Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

V5IQP5

Protein Details
Accession V5IQP5    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
52-74VLGVKLGHRRKLQRRIANYRGLAHydrophilic
108-133EPGTVIVTKRKYRRHPKADENAPERPHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 13.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
IPR001660  SAM  
IPR013761  SAM/pointed_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0010468  P:regulation of gene expression  
KEGG ncr:NCU02819  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PF00536  SAM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
Amino Acid Sequences MQHKSHQLDSMAQQLTVIFGELGISQYLDAFVEQGFDTWETILDITESDLDVLGVKLGHRRKLQRRIANYRGLAPEASLAPLAQPSIEDFRPTEVVPRAEPPKMELREPGTVIVTKRKYRRHPKADENAPERPPSAYVLFSNKMREDLKGRNLSFTEIAKLVGENWQNLTPAEKEPYESKAQAYKEKYHAELAEYKKTPQYQKYMQYLADFKAKHSLPSQDNDSSKRVKLSESGGPSSAAATPTRTCRSHSGGSDSIHGSEPPPSREQRISSIVSTTDSHQSAALSPGSYQDDCMQSPRTIHADRRSSEQRSPTAFNTNARNYPLPSRTETTRPDEHRQEQPSSTPQSQQNLPSFSDVFDSHRFLPSGSQQTNDTSSYFPRGSLTNSPGPPPGLVGGDRRYPPTLKKEQSSAGSISSASTASSFGYPRTPTDGPLPIQALLSSSSAHSYEAGQPHHSYPTGPLPVHQKQPQHQQQPQQQTSMSAGQPPVLANLAMTNGYHRALSLAHVPPAVAKTATPTSHSISAVYGIPPRPPPQQMGSGLAQQQQQQYQQQYDRKPEGGNPNLDGMSALLKAGEIVDRRTH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.24
3 0.19
4 0.17
5 0.07
6 0.06
7 0.07
8 0.07
9 0.09
10 0.08
11 0.08
12 0.07
13 0.07
14 0.08
15 0.07
16 0.07
17 0.06
18 0.06
19 0.08
20 0.08
21 0.08
22 0.09
23 0.1
24 0.11
25 0.1
26 0.11
27 0.1
28 0.1
29 0.1
30 0.08
31 0.07
32 0.08
33 0.09
34 0.08
35 0.07
36 0.07
37 0.07
38 0.07
39 0.07
40 0.07
41 0.07
42 0.08
43 0.15
44 0.2
45 0.27
46 0.35
47 0.45
48 0.55
49 0.65
50 0.74
51 0.77
52 0.82
53 0.85
54 0.85
55 0.84
56 0.76
57 0.71
58 0.64
59 0.56
60 0.46
61 0.36
62 0.31
63 0.22
64 0.21
65 0.15
66 0.11
67 0.1
68 0.1
69 0.1
70 0.07
71 0.07
72 0.09
73 0.14
74 0.15
75 0.16
76 0.16
77 0.19
78 0.21
79 0.21
80 0.25
81 0.24
82 0.26
83 0.26
84 0.32
85 0.33
86 0.33
87 0.33
88 0.31
89 0.36
90 0.36
91 0.36
92 0.35
93 0.35
94 0.37
95 0.38
96 0.35
97 0.28
98 0.28
99 0.29
100 0.33
101 0.35
102 0.38
103 0.45
104 0.53
105 0.61
106 0.7
107 0.79
108 0.8
109 0.83
110 0.87
111 0.89
112 0.9
113 0.89
114 0.83
115 0.79
116 0.71
117 0.63
118 0.53
119 0.43
120 0.34
121 0.28
122 0.24
123 0.18
124 0.18
125 0.23
126 0.25
127 0.26
128 0.29
129 0.27
130 0.29
131 0.28
132 0.29
133 0.28
134 0.33
135 0.4
136 0.45
137 0.44
138 0.44
139 0.44
140 0.44
141 0.4
142 0.34
143 0.27
144 0.19
145 0.19
146 0.15
147 0.15
148 0.12
149 0.15
150 0.16
151 0.14
152 0.16
153 0.17
154 0.17
155 0.17
156 0.19
157 0.15
158 0.16
159 0.18
160 0.16
161 0.17
162 0.18
163 0.23
164 0.25
165 0.24
166 0.23
167 0.26
168 0.29
169 0.34
170 0.37
171 0.38
172 0.4
173 0.43
174 0.42
175 0.4
176 0.38
177 0.33
178 0.36
179 0.35
180 0.37
181 0.35
182 0.35
183 0.35
184 0.39
185 0.41
186 0.39
187 0.42
188 0.41
189 0.48
190 0.52
191 0.51
192 0.47
193 0.45
194 0.42
195 0.37
196 0.36
197 0.28
198 0.23
199 0.28
200 0.27
201 0.26
202 0.26
203 0.31
204 0.27
205 0.31
206 0.35
207 0.33
208 0.36
209 0.37
210 0.38
211 0.34
212 0.33
213 0.32
214 0.27
215 0.23
216 0.23
217 0.24
218 0.26
219 0.26
220 0.27
221 0.25
222 0.24
223 0.23
224 0.21
225 0.18
226 0.13
227 0.1
228 0.1
229 0.11
230 0.16
231 0.2
232 0.2
233 0.22
234 0.25
235 0.31
236 0.33
237 0.33
238 0.35
239 0.35
240 0.35
241 0.35
242 0.31
243 0.26
244 0.22
245 0.2
246 0.14
247 0.17
248 0.18
249 0.18
250 0.21
251 0.21
252 0.24
253 0.27
254 0.28
255 0.27
256 0.29
257 0.29
258 0.25
259 0.25
260 0.22
261 0.21
262 0.2
263 0.17
264 0.16
265 0.14
266 0.14
267 0.13
268 0.13
269 0.12
270 0.13
271 0.11
272 0.08
273 0.07
274 0.09
275 0.11
276 0.1
277 0.11
278 0.11
279 0.12
280 0.12
281 0.15
282 0.15
283 0.13
284 0.14
285 0.15
286 0.18
287 0.18
288 0.22
289 0.28
290 0.32
291 0.32
292 0.38
293 0.42
294 0.41
295 0.43
296 0.43
297 0.4
298 0.38
299 0.4
300 0.35
301 0.36
302 0.33
303 0.33
304 0.35
305 0.33
306 0.32
307 0.32
308 0.31
309 0.26
310 0.3
311 0.3
312 0.26
313 0.27
314 0.27
315 0.27
316 0.32
317 0.34
318 0.35
319 0.39
320 0.42
321 0.45
322 0.49
323 0.5
324 0.53
325 0.53
326 0.5
327 0.43
328 0.41
329 0.4
330 0.39
331 0.36
332 0.33
333 0.32
334 0.33
335 0.35
336 0.37
337 0.36
338 0.33
339 0.32
340 0.29
341 0.26
342 0.23
343 0.22
344 0.18
345 0.17
346 0.17
347 0.19
348 0.18
349 0.2
350 0.2
351 0.18
352 0.2
353 0.21
354 0.27
355 0.25
356 0.25
357 0.24
358 0.26
359 0.28
360 0.27
361 0.22
362 0.15
363 0.16
364 0.19
365 0.18
366 0.16
367 0.15
368 0.15
369 0.18
370 0.22
371 0.26
372 0.28
373 0.28
374 0.3
375 0.3
376 0.3
377 0.26
378 0.21
379 0.17
380 0.12
381 0.12
382 0.14
383 0.16
384 0.2
385 0.21
386 0.22
387 0.24
388 0.25
389 0.29
390 0.34
391 0.41
392 0.41
393 0.43
394 0.44
395 0.46
396 0.47
397 0.45
398 0.38
399 0.29
400 0.25
401 0.22
402 0.18
403 0.14
404 0.11
405 0.08
406 0.07
407 0.07
408 0.07
409 0.09
410 0.09
411 0.09
412 0.14
413 0.14
414 0.15
415 0.22
416 0.21
417 0.21
418 0.26
419 0.3
420 0.27
421 0.3
422 0.3
423 0.24
424 0.23
425 0.21
426 0.17
427 0.14
428 0.13
429 0.1
430 0.09
431 0.1
432 0.1
433 0.11
434 0.1
435 0.11
436 0.15
437 0.2
438 0.21
439 0.23
440 0.24
441 0.26
442 0.28
443 0.26
444 0.21
445 0.2
446 0.26
447 0.29
448 0.27
449 0.28
450 0.34
451 0.39
452 0.46
453 0.48
454 0.47
455 0.48
456 0.59
457 0.66
458 0.67
459 0.68
460 0.7
461 0.74
462 0.78
463 0.74
464 0.65
465 0.56
466 0.48
467 0.46
468 0.42
469 0.33
470 0.26
471 0.24
472 0.22
473 0.22
474 0.21
475 0.18
476 0.14
477 0.13
478 0.09
479 0.1
480 0.1
481 0.09
482 0.09
483 0.09
484 0.1
485 0.11
486 0.11
487 0.1
488 0.1
489 0.1
490 0.12
491 0.18
492 0.18
493 0.2
494 0.2
495 0.2
496 0.21
497 0.22
498 0.22
499 0.15
500 0.12
501 0.16
502 0.21
503 0.23
504 0.24
505 0.26
506 0.28
507 0.32
508 0.32
509 0.28
510 0.23
511 0.24
512 0.22
513 0.21
514 0.22
515 0.19
516 0.23
517 0.26
518 0.3
519 0.34
520 0.35
521 0.38
522 0.38
523 0.44
524 0.43
525 0.44
526 0.43
527 0.42
528 0.42
529 0.42
530 0.39
531 0.36
532 0.37
533 0.36
534 0.38
535 0.4
536 0.42
537 0.46
538 0.52
539 0.56
540 0.58
541 0.63
542 0.64
543 0.6
544 0.57
545 0.57
546 0.59
547 0.59
548 0.57
549 0.5
550 0.48
551 0.45
552 0.42
553 0.34
554 0.25
555 0.19
556 0.15
557 0.12
558 0.08
559 0.08
560 0.08
561 0.09
562 0.13
563 0.12