Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

Q7SHW4

Protein Details
Accession Q7SHW4    Localization Confidence High Confidence Score 20.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
14-55AADSKKRKEAPLNQNQQGKESRPPARPQKRVKFQDARNIRSQHydrophilic
102-158PREMRRRTASHNAKRVPKRLRDRAKREMMEDNTPTVEARKRRPRTTRARIRAENAKRBasic
189-226QTRAPRPKIRRDTLNEPPKPKSKFKKRQINKTWLPTHLHydrophilic
613-637EMEQRAQRKKAWDRRPRGKRIEWASHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
18-21KKRK
34-42SRPPARPQK
106-128RRRTASHNAKRVPKRLRDRAKRE
139-171ARKRRPRTTRARIRAENAKRLEKLAARKRKRAL
190-216TRAPRPKIRRDTLNEPPKPKSKFKKRQ
619-632QRKKAWDRRPRGKR
Subcellular Location(s) nucl 11.5, cyto_nucl 10.5, cyto 8.5, pero 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039182  Pop1  
IPR009723  Pop1_N  
IPR012590  POPLD_dom  
Gene Ontology GO:0005655  C:nucleolar ribonuclease P complex  
GO:0000172  C:ribonuclease MRP complex  
GO:0090502  P:RNA phosphodiester bond hydrolysis, endonucleolytic  
GO:0001682  P:tRNA 5'-leader removal  
GO:0008033  P:tRNA processing  
KEGG ncr:NCU00690  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF06978  POP1  
PF08170  POPLD  
Amino Acid Sequences MDNHNKQSASGKAAADSKKRKEAPLNQNQQGKESRPPARPQKRVKFQDARNIRSQPSDAALDDGKLDLQKFLSAREFEIKALETSMRKCKSANATRVFQQVPREMRRRTASHNAKRVPKRLRDRAKREMMEDNTPTVEARKRRPRTTRARIRAENAKRLEKLAARKRKRALQNEAGGENRDEPGKTTIQTRAPRPKIRRDTLNEPPKPKSKFKKRQINKTWLPTHLWHAKRATMTESTKPLWRFAIPLTPTQKCYRPTHRASGQKGTVFWDTSYMSTVRLYGAAGGIEQVLKALGLVQESLWGNRGRKWRSGTRTWSGMVSRQQRNSRRDIGPATILWNPTPTVETAAPESNTTELKKTQRQILIRTHPSCFLELFDELVKLAKLHTPQVHVEDLRFEIGSIELTGPGSTETLLAVLQPYYTEERHGQVFSSLVGVTNPASLPKDAVLGFSIKDPRLSYPPKRVDTASKVSDSALLDTLTQWPVEEQVKPYGLFDRDVRFKASSLPPQKSINRRKGASTPGQEMQVTAADPPIPVIAFTSRPAAGGQAQGTWTLLAPWKCILPIWYSIVHYPLSTGGNPRLGGLNEQRQIAFEQGTPWFPGDFLGTNAGVVWEMEQRAQRKKAWDRRPRGKRIEWASLDLGAGRKGEIGDGLACDFEHLLGLPTDHLPNSCEDQSTSDVDPNAMDLHPGEEAEAAAKLGKVHKNTVPSLTTVEQMKKTEFQALISSVNSGRPPPRSIISVNITFVTRGVANACARIYRLPSQPSATTAVPSSETEVPATDPVAAGMGSLPADLRDQWLQKIPGNKSGSRSTKVTTAHAAPHMSRDVGQGTRKQLMAKSLLSGDPLPYPRPTANQTDIGGGHPLCPGEEDLIGFVTAGAYSLSEGKGTAVGAISAEKAFDTVKESGPKEGRLCIVRNAGENVGWLARWELV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.46
2 0.5
3 0.55
4 0.56
5 0.61
6 0.64
7 0.67
8 0.7
9 0.74
10 0.75
11 0.77
12 0.8
13 0.77
14 0.81
15 0.74
16 0.7
17 0.65
18 0.58
19 0.56
20 0.55
21 0.56
22 0.57
23 0.66
24 0.71
25 0.75
26 0.81
27 0.83
28 0.85
29 0.88
30 0.89
31 0.9
32 0.89
33 0.85
34 0.86
35 0.85
36 0.8
37 0.78
38 0.74
39 0.66
40 0.6
41 0.55
42 0.47
43 0.41
44 0.37
45 0.29
46 0.28
47 0.26
48 0.22
49 0.2
50 0.18
51 0.15
52 0.14
53 0.14
54 0.12
55 0.12
56 0.16
57 0.16
58 0.19
59 0.24
60 0.24
61 0.26
62 0.31
63 0.32
64 0.28
65 0.31
66 0.28
67 0.23
68 0.24
69 0.25
70 0.22
71 0.27
72 0.36
73 0.36
74 0.35
75 0.35
76 0.41
77 0.48
78 0.54
79 0.58
80 0.55
81 0.57
82 0.61
83 0.67
84 0.61
85 0.54
86 0.51
87 0.49
88 0.5
89 0.55
90 0.58
91 0.53
92 0.59
93 0.64
94 0.61
95 0.61
96 0.64
97 0.66
98 0.68
99 0.76
100 0.76
101 0.78
102 0.82
103 0.83
104 0.82
105 0.81
106 0.82
107 0.83
108 0.86
109 0.87
110 0.88
111 0.89
112 0.9
113 0.83
114 0.76
115 0.75
116 0.68
117 0.65
118 0.58
119 0.5
120 0.4
121 0.37
122 0.32
123 0.27
124 0.29
125 0.28
126 0.36
127 0.45
128 0.52
129 0.61
130 0.71
131 0.77
132 0.82
133 0.87
134 0.88
135 0.87
136 0.89
137 0.85
138 0.82
139 0.82
140 0.79
141 0.77
142 0.72
143 0.69
144 0.6
145 0.56
146 0.55
147 0.5
148 0.53
149 0.54
150 0.59
151 0.59
152 0.67
153 0.71
154 0.75
155 0.79
156 0.78
157 0.78
158 0.76
159 0.77
160 0.73
161 0.69
162 0.61
163 0.53
164 0.44
165 0.36
166 0.27
167 0.21
168 0.16
169 0.16
170 0.18
171 0.19
172 0.19
173 0.21
174 0.26
175 0.33
176 0.39
177 0.45
178 0.52
179 0.59
180 0.67
181 0.71
182 0.76
183 0.77
184 0.79
185 0.79
186 0.76
187 0.76
188 0.77
189 0.81
190 0.76
191 0.71
192 0.7
193 0.69
194 0.67
195 0.68
196 0.69
197 0.7
198 0.74
199 0.8
200 0.85
201 0.86
202 0.91
203 0.92
204 0.92
205 0.89
206 0.88
207 0.83
208 0.74
209 0.7
210 0.6
211 0.58
212 0.56
213 0.5
214 0.45
215 0.42
216 0.42
217 0.39
218 0.39
219 0.35
220 0.33
221 0.34
222 0.34
223 0.36
224 0.34
225 0.38
226 0.38
227 0.36
228 0.31
229 0.28
230 0.25
231 0.22
232 0.29
233 0.25
234 0.31
235 0.35
236 0.35
237 0.38
238 0.4
239 0.44
240 0.41
241 0.47
242 0.5
243 0.53
244 0.57
245 0.63
246 0.67
247 0.7
248 0.7
249 0.71
250 0.66
251 0.58
252 0.53
253 0.47
254 0.42
255 0.34
256 0.28
257 0.22
258 0.18
259 0.17
260 0.18
261 0.15
262 0.13
263 0.12
264 0.12
265 0.1
266 0.09
267 0.09
268 0.07
269 0.07
270 0.06
271 0.06
272 0.06
273 0.05
274 0.05
275 0.05
276 0.04
277 0.04
278 0.03
279 0.03
280 0.04
281 0.05
282 0.05
283 0.06
284 0.05
285 0.09
286 0.1
287 0.11
288 0.13
289 0.15
290 0.16
291 0.21
292 0.3
293 0.3
294 0.36
295 0.42
296 0.48
297 0.52
298 0.59
299 0.61
300 0.58
301 0.58
302 0.53
303 0.49
304 0.41
305 0.39
306 0.38
307 0.4
308 0.4
309 0.44
310 0.52
311 0.57
312 0.6
313 0.62
314 0.62
315 0.55
316 0.54
317 0.49
318 0.44
319 0.38
320 0.33
321 0.3
322 0.24
323 0.23
324 0.18
325 0.17
326 0.14
327 0.12
328 0.13
329 0.1
330 0.11
331 0.11
332 0.12
333 0.13
334 0.15
335 0.15
336 0.14
337 0.15
338 0.12
339 0.14
340 0.14
341 0.14
342 0.16
343 0.21
344 0.27
345 0.29
346 0.35
347 0.39
348 0.42
349 0.46
350 0.5
351 0.54
352 0.56
353 0.55
354 0.5
355 0.47
356 0.45
357 0.39
358 0.3
359 0.22
360 0.16
361 0.14
362 0.14
363 0.11
364 0.1
365 0.09
366 0.09
367 0.08
368 0.06
369 0.07
370 0.08
371 0.09
372 0.13
373 0.16
374 0.18
375 0.2
376 0.23
377 0.25
378 0.22
379 0.21
380 0.18
381 0.17
382 0.14
383 0.13
384 0.1
385 0.07
386 0.07
387 0.07
388 0.06
389 0.06
390 0.05
391 0.05
392 0.05
393 0.05
394 0.05
395 0.05
396 0.04
397 0.04
398 0.04
399 0.04
400 0.04
401 0.04
402 0.04
403 0.04
404 0.04
405 0.04
406 0.05
407 0.08
408 0.08
409 0.1
410 0.11
411 0.12
412 0.14
413 0.14
414 0.13
415 0.11
416 0.11
417 0.09
418 0.09
419 0.07
420 0.06
421 0.06
422 0.06
423 0.06
424 0.06
425 0.06
426 0.06
427 0.07
428 0.06
429 0.07
430 0.07
431 0.09
432 0.08
433 0.08
434 0.08
435 0.08
436 0.08
437 0.1
438 0.13
439 0.11
440 0.12
441 0.12
442 0.14
443 0.2
444 0.25
445 0.28
446 0.35
447 0.42
448 0.43
449 0.44
450 0.44
451 0.43
452 0.43
453 0.44
454 0.37
455 0.3
456 0.29
457 0.27
458 0.28
459 0.23
460 0.18
461 0.12
462 0.1
463 0.09
464 0.09
465 0.11
466 0.08
467 0.08
468 0.07
469 0.06
470 0.08
471 0.1
472 0.1
473 0.1
474 0.13
475 0.14
476 0.14
477 0.15
478 0.16
479 0.16
480 0.16
481 0.16
482 0.18
483 0.21
484 0.22
485 0.24
486 0.21
487 0.2
488 0.24
489 0.27
490 0.31
491 0.34
492 0.36
493 0.36
494 0.41
495 0.47
496 0.51
497 0.56
498 0.57
499 0.57
500 0.55
501 0.55
502 0.55
503 0.56
504 0.53
505 0.47
506 0.42
507 0.37
508 0.37
509 0.34
510 0.29
511 0.23
512 0.16
513 0.13
514 0.08
515 0.07
516 0.06
517 0.06
518 0.06
519 0.06
520 0.05
521 0.04
522 0.05
523 0.06
524 0.07
525 0.08
526 0.1
527 0.1
528 0.11
529 0.11
530 0.11
531 0.11
532 0.12
533 0.11
534 0.1
535 0.1
536 0.1
537 0.1
538 0.08
539 0.07
540 0.06
541 0.1
542 0.09
543 0.1
544 0.1
545 0.11
546 0.11
547 0.11
548 0.11
549 0.1
550 0.12
551 0.14
552 0.15
553 0.15
554 0.16
555 0.18
556 0.16
557 0.14
558 0.12
559 0.11
560 0.11
561 0.11
562 0.13
563 0.13
564 0.15
565 0.16
566 0.16
567 0.16
568 0.15
569 0.17
570 0.2
571 0.25
572 0.25
573 0.25
574 0.25
575 0.24
576 0.24
577 0.22
578 0.18
579 0.11
580 0.12
581 0.12
582 0.14
583 0.13
584 0.13
585 0.12
586 0.1
587 0.1
588 0.1
589 0.09
590 0.09
591 0.1
592 0.1
593 0.09
594 0.09
595 0.09
596 0.07
597 0.06
598 0.06
599 0.06
600 0.07
601 0.09
602 0.13
603 0.17
604 0.24
605 0.28
606 0.3
607 0.38
608 0.48
609 0.56
610 0.63
611 0.69
612 0.73
613 0.8
614 0.88
615 0.88
616 0.87
617 0.82
618 0.8
619 0.77
620 0.76
621 0.67
622 0.61
623 0.52
624 0.44
625 0.37
