35
557 0.42
558 0.45
559 0.51
560 0.56
561 0.56
562 0.65
563 0.69
564 0.66
565 0.61
566 0.65
567 0.66
568 0.64
569 0.58
570 0.48
571 0.39
572 0.35
573 0.33
574 0.24
575 0.18
576 0.11
577 0.1
578 0.1
579 0.14
580 0.14
581 0.14
582 0.13
583 0.13
584 0.17
585 0.21
586 0.28
587 0.29
588 0.29
589 0.33
590 0.37
591 0.37
592 0.37
593 0.39
594 0.35
595 0.39
596 0.46
597 0.47
598 0.52
599 0.59
600 0.62
601 0.6
602 0.64
603 0.65
604 0.65
605 0.64
606 0.61
607 0.6
608 0.62
609 0.62
610 0.6
611 0.6
612 0.53
613 0.54
614 0.5
615 0.49
616 0.45
617 0.43
618 0.44
619 0.39
620 0.39
621 0.34
622 0.32
623 0.26
624 0.21
625 0.18
626 0.12
627 0.08
628 0.08
629 0.08
630 0.07
631 0.08
632 0.07
633 0.11
634 0.11
635 0.11
636 0.13
637 0.14
638 0.16
639 0.16
640 0.17
641 0.14
642 0.14
643 0.14
644 0.13
645 0.14
646 0.13
647 0.15
648 0.15
649 0.15
650 0.15
651 0.14
652 0.14
653 0.11
654 0.1
655 0.09
656 0.08
657 0.07
658 0.08
659 0.08
660 0.1
661 0.11
662 0.11
663 0.09
664 0.09
665 0.09
666 0.09
667 0.12
668 0.1
669 0.1
670 0.15
671 0.16
672 0.19
673 0.25
674 0.27
675 0.3
676 0.33
677 0.37
678 0.34
679 0.32
680 0.33
681 0.29
682 0.28
683 0.26
684 0.21
685 0.18
686 0.16
687 0.16
688 0.12
689 0.1
690 0.1
691 0.08
692 0.09
693 0.08
694 0.08
695 0.08
696 0.09
697 0.09
698 0.07
699 0.08
700 0.08
701 0.09
702 0.08
703 0.1
704 0.08
705 0.08
706 0.11
707 0.13
708 0.15
709 0.17
710 0.17
711 0.16
712 0.17
713 0.18
714 0.18
715 0.16
716 0.16
717 0.15
718 0.15
719 0.16
720 0.16
721 0.15
722 0.13
723 0.12
724 0.12
725 0.11
726 0.13
727 0.21
728 0.28
729 0.33
730 0.32
731 0.32
732 0.31
733 0.31
734 0.31
735 0.22
736 0.16
737 0.11
738 0.11
739 0.1
740 0.1
741 0.09
742 0.09
743 0.1
744 0.1
745 0.1
746 0.11
747 0.14
748 0.22
749 0.32
750 0.4
751 0.48
752 0.57
753 0.64
754 0.66
755 0.7
756 0.66
757 0.59
758 0.53
759 0.48
760 0.46
761 0.42
762 0.41
763 0.34
764 0.31
765 0.28
766 0.25
767 0.21
768 0.13
769 0.1
770 0.07
771 0.07
772 0.08
773 0.07
774 0.08
775 0.07
776 0.06
777 0.06
778 0.06
779 0.06
780 0.05
781 0.07
782 0.07
783 0.08
784 0.08
785 0.07
786 0.07
787 0.07
788 0.07
789 0.09
790 0.1
791 0.13
792 0.2
793 0.23
794 0.28
795 0.29
796 0.29
797 0.27
798 0.27
799 0.28
800 0.22
801 0.19
802 0.16
803 0.18
804 0.18
805 0.18
806 0.16
807 0.15
808 0.18
809 0.18
810 0.18
811 0.19
812 0.24
813 0.29
814 0.38
815 0.4
816 0.39
817 0.41
818 0.41
819 0.42
820 0.45
821 0.48
822 0.41
823 0.39
824 0.4
825 0.37
826 0.37
827 0.34
828 0.28
829 0.21
830 0.19
831 0.2
832 0.17
833 0.18
834 0.2
835 0.21
836 0.19
837 0.19
838 0.22
839 0.23
840 0.29
841 0.34
842 0.32
843 0.38
844 0.4
845 0.42
846 0.42
847 0.36
848 0.31
849 0.27
850 0.26
851 0.19
852 0.18
853 0.15
854 0.13
855 0.12
856 0.11
857 0.1
858 0.1
859 0.09
860 0.08
861 0.11
862 0.12
863 0.17
864 0.19
865 0.19