FuNGI

A0A0D1CPH3

Protein Details

Accession

A0A0D1CPH3

Localization Confidence

High

Confidence Score

15.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1-41	MSKELKSPSKDGKRKGKASDAVPSPKKSKKASTSSHPVPSS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
7-31	SPSKDGKRKGKASDAVPSPKKSKKA
514-518	KGKAG

Subcellular Location(s)

nucl 22, cyto_nucl 14.5, cyto 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR009668 RNA_pol-assoc_fac_A49-like
Gene Ontology	GO:0005736 C:RNA polymerase I complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0001188 P:RNA polymerase I preinitiation complex assembly GO:0006362 P:transcription elongation by RNA polymerase I
KEGG	uma:UMAG_03584 -
Pfam	View protein in Pfam PF06870 RNA_pol_I_A49

Amino Acid Sequences

MSKELKSPSKDGKRKGKASDAVPSPKKSKKASTSSHPVPSSSASTSKLKNKAGAGQATLKVNGFKSGLKQLSQSGAAFASFADYNPAPSTRFSLYRADGLPDEVGASINNADERLLLAGETDTMAYVGNNFEFGSSAEARGYTGEYMVGIYDPSSSSVTLRAVPTFQVTRSIKANSSLSSISSTRTFADYGEMTAARRALGDAFGNRKQKANARNQDRMKVDTANMEVILDDFTGGIQDNLASLPSLDEVLASSTSSRPMPPANLDAKHPAEAYRISDLIPSDIFGSLPIQKLIDNVDDHEALKELLPYSKEFPAWIWSRLLDNLQRSSHLAGNSSGKKHTTFSDDEDDAEATANGAAGDDLMMMPALGATEDKEDAKDKVRIAYYMSLLWFIQSRPKSVSQRGKLISSLKLDGEDANKRIIKAILSTFTETPANSERAVMSAFHQTKVLAYMCALALHLDNFSVDHDKLARNCNIPPATLRELFRTLGCTSSVVGGEKRMVLKTPFTLPQPRKGKAGGR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.82
2	0.83
3	0.82
4	0.78
5	0.74
6	0.74
7	0.71
8	0.71
9	0.7
10	0.68
11	0.66
12	0.66
13	0.68
14	0.65
15	0.67
16	0.67
17	0.7
18	0.73
19	0.75
20	0.78
21	0.78
22	0.8
23	0.71
24	0.62
25	0.55
26	0.5
27	0.45
28	0.38
29	0.34
30	0.29
31	0.33
32	0.39
33	0.45
34	0.49
35	0.48
36	0.5
37	0.5
38	0.53
39	0.55
40	0.52
41	0.48
42	0.46
43	0.46
44	0.44
45	0.41
46	0.35
47	0.3
48	0.27
49	0.26
50	0.21
51	0.19
52	0.21
53	0.3
54	0.31
55	0.3
56	0.31
57	0.31
58	0.33
59	0.34
60	0.3
61	0.22
62	0.19
63	0.18
64	0.16
65	0.13
66	0.11
67	0.09
68	0.09
69	0.12
70	0.12
71	0.14
72	0.16
73	0.18
74	0.16
75	0.17
76	0.21
77	0.2
78	0.23
79	0.23
80	0.28
81	0.29
82	0.32
83	0.32
84	0.31
85	0.28
86	0.27
87	0.24
88	0.18
89	0.16
90	0.11
91	0.1
92	0.08
93	0.08
94	0.06
95	0.07
96	0.07
97	0.07
98	0.07
99	0.06
100	0.07
101	0.07
102	0.06
103	0.05
104	0.06
105	0.06
106	0.06
107	0.06
108	0.05
109	0.04
110	0.05
111	0.05
112	0.04
113	0.05
114	0.06
115	0.06
116	0.06
117	0.06
118	0.06
119	0.06
120	0.07
121	0.11
122	0.11
123	0.11
124	0.11
125	0.11
126	0.11
127	0.11
128	0.12
129	0.08
130	0.07
131	0.06
132	0.06
133	0.06
134	0.06
135	0.06
136	0.04
137	0.04
138	0.05
139	0.05
140	0.07
141	0.08
142	0.08
143	0.08
144	0.1
145	0.11
146	0.13
147	0.14
148	0.13
149	0.13
150	0.13
151	0.16
152	0.16
153	0.15
154	0.22
155	0.22
156	0.23
157	0.26
158	0.28
159	0.25
160	0.28
161	0.29
162	0.21
163	0.23
164	0.21
165	0.18
166	0.19
167	0.18
168	0.16
169	0.16
170	0.16
171	0.14
172	0.15
173	0.14
174	0.11
175	0.14
176	0.12
177	0.12
178	0.13
179	0.12
180	0.11
181	0.12
182	0.12
183	0.09
184	0.08
185	0.08
186	0.06
187	0.07
188	0.09
189	0.11
190	0.16
191	0.21
192	0.26
193	0.27
194	0.28
195	0.3
196	0.35
197	0.41
198	0.46
199	0.5
200	0.53
201	0.62
202	0.62
203	0.67
204	0.62
205	0.56
206	0.47
207	0.4
208	0.33
209	0.26
210	0.24
211	0.18
212	0.16
213	0.13
214	0.1
215	0.09
216	0.08
217	0.05
218	0.04
219	0.03
220	0.03
221	0.04
222	0.04
223	0.03
224	0.03
225	0.03
226	0.03
227	0.03
228	0.03
229	0.03
230	0.03
231	0.03
232	0.04
233	0.04
234	0.04
235	0.03
236	0.04
237	0.05
238	0.05
239	0.04
240	0.05
241	0.05
242	0.07
243	0.07
244	0.07
245	0.08
246	0.09
247	0.1
248	0.12
249	0.17
250	0.2
251	0.2
252	0.21
253	0.25
254	0.25
255	0.24
256	0.22
257	0.18
258	0.15
259	0.15
260	0.16
261	0.13
262	0.12
263	0.11
264	0.12
265	0.12
266	0.11
267	0.1
268	0.08
269	0.07
270	0.07
271	0.07
272	0.06
273	0.07
274	0.08
275	0.09
276	0.09
277	0.08
278	0.08
279	0.09
280	0.11
281	0.12
282	0.1
283	0.11
284	0.13
285	0.13
286	0.13
287	0.13
288	0.11
289	0.09
290	0.09
291	0.09
292	0.07
293	0.08
294	0.09
295	0.11
296	0.13
297	0.15
298	0.15
299	0.14
300	0.14
301	0.19
302	0.2
303	0.21
304	0.19
305	0.18
306	0.19
307	0.19
308	0.22
309	0.19
310	0.2
311	0.22
312	0.22
313	0.22
314	0.22
315	0.24
316	0.24
317	0.21
318	0.19
319	0.16
320	0.23
321	0.26
322	0.26
323	0.26
324	0.24
325	0.24
326	0.24
327	0.25
328	0.23
329	0.22
330	0.24
331	0.29
332	0.28
333	0.28
334	0.27
335	0.25
336	0.2
337	0.18
338	0.13
339	0.07
340	0.06
341	0.06
342	0.04
343	0.04
344	0.04
345	0.03
346	0.03
347	0.03
348	0.03
349	0.03
350	0.03
351	0.03
352	0.03
353	0.03
354	0.03
355	0.03
356	0.03
357	0.04
358	0.05
359	0.07
360	0.07
361	0.09
362	0.11
363	0.12
364	0.17
365	0.21
366	0.2
367	0.24
368	0.25
369	0.25
370	0.26
371	0.28
372	0.25
373	0.23
374	0.22
375	0.18
376	0.16
377	0.17
378	0.14
379	0.11
380	0.18
381	0.18
382	0.2
383	0.23
384	0.31
385	0.37
386	0.46
387	0.56
388	0.53
389	0.61
390	0.61
391	0.58
392	0.55
393	0.52
394	0.47
395	0.4
396	0.37
397	0.28
398	0.26
399	0.25
400	0.23
401	0.25
402	0.26
403	0.23
404	0.27
405	0.28
406	0.27
407	0.29
408	0.28
409	0.24
410	0.22
411	0.25
412	0.24
413	0.25
414	0.29
415	0.27
416	0.27
417	0.28
418	0.23
419	0.24
420	0.23
421	0.22
422	0.19
423	0.2
424	0.18
425	0.18
426	0.19
427	0.15
428	0.13
429	0.21
430	0.23
431	0.22
432	0.23
433	0.21
434	0.21
435	0.25
436	0.24
437	0.14
438	0.13
439	0.14
440	0.14
441	0.14
442	0.13
443	0.1
444	0.09
445	0.1
446	0.09
447	0.08
448	0.07
449	0.07
450	0.1
451	0.13
452	0.13
453	0.14
454	0.17
455	0.22
456	0.26
457	0.33
458	0.36
459	0.34
460	0.36
461	0.43
462	0.41
463	0.38
464	0.38
465	0.38
466	0.39
467	0.41
468	0.41
469	0.37
470	0.39
471	0.39
472	0.36
473	0.33
474	0.27
475	0.24
476	0.23
477	0.19
478	0.17
479	0.18
480	0.19
481	0.18
482	0.18
483	0.19
484	0.2
485	0.22
486	0.24
487	0.23
488	0.25
489	0.25
490	0.28
491	0.3
492	0.34
493	0.35
494	0.38
495	0.48
496	0.48
497	0.56
498	0.6
499	0.6
500	0.58

A0A0D1CPH3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer