Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2P7YCJ6

Protein Details
Accession A0A2P7YCJ6    Localization Confidence High Confidence Score 15.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
106-133RLERQKEEAEQRKRQKTEKKSKLDEEIABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
116-125QRKRQKTEKK
393-397RELKR
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 12.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034482  Mrd1_RRM3  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR003954  RRM_dom_euk  
Gene Ontology GO:0030686  C:90S preribosome  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0032040  C:small-subunit processome  
GO:0042134  F:rRNA primary transcript binding  
GO:0000480  P:endonucleolytic cleavage in 5'-ETS of tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000447  P:endonucleolytic cleavage in ITS1 to separate SSU-rRNA from 5.8S rRNA and LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000472  P:endonucleolytic cleavage to generate mature 5'-end of SSU-rRNA from (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0034462  P:small-subunit processome assembly  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12565  RRM1_MRD1  
cd12568  RRM3_MRD1  
Amino Acid Sequences MSRLIVKGLPKYLTEDRLRKHFAAEGSVSDVKLMKKRNGESRQFAFIGYKSSEDAKKAAKFFNKTFIDTARIEVEVAKTWADPTVPQAVREKRRLAERRLMEQEERLERQKEEAEQRKRQKTEKKSKLDEEIAANPKLKEFIEATKPASQRQSWANDGADGLGAPSAKALETALAEQDGPKVDEEKYSVAQAQEAASDDEYDDFGKDEPEEDEPMMSLNDVKEGENAEEEAADDDLAKDENVSDLDWLKLRRIRMKENQPEEEETKEEQPVEKPQRVHKEPVQQKSEAEKIKETGRLFIRNILYDSTEDDFRELFSDYGPLEEVHIAIDTRTGKSKGFVYIQFVRNHDAVSAYNALDKQIFQGRLLHILAAEAKKDHRLDEFALKNLPLKKQRELKRKAQAGKSQFNWNSLYMNNDAVLESVAAKMGVSKLQLIDPQNSNSAVKQALAEAHVIGDVRKYFEDRGVDLTKFDQKERDDTTILVKNFPFGTTSAELGDLFAEYGQIKRILMPPAGTIAIVEFRDAPGARAAFTKLAYRMFKKSILYLEKGPRDLFVREPVAGESVDVEKPSEKAVEAKITADDVMGSEKRAESDVEDEIEGPTVSVFVKNLNFATTSAALTNLFKQIPDFVVATVKTKPDPKNQGSVLSMGFGFAEFKSKDAADKAIATLDGYNLEGHKIQLKLSHRKSGAKDTTAKSKKSSKIIIKNLPFEAARRDVLELFGAYGQIKSVRVPKKFDKSARGFAFVEYTLLKEAENAMDQLQGVHLLGRRLVMQYAEQDSEDAEEEIEKMTNKMRKQAASREVAALKMTGKGKVSLEDDEEDPFKEF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.5
2 0.53
3 0.53
4 0.6
5 0.65
6 0.59
7 0.55
8 0.52
9 0.45
10 0.44
11 0.41
12 0.33
13 0.34
14 0.35
15 0.32
16 0.28
17 0.29
18 0.26
19 0.3
20 0.35
21 0.35
22 0.42
23 0.49
24 0.59
25 0.66
26 0.7
27 0.73
28 0.71
29 0.71
30 0.63
31 0.57
32 0.5
33 0.41
34 0.37
35 0.3
36 0.26
37 0.21
38 0.26
39 0.29
40 0.27
41 0.3
42 0.32
43 0.38
44 0.41
45 0.46
46 0.49
47 0.53
48 0.54
49 0.6
50 0.56
51 0.53
52 0.52
53 0.47
54 0.45
55 0.38
56 0.38
57 0.3
58 0.27
59 0.24
60 0.22
61 0.21
62 0.18
63 0.19
64 0.16
65 0.14
66 0.15
67 0.16
68 0.15
69 0.13
70 0.14
71 0.23
72 0.23
73 0.25
74 0.34
75 0.42
76 0.49
77 0.56
78 0.57
79 0.52
80 0.62
81 0.68
82 0.67
83 0.68
84 0.66
85 0.68
86 0.7
87 0.7
88 0.61
89 0.58
90 0.58
91 0.55
92 0.53
93 0.49
94 0.44
95 0.4
96 0.42
97 0.42
98 0.41
99 0.45
100 0.51
101 0.55
102 0.62
103 0.72
104 0.77
105 0.79
106 0.81
107 0.8
108 0.81
109 0.83
110 0.84
111 0.84
112 0.83
113 0.83
114 0.83
115 0.78
116 0.7
117 0.64
