FuNGI

V5IKM3

Protein Details

Accession

V5IKM3

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

14.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
82-106	ADQTPEAKPKRTRTRKAKTAEEDVV	Hydrophilic
130-155	EEAKVENKEPKKKRAGRPRIHIPEDG	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
90-97	PKRTRTRK
117-122	TRRKKA
132-185	AKVENKEPKKKRAGRPRIHIPEDGSAEALKLAAKLAKREAAAAAKKRPSLKPAK

Subcellular Location(s)

mito 21, mito_nucl 12.833, cyto_mito 12.333, nucl 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR001737 KsgA/Erm IPR023165 rRNA_Ade_diMease-like_C IPR029063 SAM-dependent_MTases_sf
Gene Ontology	GO:0034245 C:mitochondrial DNA-directed RNA polymerase complex GO:0005759 C:mitochondrial matrix GO:0008168 F:methyltransferase activity GO:0034246 F:mitochondrial transcription factor activity GO:0003723 F:RNA binding GO:0032259 P:methylation GO:0006364 P:rRNA processing GO:0006391 P:transcription initiation at mitochondrial promoter
KEGG	ncr:NCU17240 -
Pfam	View protein in Pfam PF00398 RrnaAD

Amino Acid Sequences

MLSRVRNNAVRRNFGLGQAPCISSIITTVTCPSTSGLSANSRVQQWHARRAYRSTQALEAKKPSAGQMMREAMGILQSVGAADQTPEAKPKRTRTRKAKTAEEDVVNQDETAEPKPTRRKKAADSAEDGEEAKVENKEPKKKRAGRPRIHIPEDGSAEALKLAAKLAKREAAAAAKKRPSLKPAKISRSDEQSMLRPCVDPMQERLYDTELWSWLDYGRTSKKGLAPAAVRKYDRTRVHVTSEKMVDDVLEYMKPTLTRHQGCDIIDLNPGAGVWSTKLNDLLKPRTHLLLEPDAGFYEPMLEPLLARDGSKLIAKDGLVWAELLSVLTPEYLPHQKEHHYSADDVPERNDTLLVTANLGSYPKRRYASFASATAMILYQFNHAIRSGALFQKYGLVRMLLWLDDEDKAAILPRMAQRRRRVAVDAELNCESITHVAGPDYSNIDPSKRLWFSRDINIDRSSALAALQRMREAGIQTPAGRETKILREVSQNSDSVVAAGETPITYDFRHQAEYEELLKDFEKGKIALASEEYKAMIRMRIQIDSANKRFSNIHNNMANFHRLVDEWRIAKAANDDKEIASIMERYKEWEKSFIALGSTACGDWFVQRDNLHLWKQKSMHWDRRAIEPLVIQSDEFFPHVPLSLLDIQPKAAHKVLRSMGPNTDRSGDMAEVLMRSIMAYTNSSMSKVLDRLAPGASEFVYPMCKSLVDPDRGGVPFPGAAEITVRGMSAWQFEDVLEQWMKWPFRPALQDLISQLSDEYVEAEGEEAKFGGVSPEF

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.53
2	0.55
3	0.46
4	0.44
5	0.4
6	0.38
7	0.31
8	0.3
9	0.26
10	0.17
11	0.17
12	0.15
13	0.12
14	0.12
15	0.14
16	0.16
17	0.16
18	0.17
19	0.16
20	0.16
21	0.16
22	0.17
23	0.18
24	0.21
25	0.25
26	0.29
27	0.31
28	0.31
29	0.32
30	0.35
31	0.41
32	0.42
33	0.49
34	0.53
35	0.55
36	0.57
37	0.63
38	0.67
39	0.66
40	0.66
41	0.58
42	0.58
43	0.61
44	0.62
45	0.61
46	0.58
47	0.51
48	0.47
49	0.44
50	0.38
51	0.38
52	0.35
53	0.32
54	0.34
55	0.36
56	0.35
57	0.34
58	0.32
59	0.23
60	0.22
61	0.19
62	0.11
63	0.07
64	0.06
65	0.06
66	0.06
67	0.06
68	0.05
69	0.05
70	0.07
71	0.09
72	0.1
73	0.18
74	0.21
75	0.29
76	0.36
77	0.46
78	0.56
79	0.65
80	0.75
81	0.79
82	0.87
83	0.88
84	0.88
85	0.88
86	0.84
87	0.81
88	0.77
89	0.7
90	0.62
91	0.56
92	0.51
93	0.41
94	0.33
95	0.25
96	0.2
97	0.19
98	0.18
99	0.2
100	0.18
101	0.25
102	0.36
103	0.45
104	0.54
105	0.6
106	0.64
107	0.67
108	0.77
109	0.79
110	0.76
111	0.73
112	0.67
113	0.6
114	0.54
115	0.46
116	0.35
117	0.25
118	0.19
119	0.15
120	0.13
121	0.13
122	0.2
123	0.28
124	0.38
125	0.45
126	0.54
127	0.63
128	0.71
129	0.8
130	0.83
131	0.86
132	0.86
133	0.88
134	0.9
135	0.89
136	0.83
137	0.76
138	0.68
139	0.63
140	0.56
141	0.46
142	0.36
143	0.26
144	0.22
145	0.18
146	0.15
147	0.09
148	0.06
149	0.07
150	0.09
151	0.11
152	0.14
153	0.17
154	0.21
155	0.21
156	0.22
157	0.24
158	0.29
159	0.35
160	0.39
161	0.43
162	0.44
163	0.48
164	0.52
165	0.52
166	0.52
167	0.55
168	0.57
169	0.6
170	0.65
171	0.7
172	0.73
173	0.77
174	0.73
175	0.71
176	0.64
177	0.57
178	0.5
179	0.47
180	0.43
181	0.39
182	0.35
183	0.27
184	0.26
185	0.28
186	0.28
187	0.24
188	0.24
189	0.27
190	0.28
191	0.28
192	0.29
193	0.26
194	0.24
195	0.23
196	0.21
197	0.16
198	0.16
199	0.15
200	0.14
201	0.12
202	0.13
203	0.12
204	0.16
205	0.2
206	0.21
207	0.22
208	0.26
209	0.29
210	0.33
211	0.34
212	0.34
213	0.34
214	0.4
215	0.45
216	0.46
217	0.43
218	0.41
219	0.46
220	0.49
221	0.48
222	0.46
223	0.46
224	0.45
225	0.51
226	0.53
227	0.5
228	0.46
229	0.44
230	0.38
231	0.31
232	0.28
233	0.21
234	0.15
235	0.14
236	0.09
237	0.07
238	0.07
239	0.08
240	0.09
241	0.1
242	0.11
243	0.16
244	0.24
245	0.26
246	0.29
247	0.32
248	0.35
249	0.34
250	0.37
251	0.32
252	0.24
253	0.23
254	0.2
255	0.15
256	0.12
257	0.11
258	0.07
259	0.06
260	0.05
261	0.05
262	0.07
263	0.08
264	0.09
265	0.13
266	0.13
267	0.17
268	0.22
269	0.28
270	0.28
271	0.31
272	0.32
273	0.3
274	0.3
275	0.28
276	0.27
277	0.25
278	0.23
279	0.21
280	0.2
281	0.18
282	0.17
283	0.15
284	0.11
285	0.09
286	0.07
287	0.07
288	0.08
289	0.07
290	0.07
291	0.08
292	0.1
293	0.08
294	0.08
295	0.08
296	0.08
297	0.09
298	0.11
299	0.11
300	0.09
301	0.1
302	0.1
303	0.11
304	0.11
305	0.11
306	0.09
307	0.09
308	0.08
309	0.06
310	0.06
311	0.05
312	0.04
313	0.03
314	0.03
315	0.03
316	0.03
317	0.03
318	0.07
319	0.12
320	0.13
321	0.15
322	0.17
323	0.2
324	0.23
325	0.27
326	0.27
327	0.24
328	0.25
329	0.25
330	0.3
331	0.29
332	0.27
333	0.24
334	0.21
335	0.2
336	0.18
337	0.16
338	0.09
339	0.08
340	0.1
341	0.09
342	0.08
343	0.08
344	0.08
345	0.08
346	0.08
347	0.08
348	0.1
349	0.12
350	0.16
351	0.18
352	0.18
353	0.22
354	0.28
355	0.34
356	0.33
357	0.32
358	0.29
359	0.28
360	0.27
361	0.23
362	0.17
363	0.1
364	0.07
365	0.06
366	0.06
367	0.07
368	0.07
369	0.07
370	0.07
371	0.07
372	0.07
373	0.08
374	0.1
375	0.11
376	0.12
377	0.11
378	0.11
379	0.16
380	0.16
381	0.15
382	0.13
383	0.11
384	0.1
385	0.11
386	0.12
387	0.07
388	0.07
389	0.06
390	0.07
391	0.07
392	0.07
393	0.06
394	0.05
395	0.05
396	0.06
397	0.06
398	0.05
399	0.08
400	0.12
401	0.22
402	0.26
403	0.33
404	0.39
405	0.47
406	0.49
407	0.48
408	0.46
409	0.39
410	0.41
411	0.43
412	0.38
413	0.33
414	0.31
415	0.29
416	0.26
417	0.23
418	0.17
419	0.09
420	0.08
421	0.05
422	0.05
423	0.05
424	0.05
425	0.06
426	0.07
427	0.09
428	0.08
429	0.11
430	0.11
431	0.12
432	0.12
433	0.13
434	0.2
435	0.19
436	0.2
437	0.21
438	0.27
439	0.29
440	0.36
441	0.42
442	0.38
443	0.4
444	0.4
445	0.38
446	0.31
447	0.28
448	0.21
449	0.13
450	0.11
451	0.09
452	0.09
453	0.11
454	0.12
455	0.12
456	0.11
457	0.12
458	0.13
459	0.11
460	0.12
461	0.12
462	0.13
463	0.13
464	0.14
465	0.16
466	0.15
467	0.14
468	0.13
469	0.13
470	0.17
471	0.23
472	0.23
473	0.23
474	0.28
475	0.31
476	0.36
477	0.36
478	0.3
479	0.25
480	0.25
481	0.23
482	0.17
483	0.14
484	0.08
485	0.06
486	0.05
487	0.05
488	0.04
489	0.04
490	0.05
491	0.06
492	0.06
493	0.08
494	0.12
495	0.13
496	0.15
497	0.15
498	0.16
499	0.17
500	0.2
501	0.2
502	0.18
503	0.17
504	0.16
505	0.16
506	0.16
507	0.15
508	0.14
509	0.14
510	0.13
511	0.14
512	0.15
513	0.15
514	0.14
515	0.15
516	0.16
517	0.14
518	0.15
519	0.14
520	0.12
521	0.13
522	0.13
523	0.13
524	0.12
525	0.18
526	0.19
527	0.2
528	0.21
529	0.24
530	0.3
531	0.37
532	0.39
533	0.38
534	0.36
535	0.37
536	0.39
537	0.39
538	0.42
539	0.37
540	0.42
541	0.4
542	0.41
543	0.41
544	0.41
545	0.39
546	0.29
547	0.25
548	0.18
549	0.14
550	0.17
551	0.19
552	0.21
553	0.2
554	0.2
555	0.2
556	0.19
557	0.2
558	0.24
559	0.26
560	0.24
561	0.26
562	0.27
563	0.26
564	0.27
565	0.26
566	0.19
567	0.13
568	0.13
569	0.12
570	0.14
571	0.14
572	0.18
573	0.22
574	0.27
575	0.28
576	0.3
577	0.3
578	0.29
579	0.3
580	0.27
581	0.23
582	0.19
583	0.17
584	0.13
585	0.13
586	0.1
587	0.09
588	0.08
589	0.08
590	0.08
591	0.11
592	0.12
593	0.15
594	0.16
595	0.18
596	0.23
597	0.28
598	0.33
599	0.37
600	0.37
601	0.4
602	0.42
603	0.44
604	0.49
605	0.54
606	0.58
607	0.58
608	0.63
609	0.59
610	0.65
611	0.66
612	0.57
613	0.49
614	0.41
615	0.37
616	0.32
617	0.31
618	0.22
619	0.18
620	0.18
621	0.17
622	0.16
623	0.14
624	0.11
625	0.11
626	0.12
627	0.11
628	0.1
629	0.14
630	0.18
631	0.19
632	0.21
633	0.21
634	0.21
635	0.24
636	0.25
637	0.24
638	0.23
639	0.24
640	0.23
641	0.3
642	0.33
643	0.36
644	0.38
645	0.37
646	0.41
647	0.43
648	0.44
649	0.39
650	0.38
651	0.32
652	0.3
653	0.3
654	0.22
655	0.17
656	0.16
657	0.15
658	0.12
659	0.12
660	0.1
661	0.07
662	0.07
663	0.07
664	0.07
665	0.08
666	0.09
667	0.1
668	0.14
669	0.15
670	0.16
671	0.16
672	0.16
673	0.18
674	0.18
675	0.19
676	0.18
677	0.19
678	0.2
679	0.2
680	0.19
681	0.16
682	0.16
683	0.15
684	0.12
685	0.11
686	0.11
687	0.14
688	0.13
689	0.14
690	0.14
691	0.13
692	0.13
693	0.22
694	0.3
695	0.3
696	0.31
697	0.31
698	0.36
699	0.36
700	0.37
701	0.28
702	0.21
703	0.18
704	0.17
705	0.18
706	0.12
707	0.11
708	0.12
709	0.12
710	0.12
711	0.12
712	0.11
713	0.09
714	0.1
715	0.11
716	0.13
717	0.13
718	0.12
719	0.12
720	0.13
721	0.16
722	0.15
723	0.2
724	0.17
725	0.16
726	0.19
727	0.26
728	0.27
729	0.26
730	0.32
731	0.29
732	0.35
733	0.42
734	0.42
735	0.44
736	0.45
737	0.47
738	0.41
739	0.43
740	0.37
741	0.31
742	0.27
743	0.19
744	0.16
745	0.13
746	0.12
747	0.08
748	0.08
749	0.08
750	0.08
751	0.1
752	0.1
753	0.1
754	0.09
755	0.08
756	0.08
757	0.08

V5IKM3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer