Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

Q7SHQ9

Protein Details
Accession Q7SHQ9    Localization Confidence High Confidence Score 17.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
210-230ATWISKKPPKAPKPLIPSKLSHydrophilic
403-425VESERSSKRRKTQHKTVRLANGKHydrophilic
970-989VIAQYVKRRRQEQKSEIDIYHydrophilic
1011-1039HDRLMKNKMRTMKRERQKQLQQRLKSGGTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
216-220KPPKA
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 13, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR040240  TAF1  
IPR022591  TAF1_HAT_dom  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0004402  F:histone acetyltransferase activity  
GO:0016251  F:RNA polymerase II general transcription initiation factor activity  
GO:0001091  F:RNA polymerase II general transcription initiation factor binding  
GO:0017025  F:TBP-class protein binding  
GO:0051123  P:RNA polymerase II preinitiation complex assembly  
KEGG ncr:NCU02556  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF12157  DUF3591  
Amino Acid Sequences MPADNDDFDFNALNEEGWKEQEARDEEAIRQINNSFGPGGNDGLTEMLGNLQSGGEIDQRGKADDAIDFEDIDLSDEDELPNDEPSTSGTSGELPSLIDDAGTNDDDDLFGGDPSSPMDTAHDGLRSSPPPLDVHDDVDAKKRPDAAAGESLEDLRNLNFDNDEEPHATNQDPDIPPPAENFIDAVKQLFPGFEENAILHWNELLKPKNATWISKKPPKAPKPLIPSKLSLELDADQEKQFRIPGPATGSVWQRIKEAEARGLFCLEEPEPLEQTDLEVFSLDDETDSERIGGYTLQDIATICQDWEQMIFLGDSLAAAIEPGPQPKPDNMLIKDEPDEEADWDAMFLDEPAQKRRKIEIPKGLPPIAHFTAPNLDEFEQVTSKLGKRVILDMNDPYLLIDDVESERSSKRRKTQHKTVRLANGKAGRDLIQRFNFSSDAAYDALKENSQNRVRATLATIPVEHSLPAQRLSWPYYRVKLAASDPHSYHRPQLHPKKDLQYLIRFDKPAIIKRKTLKGKRVSEVFKSTHDLSLNDNSTAILFEYCEEIPTVLSNFGMGQKIINYFRRAKGADSRPEKRELGETCILMPEDRSPFAIFGHVHPGEVVPTLHNHMFRAPIFKHNPRNTDFLIGRSSTGQKGSTWYIRNIDHLYVVGQTLPSMEVPGPHSRRVTNIAKNRLKMVSYRLLRKSEHVTLHDITKHVAESNESQNRQKLKEFLRFRKETKDWALPEGEELMAEPAIRSLVRPEEVCLLDAMQVGLHEIEKGGYDATDSLKDDDIGVDVNDELSPDALANKMAPWKTTKAFLDASHGKAMLAVHGAGDPTGKGLGISFLRTSMKGGYLEQLQGPMATSADAIERQRKANGGHMYNVKNQDTLYTEALTDIWNRQRESLLDSQEHDDEDVLGQEDEDERFNVQGSQFAQTPVVQDGFSQISQSATSAINRKKLVITREVRDENGQTRTVTEVVRDPAVIAQYVKRRRQEQKSEIDIYNVKMTGDQERDAVILELLEKEHDRLMKNKMRTMKRERQKQLQQRLKSGGTLPLDNDDGSLEPSIEKATGTTRRCANCGAKGHIKTNKKLCPLLNGSMTKDQTQDDGASGVGSPNPNAPVAASFMTPS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.14
3 0.15
4 0.16
5 0.18
6 0.16
7 0.18
8 0.26
9 0.28
10 0.31
11 0.34
12 0.35
13 0.34
14 0.41
15 0.42
16 0.34
17 0.33
18 0.28
19 0.27
20 0.25
21 0.26
22 0.19
23 0.17
24 0.2
25 0.19
26 0.2
27 0.17
28 0.16
29 0.15
30 0.13
31 0.12
32 0.09
33 0.08
34 0.08
35 0.07
36 0.07
37 0.07
38 0.07
39 0.07
40 0.07
41 0.09
42 0.1
43 0.11
44 0.12
45 0.16
46 0.17
47 0.19
48 0.2
49 0.19
50 0.18
51 0.18
52 0.2
53 0.2
54 0.2
55 0.17
56 0.17
57 0.17
58 0.16
59 0.16
60 0.12
61 0.1
62 0.1
63 0.11
64 0.1
65 0.1
66 0.12
67 0.11
68 0.12
69 0.12
70 0.11
71 0.11
72 0.13
73 0.18
74 0.16
75 0.16
76 0.15
77 0.17
78 0.17
79 0.18
80 0.16
81 0.1
82 0.11
83 0.11
84 0.1
85 0.08
86 0.07
87 0.08
88 0.11
89 0.11
90 0.11
91 0.1
92 0.1
93 0.1
94 0.1
95 0.1
96 0.07
97 0.07
98 0.07
99 0.07
100 0.07
101 0.09
102 0.11
103 0.09
104 0.09
105 0.12
106 0.13
107 0.15
108 0.17
109 0.18
110 0.16
111 0.18
112 0.24
113 0.22
114 0.22
115 0.23
116 0.23
117 0.22
118 0.25
119 0.31
120 0.26
121 0.28
122 0.3
123 0.32
124 0.31
125 0.37
126 0.39
127 0.34
128 0.35
129 0.34
130 0.3
131 0.32
132 0.33
133 0.31
134 0.33
135 0.32
136 0.31
137 0.28
138 0.29
139 0.24
140 0.22
141 0.17
142 0.1
143 0.11
144 0.1
145 0.11
146 0.11
147 0.11
148 0.14
149 0.15
150 0.19
151 0.2
152 0.2
153 0.2
154 0.21
155 0.2
156 0.18
157 0.17
158 0.23
159 0.21
160 0.21
161 0.25
162 0.25
163 0.25
164 0.26
165 0.28
166 0.2
167 0.19
168 0.19
169 0.14
170 0.15
171 0.15
172 0.15
173 0.11
174 0.12
175 0.12
176 0.11
177 0.11
178 0.13
179 0.13
180 0.13
181 0.13
182 0.12
183 0.13
184 0.14
185 0.13
186 0.1
187 0.09
188 0.1
189 0.12
190 0.18
191 0.21
192 0.22
193 0.25
194 0.26
195 0.34
196 0.36
197 0.4
198 0.42
199 0.49
200 0.56
201 0.61
202 0.67
203 0.66
204 0.74
205 0.77
206 0.79
207 0.78
208 0.77
209 0.78
210 0.83
211 0.8
212 0.72
213 0.67
214 0.6
215 0.59
216 0.51
217 0.41
218 0.34
219 0.28
220 0.29
221 0.27
222 0.26
223 0.19
224 0.2
225 0.19
226 0.17
227 0.18
228 0.16
229 0.19
230 0.17
231 0.2
232 0.23
233 0.26
234 0.27
235 0.29
236 0.3
237 0.32
238 0.33
239 0.3
240 0.27
241 0.24
242 0.26
243 0.27
244 0.27
245 0.28
246 0.28
247 0.29
248 0.29
249 0.29
250 0.26
251 0.21
252 0.21
253 0.14
254 0.13
255 0.13
256 0.14
257 0.15
258 0.15
259 0.16
260 0.12
261 0.13
262 0.12
263 0.11
264 0.09
265 0.08
266 0.08
267 0.07
268 0.08
269 0.07
270 0.05
271 0.06
272 0.08
273 0.08
274 0.08
275 0.08
276 0.07
277 0.07
278 0.08
279 0.08
280 0.06
281 0.07
282 0.08
283 0.08
284 0.09
285 0.09
286 0.09
287 0.1
288 0.1
289 0.08
290 0.08
291 0.09
292 0.08
293 0.08
294 0.08
295 0.07
296 0.07
297 0.07
298 0.06
299 0.06
300 0.06
301 0.05
302 0.04
303 0.04
304 0.03
305 0.03
306 0.03
307 0.06
308 0.07
309 0.09
310 0.1
311 0.11
312 0.14
313 0.15
314 0.2
315 0.22
316 0.29
317 0.29
318 0.35
319 0.35
320 0.35
321 0.36
322 0.32
323 0.27
324 0.22
325 0.2
326 0.14
327 0.14
328 0.12
329 0.1
330 0.09
331 0.08
332 0.06
333 0.06
334 0.05
335 0.07
336 0.09
337 0.11
338 0.19
339 0.23
340 0.25
341 0.28
342 0.33
343 0.38
344 0.45
345 0.52
346 0.55
347 0.58
348 0.64
349 0.67
350 0.63
351 0.55
352 0.47
353 0.45
354 0.36
355 0.3
356 0.22
357 0.18
358 0.22
359 0.22
360 0.21
361 0.17
362 0.16
363 0.15
364 0.16
365 0.17
366 0.12
367 0.12
368 0.13
369 0.13
370 0.13
371 0.16
372 0.17
373 0.17
374 0.18
375 0.23
376 0.25
377 0.25
378 0.26
379 0.24
380 0.24
381 0.21
382 0.2
383 0.15
384 0.11
385 0.09
386 0.07
387 0.06
388 0.06
389 0.06
390 0.08
391 0.08
392 0.09
393 0.1
394 0.16
395 0.21
396 0.26
397 0.34
398 0.43
399 0.53
400 0.62
401 0.71
402 0.77
403 0.82
404 0.82
405 0.81
406 0.8
407 0.76
408 0.68
409 0.63
410 0.58
411 0.48
412 0.43
413 0.37
414 0.29
415 0.27
416 0.28
417 0.3
418 0.27
419 0.28
420 0.27
421 0.28
422 0.27
423 0.22
424 0.2
425 0.13
426 0.12
427 0.11
428 0.1
429 0.09
430 0.1
431 0.1
432 0.1
433 0.11
434 0.11
435 0.19
436 0.23
437 0.25
438 0.24
439 0.26
440 0.27
441 0.26
442 0.27
443 0.23
444 0.21
445 0.19
446 0.19
447 0.17
448 0.17
449 0.17
450 0.14
451 0.1
452 0.1
453 0.11
454 0.12
455 0.11
456 0.12
457 0.14
458 0.18
459 0.2
460 0.22
461 0.24
462 0.25
463 0.26
464 0.25
465 0.23
466 0.22
467 0.21
468 0.24
469 0.25
470 0.26
471 0.25
472 0.28
473 0.3
474 0.28
475 0.3
476 0.29
477 0.31
478 0.38
479 0.47
480 0.52
481 0.54
482 0.58
483 0.59
484 0.58
485 0.56
486 0.5
487 0.47
488 0.44
489 0.44
490 0.43
491 0.37
492 0.32
493 0.34
494 0.32
495 0.33
496 0.36
497 0.35
498 0.37
499 0.41
500 0.5
501 0.54
502 0.58
503 0.6
504 0.61
505 0.65
506 0.64
507 0.67
508 0.61
509 0.56
510 0.55
511 0.48
512 0.4
513 0.37
514 0.33
515 0.29
516 0.26
517 0.22
518 0.19
519 0.24
520 0.23
521 0.19
522 0.18
523 0.15
524 0.14
525 0.13
526 0.11
527 0.05
528 0.04
529 0.04
530 0.06
531 0.06
532 0.07
533 0.06
534 0.06
535 0.06
536 0.07
537 0.07
538 0.05
539 0.05
540 0.05
541 0.05
542 0.06
543 0.07
544 0.06
545 0.06
546 0.06
547 0.09
548 0.12
549 0.15
550 0.17
551 0.2
552 0.22
553 0.26
554 0.26
555 0.25
556 0.32
557 0.36
558 0.41
559 0.45
560 0.49
561 0.47
562 0.51
563 0.49
564 0.41
565 0.39
566 0.32
567 0.31
568 0.28
569 0.26
570 0.22
571 0.22
572 0.21
573 0.15
574 0.14
575 0.11
576 0.1
577 0.1
578 0.11
579 0.1
580 0.11
581 0.11
582 0.13
583 0.11
584 0.1
585 0.17
586 0.16
587 0.16
588 0.15
589 0.15
590 0.13
591 0.13
592 0.12
593 0.05
594 0.06
595 0.09
596 0.11
597 0.11
598 0.11
599 0.11
600 0.13
601 0.13
602 0.18
603 0.17
604 0.24
605 0.29
606 0.36
607 0.45
608 0.48
609 0.52
610 0.49
611 0.53
612 0.46
613 0.46
614 0.39
615 0.31
616 0.29
617 0.24
618 0.21
619 0.19
620 0.2
621 0.15
622 0.15
623 0.14
624 0.12
625 0.15
626 0.17
627 0.21
628 0.22
629 0.23
630 0.25
631 0.25
632 0.28
633 0.27
634 0.24
635 0.18
636 0.16
637 0.15
638 0.11
639 0.11
640 0.08
641 0.06
642 0.05
643 0.05
644 0.05
645 0.05
646 0.05
647 0.05
648 0.06
649 0.1
650 0.18
651 0.2
652 0.22
653 0.24
654 0.23
655 0.26
656 0.32
657 0.36
658 0.36
659 0.42
660 0.5
661 0.53
662 0.53
663 0.54
664 0.48
665 0.42
666 0.36
667 0.33
668 0.32
669 0.32
670 0.38
671 0.4
672 0.42
673 0.42
674 0.43
675 0.43
676 0.41
677 0.4
678 0.35
679 0.35
680 0.32
681 0.35
682 0.33
683 0.28
684 0.22
685 0.19
686 0.17
687 0.14
688 0.13
689 0.11
690 0.13
691 0.22
692 0.28
693 0.29
694 0.31
695 0.34
696 0.38
697 0.38
698 0.37
699 0.36
700 0.35
701 0.44
702 0.51
703 0.55
704 0.61
705 0.64
706 0.63
707 0.66
708 0.61
709 0.58
710 0.55
711 0.54
712 0.46
713 0.44
714 0.43
715 0.34
716 0.32
717 0.26
718 0.2
719 0.11
720 0.1
721 0.08
722 0.06
723 0.06
724 0.05
725 0.04
726 0.05
727 0.05
728 0.05
729 0.07
730 0.09
731 0.11
732 0.12
733 0.13
734 0.18
735 0.18
736 0.18
737 0.16
738 0.14
739 0.13
740 0.13
741 0.12
742 0.07
743 0.06
744 0.06
745 0.06
746 0.06
747 0.05
748 0.04
749 0.05
750 0.05
751 0.05
752 0.05
753 0.04
754 0.05
755 0.06
756 0.07
757 0.09
758 0.1
759 0.11
760 0.12
761 0.12
762 0.12
763 0.11
764 0.1
765 0.08
766 0.07
767 0.06
768 0.05
769 0.06
770 0.06
771 0.06
772 0.05
773 0.05
774 0.05
775 0.04
776 0.05
777 0.05
778 0.05
779 0.05
780 0.07
781 0.12
782 0.13
783 0.14
784 0.17
785 0.22
786 0.23
787 0.29
788 0.28
789 0.27
790 0.3
791 0.29
792 0.34
793 0.33
794 0.34
795 0.31
796 0.29
797 0.25
798 0.24
799 0.23
800 0.15
801 0.12
802 0.09
803 0.08
804 0.08
805 0.08
806 0.07
807 0.07
808 0.06
809 0.05
810 0.05
811 0.05
812 0.04
813 0.05
814 0.08
815 0.09
816 0.1
817 0.1
818 0.12
819 0.14
820 0.14
821 0.15
822 0.13
823 0.15
824 0.14
825 0.15
826 0.16
827 0.17
828 0.18
829 0.17
830 0.16
831 0.14
832 0.13
833 0.13
834 0.1
835 0.08
836 0.07
837 0.06
838 0.06
839 0.07
840 0.1
841 0.12
842 0.18
843 0.2
844 0.22
845 0.23
846 0.26
847 0.27
848 0.32
849 0.38
850 0.34
851 0.37
852 0.43
853 0.45
854 0.47
855 0.51
856 0.44
857 0.36
858 0.34
859 0.3
860 0.27
861 0.27
862 0.23
863 0.18
864 0.17
865 0.17
866 0.17
867 0.16
868 0.14
869 0.16
870 0.2
871 0.24
872 0.25
873 0.26
874 0.28
875 0.28
876 0.33
877 0.34
878 0.32
879 0.3
880 0.31
881 0.33
882 0.32
883 0.31
884 0.25
885 0.19
886 0.14
887 0.12
888 0.11
889 0.09
890 0.08
891 0.07
892 0.08
893 0.09
894 0.09
895 0.1
896 0.1
897 0.09
898 0.1
899 0.1
900 0.12
901 0.11
902 0.14
903 0.15
904 0.17
905 0.18
906 0.18
907 0.19
908 0.17
909 0.19
910 0.17
911 0.17
912 0.13
913 0.12
914 0.15
915 0.16
916 0.16
917 0.14
918 0.12
919 0.12
920 0.12
921 0.13
922 0.12
923 0.1
924 0.14
925 0.22
926 0.26
927 0.32
928 0.32
929 0.34
930 0.37
931 0.41
932 0.43
933 0.45
934 0.47
935 0.45
936 0.54
937 0.55
938 0.51
939 0.5
940 0.49
941 0.44
942 0.42
943 0.39
944 0.29
945 0.28
946 0.28
947 0.27
948 0.23
949 0.2
950 0.2
951 0.21
952 0.22
953 0.21
954 0.18
955 0.18
956 0.19
957 0.18
958 0.15
959 0.18
960 0.26
961 0.35
962 0.42
963 0.46
964 0.54
965 0.63
966 0.72
967 0.78
968 0.78
969 0.79
970 0.8
971 0.8
972 0.71
973 0.67
974 0.59
975 0.5
976 0.45
977 0.36
978 0.27
979 0.23
980 0.24
981 0.26
982 0.27
983 0.25
984 0.21
985 0.21
986 0.21
987 0.2
988 0.19
989 0.12
990 0.09
991 0.09
992 0.09
993 0.08
994 0.11
995 0.1
996 0.11
997 0.15
998 0.18
999 0.2
1000 0.25
1001 0.34
1002 0.41
1003 0.45
1004 0.5
1005 0.56
1006 0.62
1007 0.69
1008 0.74
1009 0.75
1010 0.76
1011 0.82
1012 0.84
1013 0.86
1014 0.87
1015 0.88
1016 0.89
1017 0.88
1018 0.85
1019 0.82
1020 0.81
1021 0.71
1022 0.64
1023 0.56
1024 0.52
1025 0.45
1026 0.41
1027 0.34
1028 0.3
1029 0.3
1030 0.26
1031 0.24
1032 0.18
1033 0.15
1034 0.14
1035 0.14
1036 0.11
1037 0.09
1038 0.1
1039 0.11
1040 0.1
1041 0.09
1042 0.09
1043 0.16
1044 0.24
1045 0.27
1046 0.33
1047 0.39
1048 0.42
1049 0.44
1050 0.51
1051 0.5
1052 0.5
1053 0.54
1054 0.56
1055 0.57
1056 0.59
1057 0.66
1058 0.67
1059 0.68
1060 0.69
1061 0.72
1062 0.72
1063 0.69
1064 0.71
1065 0.65
1066 0.66
1067 0.65
1068 0.63
1069 0.61
1070 0.56
1071 0.55
1072 0.57
1073 0.56
1074 0.48
1075 0.44
1076 0.38
1077 0.31
1078 0.31
1079 0.26
1080 0.19
1081 0.18
1082 0.16
1083 0.14
1084 0.13
1085 0.12
1086 0.12
1087 0.12
1088 0.12
1089 0.15
1090 0.17
1091 0.17
1092 0.17
1093 0.16
1094 0.15
1095 0.17
1096 0.18