FuNGI

A0A2T2NCE2

Protein Details

Accession

A0A2T2NCE2

Localization Confidence

Low

Confidence Score

7.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
303-322	YEDYNKDRKRARQCFQKAFE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

cyto 11.5, cyto_nucl 10.833, nucl 9, mito_nucl 6.333, pero 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR039226 Ski3/TTC37 IPR011990 TPR-like_helical_dom_sf IPR019734 TPR_repeat
Gene Ontology	GO:0055087 C:Ski complex GO:0006401 P:RNA catabolic process
Pfam	View protein in Pfam PF13432 TPR_16 PF14559 TPR_19 PF13181 TPR_8
PROSITE	View protein in PROSITE PS50005 TPR PS50293 TPR_REGION

Amino Acid Sequences

MASHADSAHDLLDLDIRTLRQFVELFPEQGLSKVVTGYLSSGISKYPLHEEDGDAPDLSEGGVALTQDVPLSQEDCLVLMTEGILEAKKSPLAHCLLGDYYLSLEEYESAVETTRKGLKLAAAEAKKTDLSMQRIRDALSSTLATSLVYYQAPRNHPEAKEIFKSILQRKPQFTSALIGIGLILEEEEEYAQAVEFLEQALEQDPSNGRIGAEAAWCQALSGDYEIGLARLQEYLDYPQMDASKPRGRELRAQTLYRIGVCIWELNPSKAARKDRQGAYTKFLAAIKANPNFAPAYTKLGIFYEDYNKDRKRARQCFQKAFELSPSEIVAAERLARLFANQGEWDIVEVVSQRVVDSGKVRTAPGSKKKGVSWPYSALGVVQMNKLEYQKSIVSFLSALRISPNDYHSYVGLGESYHNSGRYNSAARAFNYAENPTDGVVLNKPDGDSWFTKYMLANVNRELSEFDDAIKGYEEVLSERPKEFGVSIALLQTLVEKGWRCIETGFFGEAADSAAKGLAVASEIIEYKPDAFNLWKAVGDACSLFSWVQEKLDKFPLGDVQKLLQSKSEVTLDYDAHKDIDGVGVQELESLSAGSAQTPTAAVVSKASILAQKRAIASCAGDVHAQAVAWYNLGWTEYRAHVCLEQEIGEGHNLTTYLRAAMRCFKRAIELEAGNSEFWNSLGVITTTLNPKVAQHAFVRSLHLNERSVRAWTNLGTLYLLQNDQELAHQAFSRAQSTDPDYALAWVGEGIIALLIGEASEALSHFTHAFELSDSSSLLTKRQYSVSTFDHLVSSASASNNITNLIQPLFALHQLNFQAPYDISHKHLAALFLERVGNHDSAIDALSSICETAEQDYESSESLTALARYAQAKTDLSRNLLASGSYENAVEEAETALDLLSDFDAEANKAIMSAEILSKTRLSARLTAGLAHYYRGDIEASIPYFRTSLEATGSNPDIICLLAEVLWAKGGENEKEVAREQLFAAVEKWGKHVGIVTLLGAMAVLDEDIDTMEAVVEDLNSLRMDKELGADQVAKVEKVIEAISAFQGGEEEELNEAKRAVMLAPWKHTGWAELADAAGGDAFAATLAKETARRSVAPAGALSANGLAEAFAGTGDVKDAQRAVVLAPWAKHGWGALAECLKAA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.13
2	0.14
3	0.15
4	0.16
5	0.17
6	0.16
7	0.16
8	0.17
9	0.16
10	0.23
11	0.25
12	0.25
13	0.25
14	0.26
15	0.22
16	0.22
17	0.23
18	0.16
19	0.14
20	0.13
21	0.13
22	0.11
23	0.11
24	0.12
25	0.13
26	0.12
27	0.13
28	0.13
29	0.13
30	0.15
31	0.15
32	0.16
33	0.21
34	0.21
35	0.25
36	0.26
37	0.29
38	0.33
39	0.36
40	0.35
41	0.28
42	0.26
43	0.22
44	0.2
45	0.17
46	0.1
47	0.06
48	0.05
49	0.06
50	0.05
51	0.06
52	0.07
53	0.07
54	0.07
55	0.07
56	0.08
57	0.09
58	0.1
59	0.09
60	0.1
61	0.1
62	0.11
63	0.11
64	0.11
65	0.09
66	0.08
67	0.08
68	0.06
69	0.06
70	0.07
71	0.07
72	0.06
73	0.08
74	0.09
75	0.12
76	0.14
77	0.15
78	0.2
79	0.24
80	0.25
81	0.24
82	0.26
83	0.24
84	0.24
85	0.23
86	0.17
87	0.13
88	0.12
89	0.12
90	0.09
91	0.08
92	0.08
93	0.08
94	0.08
95	0.08
96	0.08
97	0.09
98	0.1
99	0.1
100	0.14
101	0.2
102	0.2
103	0.2
104	0.22
105	0.24
106	0.27
107	0.32
108	0.36
109	0.33
110	0.34
111	0.34
112	0.35
113	0.31
114	0.28
115	0.28
116	0.26
117	0.31
118	0.37
119	0.4
120	0.41
121	0.42
122	0.43
123	0.39
124	0.35
125	0.29
126	0.25
127	0.22
128	0.18
129	0.18
130	0.17
131	0.15
132	0.12
133	0.11
134	0.1
135	0.1
136	0.12
137	0.16
138	0.23
139	0.27
140	0.29
141	0.34
142	0.38
143	0.38
144	0.45
145	0.45
146	0.44
147	0.46
148	0.44
149	0.41
150	0.37
151	0.45
152	0.45
153	0.47
154	0.5
155	0.53
156	0.56
157	0.59
158	0.6
159	0.54
160	0.48
161	0.44
162	0.36
163	0.3
164	0.25
165	0.19
166	0.15
167	0.12
168	0.1
169	0.06
170	0.04
171	0.03
172	0.03
173	0.03
174	0.04
175	0.04
176	0.04
177	0.04
178	0.04
179	0.05
180	0.05
181	0.05
182	0.05
183	0.05
184	0.05
185	0.05
186	0.06
187	0.07
188	0.07
189	0.07
190	0.1
191	0.11
192	0.14
193	0.15
194	0.15
195	0.13
196	0.13
197	0.14
198	0.13
199	0.14
200	0.12
201	0.11
202	0.11
203	0.11
204	0.1
205	0.1
206	0.08
207	0.08
208	0.09
209	0.08
210	0.07
211	0.08
212	0.08
213	0.08
214	0.08
215	0.07
216	0.06
217	0.06
218	0.06
219	0.06
220	0.08
221	0.11
222	0.14
223	0.15
224	0.15
225	0.17
226	0.18
227	0.19
228	0.2
229	0.24
230	0.27
231	0.28
232	0.33
233	0.36
234	0.38
235	0.46
236	0.51
237	0.55
238	0.55
239	0.55
240	0.52
241	0.51
242	0.49
243	0.4
244	0.33
245	0.21
246	0.17
247	0.16
248	0.16
249	0.11
250	0.18
251	0.19
252	0.19
253	0.24
254	0.23
255	0.29
256	0.34
257	0.42
258	0.4
259	0.47
260	0.55
261	0.56
262	0.63
263	0.66
264	0.62
265	0.59
266	0.55
267	0.48
268	0.42
269	0.37
270	0.3
271	0.22
272	0.25
273	0.28
274	0.27
275	0.28
276	0.26
277	0.27
278	0.25
279	0.24
280	0.24
281	0.17
282	0.21
283	0.21
284	0.21
285	0.2
286	0.2
287	0.21
288	0.17
289	0.19
290	0.19
291	0.23
292	0.25
293	0.32
294	0.33
295	0.37
296	0.42
297	0.48
298	0.52
299	0.57
300	0.64
301	0.68
302	0.76
303	0.8
304	0.79
305	0.79
306	0.7
307	0.62
308	0.57
309	0.5
310	0.41
311	0.32
312	0.27
313	0.19
314	0.17
315	0.15
316	0.11
317	0.08
318	0.08
319	0.08
320	0.07
321	0.07
322	0.07
323	0.07
324	0.09
325	0.09
326	0.11
327	0.11
328	0.12
329	0.11
330	0.11
331	0.11
332	0.1
333	0.09
334	0.06
335	0.07
336	0.07
337	0.07
338	0.07
339	0.06
340	0.07
341	0.07
342	0.08
343	0.11
344	0.13
345	0.15
346	0.16
347	0.16
348	0.18
349	0.24
350	0.31
351	0.38
352	0.44
353	0.45
354	0.47
355	0.49
356	0.55
357	0.55
358	0.51
359	0.46
360	0.42
361	0.4
362	0.37
363	0.34
364	0.26
365	0.22
366	0.19
367	0.15
368	0.12
369	0.11
370	0.11
371	0.13
372	0.13
373	0.12
374	0.11
375	0.13
376	0.14
377	0.14
378	0.16
379	0.14
380	0.14
381	0.14
382	0.14
383	0.15
384	0.13
385	0.12
386	0.11
387	0.12
388	0.13
389	0.15
390	0.17
391	0.16
392	0.17
393	0.18
394	0.17
395	0.17
396	0.15
397	0.13
398	0.1
399	0.07
400	0.07
401	0.08
402	0.1
403	0.1
404	0.11
405	0.11
406	0.12
407	0.13
408	0.15
409	0.16
410	0.16
411	0.2
412	0.23
413	0.23
414	0.27
415	0.26
416	0.26
417	0.26
418	0.25
419	0.2
420	0.18
421	0.17
422	0.13
423	0.13
424	0.11
425	0.09
426	0.1
427	0.1
428	0.1
429	0.1
430	0.09
431	0.09
432	0.1
433	0.13
434	0.13
435	0.16
436	0.18
437	0.18
438	0.19
439	0.19
440	0.21
441	0.25
442	0.26
443	0.24
444	0.23
445	0.25
446	0.24
447	0.24
448	0.21
449	0.15
450	0.15
451	0.13
452	0.12
453	0.11
454	0.11
455	0.11
456	0.11
457	0.09
458	0.07
459	0.08
460	0.07
461	0.07
462	0.11
463	0.13
464	0.14
465	0.14
466	0.15
467	0.14
468	0.14
469	0.13
470	0.11
471	0.1
472	0.09
473	0.09
474	0.09
475	0.09
476	0.08
477	0.08
478	0.07
479	0.05
480	0.04
481	0.06
482	0.06
483	0.07
484	0.12
485	0.12
486	0.12
487	0.13
488	0.14
489	0.14
490	0.15
491	0.15
492	0.11
493	0.1
494	0.09
495	0.09
496	0.09
497	0.06
498	0.05
499	0.04
500	0.04
501	0.04
502	0.04
503	0.03
504	0.03
505	0.03
506	0.03
507	0.03
508	0.04
509	0.05
510	0.05
511	0.05
512	0.05
513	0.06
514	0.06
515	0.06
516	0.07
517	0.07
518	0.09
519	0.1
520	0.11
521	0.1
522	0.1
523	0.1
524	0.09
525	0.09
526	0.08
527	0.07
528	0.07
529	0.07
530	0.07
531	0.07
532	0.08
533	0.08
534	0.09
535	0.12
536	0.12
537	0.14
538	0.19
539	0.19
540	0.18
541	0.18
542	0.22
543	0.2
544	0.21
545	0.18
546	0.15
547	0.17
548	0.18
549	0.17
550	0.13
551	0.12
552	0.12
553	0.13
554	0.14
555	0.11
556	0.11
557	0.13
558	0.12
559	0.13
560	0.13
561	0.12
562	0.11
563	0.1
564	0.09
565	0.07
566	0.07
567	0.06
568	0.05
569	0.05
570	0.05
571	0.05
572	0.05
573	0.05
574	0.04
575	0.04
576	0.03
577	0.03
578	0.04
579	0.04
580	0.04
581	0.04
582	0.04
583	0.04
584	0.04
585	0.04
586	0.04
587	0.05
588	0.05
589	0.05
590	0.05
591	0.05
592	0.05
593	0.06
594	0.08
595	0.09
596	0.12
597	0.13
598	0.15
599	0.15
600	0.16
601	0.16
602	0.13
603	0.13
604	0.11
605	0.11
606	0.1
607	0.09
608	0.08
609	0.08
610	0.08
611	0.07
612	0.06
613	0.06
614	0.05
615	0.05
616	0.05
617	0.05
618	0.05
619	0.05
620	0.05
621	0.05
622	0.07
623	0.09
624	0.1
625	0.11
626	0.11
627	0.12
628	0.12
629	0.12
630	0.11
631	0.09
632	0.09
633	0.08
634	0.08
635	0.07
636	0.07
637	0.06
638	0.06
639	0.05
640	0.05
641	0.06
642	0.05
643	0.06
644	0.08
645	0.08
646	0.1
647	0.18
648	0.21
649	0.23
650	0.24
651	0.23
652	0.26
653	0.27
654	0.29
655	0.26
656	0.23
657	0.21
658	0.22
659	0.22
660	0.18
661	0.16
662	0.13
663	0.08
664	0.07
665	0.07
666	0.05
667	0.05
668	0.05
669	0.06
670	0.06
671	0.07
672	0.09
673	0.1
674	0.1
675	0.11
676	0.1
677	0.11
678	0.16
679	0.16
680	0.17
681	0.17
682	0.2
683	0.22
684	0.23
685	0.26
686	0.21
687	0.22
688	0.23
689	0.24
690	0.23
691	0.22
692	0.24
693	0.21
694	0.22
695	0.21
696	0.19
697	0.17
698	0.16
699	0.17
700	0.14
701	0.13
702	0.12
703	0.11
704	0.11
705	0.1
706	0.1
707	0.07
708	0.07
709	0.07
710	0.07
711	0.07
712	0.09
713	0.08
714	0.09
715	0.09
716	0.1
717	0.12
718	0.13
719	0.14
720	0.12
721	0.12
722	0.14
723	0.18
724	0.2
725	0.17
726	0.17
727	0.15
728	0.15
729	0.15
730	0.12
731	0.08
732	0.05
733	0.05
734	0.04
735	0.04
736	0.03
737	0.02
738	0.02
739	0.02
740	0.02
741	0.02
742	0.02
743	0.02
744	0.02
745	0.02
746	0.02
747	0.02
748	0.04
749	0.05
750	0.06
751	0.06
752	0.06
753	0.07
754	0.07
755	0.08
756	0.07
757	0.08
758	0.08
759	0.08
760	0.08
761	0.08
762	0.1
763	0.1
764	0.11
765	0.13
766	0.14
767	0.15
768	0.18
769	0.2
770	0.2
771	0.25
772	0.26
773	0.27
774	0.26
775	0.25
776	0.22
777	0.21
778	0.19
779	0.13
780	0.12
781	0.1
782	0.09
783	0.1
784	0.11
785	0.11
786	0.11
787	0.11
788	0.1
789	0.09
790	0.1
791	0.09
792	0.08
793	0.08
794	0.09
795	0.09
796	0.11
797	0.12
798	0.1
799	0.14
800	0.15
801	0.16
802	0.16
803	0.15
804	0.15
805	0.13
806	0.16
807	0.15
808	0.16
809	0.18
810	0.2
811	0.2
812	0.2
813	0.21
814	0.19
815	0.17
816	0.2
817	0.17
818	0.15
819	0.16
820	0.14
821	0.15
822	0.17
823	0.16
824	0.12
825	0.12
826	0.11
827	0.1
828	0.11
829	0.08
830	0.05
831	0.05
832	0.05
833	0.05
834	0.05
835	0.04
836	0.04
837	0.05
838	0.06
839	0.08
840	0.08
841	0.08
842	0.09
843	0.1
844	0.1
845	0.1
846	0.09
847	0.07
848	0.07
849	0.08
850	0.08
851	0.07
852	0.08
853	0.1
854	0.11
855	0.11
856	0.13
857	0.14
858	0.16
859	0.17
860	0.23
861	0.23
862	0.25
863	0.26
864	0.25
865	0.24
866	0.23
867	0.21
868	0.16
869	0.15
870	0.13
871	0.11
872	0.1
873	0.09
874	0.09
875	0.09
876	0.07
877	0.06
878	0.05
879	0.05
880	0.04
881	0.04
882	0.04
883	0.04
884	0.04
885	0.04
886	0.04
887	0.04
888	0.04
889	0.05
890	0.06
891	0.06
892	0.07
893	0.07
894	0.06
895	0.06
896	0.07
897	0.06
898	0.06
899	0.07
900	0.08
901	0.1
902	0.11
903	0.12
904	0.12
905	0.13
906	0.17
907	0.2
908	0.21
909	0.24
910	0.26
911	0.31
912	0.31
913	0.32
914	0.29
915	0.28
916	0.26
917	0.22
918	0.19
919	0.13
920	0.13
921	0.13
922	0.12
923	0.08
924	0.1
925	0.13
926	0.14
927	0.15
928	0.15
929	0.15
930	0.14
931	0.14
932	0.15
933	0.12
934	0.12
935	0.14
936	0.15
937	0.16
938	0.2
939	0.21
940	0.2
941	0.18
942	0.17
943	0.14
944	0.12
945	0.11
946	0.07
947	0.06
948	0.05
949	0.06
950	0.06
951	0.06
952	0.07
953	0.07
954	0.07
955	0.11
956	0.15
957	0.15
958	0.17
959	0.19
960	0.18
961	0.21
962	0.22
963	0.23
964	0.2
965	0.2
966	0.18
967	0.21
968	0.21
969	0.19
970	0.19
971	0.19
972	0.21
973	0.2
974	0.23
975	0.2
976	0.19
977	0.19
978	0.2
979	0.17
980	0.17
981	0.17
982	0.14
983	0.12
984	0.12
985	0.11
986	0.09
987	0.07
988	0.04
989	0.03
990	0.03
991	0.02
992	0.03
993	0.03
994	0.03
995	0.04
996	0.04
997	0.04
998	0.04
999	0.04
1000	0.04
1001	0.04
1002	0.04
1003	0.04
1004	0.05
1005	0.06
1006	0.07
1007	0.07
1008	0.08
1009	0.08
1010	0.09
1011	0.09
1012	0.12
1013	0.14
1014	0.14
1015	0.16
1016	0.17
1017	0.17
1018	0.21
1019	0.22
1020	0.19
1021	0.16
1022	0.16
1023	0.14
1024	0.14
1025	0.15
1026	0.1
1027	0.09
1028	0.11
1029	0.11
1030	0.11
1031	0.11
1032	0.09
1033	0.09
1034	0.08
1035	0.09
1036	0.08
1037	0.08
1038	0.08
1039	0.1
1040	0.11
1041	0.11
1042	0.11
1043	0.1
1044	0.1
1045	0.1
1046	0.1
1047	0.13
1048	0.2
1049	0.24
1050	0.29
1051	0.33
1052	0.32
1053	0.33
1054	0.33
1055	0.31
1056	0.26
1057	0.24
1058	0.2
1059	0.17
1060	0.16
1061	0.14
1062	0.14
1063	0.12
1064	0.08
1065	0.05
1066	0.04
1067	0.03
1068	0.03
1069	0.03
1070	0.03
1071	0.03
1072	0.04
1073	0.06
1074	0.07
1075	0.11
1076	0.13
1077	0.2
1078	0.23
1079	0.24
1080	0.27
1081	0.34
1082	0.35
1083	0.33
1084	0.32
1085	0.29
1086	0.26
1087	0.25
1088	0.21
1089	0.15
1090	0.12
1091	0.1
1092	0.09
1093	0.06
1094	0.05
1095	0.05
1096	0.05
1097	0.04
1098	0.05
1099	0.05
1100	0.05
1101	0.07
1102	0.1
1103	0.1
1104	0.12
1105	0.13
1106	0.13
1107	0.14
1108	0.14
1109	0.14
1110	0.14
1111	0.18
1112	0.2
1113	0.2
1114	0.24
1115	0.24
1116	0.24
1117	0.23
1118	0.2
1119	0.19
1120	0.19
1121	0.2
1122	0.21
1123	0.23

A0A2T2NCE2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer