Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2P7YD90

Protein Details
Accession A0A2P7YD90    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
411-434FGEKREINKRKHEDGGKKKKAKHKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
414-434KREINKRKHEDGGKKKKAKHK
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 13, cyto 10.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011545  DEAD/DEAH_box_helicase_dom  
IPR014001  Helicase_ATP-bd  
IPR001650  Helicase_C  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR000629  RNA-helicase_DEAD-box_CS  
IPR014014  RNA_helicase_DEAD_Q_motif  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0032040  C:small-subunit processome  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016887  F:ATP hydrolysis activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0003724  F:RNA helicase activity  
GO:0000480  P:endonucleolytic cleavage in 5'-ETS of tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000447  P:endonucleolytic cleavage in ITS1 to separate SSU-rRNA from 5.8S rRNA and LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000472  P:endonucleolytic cleavage to generate mature 5'-end of SSU-rRNA from (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
Pfam View protein in Pfam  
PF00270  DEAD  
PF00271  Helicase_C  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00039  DEAD_ATP_HELICASE  
PS51192  HELICASE_ATP_BIND_1  
PS51194  HELICASE_CTER  
PS51195  Q_MOTIF  
CDD cd17955  DEADc_DDX49  
cd18787  SF2_C_DEAD  
Amino Acid Sequences MSFSELGIAKWLSESLQAMQIHTPTAIQAACIPEILKGKDCIGGAKTGSGKTIAFAGPMLTKWSEDPMGIFGVVLTPTRELAMQIAEQFAALGANMNIRLAVVVGGEDIVKQALELQRRPHFVIATPGRLADHILNSGEETIKGLRSVKYLVLDEADRVLSNSFSKDLLRCLEVMPEASKRQTLLFTATVTDAVRALKEKPPAKGKPPVFMHEVDSVDKVAIPATLLLYYVFTPSYVKEAYLHTVLLLEKYQDLNVIIFVNRTHQAELLRRTLRKMNFRVASLHSQMPQLERTNSLHRFKAQAAKILIATDVASRGLDIPTVELVVNYDIPADPDDFIHRVGRTARAGRKGDAVSIVGERDVERTVAIEERAKEKHVLLKEADDDAVIEKSLTKMSTAKREALMDMERENFGEKREINKRKHEDGGKKKKAKHK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.13
3 0.2
4 0.21
5 0.22
6 0.24
7 0.24
8 0.22
9 0.2
10 0.18
11 0.12
12 0.14
13 0.13
14 0.11
15 0.13
16 0.15
17 0.15
18 0.16
19 0.16
20 0.17
21 0.22
22 0.24
23 0.24
24 0.23
25 0.24
26 0.27
27 0.27
28 0.27
29 0.24
30 0.25
31 0.22
32 0.25
33 0.27
34 0.24
35 0.25
36 0.22
37 0.21
38 0.17
39 0.21
40 0.16
41 0.13
42 0.13
43 0.13
44 0.13
45 0.14
46 0.17
47 0.13
48 0.14
49 0.14
50 0.18
51 0.17
52 0.15
53 0.16
54 0.14
55 0.15
56 0.14
57 0.13
58 0.09
59 0.09
60 0.1
61 0.09
62 0.09
63 0.08
64 0.08
65 0.09
66 0.09
67 0.08
68 0.09
69 0.11
70 0.11
71 0.11
72 0.12
73 0.11
74 0.1
75 0.1
76 0.08
77 0.06
78 0.05
79 0.05
80 0.05
81 0.06
82 0.07
83 0.07
84 0.06
85 0.06
86 0.06
87 0.05
88 0.05
89 0.04
90 0.04
91 0.04
92 0.04
93 0.04
94 0.04
95 0.04
96 0.04
97 0.04
98 0.04
99 0.08
100 0.12
101 0.17
102 0.2
103 0.27
104 0.33
105 0.37
106 0.39
107 0.37
108 0.34
109 0.3
110 0.37
111 0.34
112 0.32
113 0.29
114 0.27
115 0.25
116 0.24
117 0.25
118 0.17
119 0.14
120 0.12
121 0.12
122 0.12
123 0.12
124 0.12
125 0.11
126 0.09
127 0.09
128 0.08
129 0.08
130 0.09
131 0.11
132 0.12
133 0.13
134 0.15
135 0.15
136 0.17
137 0.17
138 0.17
139 0.16
140 0.15
141 0.14
142 0.13
143 0.12
144 0.09
145 0.09
146 0.08
147 0.08
148 0.08
149 0.09
150 0.08
151 0.09
152 0.1
153 0.11
154 0.13
155 0.14
156 0.14
157 0.13
158 0.13
159 0.14
160 0.13
161 0.13
162 0.12
163 0.13
164 0.14
165 0.14
166 0.14
167 0.13
168 0.14
169 0.14
170 0.13
171 0.14
172 0.13
173 0.13
174 0.13
175 0.13
176 0.13
177 0.12
178 0.11
179 0.08
180 0.07
181 0.07
182 0.08
183 0.1
184 0.13
185 0.2
186 0.23
187 0.27
188 0.35
189 0.39
190 0.42
191 0.49
192 0.47
193 0.48
194 0.48
195 0.46
196 0.41
197 0.38
198 0.36
199 0.31
200 0.3
201 0.23
202 0.2
203 0.17
204 0.14
205 0.13
206 0.1
207 0.06
208 0.05
209 0.04
210 0.04
211 0.04
212 0.04
213 0.04
214 0.04
215 0.05
216 0.05
217 0.06
218 0.05
219 0.05
220 0.06
221 0.06
222 0.09
223 0.08
224 0.08
225 0.09
226 0.11
227 0.13
228 0.13
229 0.13
230 0.1
231 0.11
232 0.11
233 0.1
234 0.09
235 0.07
236 0.08
237 0.08
238 0.08
239 0.07
240 0.08
241 0.07
242 0.08
243 0.08
244 0.07
245 0.07
246 0.07
247 0.09
248 0.11
249 0.12
250 0.12
251 0.13
252 0.16
253 0.21
254 0.25
255 0.3
256 0.33
257 0.32
258 0.35
259 0.4
260 0.43
261 0.46
262 0.46
263 0.48
264 0.46
265 0.47
266 0.47
267 0.45
268 0.44
269 0.39
270 0.36
271 0.29
272 0.27
273 0.27
274 0.25
275 0.25
276 0.22
277 0.2
278 0.21
279 0.23
280 0.3
281 0.36
282 0.37
283 0.36
284 0.35
285 0.37
286 0.38
287 0.43
288 0.36
289 0.37
290 0.34
291 0.33
292 0.32
293 0.29
294 0.26
295 0.17
296 0.15
297 0.09
298 0.08
299 0.07
300 0.06
301 0.06
302 0.07
303 0.07
304 0.07
305 0.07
306 0.07
307 0.07
308 0.08
309 0.08
310 0.07
311 0.08
312 0.08
313 0.08
314 0.07
315 0.08
316 0.07
317 0.08
318 0.09
319 0.09
320 0.08
321 0.09
322 0.12
323 0.13
324 0.14
325 0.17
326 0.16
327 0.17
328 0.19
329 0.23
330 0.26
331 0.33
332 0.38
333 0.43
334 0.46
335 0.45
336 0.49
337 0.45
338 0.41
339 0.35
340 0.3
341 0.22
342 0.21
343 0.2
344 0.13
345 0.13
346 0.12
347 0.11
348 0.11
349 0.1
350 0.08
351 0.09
352 0.1
353 0.12
354 0.14
355 0.17
356 0.18
357 0.24
358 0.26
359 0.27
360 0.28
361 0.28
362 0.33
363 0.33
364 0.36
365 0.32
366 0.35
367 0.35
368 0.34
369 0.32
370 0.25
371 0.21
372 0.18
373 0.16
374 0.12
375 0.09
376 0.08
377 0.1
378 0.12
379 0.12
380 0.12
381 0.17
382 0.24
383 0.34
384 0.37
385 0.4
386 0.41
387 0.43
388 0.42
389 0.41
390 0.39
391 0.31
392 0.3
393 0.29
394 0.26
395 0.25
396 0.27
397 0.23
398 0.21
399 0.26
400 0.26
401 0.32
402 0.43
403 0.52
404 0.56
405 0.66
406 0.72
407 0.71
408 0.78
409 0.79
410 0.79
411 0.81
412 0.85
413 0.85
414 0.86