Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D1DYC3

Protein Details
Accession A0A0D1DYC3    Localization Confidence High Confidence Score 23
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
90-117ASQFVPPLKLNRKNPPRLKLPRPNPGDPHydrophilic
169-191GGNARPPKARLFKKKVREIHKAABasic
715-734LVQHFRKRLKSEPHIKDQLSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
171-190NARPPKARLFKKKVREIHKA
566-575EKKEKEAAKN
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR008851  TFIIF-alpha  
IPR011039  TFIIF_interaction  
Gene Ontology GO:0005674  C:transcription factor TFIIF complex  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0016251  F:RNA polymerase II general transcription initiation factor activity  
GO:0001096  F:TFIIF-class transcription factor complex binding  
GO:0032968  P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II  
GO:0006367  P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter  
KEGG uma:UMAG_15003  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF05793  TFIIF_alpha  
Amino Acid Sequences MPPVKAEPGSANVKAENGRAGGARARAANGASTNNNSARSNLKLEQDKKELPPPPPTTYRDIPLLSTDCGQWLTHLMKFAHHTRVDPNDASQFVPPLKLNRKNPPRLKLPRPNPGDPITDKYNRPMMGKDGQPLTWPGADDDLQRIEEVIKKDAAPKGPGADQSLIAPGGNARPPKARLFKKKVREIHKAADSARKTMKEEHFPWVLEDFETPDEWESIRTPIPTGTRALQDHIDELKAKKMGASASMDANGDVNMQDTTSSKAKGEHAIKQESSVSASSSSSTSHAPWIGKLEGDSSSEASSLHVLFVFDERDAGGFKVVPVSRMYKFLQKPKHSTMTNEQVEQEYQKYQKTKEMDRWAMRNKPVSATPAISKQEDNAAWRSWPQVSRLSLPTGMAFGAGRRRNLMAVHGGELLRDDDDDDASGARRRKREDSPGAGYDELDFEEEFADDEETHDPEADVADDEEAKELEERLKREMARANHVGDDEDEAQEVSAPEDEDQLLTGSGKQMMKIMRALAKREGNEAYDKDDDGRNPYATEESDEEEEESYVANPEKAIQLAREEREKKEKEAAKNNKPSATPGRASGSNTPTDRAEKRPVPPSAIGQAQRPGAGHASLAQRATSPTRSAPRWMCASMAAMAAGSAGSSSLPEAKRVKTASTGSGSRAGSPSGSPPGSKPASRAGSPGAPRLAANAVEAEIIQLIRDGKIANTSELVQHFRKRLKSEPHIKDQLSAAVRKVAVMDKATNRLKLKDGF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.31
2 0.29
3 0.26
4 0.21
5 0.21
6 0.19
7 0.21
8 0.22
9 0.23
10 0.24
11 0.22
12 0.23
13 0.23
14 0.23
15 0.24
16 0.22
17 0.24
18 0.24
19 0.26
20 0.3
21 0.31
22 0.34
23 0.31
24 0.31
25 0.31
26 0.33
27 0.36
28 0.35
29 0.4
30 0.46
31 0.51
32 0.57
33 0.61
34 0.62
35 0.6
36 0.64
37 0.62
38 0.57
39 0.62
40 0.6
41 0.59
42 0.61
43 0.6
44 0.59
45 0.57
46 0.56
47 0.52
48 0.47
49 0.41
50 0.39
51 0.38
52 0.32
53 0.29
54 0.25
55 0.21
56 0.21
57 0.2
58 0.15
59 0.17
60 0.18
61 0.19
62 0.24
63 0.23
64 0.25
65 0.31
66 0.35
67 0.39
68 0.37
69 0.37
70 0.38
71 0.45
72 0.47
73 0.43
74 0.41
75 0.38
76 0.37
77 0.37
78 0.31
79 0.28
80 0.22
81 0.25
82 0.24
83 0.27
84 0.36
85 0.44
86 0.51
87 0.58
88 0.68
89 0.75
90 0.82
91 0.81
92 0.82
93 0.83
94 0.86
95 0.86
96 0.85
97 0.84
98 0.83
99 0.79
100 0.74
101 0.68
102 0.64
103 0.57
104 0.54
105 0.51
106 0.49
107 0.46
108 0.44
109 0.47
110 0.42
111 0.41
112 0.37
113 0.35
114 0.36
115 0.38
116 0.39
117 0.35
118 0.33
119 0.33
120 0.32
121 0.29
122 0.24
123 0.22
124 0.17
125 0.17
126 0.18
127 0.18
128 0.19
129 0.18
130 0.17
131 0.16
132 0.16
133 0.14
134 0.18
135 0.19
136 0.19
137 0.18
138 0.19
139 0.24
140 0.28
141 0.31
142 0.28
143 0.27
144 0.28
145 0.29
146 0.31
147 0.3
148 0.26
149 0.23
150 0.21
151 0.21
152 0.18
153 0.15
154 0.12
155 0.09
156 0.11
157 0.15
158 0.15
159 0.16
160 0.21
161 0.24
162 0.33
163 0.42
164 0.48
165 0.55
166 0.64
167 0.71
168 0.76
169 0.83
170 0.83
171 0.82
172 0.82
173 0.78
174 0.77
175 0.74
176 0.67
177 0.6
178 0.61
179 0.53
180 0.49
181 0.47
182 0.41
183 0.37
184 0.42
185 0.46
186 0.46
187 0.47
188 0.47
189 0.46
190 0.44
191 0.43
192 0.35
193 0.29
194 0.21
195 0.18
196 0.15
197 0.12
198 0.12
199 0.11
200 0.11
201 0.11
202 0.1
203 0.11
204 0.1
205 0.11
206 0.13
207 0.13
208 0.13
209 0.15
210 0.17
211 0.18
212 0.19
213 0.19
214 0.22
215 0.23
216 0.24
217 0.23
218 0.21
219 0.22
220 0.21
221 0.2
222 0.17
223 0.18
224 0.2
225 0.19
226 0.18
227 0.16
228 0.17
229 0.16
230 0.17
231 0.19
232 0.16
233 0.16
234 0.18
235 0.17
236 0.15
237 0.14
238 0.11
239 0.08
240 0.07
241 0.06
242 0.05
243 0.05
244 0.05
245 0.06
246 0.1
247 0.12
248 0.13
249 0.12
250 0.15
251 0.17
252 0.25
253 0.28
254 0.31
255 0.35
256 0.39
257 0.38
258 0.37
259 0.36
260 0.29
261 0.27
262 0.2
263 0.15
264 0.11
265 0.11
266 0.11
267 0.1
268 0.1
269 0.09
270 0.1
271 0.1
272 0.11
273 0.14
274 0.13
275 0.14
276 0.17
277 0.16
278 0.15
279 0.14
280 0.14
281 0.12
282 0.13
283 0.13
284 0.1
285 0.1
286 0.1
287 0.1
288 0.09
289 0.09
290 0.07
291 0.07
292 0.06
293 0.06
294 0.06
295 0.07
296 0.08
297 0.06
298 0.06
299 0.06
300 0.06
301 0.07
302 0.07
303 0.06
304 0.05
305 0.05
306 0.11
307 0.11
308 0.12
309 0.13
310 0.16
311 0.17
312 0.21
313 0.22
314 0.25
315 0.3
316 0.37
317 0.44
318 0.46
319 0.52
320 0.54
321 0.6
322 0.53
323 0.53
324 0.52
325 0.52
326 0.48
327 0.43
328 0.37
329 0.31
330 0.31
331 0.27
332 0.21
333 0.14
334 0.14
335 0.17
336 0.19
337 0.19
338 0.24
339 0.27
340 0.31
341 0.36
342 0.43
343 0.47
344 0.48
345 0.53
346 0.54
347 0.55
348 0.53
349 0.5
350 0.42
351 0.36
352 0.35
353 0.31
354 0.26
355 0.23
356 0.21
357 0.21
358 0.22
359 0.21
360 0.2
361 0.17
362 0.2
363 0.19
364 0.2
365 0.17
366 0.15
367 0.15
368 0.15
369 0.17
370 0.15
371 0.15
372 0.16
373 0.19
374 0.2
375 0.23
376 0.24
377 0.24
378 0.22
379 0.21
380 0.19
381 0.13
382 0.11
383 0.09
384 0.07
385 0.06
386 0.13
387 0.15
388 0.15
389 0.16
390 0.16
391 0.17
392 0.17
393 0.18
394 0.15
395 0.14
396 0.15
397 0.15
398 0.15
399 0.14
400 0.14
401 0.12
402 0.08
403 0.07
404 0.06
405 0.05
406 0.05
407 0.05
408 0.05
409 0.05
410 0.06
411 0.1
412 0.14
413 0.18
414 0.21
415 0.25
416 0.31
417 0.37
418 0.46
419 0.5
420 0.53
421 0.54
422 0.53
423 0.51
424 0.45
425 0.39
