Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

V5IRC9

Protein Details
Accession V5IRC9    Localization Confidence High Confidence Score 18
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
67-88DSFGTRRRTRGQQEERERANNKHydrophilic
458-486AATPTAKIEKKRSHKKKGRNQYTRDDNEPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
339-341RGG
343-377AGRTLRTEKTTEKEERERQRAEAANKRKGRAERRR
464-476KIEKKRSHKKKGR
505-521KPSKAEEKATGHGKQGK
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto_nucl 10.5, mito 8, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019786  Zinc_finger_PHD-type_CS  
IPR011011  Znf_FYVE_PHD  
IPR001965  Znf_PHD  
IPR019787  Znf_PHD-finger  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0033698  C:Rpd3L complex  
GO:0070210  C:Rpd3L-Expanded complex  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0035064  F:methylated histone binding  
GO:0061188  P:negative regulation of rDNA heterochromatin formation  
GO:0061186  P:negative regulation of silent mating-type cassette heterochromatin formation  
Pfam View protein in Pfam  
PF00628  PHD  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS01359  ZF_PHD_1  
Amino Acid Sequences MAGSDPRRSSRARTSQSQSQISSSTSSTSGRGERSTRYFNKAVSPQKSSSSGSLSSEAPDETITADDSFGTRRRTRGQQEERERANNKSEQVEMAHGDDDAQDEDEAVRCICGYEDYPGPPPFDEDSKHGLKDGMDIDPIFATDVTDDAAGFFVQCDICKVWQHGACVGIMTEESSPDEYFCEECRKEFHKIFTASNGQRYSHYLPLKRPSRTTSRSASLNKDGTRSPPKDKPEGRNGRGTTTSSASKRRSTMNSRGADYDEAEALRRAIEASKEDAASEQPETTTRRTKRGRSDSEEKSENKRQRTSSRSASPSLDKTTEDSDDAGTTTRNGAKSRSRGGVAGRTLRTEKTTEKEERERQRAEAANKRKGRAERRRADDSDPSDELPLAARAAVNKTPATTTPVAAATAVTTTTTTTTTTMATPAAAEEPAEQEEQSPAVPEPPPASQSTPEDPPAAATPTAKIEKKRSHKKKGRNQYTRDDNEPSPARSQSGEAPAEVPPPPKPSKAEEKATGHGKQGKNKGGMNSKITMTDMKRRAAALLDFISRTQVELAGESPSDDDKTNGNSVAPQLATDCEKPGSATGILGVNCSTPAAVMTSEGQLGKDFKDLSCVEMMDSLTRRLVKWQQEYTV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.66
2 0.71
3 0.77
4 0.76
5 0.66
6 0.59
7 0.54
8 0.46
9 0.41
10 0.33
11 0.26
12 0.22
13 0.21
14 0.2
15 0.22
16 0.25
17 0.26
18 0.3
19 0.31
20 0.36
21 0.42
22 0.5
23 0.51
24 0.54
25 0.54
26 0.51
27 0.57
28 0.59
29 0.61
30 0.58
31 0.59
32 0.54
33 0.55
34 0.57
35 0.51
36 0.46
37 0.41
38 0.37
39 0.33
40 0.33
41 0.29
42 0.26
43 0.24
44 0.21
45 0.16
46 0.14
47 0.12
48 0.1
49 0.1
50 0.1
51 0.09
52 0.09
53 0.09
54 0.1
55 0.13
56 0.17
57 0.24
58 0.25
59 0.3
60 0.37
61 0.46
62 0.55
63 0.62
64 0.68
65 0.72
66 0.79
67 0.84
68 0.83
69 0.82
70 0.76
71 0.69
72 0.65
73 0.59
74 0.52
75 0.46
76 0.41
77 0.34
78 0.33
79 0.32
80 0.26
81 0.23
82 0.2
83 0.16
84 0.15
85 0.13
86 0.13
87 0.1
88 0.1
89 0.08
90 0.08
91 0.09
92 0.1
93 0.11
94 0.09
95 0.08
96 0.07
97 0.08
98 0.08
99 0.09
100 0.09
101 0.12
102 0.15
103 0.17
104 0.23
105 0.25
106 0.26
107 0.24
108 0.26
109 0.25
110 0.25
111 0.25
112 0.24
113 0.29
114 0.31
115 0.31
116 0.28
117 0.27
118 0.24
119 0.26
120 0.24
121 0.19
122 0.17
123 0.17
124 0.17
125 0.15
126 0.15
127 0.11
128 0.09
129 0.07
130 0.06
131 0.06
132 0.06
133 0.06
134 0.05
135 0.05
136 0.06
137 0.05
138 0.05
139 0.05
140 0.06
141 0.06
142 0.06
143 0.09
144 0.1
145 0.13
146 0.15
147 0.18
148 0.23
149 0.25
150 0.27
151 0.26
152 0.25
153 0.23
154 0.21
155 0.18
156 0.12
157 0.09
158 0.08
159 0.07
160 0.06
161 0.07
162 0.09
163 0.09
164 0.09
165 0.09
166 0.09
167 0.11
168 0.12
169 0.19
170 0.18
171 0.19
172 0.24
173 0.28
174 0.34
175 0.36
176 0.39
177 0.4
178 0.43
179 0.43
180 0.43
181 0.48
182 0.43
183 0.46
184 0.43
185 0.35
186 0.33
187 0.37
188 0.36
189 0.34
190 0.38
191 0.35
192 0.39
193 0.48
194 0.54
195 0.52
196 0.51
197 0.49
198 0.53
199 0.53
200 0.53
201 0.49
202 0.46
203 0.51
204 0.51
205 0.52
206 0.49
207 0.5
208 0.45
209 0.42
210 0.38
211 0.38
212 0.43
213 0.41
214 0.41
215 0.42
216 0.46
217 0.54
218 0.6
219 0.6
220 0.62
221 0.68
222 0.65
223 0.66
224 0.63
225 0.56
226 0.51
227 0.46
228 0.37
229 0.3
230 0.32
231 0.27
232 0.33
233 0.33
234 0.34
235 0.35
236 0.38
237 0.42
238 0.44
239 0.5
240 0.52
241 0.52
242 0.5
243 0.49
244 0.46
245 0.39
246 0.32
247 0.23
248 0.15
249 0.12
250 0.11
251 0.1
252 0.08
253 0.07
254 0.06
255 0.06
256 0.06
257 0.08
258 0.09
259 0.11
260 0.13
261 0.12
262 0.12
263 0.13
264 0.12
265 0.12
266 0.11
267 0.08
268 0.07
269 0.1
270 0.12
271 0.15
272 0.24
273 0.25
274 0.33
275 0.39
276 0.45
277 0.53
278 0.61
279 0.65
280 0.64
281 0.71
282 0.67
283 0.67
284 0.66
285 0.58
286 0.55
287 0.56
288 0.54
289 0.5
290 0.49
291 0.48
292 0.51
293 0.55
294 0.53
295 0.53
296 0.55
297 0.53
298 0.5
299 0.48
300 0.43
301 0.4
302 0.36
303 0.29
304 0.22
305 0.2
306 0.2
307 0.18
308 0.16
309 0.13
310 0.11
311 0.1
312 0.1
313 0.09
314 0.07
315 0.06
316 0.07
317 0.09
318 0.11
319 0.11
320 0.15
321 0.2
322 0.24
323 0.28
324 0.29
325 0.27
326 0.27
327 0.29
328 0.31
329 0.28
330 0.3
331 0.26
332 0.26
333 0.26
334 0.25
335 0.25
336 0.22
337 0.21
338 0.19
339 0.25
340 0.28
341 0.32
342 0.4
343 0.47
344 0.53
345 0.57
346 0.56
347 0.5
348 0.52
349 0.52
350 0.5
351 0.51
352 0.5
353 0.53
354 0.54
355 0.55
356 0.54
357 0.56
358 0.6
359 0.62
360 0.64
361 0.64
362 0.67
363 0.73
364 0.71
365 0.67
366 0.64
367 0.57
368 0.51
369 0.43
370 0.37
371 0.3
372 0.27
373 0.23
374 0.16
375 0.13
376 0.07
377 0.06
378 0.06
379 0.07
380 0.1
381 0.11
382 0.12
383 0.12
384 0.13
385 0.14
386 0.14
387 0.19
388 0.17
389 0.16
390 0.16
391 0.16
392 0.16
393 0.14
394 0.13
395 0.08
396 0.07
397 0.07
398 0.05
399 0.05
400 0.05
401 0.06
402 0.06
403 0.07
404 0.07
405 0.08
406 0.09
407 0.09
408 0.1
409 0.09
410 0.08
411 0.08
412 0.07
413 0.08
414 0.07
415 0.06
416 0.06
417 0.08
418 0.09
419 0.1
420 0.09
421 0.09
422 0.09
423 0.09
424 0.09
425 0.09
426 0.07
427 0.1
428 0.1
429 0.11
430 0.12
431 0.13
432 0.15
433 0.16
434 0.18
435 0.19
436 0.23
437 0.26
438 0.26
439 0.27
440 0.26
441 0.23
442 0.23
443 0.22
444 0.2
445 0.16
446 0.14
447 0.13
448 0.17
449 0.23
450 0.24
451 0.27
452 0.34
453 0.43
454 0.53
455 0.63
456 0.69
457 0.75
458 0.82
459 0.88
460 0.9
461 0.92
462 0.93
463 0.92
464 0.88
465 0.87
466 0.88
467 0.82
468 0.76
469 0.7
470 0.59
471 0.57
472 0.54
473 0.47
474 0.39
475 0.35
476 0.31
477 0.27
478 0.28
479 0.25
480 0.28
481 0.26
482 0.23
483 0.24
484 0.23
485 0.25
486 0.25
487 0.21
488 0.17
489 0.23
490 0.26
491 0.28
492 0.31
493 0.35
494 0.44
495 0.49
496 0.54
497 0.55
498 0.57
499 0.59
500 0.63
501 0.58
502 0.53
503 0.54
504 0.52
505 0.52
506 0.55
507 0.56
508 0.55
509 0.57
510 0.58
511 0.59
512 0.6
513 0.56
514 0.51
515 0.44
516 0.4
517 0.38
518 0.37
519 0.32
520 0.36
521 0.37
522 0.36
523 0.37
524 0.36
525 0.36
526 0.34
527 0.31
528 0.26
529 0.24
530 0.24
531 0.23
532 0.22
533 0.24
534 0.2
535 0.19
536 0.15
537 0.13
538 0.12
539 0.12
540 0.13
541 0.12
542 0.12
543 0.12
544 0.12
545 0.12
546 0.13
547 0.12
548 0.13
549 0.14
550 0.18
551 0.2
552 0.2
553 0.19
554 0.19
555 0.2
556 0.23
557 0.2
558 0.16
559 0.15
560 0.16
561 0.2
562 0.19
563 0.2
564 0.17
565 0.17
566 0.18
567 0.18
568 0.19
569 0.16
570 0.15
571 0.14
572 0.18
573 0.17
574 0.17
575 0.16
576 0.13
577 0.13
578 0.13
579 0.11
580 0.06
581 0.07
582 0.08
583 0.07
584 0.09
585 0.1
586 0.12
587 0.14
588 0.15
589 0.14
590 0.16
591 0.17
592 0.17
593 0.2
594 0.2
595 0.17
596 0.25
597 0.25
598 0.25
599 0.26
600 0.25
601 0.21
602 0.23
603 0.24
604 0.22
605 0.24
606 0.23
607 0.24
608 0.25
609 0.25
610 0.31
611 0.38
612 0.42
613 0.49