118 0.62
119 0.57
120 0.5
121 0.46
122 0.38
123 0.34
124 0.32
125 0.27
126 0.21
127 0.19
128 0.22
129 0.28
130 0.31
131 0.34
132 0.39
133 0.4
134 0.41
135 0.44
136 0.38
137 0.35
138 0.39
139 0.41
140 0.37
141 0.4
142 0.37
143 0.31
144 0.31
145 0.27
146 0.2
147 0.13
148 0.1
149 0.07
150 0.06
151 0.05
152 0.05
153 0.05
154 0.05
155 0.06
156 0.06
157 0.06
158 0.07
159 0.08
160 0.09
161 0.09
162 0.09
163 0.09
164 0.11
165 0.11
166 0.11
167 0.11
168 0.12
169 0.12
170 0.14
171 0.16
172 0.17
173 0.17
174 0.18
175 0.19
176 0.17
177 0.18
178 0.17
179 0.15
180 0.12
181 0.12
182 0.12
183 0.1
184 0.1
185 0.1
186 0.09
187 0.1
188 0.09
189 0.08
190 0.07
191 0.07
192 0.08
193 0.08
194 0.08
195 0.09
196 0.11
197 0.13
198 0.12
199 0.12
200 0.11
201 0.12
202 0.11
203 0.09
204 0.08
205 0.06
206 0.09
207 0.09
208 0.1
209 0.1
210 0.12
211 0.12
212 0.12
213 0.12
214 0.1
215 0.09
216 0.09
217 0.08
218 0.07
219 0.06
220 0.05
221 0.05
222 0.06
223 0.06
224 0.06
225 0.05
226 0.05
227 0.06
228 0.06
229 0.06
230 0.07
231 0.07
232 0.09
233 0.12
234 0.12
235 0.16
236 0.18
237 0.22
238 0.29
239 0.34
240 0.41
241 0.48
242 0.59
243 0.64
244 0.68
245 0.7
246 0.65
247 0.65
248 0.58
249 0.5
250 0.42
251 0.34
252 0.29
253 0.25
254 0.22
255 0.19
256 0.19
257 0.27
258 0.31
259 0.34
260 0.35
261 0.41
262 0.51
263 0.53
264 0.57
265 0.53
266 0.57
267 0.61
268 0.66
269 0.63
270 0.54
271 0.52
272 0.51
273 0.52
274 0.45
275 0.39
276 0.32
277 0.3
278 0.33
279 0.36
280 0.31
281 0.3
282 0.3
283 0.32
284 0.31
285 0.35
286 0.33
287 0.29
288 0.3
289 0.24
290 0.21
291 0.17
292 0.19
293 0.15
294 0.14
295 0.13
296 0.12
297 0.11
298 0.1
299 0.11
300 0.1
301 0.08
302 0.07
303 0.08
304 0.08
305 0.08
306 0.09
307 0.07
308 0.07
309 0.07
310 0.07
311 0.06
312 0.06
313 0.06
314 0.05
315 0.08
316 0.09
317 0.09
318 0.13
319 0.14
320 0.13
321 0.15
322 0.17
323 0.18
324 0.2
325 0.2
326 0.23
327 0.3
328 0.35
329 0.36
330 0.35
331 0.34
332 0.31
333 0.3
334 0.24
335 0.18
336 0.13
337 0.12
338 0.13
339 0.1
340 0.11
341 0.11
342 0.11
343 0.11
344 0.1
345 0.1
346 0.14
347 0.14
348 0.13
349 0.17
350 0.17
351 0.2
352 0.2
353 0.18
354 0.12
355 0.12
356 0.14
357 0.11
358 0.11
359 0.08
360 0.09
361 0.13
362 0.13
363 0.14
364 0.12
365 0.14
366 0.16
367 0.23
368 0.24
369 0.22
370 0.22
371 0.21
372 0.24
373 0.25
374 0.28
375 0.28
376 0.3
377 0.35
378 0.43
379 0.52
380 0.59
381 0.63
382 0.66
383 0.68
384 0.73
385 0.73
386 0.71
387 0.69
388 0.66
389 0.65
390 0.58
391 0.58
392 0.51
393 0.47
394 0.42
395 0.35
396 0.29
397 0.23
398 0.23
399 0.15
400 0.14
401 0.12
402 0.1
403 0.09
404 0.08
405 0.08
406 0.05
407 0.05
408 0.04
409 0.04
410 0.04
411 0.04
412 0.04
413 0.04
414 0.05
415 0.05
416 0.06
417 0.06
418 0.07
419 0.11
420 0.12
421 0.15
422 0.16
423 0.17
424 0.18
425 0.18
426 0.18
427 0.15
428 0.15
429 0.11
430 0.1
431 0.09
432 0.08
433 0.08
434 0.08
435 0.08
436 0.07
437 0.06
438 0.06
439 0.06
440 0.06
441 0.06
442 0.06
443 0.07
444 0.07
445 0.09
446 0.09
447 0.12
448 0.14
449 0.13
450 0.18
451 0.2
452 0.2
453 0.19
454 0.2
455 0.23
456 0.22
457 0.22
458 0.22
459 0.2
460 0.25
461 0.28
462 0.29
463 0.24
464 0.24
465 0.29
466 0.3
467 0.29
468 0.26
469 0.22
470 0.21
471 0.2
472 0.2
473 0.16
474 0.1
475 0.14
476 0.13
477 0.14
478 0.12
479 0.13
480 0.12
481 0.11
482 0.11
483 0.06
484 0.05
485 0.04
486 0.05
487 0.04
488 0.05
489 0.06
490 0.07
491 0.07
492 0.08
493 0.12
494 0.14
495 0.15
496 0.15
497 0.14
498 0.15
499 0.16
500 0.14
501 0.1
502 0.08
503 0.09
504 0.08
505 0.08
506 0.07
507 0.07
508 0.1
509 0.1
510 0.1
511 0.11
512 0.11
513 0.11
514 0.12
515 0.14
516 0.12
517 0.13
518 0.15
519 0.14
520 0.19
521 0.22
522 0.24
523 0.28
524 0.29
525 0.31
526 0.3
527 0.31
528 0.33
529 0.34
530 0.34
531 0.36
532 0.41
533 0.41
534 0.42
535 0.39
536 0.33
537 0.31
538 0.3
539 0.25
540 0.23
541 0.22
542 0.2
543 0.21
544 0.2
545 0.19
546 0.17
547 0.14
548 0.1
549 0.1
550 0.11
551 0.1
552 0.1
553 0.09
554 0.1
555 0.11
556 0.11
557 0.09
558 0.11
559 0.13
560 0.17
561 0.17
562 0.17
563 0.17
564 0.16
565 0.16
566 0.13
567 0.11
568 0.07
569 0.1
570 0.09
571 0.1
572 0.1
573 0.1
574 0.11
575 0.12
576 0.12
577 0.09
578 0.12
579 0.13
580 0.13
581 0.13
582 0.13
583 0.12
584 0.12
585 0.11
586 0.08
587 0.06
588 0.05
589 0.06
590 0.06
591 0.06
592 0.08
593 0.09
594 0.11
595 0.12
596 0.12
597 0.13
598 0.13
599 0.16
600 0.14
601 0.14
602 0.12
603 0.13
604 0.13
605 0.13
606 0.14
607 0.14
608 0.13
609 0.13
610 0.13
611 0.14
612 0.15
613 0.16
614 0.15
615 0.11
616 0.15
617 0.16
618 0.18
619 0.18
620 0.18
621 0.19
622 0.26
623 0.31
624 0.37
625 0.46
626 0.48
627 0.54
628 0.54
629 0.55
630 0.49
631 0.46
632 0.36
633 0.28
634 0.24
635 0.15
636 0.13
637 0.09
638 0.09
639 0.07
640 0.13
641 0.11
642 0.12
643 0.15
644 0.15
645 0.17
646 0.18
647 0.2
648 0.16
649 0.17
650 0.17
651 0.16
652 0.16
653 0.14
654 0.13
655 0.11
656 0.1
657 0.09
658 0.09
659 0.08
660 0.1
661 0.1
662 0.1
663 0.15
664 0.14
665 0.15
666 0.2
667 0.28
668 0.37
669 0.42
670 0.5
671 0.49
672 0.56
673 0.6
674 0.64
675 0.64
676 0.59
677 0.62
678 0.57
679 0.64
680 0.64
681 0.62
682 0.57
683 0.59
684 0.59
685 0.6
686 0.65
687 0.64
688 0.68
689 0.75
690 0.79
691 0.77
692 0.75
693 0.68
694 0.62
695 0.53
696 0.44
697 0.4
698 0.34
699 0.29
700 0.25
701 0.26
702 0.23
703 0.23
704 0.23
705 0.17
706 0.14
707 0.13
708 0.13
709 0.11
710 0.1
711 0.1
712 0.1
713 0.11
714 0.13
715 0.22
716 0.29
717 0.33
718 0.41
719 0.49
720 0.58
721 0.67
722 0.71
723 0.72
724 0.72
725 0.78
726 0.74
727 0.7
728 0.6
729 0.52
730 0.48
731 0.38
732 0.32
733 0.22
734 0.2
735 0.16
736 0.16
737 0.14
738 0.11
739 0.13
740 0.13
741 0.15
742 0.14
743 0.13
744 0.14
745 0.14
746 0.13
747 0.12
748 0.1
749 0.09
750 0.11
751 0.12
752 0.13
753 0.13
754 0.14
755 0.15
756 0.16
757 0.17
758 0.16
759 0.16
760 0.2
761 0.23
762 0.24
763 0.23
764 0.21
765 0.2
766 0.21
767 0.19
768 0.15
769 0.1
770 0.09
771 0.1
772 0.11
773 0.12
774 0.11
775 0.11
776 0.18
777 0.24
778 0.26
779 0.34
780 0.4
781 0.46
782 0.52
783 0.61
784 0.63
785 0.63
786 0.64
787 0.62
788 0.56
789 0.5
790 0.44
791 0.35
792 0.27
793 0.27
794 0.26
795 0.23
796 0.23
797 0.26
798 0.27
799 0.3
800 0.33
801 0.3
802 0.32
803 0.32
804 0.31
805 0.31
806 0.3