426 0.3
427 0.22
428 0.15
429 0.1
430 0.07
431 0.05
432 0.06
433 0.05
434 0.05
435 0.05
436 0.06
437 0.05
438 0.06
439 0.07
440 0.08
441 0.08
442 0.08
443 0.07
444 0.07
445 0.07
446 0.06
447 0.05
448 0.05
449 0.05
450 0.05
451 0.05
452 0.06
453 0.05
454 0.05
455 0.05
456 0.06
457 0.11
458 0.14
459 0.15
460 0.18
461 0.22
462 0.22
463 0.26
464 0.32
465 0.3
466 0.34
467 0.36
468 0.35
469 0.32
470 0.32
471 0.28
472 0.22
473 0.22
474 0.16
475 0.13
476 0.12
477 0.1
478 0.09
479 0.1
480 0.09
481 0.06
482 0.06
483 0.06
484 0.06
485 0.07
486 0.08
487 0.07
488 0.07
489 0.07
490 0.06
491 0.06
492 0.06
493 0.06
494 0.11
495 0.11
496 0.11
497 0.14
498 0.15
499 0.17
500 0.18
501 0.2
502 0.22
503 0.24
504 0.27
505 0.3
506 0.33
507 0.32
508 0.35
509 0.33
510 0.29
511 0.31
512 0.29
513 0.26
514 0.23
515 0.23
516 0.21
517 0.22
518 0.21
519 0.22
520 0.24
521 0.2
522 0.19
523 0.2
524 0.19
525 0.17
526 0.19
527 0.16
528 0.15
529 0.15
530 0.15
531 0.15
532 0.14
533 0.13
534 0.11
535 0.09
536 0.07
537 0.08
538 0.08
539 0.08
540 0.07
541 0.09
542 0.1
543 0.1
544 0.11
545 0.1
546 0.16
547 0.21
548 0.24
549 0.32
550 0.34
551 0.38
552 0.47
553 0.49
554 0.46
555 0.5
556 0.55
557 0.55
558 0.63
559 0.68
560 0.69
561 0.76
562 0.76
563 0.71
564 0.65
565 0.62
566 0.59
567 0.56
568 0.46
569 0.4
570 0.41
571 0.38
572 0.41
573 0.42
574 0.37
575 0.36
576 0.36
577 0.35
578 0.32
579 0.36
580 0.36
581 0.35
582 0.4
583 0.4
584 0.45
585 0.51
586 0.52
587 0.51
588 0.5
589 0.48
590 0.44
591 0.44
592 0.4
593 0.35
594 0.36
595 0.32
596 0.31
597 0.27
598 0.24
599 0.19
600 0.18
601 0.15
602 0.16
603 0.19
604 0.2
605 0.2
606 0.18
607 0.17
608 0.2
609 0.24
610 0.22
611 0.21
612 0.25
613 0.32
614 0.34
615 0.41
616 0.42
617 0.43
618 0.45
619 0.43
620 0.38
621 0.32
622 0.32
623 0.25
624 0.21
625 0.16
626 0.11
627 0.1
628 0.09
629 0.07
630 0.05
631 0.03
632 0.03
633 0.03
634 0.03
635 0.04
636 0.11
637 0.12
638 0.18
639 0.22
640 0.24
641 0.31
642 0.32
643 0.34
644 0.34
645 0.36
646 0.36
647 0.39
648 0.39
649 0.35
650 0.4
651 0.38
652 0.34
653 0.32
654 0.27
655 0.22
656 0.21
657 0.22
658 0.23
659 0.23
660 0.22
661 0.22
662 0.3
663 0.33
664 0.33
665 0.32
666 0.34
667 0.39
668 0.39
669 0.4
670 0.36
671 0.39
672 0.41
673 0.44
674 0.37
675 0.32
676 0.31
677 0.31
678 0.29
679 0.22
680 0.2
681 0.15
682 0.14
683 0.13
684 0.13
685 0.11
686 0.09
687 0.08
688 0.07
689 0.08
690 0.09
691 0.09
692 0.1
693 0.1
694 0.1
695 0.17
696 0.19
697 0.19
698 0.19
699 0.2
700 0.24
701 0.27
702 0.32
703 0.3
704 0.35
705 0.4
706 0.46
707 0.52
708 0.53
709 0.59
710 0.64
711 0.7
712 0.74
713 0.76
714 0.8
715 0.81
716 0.76
717 0.7
718 0.62
719 0.59
720 0.53
721 0.46
722 0.38
723 0.35
724 0.34
725 0.31
726 0.31
727 0.27
728 0.26
729 0.27
730 0.33
731 0.32
732 0.42
733 0.46
734 0.51
735 0.5
736 0.49