Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

V5IR20

Protein Details
Accession V5IR20    Localization Confidence High Confidence Score 20.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
9-31CGDVVTKKKLDPHRQRCWGANFTHydrophilic
59-81GALYRPKKGKGPQNQNQNQNQNPHydrophilic
184-214TPAPKKKSKDGEKEVKKDKKRKRELHIETDHBasic
250-270TPASPLKKSKHSKHHKSESLGHydrophilic
278-301AGSKLKKSKSSKTKESKDTKEGKEBasic
304-327SSSASPSSKKHKHSHSKSLEVPKEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
186-206APKKKSKDGEKEVKKDKKRKR
280-319SKLKKSKSSKTKESKDTKEGKEKKSSSASPSSKKHKHSHS
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 12.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039999  LYAR  
IPR014898  Znf_C2H2_LYAR  
IPR036236  Znf_C2H2_sf  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0000122  P:negative regulation of transcription by RNA polymerase II  
GO:0006364  P:rRNA processing  
KEGG ncr:NCU03274  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08790  zf-LYAR  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51804  ZF_C2HC_LYAR  
Amino Acid Sequences MVSFSCEVCGDVVTKKKLDPHRQRCWGANFTCIDCMTHFPGTEYRSHTSCMTEEQKYQGALYRPKKGKGPQNQNQNQNQNPNQNRNQNNVQAMAQPAYVEEVAEDFDTWRQHDNNGNAAAQAPTPPSATEAPVNVFDYMVNPTPTTSRVSVAEEQPGQTESNEMVRYESKTKESTENAVVHHETPAPKKKSKDGEKEVKKDKKRKRELHIETDHPMTDAPPVLHSGLTGGISRMMSRPDVFPPSPESAETPASPLKKSKHSKHHKSESLGNSLMAMIAGSKLKKSKSSKTKESKDTKEGKEKKSSSASPSSKKHKHSHSKSLEVPKEQKMIEYTPGSKDGAVDKDKDNQVVIFQPRAERFLSFVNKGPESDKGVSLNKALKRYHRERSASGTSVSKLAEEKELWRSLRMRRNDRGEIVLFCV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.32
3 0.4
4 0.49
5 0.58
6 0.64
7 0.67
8 0.73
9 0.81
10 0.83
11 0.83
12 0.81
13 0.79
14 0.69
15 0.65
16 0.57
17 0.5
18 0.48
19 0.4
20 0.34
21 0.26
22 0.29
23 0.27
24 0.26
25 0.24
26 0.23
27 0.27
28 0.28
29 0.32
30 0.33
31 0.32
32 0.31
33 0.34
34 0.32
35 0.3
36 0.29
37 0.32
38 0.32
39 0.32
40 0.33
41 0.35
42 0.37
43 0.34
44 0.34
45 0.31
46 0.33
47 0.39
48 0.43
49 0.49
50 0.51
51 0.54
52 0.61
53 0.63
54 0.66
55 0.67
56 0.72
57 0.69
58 0.76
59 0.8
60 0.82
61 0.83
62 0.82
63 0.77
64 0.75
65 0.73
66 0.72
67 0.72
68 0.72
69 0.71
70 0.71
71 0.7
72 0.67
73 0.67
74 0.63
75 0.58
76 0.51
77 0.44
78 0.37
79 0.35
80 0.29
81 0.22
82 0.16
83 0.13
84 0.13
85 0.12
86 0.09
87 0.07
88 0.06
89 0.07
90 0.07
91 0.08
92 0.06
93 0.09
94 0.1
95 0.12
96 0.15
97 0.15
98 0.18
99 0.25
100 0.27
101 0.3
102 0.31
103 0.3
104 0.26
105 0.26
106 0.23
107 0.17
108 0.15
109 0.11
110 0.1
111 0.1
112 0.1
113 0.12
114 0.12
115 0.14
116 0.14
117 0.14
118 0.15
119 0.16
120 0.18
121 0.15