626 0.3
627 0.23
628 0.15
629 0.13
630 0.09
631 0.08
632 0.08
633 0.08
634 0.07
635 0.07
636 0.06
637 0.07
638 0.07
639 0.06
640 0.06
641 0.06
642 0.06
643 0.05
644 0.05
645 0.04
646 0.05
647 0.05
648 0.06
649 0.06
650 0.08
651 0.09
652 0.09
653 0.1
654 0.09
655 0.12
656 0.16
657 0.16
658 0.15
659 0.15
660 0.18
661 0.2
662 0.22
663 0.21
664 0.19
665 0.18
666 0.18
667 0.17
668 0.15
669 0.14
670 0.1
671 0.09
672 0.07
673 0.08
674 0.08
675 0.08
676 0.07
677 0.06
678 0.06
679 0.06
680 0.06
681 0.05
682 0.06
683 0.06
684 0.07
685 0.13
686 0.18
687 0.2
688 0.24
689 0.27
690 0.32
691 0.34
692 0.37
693 0.32
694 0.29
695 0.31
696 0.28
697 0.27
698 0.26
699 0.28
700 0.27
701 0.28
702 0.29
703 0.27
704 0.27
705 0.31
706 0.27
707 0.25
708 0.25
709 0.25
710 0.24
711 0.21
712 0.22
713 0.16
714 0.18
715 0.17
716 0.17
717 0.19
718 0.21
719 0.24
720 0.26
721 0.27
722 0.29
723 0.3
724 0.34
725 0.35
726 0.34
727 0.32
728 0.3
729 0.28
730 0.24
731 0.22
732 0.17
733 0.12
734 0.1
735 0.1
736 0.14
737 0.14
738 0.16
739 0.17
740 0.15
741 0.17
742 0.18
743 0.22
744 0.23
745 0.29
746 0.3
747 0.33
748 0.36
749 0.36
750 0.37
751 0.37
752 0.31
753 0.26
754 0.23
755 0.21
756 0.19
757 0.19
758 0.2
759 0.18
760 0.18
761 0.17
762 0.17
763 0.17
764 0.16
765 0.16
766 0.12
767 0.09
768 0.08
769 0.08
770 0.07
771 0.06
772 0.05
773 0.06
774 0.05
775 0.05
776 0.05
777 0.05
778 0.07
779 0.07
780 0.11
781 0.15
782 0.17
783 0.2
784 0.27
785 0.29
786 0.31
787 0.4
788 0.39
789 0.43
790 0.47
791 0.46
792 0.45
793 0.52
794 0.55
795 0.51
796 0.5
797 0.44
798 0.45
799 0.45
800 0.43
801 0.39
802 0.36
803 0.36
804 0.38
805 0.39
806 0.33
807 0.34
808 0.33
809 0.28
810 0.26
811 0.23
812 0.23
813 0.25
814 0.29
815 0.3
816 0.33
817 0.37
818 0.37
819 0.38
820 0.36
821 0.37
822 0.37
823 0.33
824 0.31
825 0.3
826 0.29
827 0.28
828 0.27
829 0.22
830 0.23
831 0.25
832 0.25
833 0.23
834 0.27
835 0.26
836 0.31
837 0.34
838 0.36
839 0.38
840 0.41
841 0.4
842 0.4
843 0.38
844 0.34
845 0.34
846 0.26
847 0.22
848 0.19
849 0.18
850 0.14
851 0.15
852 0.15
853 0.12
854 0.13
855 0.12
856 0.11
857 0.12
858 0.12
859 0.1
860 0.09
861 0.07
862 0.06
863 0.06
864 0.05
865 0.04
866 0.05
867 0.08
868 0.08
869 0.08
870 0.08
871 0.09
872 0.1
873 0.1
874 0.1
875 0.08
876 0.08
877 0.08
878 0.09
879 0.1
880 0.09
881 0.09
882 0.08
883 0.08
884 0.09
885 0.09
886 0.13
887 0.15
888 0.21
889 0.28
890 0.29
891 0.37
892 0.41
893 0.46
894 0.43
895 0.45
896 0.45
897 0.43
898 0.45
899 0.43
900 0.46
901 0.43
902 0.45
903 0.44
904 0.4
905 0.35
906 0.33
907 0.29
908 0.22
909 0.19
910 0.16