Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q7SHK5

Protein Details
Accession Q7SHK5    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
24-51DDIAIKKSSTPKTKRAPAKPKNDAADRDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
35-42KTKRAPAK
Subcellular Location(s) cyto 15cyto_nucl 15, nucl 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR018814  DUF5427  
KEGG ncr:NCU02899  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF10310  DUF5427  
Amino Acid Sequences MATKRSKTDPTDDELGELFEGIGDDIAIKKSSTPKTKRAPAKPKNDAADRDILAELEDELVSKAPERPHTPRVRDIAARASPAKRTSTNTPPPPAADTGASTRKSGESTASHPTDTFTPSATSSDPHESEKKPAEKPQPAANSGGSWWGGFLSTAASTAAAAVKQAEAAVKEIQQNEEAKKWADQVRGNVGALRGLVGEDLVHRAIPTFTNILHTLAPPISSHERLLIHITHDFVGYPSLDPLIHGVFSRVMSQVEGGDLLVIQRGQESTARNSSEKPSFFGGSSTVGWRDGPWWRQVEIPRDLGVINGLVEGTKLCRANAEGYANDYFAAHGGIEAARQRAMEPARESNPVRTSDIFLSVQAIGVKEDKALFAGSSASEKEKESSDVLDEDKTDDLVCFAVYLFDPIHDIQYSAVSQSIPAKWIRWLDAAAAPLTPGSADEGQEFDFERVPEEIREIVESGGVDPREWVAEWVEEALNLSVGIIAQRYVARRMGVGEGSIGKGKQKVETILEEGGSEAARAGLI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.4
2 0.36
3 0.27
4 0.22
5 0.15
6 0.08
7 0.08
8 0.07
9 0.06
10 0.05
11 0.05
12 0.07
13 0.09
14 0.09
15 0.09
16 0.13
17 0.22
18 0.31
19 0.41
20 0.47
21 0.55
22 0.65
23 0.74
24 0.81
25 0.84
26 0.86
27 0.85
28 0.89
29 0.89
30 0.87
31 0.85
32 0.82
33 0.76
34 0.69
35 0.67
36 0.56
37 0.49
38 0.41
39 0.33
40 0.26
41 0.21
42 0.17
43 0.1
44 0.09
45 0.07
46 0.08
47 0.08
48 0.08
49 0.09
50 0.13
51 0.17
52 0.24
53 0.3
54 0.37
55 0.46
56 0.56
57 0.6
58 0.64
59 0.65
60 0.64
61 0.6
62 0.57
63 0.56
64 0.49
65 0.47
66 0.44
67 0.42
68 0.41
69 0.41
70 0.42
71 0.36
72 0.39
73 0.42
74 0.48
75 0.55
76 0.58
77 0.59
78 0.56
79 0.55
80 0.53
81 0.47
82 0.39
83 0.3
84 0.25
85 0.26
86 0.31
87 0.3
88 0.27
89 0.26
90 0.25
91 0.25
92 0.24
93 0.23
94 0.19
95 0.22
96 0.3
97 0.3
98 0.29
99 0.28
100 0.29
101 0.26
102 0.25
103 0.22
104 0.15
105 0.15
106 0.15
107 0.17
108 0.16
109 0.15
110 0.16
111 0.22
112 0.22
113 0.25
114 0.3
115 0.3
116 0.36
117 0.44
118 0.46
119 0.44
120 0.51
121 0.56
122 0.57
123 0.59
124 0.61
125 0.59
126 0.55
127 0.53
128 0.45
129 0.36
130 0.29
131 0.28
132 0.2
133 0.13
134 0.11
135 0.09
136 0.08
137 0.07
138 0.07
139 0.06
140 0.05
141 0.06
142 0.06
143 0.06
144 0.05
145 0.06
146 0.07
147 0.05
148 0.05
149 0.05
150 0.05
151 0.05
152 0.06
153 0.06
154 0.06
155 0.09
156 0.1
157 0.12
158 0.15
159 0.16
160 0.17
161 0.19
162 0.22
163 0.22
164 0.23
165 0.22
166 0.2
167 0.2
168 0.24
169 0.26
170 0.28
171 0.29
172 0.3
173 0.34
174 0.35
175 0.34
176 0.3
177 0.25
178 0.21
179 0.18
180 0.14
181 0.08
182 0.06
183 0.06
184 0.04
185 0.04
186 0.04
187 0.06
188 0.06
189 0.05
190 0.05
191 0.06
192 0.07
193 0.07
194 0.09
195 0.08
196 0.08
197 0.12
198 0.12
199 0.13
200 0.13
201 0.13
202 0.13
203 0.12
204 0.12
205 0.09
206 0.12
207 0.15
208 0.15
209 0.15
210 0.17
211 0.17
212 0.18
213 0.2
214 0.17
215 0.15
216 0.15
217 0.15
218 0.12
219 0.12
220 0.11
221 0.08
222 0.09
223 0.07
224 0.07
225 0.06
226 0.06
227 0.06
228 0.06
229 0.07
230 0.06
231 0.06
232 0.06
233 0.07
234 0.07
235 0.08
236 0.09
237 0.08
238 0.08
239 0.08
240 0.08
241 0.07
242 0.06
243 0.06
244 0.05
245 0.04
246 0.03
247 0.03
248 0.03
249 0.03
250 0.03
251 0.03
252 0.04
253 0.04
254 0.07
255 0.09
256 0.12
257 0.16
258 0.18
259 0.19
260 0.2
261 0.24
262 0.26
263 0.25
264 0.24
265 0.22
266 0.21
267 0.21
268 0.2
269 0.17
270 0.14
271 0.14
272 0.13
273 0.11
274 0.1
275 0.1
276 0.1
277 0.11
278 0.14
279 0.16
280 0.19
281 0.2
282 0.21
283 0.25
284 0.29
285 0.33
286 0.32
287 0.32
288 0.27
289 0.26
290 0.25
291 0.21
292 0.17
293 0.1
294 0.07
295 0.05
296 0.04
297 0.04
298 0.04
299 0.04
300 0.05
301 0.08
302 0.08
303 0.08
304 0.09
305 0.11
306 0.13
307 0.17
308 0.18
309 0.15
310 0.18
311 0.18
312 0.18
313 0.16
314 0.14
315 0.1
316 0.08
317 0.08
318 0.05
319 0.04
320 0.04
321 0.04
322 0.06
323 0.07
324 0.08
325 0.08
326 0.08
327 0.09
328 0.13
329 0.15
330 0.18
331 0.2
332 0.25
333 0.27
334 0.32
335 0.33
336 0.33
337 0.36
338 0.34
339 0.33
340 0.29
341 0.3
342 0.26
343 0.29
344 0.24
345 0.19
346 0.19
347 0.16
348 0.16
349 0.14
350 0.13
351 0.1
352 0.1
353 0.1
354 0.09
355 0.1
356 0.09
357 0.09
358 0.09
359 0.07
360 0.07
361 0.07
362 0.07
363 0.08
364 0.09
365 0.11
366 0.12
367 0.13
368 0.14
369 0.15
370 0.16
371 0.16
372 0.16
373 0.16
374 0.16
375 0.17
376 0.16
377 0.15
378 0.14
379 0.14
380 0.13
381 0.11
382 0.09
383 0.08
384 0.07
385 0.07
386 0.05
387 0.05
388 0.06
389 0.06
390 0.07
391 0.07
392 0.07
393 0.09
394 0.09
395 0.12
396 0.11
397 0.11
398 0.1
399 0.12
400 0.12
401 0.11
402 0.11
403 0.09
404 0.1
405 0.15
406 0.15
407 0.15
408 0.16
409 0.17
410 0.2
411 0.23
412 0.25
413 0.23
414 0.22
415 0.23
416 0.24
417 0.25
418 0.21
419 0.18
420 0.15
421 0.13
422 0.12
423 0.09
424 0.06
425 0.09
426 0.09
427 0.1
428 0.11
429 0.13
430 0.13
431 0.14
432 0.15
433 0.12
434 0.14
435 0.13
436 0.15
437 0.15
438 0.16
439 0.15
440 0.16
441 0.17
442 0.15
443 0.17
444 0.15
445 0.14
446 0.14
447 0.13
448 0.12
449 0.15
450 0.15
451 0.13
452 0.13
453 0.14
454 0.14
455 0.14
456 0.14
457 0.11
458 0.12
459 0.13
460 0.14
461 0.14
462 0.12
463 0.13
464 0.12
465 0.1
466 0.09
467 0.08
468 0.06
469 0.06
470 0.07
471 0.06
472 0.06
473 0.08
474 0.11
475 0.13
476 0.17
477 0.19
478 0.19
479 0.2
480 0.22
481 0.24
482 0.22
483 0.2
484 0.2
485 0.19
486 0.2
487 0.22
488 0.2
489 0.19
490 0.22
491 0.23
492 0.25
493 0.28
494 0.31
495 0.33
496 0.38
497 0.39
498 0.37
499 0.35
500 0.31
501 0.26
502 0.23
503 0.18
504 0.13
505 0.09