FuNGI

A0A2T2P2J6

Protein Details

Accession

A0A2T2P2J6

Localization Confidence

High

Confidence Score

16.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
487-513	DASGNESSRKKHKKKHDKLKSSALKGA	Basic
521-540	MTDAGKSKKHKLKVRLGGAS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
135-139	RRKIR
145-145	K
147-153	APSGAKK
477-480	KKRP
493-512	SSRKKHKKKHDKLKSSALKG
525-539	GKSKKHKLKVRLGGA

Subcellular Location(s)

mito_nucl 13.833, nucl 13.5, mito 13, cyto_mito 7.333

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter

Amino Acid Sequences

MRPPRRPLKQIARPLVSLTQMNETPAQKKEATKADEGASVEALKQEYLAKGAMRLPLVLTKRDLRSLRHHVMRLQSKGRVNIEDEEQFTPPIRLHRRDPRAPPSGAGSHFEEEETKEDVEEAKERERLEMQKEERRKIREENMAKIAPSGAKKPAVPFQKKTEQKYRPDDTPEARKRQLLRYEETLPWHLEDFENKQTWVGTYESELSEAHVMLTPDFSNGQGAIQMAPMERWYRFQVKSKVKGTNAEDVDKALAKTEKVPSFLSNLEKRNMKREQEYEAEQRRGMRTRVGGKGDDDEGRIRPRRPDDDEIVIKREADADDIDFNVEEDFADDEEGLNGLFEGEDVEVKDAAERLKRDQLAANAFELRSEEQIYRQEEREKAAAEEAKIFEKQLRKALARREKNYDYLDDDENKYGDTSEDETDSETERQRAKEEEEKKAAEQNGNDPEGAKVGSGASTKGSNTPLAIHKAVDMNKKKRPGSPNLSDASGNESSRKKHKKKHDKLKSSALKGAASGSESEMTDAGKSKKHKLKVRLGGASPGGSPGGSRAGSPAATQANGSRAGSPAAPGSAIHKLETRLPSAQEIYDALPAGGMTIQSLITTFKDRVDKSNTQLFIRLVKAVSSFDKQRSWLTPLAEMPAAETINAVMNNQK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.68
2	0.61
3	0.54
4	0.46
5	0.37
6	0.33
7	0.29
8	0.3
9	0.32
10	0.31
11	0.32
12	0.33
13	0.35
14	0.33
15	0.36
16	0.41
17	0.45
18	0.47
19	0.46
20	0.47
21	0.44
22	0.45
23	0.42
24	0.36
25	0.28
26	0.23
27	0.2
28	0.18
29	0.17
30	0.12
31	0.12
32	0.13
33	0.13
34	0.14
35	0.16
36	0.14
37	0.16
38	0.19
39	0.22
40	0.2
41	0.2
42	0.19
43	0.25
44	0.27
45	0.27
46	0.28
47	0.32
48	0.34
49	0.42
50	0.44
51	0.43
52	0.5
53	0.57
54	0.62
55	0.62
56	0.62
57	0.59
58	0.66
59	0.68
60	0.66
61	0.62
62	0.6
63	0.58
64	0.61
65	0.6
66	0.54
67	0.49
68	0.44
69	0.43
70	0.4
71	0.38
72	0.33
73	0.3
74	0.28
75	0.25
76	0.23
77	0.2
78	0.26
79	0.31
80	0.34
81	0.42
82	0.52
83	0.6
84	0.68
85	0.75
86	0.74
87	0.73
88	0.69
89	0.62
90	0.57
91	0.54
92	0.47
93	0.41
94	0.36
95	0.3
96	0.29
97	0.28
98	0.23
99	0.19
100	0.2
101	0.19
102	0.15
103	0.14
104	0.14
105	0.15
106	0.16
107	0.19
108	0.19
109	0.21
110	0.24
111	0.25
112	0.27
113	0.31
114	0.33
115	0.34
116	0.41
117	0.43
118	0.49
119	0.56
120	0.61
121	0.63
122	0.63
123	0.62
124	0.6
125	0.63
126	0.64
127	0.62
128	0.61
129	0.61
130	0.58
131	0.53
132	0.45
133	0.39
134	0.32
135	0.29
136	0.26
137	0.22
138	0.24
139	0.25
140	0.28
141	0.33
142	0.4
143	0.44
144	0.46
145	0.49
146	0.57
147	0.63
148	0.67
149	0.71
150	0.69
151	0.71
152	0.76
153	0.73
154	0.68
155	0.68
156	0.67
157	0.62
158	0.65
159	0.65
160	0.63
161	0.6
162	0.59
163	0.56
164	0.58
165	0.6
166	0.54
167	0.51
168	0.49
169	0.52
170	0.49
171	0.48
172	0.42
173	0.35
174	0.3
175	0.26
176	0.21
177	0.17
178	0.18
179	0.2
180	0.23
181	0.23
182	0.22
183	0.22
184	0.22
185	0.21
186	0.2
187	0.16
188	0.11
189	0.11
190	0.13
191	0.13
192	0.13
193	0.13
194	0.11
195	0.11
196	0.11
197	0.1
198	0.09
199	0.09
200	0.08
201	0.1
202	0.09
203	0.09
204	0.09
205	0.09
206	0.07
207	0.07
208	0.07
209	0.07
210	0.07
211	0.06
212	0.07
213	0.07
214	0.06
215	0.07
216	0.08
217	0.09
218	0.09
219	0.12
220	0.16
221	0.22
222	0.24
223	0.33
224	0.41
225	0.48
226	0.57
227	0.6
228	0.63
229	0.58
230	0.62
231	0.57
232	0.56
233	0.49
234	0.42
235	0.36
236	0.3
237	0.29
238	0.23
239	0.19
240	0.13
241	0.12
242	0.1
243	0.14
244	0.2
245	0.21
246	0.22
247	0.23
248	0.22
249	0.24
250	0.26
251	0.29
252	0.28
253	0.29
254	0.3
255	0.35
256	0.35
257	0.4
258	0.43
259	0.4
260	0.41
261	0.4
262	0.41
263	0.4
264	0.44
265	0.45
266	0.45
267	0.43
268	0.38
269	0.38
270	0.36
271	0.36
272	0.32
273	0.26
274	0.25
275	0.29
276	0.34
277	0.34
278	0.32
279	0.29
280	0.3
281	0.29
282	0.25
283	0.2
284	0.16
285	0.15
286	0.2
287	0.23
288	0.22
289	0.25
290	0.29
291	0.34
292	0.38
293	0.42
294	0.4
295	0.43
296	0.47
297	0.44
298	0.42
299	0.36
300	0.29
301	0.24
302	0.22
303	0.15
304	0.11
305	0.1
306	0.08
307	0.08
308	0.08
309	0.08
310	0.06
311	0.06
312	0.05
313	0.05
314	0.03
315	0.04
316	0.04
317	0.04
318	0.04
319	0.04
320	0.04
321	0.04
322	0.04
323	0.03
324	0.03
325	0.03
326	0.02
327	0.02
328	0.02
329	0.03
330	0.03
331	0.04
332	0.04
333	0.05
334	0.05
335	0.05
336	0.05
337	0.06
338	0.07
339	0.1
340	0.11
341	0.14
342	0.19
343	0.2
344	0.21
345	0.22
346	0.25
347	0.26
348	0.25
349	0.24
350	0.19
351	0.19
352	0.17
353	0.16
354	0.13
355	0.1
356	0.11
357	0.1
358	0.11
359	0.17
360	0.2
361	0.21
362	0.23
363	0.26
364	0.26
365	0.28
366	0.28
367	0.23
368	0.21
369	0.22
370	0.22
371	0.18
372	0.19
373	0.18
374	0.17
375	0.16
376	0.16
377	0.16
378	0.19
379	0.21
380	0.24
381	0.28
382	0.29
383	0.34
384	0.44
385	0.5
386	0.54
387	0.55
388	0.58
389	0.56
390	0.58
391	0.56
392	0.48
393	0.41
394	0.36
395	0.35
396	0.3
397	0.29
398	0.25
399	0.22
400	0.2
401	0.17
402	0.14
403	0.11
404	0.1
405	0.11
406	0.1
407	0.11
408	0.11
409	0.12
410	0.13
411	0.15
412	0.15
413	0.14
414	0.17
415	0.2
416	0.2
417	0.22
418	0.23
419	0.26
420	0.33
421	0.38
422	0.42
423	0.44
424	0.45
425	0.44
426	0.47
427	0.44
428	0.39
429	0.33
430	0.32
431	0.32
432	0.31
433	0.3
434	0.25
435	0.22
436	0.2
437	0.18
438	0.12
439	0.07
440	0.06
441	0.08
442	0.08
443	0.08
444	0.08
445	0.1
446	0.1
447	0.13
448	0.14
449	0.13
450	0.13
451	0.16
452	0.19
453	0.22
454	0.23
455	0.2
456	0.2
457	0.25
458	0.29
459	0.35
460	0.4
461	0.43
462	0.48
463	0.56
464	0.57
465	0.6
466	0.63
467	0.63
468	0.63
469	0.63
470	0.64
471	0.58
472	0.57
473	0.5
474	0.42
475	0.39
476	0.33
477	0.26
478	0.24
479	0.25
480	0.27
481	0.38
482	0.48
483	0.5
484	0.57
485	0.68
486	0.74
487	0.83
488	0.9
489	0.91
490	0.91
491	0.89
492	0.91
493	0.89
494	0.82
495	0.76
496	0.67
497	0.56
498	0.46
499	0.4
500	0.3
501	0.21
502	0.17
503	0.13
504	0.13
505	0.12
506	0.12
507	0.11
508	0.11
509	0.11
510	0.14
511	0.15
512	0.19
513	0.23
514	0.32
515	0.4
516	0.49
517	0.56
518	0.62
519	0.71
520	0.75
521	0.8
522	0.78
523	0.71
524	0.67
525	0.6
526	0.51
527	0.4
528	0.31
529	0.22
530	0.15
531	0.13
532	0.1
533	0.13
534	0.11
535	0.11
536	0.12
537	0.14
538	0.15
539	0.15
540	0.18
541	0.16
542	0.16
543	0.16
544	0.17
545	0.18
546	0.2
547	0.2
548	0.17
549	0.16
550	0.17
551	0.16
552	0.16
553	0.14
554	0.12
555	0.12
556	0.11
557	0.14
558	0.19
559	0.19
560	0.2
561	0.21
562	0.22
563	0.29
564	0.32
565	0.33
566	0.29
567	0.3
568	0.33
569	0.32
570	0.31
571	0.25
572	0.24
573	0.21
574	0.2
575	0.18
576	0.14
577	0.12
578	0.11
579	0.1
580	0.09
581	0.07
582	0.06
583	0.06
584	0.06
585	0.06
586	0.07
587	0.08
588	0.09
589	0.14
590	0.14
591	0.19
592	0.27
593	0.29
594	0.35
595	0.42
596	0.46
597	0.48
598	0.56
599	0.53
600	0.47
601	0.5
602	0.45
603	0.42
604	0.38
605	0.35
606	0.27
607	0.26
608	0.26
609	0.24
610	0.27
611	0.28
612	0.32
613	0.34
614	0.37
615	0.38
616	0.42
617	0.44
618	0.45
619	0.43
620	0.4
621	0.4
622	0.38
623	0.4
624	0.36
625	0.3
626	0.26
627	0.25
628	0.22
629	0.17
630	0.15
631	0.12
632	0.15
633	0.15

A0A2T2P2J6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer