FuNGI

V5IN26

Protein Details

Accession

V5IN26

Localization Confidence

Low

Confidence Score

7.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1153-1175	TLPVSIRKFRRGRTRPTWEQGAW	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

cyto_nucl 10.333, cyto 10, nucl 9.5, cyto_pero 7.333, mito 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR018846 Cleavage/polyA-sp_fac_asu_N IPR015943 WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0005686 C:U2 snRNP GO:0030620 F:U2 snRNA binding GO:0000398 P:mRNA splicing, via spliceosome
KEGG	ncr:NCU05271 -
Pfam	View protein in Pfam PF10433 MMS1_N

Amino Acid Sequences

MATFRTNVLRNGEWVTETVNIQTIFKAKSAQGPKRAEQTETPVCGLLTRTVADSQMLKSVLPVRLRSPHHNDVAFIGHRSVQIREFQSNGQFRDILFRRFPHNIRNACVVGSFDIPDGVDDLNPAMDIEPPVKMEDQDVDLSPPSASTSQLPPQLLALAMENADVVFLWIGPGADGRPEFYSSTQFLFRRPPQFLNGNLGAHMAVDPSSRYMALSSYHGLFAVGELESLANFTQPQDENNVEIVKSWRLRSVQGVIQSLTFLYPRPEDKDHIILLLIVVNSGKSRMVIYEWTLGDDLATVFAEEKRGHRLPVENQMPQLLIPLTVGSAFIAISPEQVAVCTECLHGPPRFDTLELEAPPKSPNYYGTGKPLWTAWDRPYRLPRYLKGKDCLYLAREDGIVVYIEVDEDHALERSTFIDAFKCNISSAFAYLFDQYADVLVLGSDNGTGSVWKIPPRDHPLRIGTLPSGAPTLDFATTDSPSSGEKVPDPFGTSIAPSNDGQLRSPDRIFAASGHGLTGCITEYRHGLRADIGLELELEEGLKQAWLLNFSNTHGRYDLLWTTPTRSKVWQLPDDFSELIDPEPDQVLYDLSSPTLAVAQVNGVTVQVTTASITLFKNEAQSHADEWTRLSFDKLLPDQSQVSVSDACVTDDWITVSTHVGPQFRIYSFKFYDTAVVSQIQFDVPGDVTSLHHSQNLGIIVGLWKDGRPYLLIRSPTTETATQDIEEIDITERLVTSAGFTGYRDDVPLKAIGSIASVNNAILLGTRGGELIHISKEWKGTTMAYYQQLGLTAVNVTAARHSLTARPRVLVSCDQALIEVRLDEHGPNGSVHDLAKYRVMPVNAGDLGAPLPLVEYGVAIDIPCASEGFTPILMLAGSSAIIAELHQEPGPAHRYITIGKTPVKTFFSPNLRCLVVGVNEEGNKSTLMFMDPDTGKDIGRPSHKAGTPVQYIVGLGKPDDRIHGLAEWEYKKNNGTWRYLLVGTKQGQLIIVSTEKEPSNGDHPPSIKYWTRFKKNCDGPVYSVIGHEESVIYCVDQIVHWDVLDPVEKKLKPRKLCDLGSLALELHISGTKILALTWDGSLQMIDPALDDVIENSATLEFHDPRNVVPTSSMQIGSNVFLVADKDRGVGGLWQWSRTPGTHNWAEFRVLFEGTLPVSIRKFRRGRTRPTWEQGAWNAPKYGRLISTPNDAEMLGIAMDGTMYHFTLLDQHALRLLRFIVNLYNLRGKRDEERLLHAEPNLGPTEPSHVDGDVLKTLLDAEVLQELINTEELLARFKSLLDKLDGGKHTAEWMGEGTADQYFELAYNVLMYYLRQVY

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.27
2	0.25
3	0.21
4	0.2
5	0.19
6	0.2
7	0.19
8	0.18
9	0.2
10	0.22
11	0.21
12	0.22
13	0.25
14	0.21
15	0.3
16	0.4
17	0.47
18	0.51
19	0.57
20	0.61
21	0.66
22	0.67
23	0.62
24	0.56
25	0.56
26	0.55
27	0.52
28	0.48
29	0.39
30	0.37
31	0.34
32	0.31
33	0.25
34	0.19
35	0.17
36	0.17
37	0.17
38	0.18
39	0.19
40	0.2
41	0.18
42	0.21
43	0.21
44	0.18
45	0.2
46	0.26
47	0.3
48	0.32
49	0.33
50	0.33
51	0.42
52	0.48
53	0.54
54	0.56
55	0.59
56	0.61
57	0.6
58	0.55
59	0.49
60	0.5
61	0.43
62	0.36
63	0.29
64	0.24
65	0.26
66	0.27
67	0.27
68	0.23
69	0.28
70	0.31
71	0.33
72	0.33
73	0.34
74	0.41
75	0.45
76	0.44
77	0.41
78	0.37
79	0.34
80	0.42
81	0.42
82	0.39
83	0.38
84	0.38
85	0.41
86	0.49
87	0.52
88	0.51
89	0.57
90	0.55
91	0.55
92	0.59
93	0.53
94	0.45
95	0.43
96	0.35
97	0.27
98	0.24
99	0.2
100	0.14
101	0.13
102	0.13
103	0.12
104	0.12
105	0.1
106	0.08
107	0.08
108	0.08
109	0.08
110	0.08
111	0.08
112	0.06
113	0.08
114	0.09
115	0.1
116	0.11
117	0.12
118	0.14
119	0.15
120	0.14
121	0.14
122	0.16
123	0.18
124	0.19
125	0.19
126	0.19
127	0.18
128	0.19
129	0.17
130	0.14
131	0.14
132	0.12
133	0.13
134	0.14
135	0.19
136	0.24
137	0.29
138	0.29
139	0.27
140	0.27
141	0.27
142	0.24
143	0.19
144	0.15
145	0.11
146	0.1
147	0.1
148	0.09
149	0.07
150	0.07
151	0.06
152	0.05
153	0.04
154	0.04
155	0.04
156	0.05
157	0.05
158	0.05
159	0.06
160	0.06
161	0.09
162	0.09
163	0.11
164	0.13
165	0.15
166	0.16
167	0.17
168	0.22
169	0.2
170	0.23
171	0.28
172	0.26
173	0.27
174	0.35
175	0.41
176	0.44
177	0.47
178	0.47
179	0.47
180	0.52
181	0.51
182	0.5
183	0.47
184	0.4
185	0.35
186	0.32
187	0.26
188	0.2
189	0.18
190	0.1
191	0.07
192	0.07
193	0.07
194	0.08
195	0.09
196	0.09
197	0.09
198	0.09
199	0.1
200	0.11
201	0.14
202	0.15
203	0.15
204	0.15
205	0.15
206	0.15
207	0.13
208	0.11
209	0.1
210	0.07
211	0.06
212	0.06
213	0.06
214	0.05
215	0.07
216	0.06
217	0.05
218	0.06
219	0.06
220	0.11
221	0.12
222	0.14
223	0.18
224	0.19
225	0.2
226	0.23
227	0.23
228	0.18
229	0.19
230	0.2
231	0.22
232	0.24
233	0.23
234	0.26
235	0.26
236	0.29
237	0.32
238	0.34
239	0.32
240	0.34
241	0.35
242	0.3
243	0.29
244	0.27
245	0.23
246	0.18
247	0.14
248	0.1
249	0.1
250	0.13
251	0.16
252	0.22
253	0.25
254	0.27
255	0.32
256	0.36
257	0.33
258	0.31
259	0.28
260	0.22
261	0.19
262	0.18
263	0.13
264	0.08
265	0.07
266	0.07
267	0.07
268	0.08
269	0.08
270	0.06
271	0.07
272	0.07
273	0.09
274	0.11
275	0.14
276	0.2
277	0.2
278	0.21
279	0.2
280	0.19
281	0.17
282	0.15
283	0.12
284	0.07
285	0.07
286	0.05
287	0.06
288	0.07
289	0.1
290	0.11
291	0.12
292	0.2
293	0.21
294	0.22
295	0.24
296	0.3
297	0.32
298	0.41
299	0.45
300	0.39
301	0.39
302	0.39
303	0.36
304	0.3
305	0.27
306	0.16
307	0.1
308	0.09
309	0.08
310	0.07
311	0.07
312	0.07
313	0.05
314	0.05
315	0.04
316	0.04
317	0.06
318	0.05
319	0.06
320	0.06
321	0.07
322	0.06
323	0.07
324	0.07
325	0.07
326	0.08
327	0.08
328	0.08
329	0.09
330	0.1
331	0.15
332	0.16
333	0.17
334	0.18
335	0.21
336	0.21
337	0.21
338	0.21
339	0.21
340	0.26
341	0.25
342	0.25
343	0.22
344	0.22
345	0.22
346	0.22
347	0.18
348	0.13
349	0.14
350	0.18
351	0.22
352	0.23
353	0.29
354	0.3
355	0.29
356	0.28
357	0.27
358	0.25
359	0.24
360	0.25
361	0.26
362	0.33
363	0.35
364	0.4
365	0.49
366	0.5
367	0.54
368	0.56
369	0.56
370	0.57
371	0.62
372	0.63
373	0.59
374	0.57
375	0.51
376	0.48
377	0.46
378	0.37
379	0.32
380	0.26
381	0.21
382	0.19
383	0.16
384	0.14
385	0.11
386	0.09
387	0.06
388	0.06
389	0.05
390	0.05
391	0.05
392	0.05
393	0.04
394	0.04
395	0.05
396	0.05
397	0.05
398	0.05
399	0.06
400	0.06
401	0.08
402	0.08
403	0.08
404	0.1
405	0.11
406	0.13
407	0.13
408	0.13
409	0.12
410	0.12
411	0.13
412	0.11
413	0.12
414	0.11
415	0.1
416	0.11
417	0.11
418	0.11
419	0.09
420	0.08
421	0.07
422	0.06
423	0.06
424	0.04
425	0.04
426	0.03
427	0.03
428	0.03
429	0.03
430	0.03
431	0.03
432	0.03
433	0.03
434	0.03
435	0.04
436	0.08
437	0.1
438	0.13
439	0.16
440	0.17
441	0.25
442	0.34
443	0.4
444	0.39
445	0.43
446	0.43
447	0.45
448	0.43
449	0.37
450	0.29
451	0.24
452	0.22
453	0.17
454	0.14
455	0.1
456	0.09
457	0.08
458	0.09
459	0.07
460	0.07
461	0.08
462	0.09
463	0.1
464	0.1
465	0.09
466	0.09
467	0.09
468	0.11
469	0.12
470	0.11
471	0.12
472	0.14
473	0.16
474	0.16
475	0.19
476	0.17
477	0.16
478	0.15
479	0.14
480	0.15
481	0.13
482	0.15
483	0.12
484	0.14
485	0.17
486	0.17
487	0.17
488	0.19
489	0.21
490	0.22
491	0.22
492	0.21
493	0.18
494	0.18
495	0.18
496	0.14
497	0.15
498	0.13
499	0.13
500	0.12
501	0.11
502	0.1
503	0.1
504	0.09
505	0.06
506	0.05
507	0.05
508	0.06
509	0.08
510	0.1
511	0.14
512	0.14
513	0.14
514	0.14
515	0.15
516	0.15
517	0.13
518	0.12
519	0.07
520	0.07
521	0.07
522	0.06
523	0.04
524	0.04
525	0.03
526	0.03
527	0.03
528	0.03
529	0.03
530	0.05
531	0.05
532	0.08
533	0.09
534	0.11
535	0.11
536	0.13
537	0.2
538	0.19
539	0.2
540	0.17
541	0.17
542	0.16
543	0.18
544	0.19
545	0.13
546	0.14
547	0.14
548	0.18
549	0.21
550	0.23
551	0.21
552	0.22
553	0.24
554	0.28
555	0.34
556	0.36
557	0.35
558	0.34
559	0.33
560	0.35
561	0.31
562	0.25
563	0.19
564	0.13
565	0.11
566	0.09
567	0.08
568	0.05
569	0.06
570	0.06
571	0.05
572	0.05
573	0.05
574	0.05
575	0.06
576	0.06
577	0.05
578	0.05
579	0.05
580	0.05
581	0.05
582	0.05
583	0.04
584	0.04
585	0.04
586	0.04
587	0.04
588	0.04
589	0.04
590	0.04
591	0.04
592	0.04
593	0.03
594	0.03
595	0.03
596	0.04
597	0.04
598	0.05
599	0.06
600	0.07
601	0.07
602	0.07
603	0.11
604	0.11
605	0.13
606	0.13
607	0.14
608	0.14
609	0.16
610	0.16
611	0.12
612	0.13
613	0.12
614	0.11
615	0.1
616	0.1
617	0.1
618	0.1
619	0.15
620	0.15
621	0.17
622	0.17
623	0.19
624	0.18
625	0.17
626	0.17
627	0.13
628	0.13
629	0.1
630	0.09
631	0.1
632	0.09
633	0.09
634	0.08
635	0.09
636	0.08
637	0.08
638	0.08
639	0.07
640	0.07
641	0.07
642	0.07
643	0.07
644	0.08
645	0.1
646	0.1
647	0.1
648	0.11
649	0.13
650	0.13
651	0.16
652	0.15
653	0.19
654	0.19
655	0.21
656	0.2
657	0.18
658	0.2
659	0.17
660	0.17
661	0.13
662	0.13
663	0.11
664	0.11
665	0.11
666	0.08
667	0.07
668	0.06
669	0.06
670	0.05
671	0.05
672	0.05
673	0.05
674	0.06
675	0.09
676	0.1
677	0.1
678	0.11
679	0.11
680	0.11
681	0.12
682	0.12
683	0.09
684	0.07
685	0.07
686	0.07
687	0.07
688	0.07
689	0.05
690	0.04
691	0.05
692	0.05
693	0.06
694	0.06
695	0.08
696	0.11
697	0.15
698	0.18
699	0.18
700	0.21
701	0.22
702	0.22
703	0.24
704	0.21
705	0.18
706	0.18
707	0.18
708	0.15
709	0.13
710	0.12
711	0.09
712	0.08
713	0.07
714	0.06
715	0.05
716	0.05
717	0.05
718	0.05
719	0.05
720	0.05
721	0.04
722	0.04
723	0.05
724	0.06
725	0.06
726	0.06
727	0.08
728	0.09
729	0.09
730	0.09
731	0.09
732	0.09
733	0.1
734	0.11
735	0.09
736	0.08
737	0.08
738	0.07
739	0.08
740	0.08
741	0.07
742	0.07
743	0.07
744	0.06
745	0.06
746	0.06
747	0.05
748	0.04
749	0.05
750	0.04
751	0.04
752	0.04
753	0.04
754	0.04
755	0.05
756	0.05
757	0.06
758	0.06
759	0.07
760	0.07
761	0.09
762	0.11
763	0.11
764	0.11
765	0.11
766	0.11
767	0.13
768	0.15
769	0.17
770	0.17
771	0.17
772	0.16
773	0.15
774	0.15
775	0.14
776	0.11
777	0.08
778	0.06
779	0.05
780	0.06
781	0.06
782	0.05
783	0.05
784	0.06
785	0.06
786	0.07
787	0.08
788	0.12
789	0.17
790	0.24
791	0.24
792	0.25
793	0.25
794	0.26
795	0.29
796	0.27
797	0.24
798	0.19
799	0.19
800	0.17
801	0.17
802	0.17
803	0.13
804	0.1
805	0.08
806	0.06
807	0.07
808	0.08
809	0.07
810	0.07
811	0.07
812	0.08
813	0.08
814	0.08
815	0.08
816	0.08
817	0.08
818	0.1
819	0.1
820	0.1
821	0.13
822	0.12
823	0.14
824	0.16
825	0.17
826	0.15
827	0.15
828	0.18
829	0.15
830	0.15
831	0.13
832	0.1
833	0.1
834	0.09
835	0.08
836	0.03
837	0.04
838	0.03
839	0.04
840	0.03
841	0.03
842	0.03
843	0.04
844	0.04
845	0.04
846	0.04
847	0.04
848	0.04
849	0.04
850	0.04
851	0.04
852	0.05
853	0.06
854	0.07
855	0.07
856	0.07
857	0.06
858	0.07
859	0.06
860	0.05
861	0.04
862	0.03
863	0.03
864	0.03
865	0.03
866	0.03
867	0.03
868	0.03
869	0.05
870	0.06
871	0.07
872	0.08
873	0.08
874	0.08
875	0.12
876	0.16
877	0.14
878	0.13
879	0.14
880	0.15
881	0.17
882	0.21
883	0.2
884	0.21
885	0.24
886	0.27
887	0.27
888	0.3
889	0.33
890	0.3
891	0.31
892	0.35
893	0.41
894	0.41
895	0.41
896	0.4
897	0.36
898	0.35
899	0.32
900	0.26
901	0.19
902	0.17
903	0.16
904	0.15
905	0.15
906	0.16
907	0.16
908	0.14
909	0.11
910	0.1
911	0.1
912	0.08
913	0.08
914	0.09
915	0.08
916	0.14
917	0.14
918	0.15
919	0.17
920	0.17
921	0.16
922	0.17
923	0.19
924	0.18
925	0.23
926	0.25
927	0.27
928	0.34
929	0.36
930	0.37
931	0.39
932	0.4
933	0.38
934	0.35
935	0.31
936	0.24
937	0.22
938	0.2
939	0.18
940	0.11
941	0.09
942	0.11
943	0.13
944	0.13
945	0.15
946	0.15
947	0.14
948	0.16
949	0.16
950	0.15
951	0.15
952	0.21
953	0.22
954	0.22
955	0.22
956	0.22
957	0.23
958	0.25
959	0.32
960	0.3
961	0.32
962	0.32
963	0.34
964	0.36
965	0.36
966	0.34
967	0.28
968	0.3
969	0.27
970	0.28
971	0.26
972	0.23
973	0.21
974	0.19
975	0.18
976	0.13
977	0.12
978	0.11
979	0.11
980	0.14
981	0.13
982	0.14
983	0.14
984	0.15
985	0.18
986	0.2
987	0.22
988	0.24
989	0.25
990	0.27
991	0.27
992	0.31
993	0.32
994	0.32
995	0.41
996	0.46
997	0.56
998	0.59
999	0.64
1000	0.69
1001	0.72
1002	0.76
1003	0.71
1004	0.66
1005	0.59
1006	0.59
1007	0.55
1008	0.45
1009	0.37
1010	0.3
1011	0.24
1012	0.19
1013	0.15
1014	0.11
1015	0.08
1016	0.09
1017	0.08
1018	0.07
1019	0.06
1020	0.06
1021	0.07
1022	0.06
1023	0.09
1024	0.11
1025	0.11
1026	0.11
1027	0.12
1028	0.12
1029	0.13
1030	0.18
1031	0.16
1032	0.16
1033	0.23
1034	0.25
1035	0.32
1036	0.41
1037	0.49
1038	0.52
1039	0.58
1040	0.66
1041	0.67
1042	0.68
1043	0.66
1044	0.61
1045	0.53
1046	0.46
1047	0.4
1048	0.29
1049	0.21
1050	0.18
1051	0.12
1052	0.08
1053	0.08
1054	0.07
1055	0.06
1056	0.06
1057	0.07
1058	0.07
1059	0.07
1060	0.07
1061	0.07
1062	0.08
1063	0.09
1064	0.09
1065	0.08
1066	0.09
1067	0.09
1068	0.08
1069	0.07
1070	0.06
1071	0.06
1072	0.06
1073	0.06
1074	0.06
1075	0.06
1076	0.05
1077	0.05
1078	0.07
1079	0.07
1080	0.06
1081	0.06
1082	0.07
1083	0.07
1084	0.08
1085	0.13
1086	0.13
1087	0.15
1088	0.19
1089	0.19
1090	0.19
1091	0.25
1092	0.24
1093	0.2
1094	0.2
1095	0.21
1096	0.2
1097	0.23
1098	0.23
1099	0.18
1100	0.19
1101	0.19
1102	0.18
1103	0.16
1104	0.13
1105	0.1
1106	0.09
1107	0.11
1108	0.1
1109	0.11
1110	0.1
1111	0.1
1112	0.1
1113	0.11
1114	0.11
1115	0.12
1116	0.11
1117	0.19
1118	0.2
1119	0.21
1120	0.21
1121	0.23
1122	0.25
1123	0.24
1124	0.28
1125	0.24
1126	0.31
1127	0.35
1128	0.37
1129	0.38
1130	0.38
1131	0.4
1132	0.35
1133	0.32
1134	0.27
1135	0.22
1136	0.19
1137	0.16
1138	0.16
1139	0.13
1140	0.15
1141	0.13
1142	0.14
1143	0.16
1144	0.23
1145	0.26
1146	0.34
1147	0.4
1148	0.45
1149	0.56
1150	0.62
1151	0.7
1152	0.74
1153	0.8
1154	0.8
1155	0.81
1156	0.82
1157	0.72
1158	0.7
1159	0.64
1160	0.64
1161	0.57
1162	0.5
1163	0.47
1164	0.39
1165	0.4
1166	0.36
1167	0.35
1168	0.27
1169	0.26
1170	0.28
1171	0.28
1172	0.37
1173	0.34
1174	0.33
1175	0.3
1176	0.28
1177	0.24
1178	0.19
1179	0.17
1180	0.08
1181	0.06
1182	0.05
1183	0.04
1184	0.04
1185	0.04
1186	0.05
1187	0.06
1188	0.06
1189	0.06
1190	0.07
1191	0.07
1192	0.13
1193	0.14
1194	0.19
1195	0.18
1196	0.19
1197	0.23
1198	0.24
1199	0.24
1200	0.21
1201	0.21
1202	0.18
1203	0.17
1204	0.18
1205	0.18
1206	0.23
1207	0.25
1208	0.27
1209	0.35
1210	0.33
1211	0.37
1212	0.39
1213	0.38
1214	0.39
1215	0.45
1216	0.49
1217	0.43
1218	0.51
1219	0.51
1220	0.52
1221	0.51
1222	0.45
1223	0.42
1224	0.34
1225	0.34
1226	0.28
1227	0.23
1228	0.2
1229	0.18
1230	0.24
1231	0.21
1232	0.23
1233	0.2
1234	0.19
1235	0.2
1236	0.21
1237	0.24
1238	0.19
1239	0.18
1240	0.15
1241	0.13
1242	0.14
1243	0.12
1244	0.11
1245	0.08
1246	0.07
1247	0.08
1248	0.09
1249	0.08
1250	0.08
1251	0.09
1252	0.09
1253	0.1
1254	0.08
1255	0.07
1256	0.11
1257	0.11
1258	0.14
1259	0.14
1260	0.14
1261	0.14
1262	0.15
1263	0.21
1264	0.21
1265	0.24
1266	0.26
1267	0.29
1268	0.31
1269	0.39
1270	0.39
1271	0.36
1272	0.34
1273	0.3
1274	0.28
1275	0.27
1276	0.24
1277	0.17
1278	0.16
1279	0.14
1280	0.13
1281	0.13
1282	0.11
1283	0.11
1284	0.11
1285	0.09
1286	0.08
1287	0.08
1288	0.08
1289	0.09
1290	0.07
1291	0.06
1292	0.07
1293	0.07
1294	0.08
1295	0.08
1296	0.08

V5IN26

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer