Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q7SBX5

Protein Details
Accession Q7SBX5    Localization Confidence High Confidence Score 19.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
5-44TRSRRETKTTESPANKKSKASTPKSDSKKPEKRKATEDATHydrophilic
71-114KSAPKTTPKEDKKSAQKPVKENKKEKKEKPAQKEKKTKEPTPEPBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
18-108ANKKSKASTPKSDSKKPEKRKATEDATPVAAKKQKATKDTVAAPSPKPTPKTDKSAPKTTPKEDKKSAQKPVKENKKEKKEKPAQKEKKTK
170-177KIPKKKTK
387-438KSTRKRAAATPKKATATPKKAAGTTPKKAAATPKAEATTPARATRSTRKTKA
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 13.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000463  P:maturation of LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
KEGG ncr:NCU08518  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12307  RRM_NIFK_like  
Amino Acid Sequences MAPVTRSRRETKTTESPANKKSKASTPKSDSKKPEKRKATEDATPVAAKKQKATKDTVAAPSPKPTPKTDKSAPKTTPKEDKKSAQKPVKENKKEKKEKPAQKEKKTKEPTPEPEAQEQEDDKEEEEEEEELDNETQALVENLDGDDKEEDNEEASKQISTFKKGQDVGKIPKKKTKDDKDASATKGSGKRGVMYLGRIPHGFYEHEIRAYFGQFGEITRLRVVRNKKTGASRHRAFVEFADAEVADIAARTMDKYLLFGHILTAKVVPPAQVHKDLFKGANRRFKVIPWNKMAGKQLEKALPESKWQGKITKEEQRRAARAAKLAEMDYEWEAPQLKAAEAKEPALLTAAEEEPVKAIEAPAAAEEKTEEKAETKEEETKEEEEPKSTRKRAAATPKKATATPKKAAGTTPKKAAATPKAEATTPARATRSTRKTKA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.69
2 0.72
3 0.73
4 0.76
5 0.8
6 0.74
7 0.67
8 0.65
9 0.65
10 0.67
11 0.67
12 0.68
13 0.67
14 0.74
15 0.79
16 0.82
17 0.82
18 0.82
19 0.85
20 0.85
21 0.87
22 0.88
23 0.86
24 0.84
25 0.84
26 0.8
27 0.76
28 0.7
29 0.63
30 0.57
31 0.52
32 0.45
33 0.43
34 0.4
35 0.34
36 0.36
37 0.41
38 0.44
39 0.46
40 0.53
41 0.53
42 0.55
43 0.6
44 0.59
45 0.58
46 0.55
47 0.52
48 0.5
49 0.5
50 0.48
51 0.45
52 0.45
53 0.48
54 0.5
55 0.57
56 0.61
57 0.65
58 0.67
59 0.73
60 0.73
61 0.74
62 0.75
63 0.74
64 0.76
65 0.74
66 0.76
67 0.73
68 0.76
69 0.77
70 0.79
71 0.81
72 0.79
73 0.78
74 0.79
75 0.82
76 0.84
77 0.84
78 0.85
79 0.85
80 0.88
81 0.91
82 0.88
83 0.88
84 0.88
85 0.88
86 0.88
87 0.89
88 0.88
89 0.89
90 0.92
91 0.88
92 0.88
93 0.87
94 0.81
95 0.8
96 0.8
97 0.76
98 0.73
99 0.74
100 0.67
101 0.64
102 0.61
103 0.52
104 0.45
105 0.38
106 0.33
107 0.27
108 0.23
109 0.18
110 0.16
111 0.15
112 0.12
113 0.12
114 0.11
115 0.09
116 0.09
117 0.08
118 0.08
119 0.08
120 0.07
121 0.06
122 0.06
123 0.05
124 0.05
125 0.05
126 0.04
127 0.04
128 0.04
129 0.05
130 0.05
131 0.05
132 0.06
133 0.07
134 0.07
135 0.08
136 0.08
137 0.08
138 0.09
139 0.1
140 0.09
