Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

V5IRI9

Protein Details
Accession V5IRI9    Localization Confidence High Confidence Score 20
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
223-302AGSAEQEQKEKKKKKKNYGPKQPNPLAMKKAKKEDDKKKKSPSDPQRPKKPSETTTDSTAEGKAKRKRRRKTAGGAAEGGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
182-188RRSLKRK
231-274KEKKKKKKNYGPKQPNPLAMKKAKKEDDKKKKSPSDPQRPKKPS
283-296EGKAKRKRRRKTAG
Subcellular Location(s) nucl 20, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006984  Fcf1/Utp23  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0032040  C:small-subunit processome  
GO:0070181  F:small ribosomal subunit rRNA binding  
GO:0000480  P:endonucleolytic cleavage in 5'-ETS of tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000447  P:endonucleolytic cleavage in ITS1 to separate SSU-rRNA from 5.8S rRNA and LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000472  P:endonucleolytic cleavage to generate mature 5'-end of SSU-rRNA from (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
KEGG ncr:NCU02748  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04900  Fcf1  
CDD cd09865  PIN_ScUtp23p-like  
Amino Acid Sequences MGKSRKAYKKLMRSFEQLGFRQPYQLLLTSDIVLDTVKLDIMNLFQKTLNTKDIKPMITQCCIRALYAKNKPGPDRDPNVPAAIERAKTFERRRCGHLMDQDPLTERECMLSVVDPKGKGQNKFRYVVATNDEWLRHRLRSVVSTPLMYCRRSVMILEPMSEASQQIRDREERQKFKDGIIRRSLKRKREDGDEKEDSEGDSDSEGEGGQGQEVNKEKSTDAAGSAEQEQKEKKKKKKNYGPKQPNPLAMKKAKKEDDKKKKSPSDPQRPKKPSETTTDSTAEGKAKRKRRRKTAGGAAEGGGGAGEQSAETTVAGVKEE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.74
2 0.71
3 0.69
4 0.6
5 0.58
6 0.55
7 0.49
8 0.47
9 0.41
10 0.37
11 0.32
12 0.34
13 0.28
14 0.26
15 0.27
16 0.24
17 0.23
18 0.2
19 0.17
20 0.12
21 0.11
22 0.07
23 0.06
24 0.06
25 0.06
26 0.06
27 0.06
28 0.09
29 0.15
30 0.15
31 0.16
32 0.17
33 0.19
34 0.23
35 0.26
36 0.31
37 0.3
38 0.3
39 0.37
40 0.42
41 0.41
42 0.41
43 0.46
44 0.43
45 0.45
46 0.46
47 0.38
48 0.39
49 0.38
50 0.34
51 0.32
52 0.34
53 0.37
54 0.44
55 0.5
56 0.5
57 0.54
58 0.57
59 0.58
60 0.58
61 0.57
62 0.54
63 0.51
64 0.5
65 0.47
66 0.45
67 0.39
68 0.32
69 0.28
70 0.25
71 0.21
72 0.17
73 0.2
74 0.21
75 0.28
76 0.36
77 0.38
78 0.44
79 0.46
80 0.51
81 0.53
82 0.55
83 0.54
84 0.55
85 0.53
86 0.47
87 0.44
88 0.39
89 0.36
90 0.33
91 0.27
92 0.19
93 0.14
94 0.12
95 0.12
96 0.11
97 0.09
98 0.1
99 0.12
100 0.15
101 0.17
102 0.16
103 0.17
104 0.25
105 0.29
106 0.32
107 0.38
108 0.45
109 0.47
110 0.49
111 0.48
112 0.45
113 0.42
114 0.4
115 0.34
116 0.26
117 0.23
118 0.22
119 0.22
120 0.19
121 0.2
122 0.19
123 0.16
124 0.16
125 0.17
126 0.17
127 0.2
128 0.21
129 0.23
130 0.22
131 0.22
132 0.22
133 0.26
134 0.27
135 0.24
136 0.22
137 0.18
138 0.18
139 0.17
140 0.18
141 0.13
142 0.18
143 0.18
144 0.18
145 0.17
146 0.16
147 0.16
148 0.16
149 0.13
150 0.07
151 0.11
152 0.11
153 0.12
154 0.14
155 0.16
156 0.21
157 0.3
158 0.38
159 0.41
160 0.45
161 0.52
162 0.5
163 0.51
164 0.53
165 0.49
166 0.47
167 0.48
168 0.5
169 0.46
170 0.55
171 0.59
172 0.61
173 0.62
174 0.63
175 0.57
176 0.61
177 0.67
178 0.63
179 0.65
180 0.61
181 0.55
182 0.49
183 0.45
184 0.35
185 0.26
186 0.2
187 0.11
188 0.08
189 0.07
190 0.06
191 0.06
192 0.05
193 0.04
194 0.05
195 0.05
196 0.05
197 0.06
198 0.06
199 0.1
200 0.13
201 0.16
202 0.16
203 0.17
204 0.17
205 0.17
206 0.19
207 0.16
208 0.14
209 0.13
210 0.12
211 0.13
212 0.16
213 0.18
214 0.17
215 0.19
216 0.22
217 0.29
218 0.4
219 0.48
220 0.54
221 0.61
222 0.72
223 0.8
224 0.87
225 0.9
226 0.91
227 0.93
228 0.95
229 0.93
230 0.93
231 0.87
232 0.84
233 0.78
234 0.73
235 0.69
236 0.67
237 0.66
238 0.62
239 0.67
240 0.66
241 0.7
242 0.75
243 0.78
244 0.81
245 0.83
246 0.86
247 0.87
248 0.89
249 0.87
250 0.87
251 0.87
252 0.87
253 0.88
254 0.89
255 0.9
256 0.86
257 0.84
258 0.83
259 0.8
260 0.74
261 0.72
262 0.7
263 0.62
264 0.62
265 0.58
266 0.5
267 0.42
268 0.4
269 0.36
270 0.32
271 0.37
272 0.4
273 0.48
274 0.58
275 0.67
276 0.75
277 0.8
278 0.86
279 0.88
280 0.9
281 0.91
282 0.9
283 0.85
284 0.77
285 0.66
286 0.56
287 0.45
288 0.34
289 0.22
290 0.12
291 0.07
292 0.04
293 0.04
294 0.03
295 0.03
296 0.04
297 0.05
298 0.05
299 0.06
300 0.08