Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2P7YHL3

Protein Details
Accession A0A2P7YHL3    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
14-64ANLPVKKSNDKPTEQKQPKKRPAPSQNNNKKDKKQDKLEKNEKRKNPVVSDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
27-58EQKQPKKRPAPSQNNNKKDKKQDKLEKNEKRK
Subcellular Location(s) nucl 13cyto_nucl 13, cyto 11
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011545  DEAD/DEAH_box_helicase_dom  
IPR014001  Helicase_ATP-bd  
IPR001650  Helicase_C  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR025696  rRNA_proc-arch_dom  
IPR016438  SKI2-like  
IPR012961  Ski2/MTR4_C  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0031499  C:TRAMP complex  
GO:0034458  F:3'-5' RNA helicase activity  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0008143  F:poly(A) binding  
GO:0004532  F:RNA exonuclease activity  
GO:0000467  P:exonucleolytic trimming to generate mature 3'-end of 5.8S rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0043629  P:ncRNA polyadenylation  
GO:0071031  P:nuclear mRNA surveillance of mRNA 3'-end processing  
GO:0071042  P:nuclear polyadenylation-dependent mRNA catabolic process  
GO:0071035  P:nuclear polyadenylation-dependent rRNA catabolic process  
GO:0071038  P:nuclear polyadenylation-dependent tRNA catabolic process  
GO:0071051  P:polyadenylation-dependent snoRNA 3'-end processing  
GO:0000292  P:RNA fragment catabolic process  
GO:0034475  P:U4 snRNA 3'-end processing  
GO:0034476  P:U5 snRNA 3'-end processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF00270  DEAD  
PF08148  DSHCT  
PF00271  Helicase_C  
PF13234  rRNA_proc-arch  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51192  HELICASE_ATP_BIND_1  
PS51194  HELICASE_CTER  
CDD cd18024  DEXHc_Mtr4-like  
cd18795  SF2_C_Ski2  
Amino Acid Sequences MDDDLFGVFSETPANLPVKKSNDKPTEQKQPKKRPAPSQNNNKKDKKQDKLEKNEKRKNPVVSDAVEIEASREVAPSAGLMAAKEEESKLKLKHQVRHQVAIPPDFPYVPIGEHVRTNEARTYPFTLDPFQDTAISCIDRNESVLVSAHTSAGKTVVAEYAIAQSLREKQRVIYTSPIKALSNQKYRELLAEFGDVGLMTGDVTINPDAGCLVMTTEILRSMLYRGSEVMREVAWVIFDEVHYMRDKNRGVVWEETIILLPDKVHHVFLSATIPNAMEFAEWVVKTHNQPCHVVYTDFRPTPLQHYLFPAAGDGIHLVVDEKGTFREENFQKAMSSISNNIGDDPASAEASKSKKKGETYKGGVKDGKSDIYKIVKMIYMKRYNPVIVFSFSKRDCESLALKMSKLDFNTDEERSALTKVFENAIDVLPEADRELPQIKNILPLLRRGIGIHHSGLLPILKEVIELLFQEGLLKVLFATETFSIGLNMPAKTVVFTSVRKWDGLGFRWVSGGEYIQMSGRAGRRGLDDRGIVIMMIDEKMEPQVAKGMVKGQADRLDSAFHLGYNMILNLMRVEGISPQFMLQNSFYQFQNAASVPKLEQHLQQLTLDYNDVKVDDEFHVKEYYDLKMQLEGYQENVRQVVTHPGHILPFLQPGRVIKIKIGEFDYGWGMVASFTKRSNKRDPSQAYTDHELYLVSVFVCTMFVDAPVNLIKSFNPVFPEGIRPSNEGEKLRAEYIPITLDSIQAISSVRLKVPDDFKSSTAKRNLVRTLRDLPKKLPDGIPTMDPVESMKIDDPEFKMLLRKIDVLESKLATNPLHESDRINDLYAKYSHKVDIETKIAETKDKILQAQAVIQLDDLKHRRRVLRKLGFVTPDEIIELKGRVACEISTGDELLLTELIFNGTFNDLLPEQCAALLSCFVFQERAKEVPRLKPELAEPLKAMQDMAGKIAKVFKESKIEIAEKEYVELFRPELMEVTYAWCKGAKFAQICKMTDVYEGSLIRTFKRLEEMIRQMIQAAKTIGNLELEDKMEKATEMVHRDIVSAASLYL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.17
3 0.21
4 0.28
5 0.34
6 0.42
7 0.49
8 0.56
9 0.62
10 0.67
11 0.72
12 0.74
13 0.78
14 0.8
15 0.83
16 0.84
17 0.86
18 0.9
19 0.91
20 0.91
21 0.9
22 0.91
23 0.92
24 0.92
25 0.92
26 0.92
27 0.92
28 0.92
29 0.9
30 0.88
31 0.88
32 0.88
33 0.86
34 0.87
35 0.88
36 0.89
37 0.91
38 0.93
39 0.93
40 0.93
41 0.93
42 0.9
43 0.89
44 0.86
45 0.83
46 0.78
47 0.75
48 0.7
49 0.62
50 0.58
51 0.5
52 0.43
53 0.35
54 0.28
55 0.21
56 0.17
57 0.15
58 0.11
59 0.1
60 0.09
61 0.09
62 0.09
63 0.08
64 0.07
65 0.08
66 0.08
67 0.07
68 0.09
69 0.1
70 0.11
71 0.12
72 0.12
73 0.14
74 0.17
75 0.23
76 0.24
77 0.3
78 0.39
79 0.45
80 0.53
81 0.6
82 0.68
83 0.68
84 0.72
85 0.68
86 0.65
87 0.63
88 0.6
89 0.51
90 0.43
91 0.38
92 0.32
93 0.29
94 0.24
95 0.19
96 0.15
97 0.18
98 0.19
99 0.18
100 0.21
101 0.23
102 0.27
103 0.27
104 0.3
105 0.31
106 0.3
107 0.31
108 0.32
109 0.36
110 0.32
111 0.34
112 0.33
113 0.31
114 0.31
115 0.32
116 0.3
117 0.26
118 0.25
119 0.22
120 0.21
121 0.21
122 0.2
123 0.17
124 0.17
125 0.18
126 0.16
127 0.17
128 0.17
129 0.14
130 0.13
131 0.15
132 0.14
133 0.14
134 0.14
135 0.14
136 0.13
137 0.13
138 0.12
139 0.12
140 0.11
141 0.09
142 0.09
143 0.09
144 0.09
145 0.09
146 0.09
147 0.11
148 0.12
149 0.12
150 0.11
151 0.12
152 0.21
153 0.27
154 0.28
155 0.27
156 0.27
157 0.36
158 0.39
159 0.4
160 0.41
161 0.41
162 0.43
163 0.45
164 0.45
165 0.37
166 0.4
167 0.46
168 0.46
169 0.5
170 0.48
171 0.5
172 0.5
173 0.5
174 0.49
175 0.41
176 0.33
177 0.26
178 0.25
179 0.2
180 0.17
181 0.16
182 0.12
183 0.09
184 0.08
185 0.05
186 0.03
187 0.04
188 0.04
189 0.04
190 0.06
191 0.06
192 0.07
193 0.07
194 0.07
195 0.07
196 0.07
197 0.07
198 0.05
199 0.05
200 0.05
201 0.05
202 0.06
203 0.06
204 0.07
205 0.07
206 0.07
207 0.07
208 0.08
209 0.11
210 0.11
211 0.11
212 0.12
213 0.13
214 0.15
215 0.15
216 0.15
217 0.12
218 0.12
219 0.12
220 0.11
221 0.09
222 0.09
223 0.09
224 0.08
225 0.08
226 0.11
227 0.1
228 0.12
229 0.13
230 0.14
231 0.15
232 0.22
233 0.23
234 0.23
235 0.26
236 0.27
237 0.29
238 0.31
239 0.32
240 0.26
241 0.25
242 0.22
243 0.19
244 0.17
245 0.13
246 0.1
247 0.08
248 0.08
249 0.11
250 0.12
251 0.13
252 0.12
253 0.13
254 0.13
255 0.14
256 0.18
257 0.14
258 0.13
259 0.13
260 0.13
261 0.12
262 0.12
263 0.11
264 0.05
265 0.05
266 0.06
267 0.09
268 0.09
269 0.1
270 0.12
271 0.15
272 0.19
273 0.26
274 0.29
275 0.28
276 0.3
277 0.31
278 0.34
279 0.33
280 0.31
281 0.26
282 0.28
283 0.32
284 0.3
285 0.3
286 0.27
287 0.26
288 0.3
289 0.36
290 0.32
291 0.26
292 0.3
293 0.32
294 0.3
295 0.28
296 0.23
297 0.16
298 0.13
299 0.12
300 0.07
301 0.05
302 0.04
303 0.04
304 0.05
305 0.05
306 0.05
307 0.05
308 0.05
309 0.06
310 0.08
311 0.09
312 0.09
313 0.19
314 0.2
315 0.25
316 0.26
317 0.26
318 0.24
319 0.24
320 0.25
321 0.17
322 0.17
323 0.14
324 0.16
325 0.17
326 0.17
327 0.17
328 0.16
329 0.14
330 0.12
331 0.12
332 0.09
333 0.08
334 0.07
335 0.07
336 0.11
337 0.16
338 0.21
339 0.22
340 0.25
341 0.29
342 0.35
343 0.44
344 0.49
345 0.54
346 0.56
347 0.62
348 0.62
349 0.62
350 0.58
351 0.49
352 0.46
353 0.38
354 0.35
355 0.27
356 0.25
357 0.25
358 0.26
359 0.27
360 0.22
361 0.21
362 0.19
363 0.21
364 0.26
365 0.31
366 0.34
367 0.34
368 0.38
369 0.38
370 0.37
371 0.36
372 0.33
373 0.26
374 0.21
375 0.23
376 0.21
377 0.25
378 0.24
379 0.26
380 0.24
381 0.23
382 0.21
383 0.22
384 0.23
385 0.2
386 0.26
387 0.24
388 0.23
389 0.24
390 0.25
391 0.23
392 0.21
393 0.2
394 0.15
395 0.18
396 0.22
397 0.21
398 0.2
399 0.18
400 0.19
401 0.17
402 0.17
403 0.13
404 0.1
405 0.11
406 0.11
407 0.12
408 0.11
409 0.11
410 0.12
411 0.11
412 0.1
413 0.08
414 0.08
415 0.07
416 0.07
417 0.06
418 0.06
419 0.05
420 0.07
421 0.1
422 0.1
423 0.1
424 0.13
425 0.12
426 0.15
427 0.16
428 0.19
429 0.17
430 0.19
431 0.21
432 0.2
433 0.2
434 0.17
435 0.18
436 0.17
437 0.18
438 0.16
439 0.14
440 0.13
441 0.12
442 0.13
443 0.11
444 0.08
445 0.06
446 0.06
447 0.05
448 0.05
449 0.05
450 0.05
451 0.05
452 0.05
453 0.06
454 0.05
455 0.05
456 0.06
457 0.05
458 0.06
459 0.05
460 0.05
461 0.04
462 0.04
463 0.04
464 0.03
465 0.05
466 0.05
467 0.06
468 0.06
469 0.07
470 0.07
471 0.07
472 0.1
473 0.1
474 0.09
475 0.09
476 0.09
477 0.08
478 0.08
479 0.08
480 0.09
481 0.09
482 0.11
483 0.13
484 0.19
485 0.2
486 0.19
487 0.2
488 0.21
489 0.22
490 0.23
491 0.25
492 0.2
493 0.19
494 0.2
495 0.19
496 0.16
497 0.13
498 0.11
499 0.06
500 0.06
501 0.06
502 0.06
503 0.06
504 0.06
505 0.08
506 0.1
507 0.1
508 0.1
509 0.11
510 0.14
511 0.17
512 0.18
513 0.17
514 0.16
515 0.15
516 0.15
517 0.14
518 0.11
519 0.08
520 0.06
521 0.04
522 0.04
523 0.04
524 0.03
525 0.04
526 0.04
527 0.05
528 0.04
529 0.04
530 0.07
531 0.08
532 0.08
533 0.09
534 0.11
535 0.15
536 0.16
537 0.16
538 0.15
539 0.18
540 0.19
541 0.19
542 0.17
543 0.14
544 0.13
545 0.15
546 0.12
547 0.08
548 0.08
549 0.07
550 0.07
551 0.06
552 0.06
553 0.05
554 0.05
555 0.05
556 0.04
557 0.05
558 0.04
559 0.04
560 0.04
561 0.06
562 0.06
563 0.07
564 0.07
565 0.07
566 0.08
567 0.09
568 0.1
569 0.09
570 0.12
571 0.14
572 0.16
573 0.15
574 0.15
575 0.15
576 0.13
577 0.15
578 0.13
579 0.12
580 0.1
581 0.11
582 0.11
583 0.13
584 0.14
585 0.13
586 0.15
587 0.18
588 0.2
589 0.2
590 0.2
591 0.18
592 0.17
593 0.16
594 0.14
595 0.1
596 0.08
597 0.07
598 0.07
599 0.07
600 0.07
601 0.08
602 0.09
603 0.12
604 0.12
605 0.14
606 0.15
607 0.14
608 0.16
609 0.15
610 0.15
611 0.15
612 0.15
613 0.14
614 0.15
615 0.15
616 0.16
617 0.16
618 0.15
619 0.15
620 0.18
621 0.18
622 0.16
623 0.16
624 0.14
625 0.12
626 0.13
627 0.2
628 0.17
629 0.18
630 0.18
631 0.19
632 0.19
633 0.19
634 0.19
635 0.1
636 0.15
637 0.14
638 0.13
639 0.14
640 0.15
641 0.2
642 0.21
643 0.21
644 0.16
645 0.21
646 0.22
647 0.23
648 0.25
649 0.21
650 0.18
651 0.19
652 0.18
653 0.12
654 0.12
655 0.09
656 0.07
657 0.06
658 0.08
659 0.07
660 0.08
661 0.11
662 0.2
663 0.25
664 0.32
665 0.41
666 0.48
667 0.52
668 0.61
669 0.64
670 0.62
671 0.63
672 0.61
673 0.56
674 0.52
675 0.48
676 0.38
677 0.32
678 0.25
679 0.2
680 0.15
681 0.11
682 0.06
683 0.05
684 0.04
685 0.04
686 0.05
687 0.04
688 0.04
689 0.04
690 0.05
691 0.06
692 0.06
693 0.07
694 0.08
695 0.09
696 0.08
697 0.09
698 0.09
699 0.12
700 0.14
701 0.14
702 0.15
703 0.16
704 0.17
705 0.18
706 0.23
707 0.21
708 0.24
709 0.24
710 0.23
711 0.25
712 0.29
713 0.32
714 0.27
715 0.27
716 0.26
717 0.26
718 0.26
719 0.24
720 0.2
721 0.16
722 0.16
723 0.16
724 0.13
725 0.13
726 0.11
727 0.11
728 0.1
729 0.1
730 0.08
731 0.07
732 0.08
733 0.07
734 0.1
735 0.11
736 0.11
737 0.13
738 0.14
739 0.19
740 0.24
741 0.28
742 0.3
743 0.31
744 0.32
745 0.39
746 0.4
747 0.43
748 0.44
749 0.45
750 0.42
751 0.47
752 0.54
753 0.52
754 0.53
755 0.51
756 0.55
757 0.58
758 0.61
759 0.58
760 0.53
761 0.55
762 0.55
763 0.53
764 0.47
765 0.41
766 0.39
767 0.38
768 0.35
769 0.28
770 0.26
771 0.22
772 0.19
773 0.17
774 0.14
775 0.12
776 0.12
777 0.13
778 0.13
779 0.14
780 0.18
781 0.19
782 0.2
783 0.2
784 0.19
785 0.22
786 0.22
787 0.25
788 0.23
789 0.24
790 0.21
791 0.27
792 0.29
793 0.26
794 0.27
795 0.25
796 0.24
797 0.23
798 0.25
799 0.18
800 0.18
801 0.18
802 0.18
803 0.2
804 0.2
805 0.2
806 0.21
807 0.27
808 0.26
809 0.25
810 0.24
811 0.22
812 0.25
813 0.26
814 0.28
815 0.23
816 0.25
817 0.26
818 0.25
819 0.27
820 0.27
821 0.3
822 0.3
823 0.29
824 0.28
825 0.3
826 0.29
827 0.28
828 0.25
829 0.24
830 0.24
831 0.26
832 0.25
833 0.23
834 0.25
835 0.23
836 0.25
837 0.25
838 0.21
839 0.18
840 0.18
841 0.18
842 0.16
843 0.23
844 0.25
845 0.27
846 0.32
847 0.37
848 0.45
849 0.51
850 0.61
851 0.64
852 0.69
853 0.72
854 0.72
855 0.73
856 0.68
857 0.61
858 0.54
859 0.44
860 0.34
861 0.27
862 0.22
863 0.16
864 0.14
865 0.13
866 0.11
867 0.13
868 0.12
869 0.12
870 0.13
871 0.12
872 0.12
873 0.13
874 0.14
875 0.14
876 0.14
877 0.13
878 0.12
879 0.12
880 0.11
881 0.1
882 0.07
883 0.06
884 0.05
885 0.06
886 0.06
887 0.06
888 0.06
889 0.07
890 0.07
891 0.07
892 0.11
893 0.1
894 0.11
895 0.12
896 0.12
897 0.11
898 0.11
899 0.11
900 0.09
901 0.09
902 0.1
903 0.09
904 0.1
905 0.1
906 0.11
907 0.14
908 0.14
909 0.18
910 0.21
911 0.26
912 0.28
913 0.35
914 0.4
915 0.45
916 0.52
917 0.54
918 0.51
919 0.48
920 0.48
921 0.52
922 0.49
923 0.43
924 0.37
925 0.34
926 0.35
927 0.31
928 0.29
929 0.2
930 0.22
931 0.19
932 0.22
933 0.2
934 0.18
935 0.19
936 0.25
937 0.23
938 0.23
939 0.26
940 0.27
941 0.33
942 0.34
943 0.39
944 0.4
945 0.42
946 0.39
947 0.41
948 0.41
949 0.33
950 0.33
951 0.29
952 0.24
953 0.24
954 0.23
955 0.19
956 0.16
957 0.17
958 0.16
959 0.15
960 0.15
961 0.13
962 0.12
963 0.17
964 0.18
965 0.17
966 0.18
967 0.19
968 0.18
969 0.2
970 0.25
971 0.28
972 0.3
973 0.36
974 0.45
975 0.49
976 0.5
977 0.51
978 0.48
979 0.4
980 0.38
981 0.34
982 0.27
983 0.26
984 0.25
985 0.23
986 0.26
987 0.26
988 0.24
989 0.27
990 0.26
991 0.22
992 0.29
993 0.29
994 0.3
995 0.39
996 0.45
997 0.47
998 0.48
999 0.46
1000 0.41
1001 0.43
1002 0.38
1003 0.32
1004 0.27
1005 0.21
1006 0.2
1007 0.22
1008 0.21
1009 0.18
1010 0.18
1011 0.17
1012 0.17
1013 0.18
1014 0.18
1015 0.17
1016 0.16
1017 0.15
1018 0.15
1019 0.13
1020 0.15
1021 0.2
1022 0.24
1023 0.26
1024 0.29
1025 0.29
1026 0.3
1027 0.3
1028 0.25
1029 0.2