141 0.08
142 0.09
143 0.08
144 0.08
145 0.15
146 0.16
147 0.2
148 0.24
149 0.25
150 0.31
151 0.34
152 0.37
153 0.37
154 0.42
155 0.47
156 0.52
157 0.57
158 0.54
159 0.56
160 0.58
161 0.6
162 0.64
163 0.65
164 0.66
165 0.64
166 0.69
167 0.7
168 0.71
169 0.64
170 0.56
171 0.46
172 0.4
173 0.39
174 0.33
175 0.29
176 0.24
177 0.23
178 0.21
179 0.23
180 0.19
181 0.17
182 0.19
183 0.17
184 0.18
185 0.17
186 0.17
187 0.15
188 0.15
189 0.13
190 0.11
191 0.15
192 0.14
193 0.16
194 0.15
195 0.16
196 0.15
197 0.15
198 0.14
199 0.08
200 0.09
201 0.07
202 0.08
203 0.11
204 0.11
205 0.12
206 0.12
207 0.14
208 0.13
209 0.19
210 0.25
211 0.28
212 0.35
213 0.36
214 0.39
215 0.45
216 0.53
217 0.56
218 0.59
219 0.53
220 0.5
221 0.5
222 0.47
223 0.4
224 0.33
225 0.29
226 0.2
227 0.18
228 0.15
229 0.12
230 0.11
231 0.1
232 0.09
233 0.03
234 0.03
235 0.03
236 0.03
237 0.03
238 0.03
239 0.04
240 0.05
241 0.05
242 0.06
243 0.07
244 0.09
245 0.09
246 0.09
247 0.1
248 0.11
249 0.11
250 0.11
251 0.11
252 0.09
253 0.1
254 0.11
255 0.1
256 0.1
257 0.14
258 0.17
259 0.22
260 0.22
261 0.23
262 0.25
263 0.26
264 0.27
265 0.28
266 0.33
267 0.34
268 0.43
269 0.42
270 0.45
271 0.43
272 0.43
273 0.49
274 0.49
275 0.5
276 0.46
277 0.51
278 0.49
279 0.52
280 0.54
281 0.49
282 0.44
283 0.4
284 0.39
285 0.36
286 0.35
287 0.34
288 0.34
289 0.28
290 0.27
291 0.31
292 0.32
293 0.34
294 0.36
295 0.37
296 0.36
297 0.43
298 0.47
299 0.51
300 0.53
301 0.54
302 0.61
303 0.64
304 0.63
305 0.61
306 0.6
307 0.54
308 0.51
309 0.47
310 0.41
311 0.35
312 0.32
313 0.28
314 0.21
315 0.2
316 0.16
317 0.15
318 0.12
319 0.12
320 0.13
321 0.12
322 0.14
323 0.13
324 0.12
325 0.15
326 0.16
327 0.19
328 0.19
329 0.21
330 0.2
331 0.19
332 0.18
333 0.15
334 0.15
335 0.1
336 0.12
337 0.11
338 0.1
339 0.11
340 0.1
341 0.1
342 0.1
343 0.1
344 0.07
345 0.07
346 0.08
347 0.08
348 0.08
349 0.09
350 0.1
351 0.09
352 0.09
353 0.1
354 0.11
355 0.12
356 0.13
357 0.13
358 0.13
359 0.15
360 0.19
361 0.21
362 0.23
363 0.29
364 0.29
365 0.32
366 0.34
367 0.35
368 0.36
369 0.39
370 0.37
371 0.34
372 0.36
373 0.4
374 0.46
375 0.48
376 0.5
377 0.48
378 0.52
379 0.57
380 0.65
381 0.68
382 0.68
383 0.73
384 0.74
385 0.71
386 0.7
387 0.7
388 0.69
389 0.67
390 0.63
391 0.62
392 0.59
393 0.57
394 0.6
395 0.61
396 0.6
397 0.58
398 0.6
399 0.58
400 0.55
401 0.56
402 0.59
403 0.58
404 0.55
405 0.51
406 0.5
407 0.46
408 0.46
409 0.47
410 0.43
411 0.43
412 0.41
413 0.42
414 0.38
415 0.38
416 0.45
417 0.51
418 0.57