122 0.14
123 0.12
124 0.11
125 0.13
126 0.14
127 0.13
128 0.11
129 0.12
130 0.13
131 0.14
132 0.16
133 0.14
134 0.14
135 0.15
136 0.19
137 0.22
138 0.23
139 0.26
140 0.23
141 0.23
142 0.22
143 0.21
144 0.17
145 0.14
146 0.13
147 0.09
148 0.12
149 0.13
150 0.12
151 0.13
152 0.14
153 0.17
154 0.2
155 0.21
156 0.2
157 0.22
158 0.24
159 0.27
160 0.27
161 0.28
162 0.29
163 0.29
164 0.27
165 0.28
166 0.26
167 0.22
168 0.21
169 0.2
170 0.17
171 0.21
172 0.3
173 0.32
174 0.35
175 0.37
176 0.43
177 0.51
178 0.59
179 0.63
180 0.63
181 0.68
182 0.73
183 0.79
184 0.81
185 0.8
186 0.79
187 0.79
188 0.79
189 0.79
190 0.81
191 0.82
192 0.8
193 0.82
194 0.81
195 0.81
196 0.77
197 0.7
198 0.61
199 0.53
200 0.45
201 0.34
202 0.26
203 0.16
204 0.12
205 0.1
206 0.08
207 0.07
208 0.08
209 0.08
210 0.08
211 0.08
212 0.07
213 0.06
214 0.07
215 0.07
216 0.06
217 0.06
218 0.07
219 0.07
220 0.08
221 0.08
222 0.09
223 0.09
224 0.11
225 0.13
226 0.18
227 0.18
228 0.18
229 0.22
230 0.24
231 0.23
232 0.22
233 0.21
234 0.18
235 0.2
236 0.19
237 0.17
238 0.17
239 0.18
240 0.19
241 0.22
242 0.23
243 0.31
244 0.4
245 0.46
246 0.54
247 0.64
248 0.74
249 0.79
250 0.86
251 0.83
252 0.78
253 0.78
254 0.72
255 0.66
256 0.56
257 0.46
258 0.35
259 0.29
260 0.24
261 0.15
262 0.1
263 0.04
264 0.04
265 0.06
266 0.06
267 0.08
268 0.12
269 0.13
270 0.22
271 0.28
272 0.37
273 0.46
274 0.55
275 0.64
276 0.72
277 0.8
278 0.82
279 0.85
280 0.82
281 0.81
282 0.82
283 0.78
284 0.78
285 0.78
286 0.73
287 0.74
288 0.69
289 0.65
290 0.64
291 0.61
292 0.56
293 0.58
294 0.59
295 0.57
296 0.62
297 0.67
298 0.66
299 0.7
300 0.72
301 0.72
302 0.77
303 0.77
304 0.81
305 0.78
306 0.79
307 0.79
308 0.81
309 0.76
310 0.72
311 0.69
312 0.63
313 0.6
314 0.52
315 0.47
316 0.4
317 0.36
318 0.35
319 0.34
320 0.31
321 0.29
322 0.31
323 0.29
324 0.26
325 0.25
326 0.24
327 0.26
328 0.26
329 0.26
330 0.26
331 0.34
332 0.36
333 0.36
334 0.32
335 0.25
336 0.25
337 0.29
338 0.3
339 0.25
340 0.24
341 0.29
342 0.29
343 0.32
344 0.31
345 0.24
346 0.23
347 0.28
348 0.33
349 0.29
350 0.33
351 0.37
352 0.36
353 0.37
354 0.37
355 0.33
356 0.34
357 0.34
358 0.31
359 0.3
360 0.33
361 0.33
362 0.36
363 0.39
364 0.37
365 0.41
366 0.43
367 0.47
368 0.53
369 0.6
370 0.65
371 0.68
372 0.69
373 0.67
374 0.71
375 0.7
376 0.63
377 0.58
378 0.51
379 0.43
380 0.4
381 0.36
382 0.28
383 0.22
384 0.21
385 0.24
386 0.22
387 0.24
388 0.29
389 0.35
390 0.35
391 0.39
392 0.43
393 0.47
394 0.54
395 0.61
396 0.62
397 0.65
398 0.73
399 0.75
400 0.74
401 0.71
402 0.65