FuNGI

A0A2T2N9R6

Protein Details

Accession

A0A2T2N9R6

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
53-80	VSLNRIRGFKKMRRWKDKKLVLDALRKS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
59-71	RGFKKMRRWKDKK

Subcellular Location(s)

nucl 14, cyto 10, pero 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR018606 Arb1 IPR045180 La_dom_prot IPR006630 La_HTH IPR036388 WH-like_DNA-bd_sf IPR036390 WH_DNA-bd_sf
Gene Ontology	GO:0033167 C:ARC complex GO:0003723 F:RNA binding GO:0031047 P:RNA-mediated gene silencing
Pfam	View protein in Pfam PF09692 Arb1 PF05383 La
PROSITE	View protein in PROSITE PS50961 HTH_LA

Amino Acid Sequences

MADSSTDLERDAPEEHPDAPEIRRQVEYYFSDENLPTDLHLLQCCGGRENIPVSLNRIRGFKKMRRWKDKKLVLDALRKSATLDVSEDGKTIKRKVPLRGLCALDPGFLEGFKDDDIAYHPKLKKLAQYPVPLLPQKKKEYPPGTSKNMMKPTGFESHVEDLLTLQEAEEEIAMYDPQKPFVDRIEIAIQRFKQKRRMHEIYSKIFNKWMKFGGVDCTPRMFSGLTPQEMKEMTGEEIARAQATHNVPWDREDETRWVVDFDGVAAAFLSAFYPNNYGYEPHGVKTACQVLRSFLNYLLYHNVCPEHAASIHKALTICDTAQRELPKLYNAGLNLPGAYNKAASTLFGGSHMGTFTGDAKWAEGFDLNDIGVRNEEARITFATAVCIHGTDEQFNMIEPATKGSTRNTSAFRIKNDFEVSLEVLSIDVPTAETVDFYVKQNDLYTNKKMFLEPTGIMTCCIVSRPSPEDYDLPADYDMPTVPKDPLNFWVESPALENCFVGMKMHARVLGLTGGLYVLDEVREVLTSFWTCLPNEMWMIRKPKEVRIMDRAMPGYEEPLDLEDGEEVSIVQGRSKGDAEKDGDGDEVPEDEFDDE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.21
2	0.21
3	0.22
4	0.23
5	0.24
6	0.24
7	0.28
8	0.27
9	0.28
10	0.3
11	0.29
12	0.29
13	0.33
14	0.34
15	0.34
16	0.34
17	0.31
18	0.33
19	0.32
20	0.31
21	0.25
22	0.22
23	0.17
24	0.16
25	0.16
26	0.15
27	0.15
28	0.16
29	0.16
30	0.19
31	0.2
32	0.2
33	0.2
34	0.19
35	0.22
36	0.23
37	0.26
38	0.25
39	0.25
40	0.29
41	0.34
42	0.37
43	0.36
44	0.39
45	0.37
46	0.43
47	0.52
48	0.53
49	0.58
50	0.65
51	0.74
52	0.79
53	0.85
54	0.88
55	0.89
56	0.9
57	0.88
58	0.86
59	0.85
60	0.81
61	0.82
62	0.74
63	0.7
64	0.62
65	0.53
66	0.45
67	0.38
68	0.32
69	0.24
70	0.22
71	0.17
72	0.19
73	0.19
74	0.18
75	0.16
76	0.2
77	0.22
78	0.25
79	0.29
80	0.34
81	0.4
82	0.48
83	0.57
84	0.6
85	0.61
86	0.64
87	0.62
88	0.55
89	0.54
90	0.46
91	0.36
92	0.28
93	0.24
94	0.18
95	0.14
96	0.14
97	0.09
98	0.09
99	0.09
100	0.09
101	0.07
102	0.07
103	0.12
104	0.16
105	0.18
106	0.25
107	0.27
108	0.3
109	0.34
110	0.36
111	0.39
112	0.42
113	0.49
114	0.48
115	0.52
116	0.53
117	0.54
118	0.58
119	0.54
120	0.53
121	0.51
122	0.52
123	0.53
124	0.58
125	0.58
126	0.62
127	0.64
128	0.66
129	0.68
130	0.68
131	0.67
132	0.66
133	0.66
134	0.64
135	0.64
136	0.6
137	0.5
138	0.44
139	0.42
140	0.41
141	0.37
142	0.29
143	0.27
144	0.28
145	0.28
146	0.26
147	0.21
148	0.16
149	0.15
150	0.15
151	0.09
152	0.06
153	0.05
154	0.05
155	0.06
156	0.05
157	0.05
158	0.04
159	0.05
160	0.05
161	0.05
162	0.1
163	0.1
164	0.13
165	0.14
166	0.14
167	0.15
168	0.18
169	0.23
170	0.18
171	0.22
172	0.27
173	0.28
174	0.28
175	0.32
176	0.31
177	0.35
178	0.41
179	0.42
180	0.45
181	0.48
182	0.56
183	0.61
184	0.67
185	0.65
186	0.67
187	0.71
188	0.67
189	0.71
190	0.63
191	0.54
192	0.52
193	0.48
194	0.41
195	0.36
196	0.31
197	0.24
198	0.23
199	0.23
200	0.22
201	0.24
202	0.24
203	0.22
204	0.22
205	0.21
206	0.2
207	0.2
208	0.16
209	0.11
210	0.18
211	0.21
212	0.21
213	0.22
214	0.22
215	0.23
216	0.23
217	0.23
218	0.15
219	0.12
220	0.11
221	0.11
222	0.11
223	0.09
224	0.1
225	0.1
226	0.09
227	0.08
228	0.08
229	0.12
230	0.13
231	0.14
232	0.18
233	0.19
234	0.2
235	0.21
236	0.22
237	0.19
238	0.19
239	0.19
240	0.18
241	0.18
242	0.19
243	0.17
244	0.16
245	0.13
246	0.13
247	0.11
248	0.07
249	0.06
250	0.05
251	0.05
252	0.04
253	0.04
254	0.03
255	0.03
256	0.04
257	0.03
258	0.04
259	0.04
260	0.06
261	0.06
262	0.07
263	0.08
264	0.08
265	0.09
266	0.16
267	0.16
268	0.15
269	0.18
270	0.17
271	0.17
272	0.19
273	0.25
274	0.2
275	0.2
276	0.2
277	0.18
278	0.2
279	0.22
280	0.2
281	0.13
282	0.17
283	0.16
284	0.16
285	0.19
286	0.17
287	0.16
288	0.15
289	0.15
290	0.11
291	0.11
292	0.11
293	0.07
294	0.08
295	0.09
296	0.1
297	0.12
298	0.12
299	0.13
300	0.13
301	0.12
302	0.12
303	0.12
304	0.11
305	0.13
306	0.14
307	0.13
308	0.16
309	0.17
310	0.16
311	0.17
312	0.18
313	0.15
314	0.14
315	0.15
316	0.13
317	0.13
318	0.13
319	0.13
320	0.12
321	0.1
322	0.1
323	0.09
324	0.08
325	0.08
326	0.07
327	0.06
328	0.07
329	0.07
330	0.07
331	0.08
332	0.08
333	0.08
334	0.08
335	0.09
336	0.08
337	0.08
338	0.08
339	0.06
340	0.05
341	0.06
342	0.06
343	0.06
344	0.07
345	0.07
346	0.07
347	0.07
348	0.08
349	0.08
350	0.08
351	0.08
352	0.07
353	0.08
354	0.07
355	0.08
356	0.08
357	0.08
358	0.07
359	0.07
360	0.07
361	0.07
362	0.08
363	0.07
364	0.08
365	0.08
366	0.1
367	0.11
368	0.1
369	0.12
370	0.12
371	0.12
372	0.11
373	0.11
374	0.1
375	0.12
376	0.12
377	0.11
378	0.11
379	0.11
380	0.11
381	0.1
382	0.11
383	0.07
384	0.09
385	0.08
386	0.11
387	0.11
388	0.12
389	0.13
390	0.16
391	0.21
392	0.22
393	0.26
394	0.27
395	0.31
396	0.38
397	0.41
398	0.43
399	0.43
400	0.4
401	0.41
402	0.4
403	0.35
404	0.28
405	0.26
406	0.22
407	0.16
408	0.15
409	0.11
410	0.08
411	0.08
412	0.07
413	0.04
414	0.03
415	0.03
416	0.04
417	0.05
418	0.04
419	0.05
420	0.05
421	0.08
422	0.1
423	0.11
424	0.14
425	0.14
426	0.15
427	0.16
428	0.2
429	0.22
430	0.26
431	0.31
432	0.31
433	0.34
434	0.34
435	0.33
436	0.3
437	0.28
438	0.28
439	0.22
440	0.24
441	0.24
442	0.23
443	0.23
444	0.21
445	0.18
446	0.14
447	0.14
448	0.1
449	0.09
450	0.14
451	0.17
452	0.2
453	0.21
454	0.24
455	0.25
456	0.27
457	0.3
458	0.25
459	0.23
460	0.21
461	0.19
462	0.17
463	0.16
464	0.13
465	0.1
466	0.11
467	0.11
468	0.13
469	0.15
470	0.16
471	0.18
472	0.23
473	0.26
474	0.26
475	0.24
476	0.27
477	0.25
478	0.23
479	0.24
480	0.2
481	0.17
482	0.17
483	0.16
484	0.12
485	0.13
486	0.13
487	0.11
488	0.12
489	0.14
490	0.15
491	0.17
492	0.18
493	0.17
494	0.17
495	0.17
496	0.16
497	0.12
498	0.1
499	0.08
500	0.07
501	0.07
502	0.07
503	0.05
504	0.04
505	0.04
506	0.05
507	0.05
508	0.06
509	0.06
510	0.07
511	0.07
512	0.1
513	0.11
514	0.13
515	0.16
516	0.18
517	0.18
518	0.2
519	0.21
520	0.2
521	0.23
522	0.23
523	0.24
524	0.28
525	0.35
526	0.35
527	0.42
528	0.43
529	0.47
530	0.55
531	0.58
532	0.59
533	0.6
534	0.64
535	0.6
536	0.63
537	0.57
538	0.47
539	0.43
540	0.36
541	0.3
542	0.24
543	0.2
544	0.15
545	0.15
546	0.15
547	0.13
548	0.13
549	0.1
550	0.1
551	0.09
552	0.09
553	0.07
554	0.06
555	0.1
556	0.1
557	0.11
558	0.13
559	0.14
560	0.18
561	0.2
562	0.23
563	0.23
564	0.3
565	0.32
566	0.33
567	0.34
568	0.31
569	0.3
570	0.26
571	0.23
572	0.17
573	0.14
574	0.11
575	0.09

A0A2T2N9R6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer