Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2T2P079

Protein Details
Accession A0A2T2P079    Localization Confidence High Confidence Score 20
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-23MDGERPRDRQRDRRGPGEPRDGTBasic
28-63GTPGEGRHRSRSPRRDRRRDDRYRSRSPFRRDDRDRBasic
187-209KNYAVRKDKKMEARQYMNRQGGFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
6-111PRDRQRDRRGPGEPRDGTRGRGGTPGEGRHRSRSPRRDRRRDDRYRSRSPFRRDDRDRDGPRKGREERGDRGDRGDRVDRNDRGRNDFRGRGRDPPKGPRGGGRRP
Subcellular Location(s) nucl 19, mito 5, cyto 1, extr 1, vacu 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013957  SNRNP27  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
Pfam View protein in Pfam  
PF08648  SNRNP27  
Amino Acid Sequences MDGERPRDRQRDRRGPGEPRDGTRGRGGTPGEGRHRSRSPRRDRRRDDRYRSRSPFRRDDRDRDGPRKGREERGDRGDRGDRVDRNDRGRNDFRGRGRDPPKGPRGGGRRPDYHDRNDRTSRNDRSDGAVKPPTGPQVDMKVESENHEDKILARPEGMDDETWEVFKTMGFCNWRSTKNTKVPGNAKNYAVRKDKKMEARQYMNRQGGFNRPLSPSH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.81
2 0.8
3 0.8
4 0.8
5 0.74
6 0.67
7 0.69
8 0.61
9 0.56
10 0.53
11 0.46
12 0.37
13 0.38
14 0.34
15 0.32
16 0.36
17 0.4
18 0.41
19 0.46
20 0.48
21 0.51
22 0.56
23 0.6
24 0.65
25 0.69
26 0.72
27 0.77
28 0.85
29 0.88
30 0.91
31 0.92
32 0.93
33 0.93
34 0.92
35 0.92
36 0.9
37 0.9
38 0.87
39 0.87
40 0.85
41 0.82
42 0.82
43 0.79
44 0.81
45 0.77
46 0.78
47 0.77
48 0.78
49 0.79
50 0.75
51 0.75
52 0.72
53 0.7
54 0.71
55 0.66
56 0.64
57 0.64
58 0.64
59 0.61
60 0.63
61 0.63
62 0.54
63 0.55
64 0.51
65 0.44
66 0.42
67 0.42
68 0.35
69 0.35
70 0.43
71 0.42
72 0.44
73 0.5
74 0.47
75 0.49
76 0.51
77 0.52
78 0.49
79 0.51
80 0.48
81 0.49
82 0.49
83 0.5
84 0.52
85 0.53
86 0.51
87 0.54
88 0.56
89 0.51
90 0.49
91 0.47
92 0.48
93 0.48
94 0.52
95 0.48
96 0.47
97 0.48
98 0.57
99 0.54
100 0.54
101 0.55
102 0.51
103 0.54
104 0.56
105 0.54
106 0.52
107 0.56
108 0.55
109 0.52
110 0.5
111 0.44
112 0.42
113 0.45
114 0.39
115 0.36
116 0.34
117 0.28
118 0.27
119 0.28
120 0.27
121 0.22
122 0.22
123 0.19
124 0.21
125 0.23
126 0.23
127 0.23
128 0.21
129 0.21
130 0.22
131 0.25
132 0.21
133 0.2
134 0.19
135 0.18
136 0.17
137 0.24
138 0.23
139 0.18
140 0.17
141 0.16
142 0.17
143 0.2
144 0.2
145 0.12
146 0.11
147 0.14
148 0.15
149 0.15
150 0.14
151 0.11
152 0.1
153 0.11
154 0.12
155 0.1
156 0.15
157 0.18
158 0.19
159 0.27
160 0.32
161 0.35
162 0.38
163 0.42
164 0.47
165 0.53
166 0.61
167 0.58
168 0.62
169 0.66
170 0.68
171 0.71
172 0.65
173 0.6
174 0.59
175 0.59
176 0.58
177 0.6
178 0.57
179 0.56
180 0.59
181 0.64
182 0.66
183 0.71
184 0.73
185 0.73
186 0.77
187 0.8
188 0.83
189 0.84
190 0.8
191 0.73
192 0.65
193 0.59
194 0.58
195 0.53
196 0.47
197 0.42