Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2P7YLN4

Protein Details
Accession A0A2P7YLN4    Localization Confidence High Confidence Score 22
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
4-31ATKPTAPKFAFKKKKKVKDDPQPLIKYDHydrophilic
175-198VHSEENRKRREKNKKKKAAAAVVNHydrophilic
227-257KPGSSNEGKKDKKKPSKKSDKINDQKKKETIBasic
282-314KPGAEPSKPKSKENKPHKSKKAGPKHDNSGTNTBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
13-20AFKKKKKV
180-192NRKRREKNKKKKA
232-307NEGKKDKKKPSKKSDKINDQKKKETIPPKKSASTNGPKPQAQPKKTTEGKKPGAEPSKPKSKENKPHKSKKAGPKH
326-334TKATKAAKK
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 10.5, mito 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR005120  UPF3_dom  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF03467  Smg4_UPF3  
CDD cd12455  RRM_like_Smg4_UPF3  
Amino Acid Sequences MLTATKPTAPKFAFKKKKKVKDDPQPLIKYDDPDLKVVIRLLPPNLTEEAFLRQIPFGNEKSPLEITGLSRFFYQTGSPSLKPFEEPSFSRAYFLFQNKEAANAFRTKMQHVVIEDSDSGDQVKCEMMKPIFGEVIETSQKPGLGKIEQEPLFKKFTALRAASTEVDLIKMIRAVHSEENRKRREKNKKKKAAAAVVNAEKDKTVQSETPTAPAINEPKPQPASDNKPGSSNEGKKDKKKPSKKSDKINDQKKKETIPPKKSASTNGPKPQAQPKKTTEGKKPGAEPSKPKSKENKPHKSKKAGPKHDNSGTNTAQRAATEEKKVTKATKAAKKSS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.68
2 0.77
3 0.79
4 0.88
5 0.9
6 0.92
7 0.92
8 0.92
9 0.94
10 0.93
11 0.92
12 0.86
13 0.77
14 0.73
15 0.64
16 0.56
17 0.5
18 0.48
19 0.39
20 0.36
21 0.36
22 0.3
23 0.29
24 0.27
25 0.26
26 0.22
27 0.23
28 0.23
29 0.25
30 0.24
31 0.25
32 0.26
33 0.23
34 0.2
35 0.18
36 0.21
37 0.19
38 0.19
39 0.17
40 0.16
41 0.18
42 0.2
43 0.24
44 0.21
45 0.22
46 0.25
47 0.25
48 0.28
49 0.26
50 0.24
51 0.21
52 0.21
53 0.2
54 0.24
55 0.24
56 0.21
57 0.2
58 0.2
59 0.19
60 0.18
61 0.17
62 0.12
63 0.17
64 0.22
65 0.23
66 0.24
67 0.26
68 0.26
69 0.26
70 0.27
71 0.25
72 0.25
73 0.25
74 0.27
75 0.31
76 0.3
77 0.3
78 0.26
79 0.25
80 0.27
81 0.29
82 0.29
83 0.24
84 0.28
85 0.27
86 0.29
87 0.27
88 0.23
89 0.21
90 0.2
91 0.2
92 0.2
93 0.22
94 0.21
95 0.24
96 0.23
97 0.24
98 0.22
99 0.25
100 0.2
101 0.21
102 0.19
103 0.17
104 0.15
105 0.13
106 0.12
107 0.08
108 0.08
109 0.06
110 0.08
111 0.07
112 0.07
113 0.12
114 0.11
115 0.13
116 0.14
117 0.15
118 0.14
119 0.14
120 0.15
121 0.1
122 0.13
123 0.13
124 0.12
125 0.12
126 0.12
127 0.13
128 0.12
129 0.13
130 0.12
131 0.11
132 0.13
133 0.14
134 0.22
135 0.23
136 0.25
137 0.26
138 0.25
139 0.27
140 0.25
141 0.24
142 0.19
143 0.2
144 0.25
145 0.24
146 0.22
147 0.22
148 0.25
149 0.23
150 0.21
151 0.18
152 0.11
153 0.11
154 0.1
155 0.07
156 0.05
157 0.06
158 0.06
159 0.06
160 0.07
161 0.09
162 0.14
163 0.2
164 0.29
165 0.34
166 0.43
167 0.48
168 0.52
169 0.55
170 0.6
171 0.67
172 0.69
173 0.74
174 0.77
175 0.82
176 0.83
177 0.85
178 0.83
179 0.81
180 0.75
181 0.68
182 0.63
183 0.55
184 0.51
185 0.43
186 0.35
187 0.25
188 0.2
189 0.16
190 0.12
191 0.11
192 0.12
193 0.14
194 0.21
195 0.21
196 0.22
197 0.22
198 0.21
199 0.18
200 0.19
201 0.21
202 0.19
203 0.22
204 0.22
205 0.26
206 0.28
207 0.27
208 0.28
209 0.31
210 0.36
211 0.41
212 0.46
213 0.41
214 0.43
215 0.44
216 0.46
217 0.48
218 0.44
219 0.43
220 0.47
221 0.52
222 0.57
223 0.66
224 0.71
225 0.73
226 0.78
227 0.82
228 0.83
229 0.89
230 0.9
231 0.91
232 0.91
233 0.91
234 0.91
235 0.91
236 0.9
237 0.85
238 0.85
239 0.78
240 0.73
241 0.7
242 0.71
243 0.71
244 0.7
245 0.71
246 0.7
247 0.71
248 0.68
249 0.66
250 0.65
251 0.65
252 0.65
253 0.65
254 0.65
255 0.61
256 0.64
257 0.67
258 0.68
259 0.62
260 0.6
261 0.57
262 0.61
263 0.67
264 0.7
265 0.69
266 0.7
267 0.72
268 0.7
269 0.69
270 0.69
271 0.69
272 0.68
273 0.66
274 0.63
275 0.67
276 0.64
277 0.67
278 0.68
279 0.7
280 0.74
281 0.77
282 0.81
283 0.81
284 0.89
285 0.92
286 0.92
287 0.91
288 0.91
289 0.91
290 0.91
291 0.9
292 0.88
293 0.87
294 0.85
295 0.82
296 0.77
297 0.73
298 0.66
299 0.62
300 0.54
301 0.47
302 0.39
303 0.33
304 0.32
305 0.31
306 0.33
307 0.35
308 0.39
309 0.42
310 0.46
311 0.5
312 0.49
313 0.48
314 0.51
315 0.54
316 0.58