FuNGI

V5IRK1

Protein Details

Accession

V5IRK1

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
50-72	DDGGDKQPRKRGRPMKSRPSGGV	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
56-68	QPRKRGRPMKSRP

Subcellular Location(s)

nucl 25

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR013933 CRC_Rsc7/Swp82
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0016586 C:RSC-type complex GO:0031490 F:chromatin DNA binding
Pfam	View protein in Pfam PF08624 CRC_subunit

Amino Acid Sequences

MYAAQPNGVDSATINPAALNTDLSGPPRNLKRERSPDDYHYSGPPGSTGDDGGDKQPRKRGRPMKSRPSGGVPEPVGQGPVAPSIQQTLPPQTPQSQSAPLPLPTQTPTYAPAPAPAPAATPLQASPPKTTPTKTTLKALPTVRDHTTDQLGPGGDEYLPREIDEAGEKKVMPNGQLTGNREYRCRTFLVPNRGDKLFMLATECARVLGYRDSYLLFNKNRSLYKIIANQEEKDDLVNQEILPFSYRSRQIAIVTARSMFRQFGSRVITNGRRVRDDYWETKARKQGFTEADLAGEKRPGGTKAREAAAEANQNSMLGGPHGEIIYNTNPGPYGAPQPLVQPGMIGPPPTTSTRMPVITLGPDYHDTRSRDYSTILKTGPRQEITGPPYQDRTQTTPLSELHAQAHHAAEFNRAVNQQREMRGDYLQNLWRRPHDQATATNLNQPVGSEASAVPTSRPAASSHAPSSGLQQPAIVPNQSPQMMMTAAPYSQPLHAQASATQGTMRGMAPAPAQNSSKPTNSSSASSGSMPQPGQNYGYTNSQMWPPTPQTPQHSYSAYTAQPQQPHSQQSPAPQLRHSGSGSQVQPNNMSYSTMPSMNQGYGAPSQGMYSNDQTPRQYMHQSAPSPAVSQPWTQQQQTPATWWTNQPQ

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.14
2	0.13
3	0.13
4	0.15
5	0.15
6	0.12
7	0.1
8	0.13
9	0.15
10	0.18
11	0.23
12	0.22
13	0.3
14	0.36
15	0.44
16	0.48
17	0.55
18	0.63
19	0.69
20	0.74
21	0.75
22	0.74
23	0.73
24	0.74
25	0.69
26	0.61
27	0.53
28	0.49
29	0.41
30	0.34
31	0.28
32	0.21
33	0.19
34	0.18
35	0.15
36	0.13
37	0.16
38	0.17
39	0.21
40	0.28
41	0.3
42	0.34
43	0.42
44	0.49
45	0.53
46	0.63
47	0.67
48	0.7
49	0.77
50	0.83
51	0.86
52	0.87
53	0.86
54	0.79
55	0.77
56	0.72
57	0.64
58	0.6
59	0.51
60	0.45
61	0.41
62	0.37
63	0.3
64	0.24
65	0.21
66	0.14
67	0.15
68	0.12
69	0.11
70	0.11
71	0.14
72	0.14
73	0.18
74	0.2
75	0.24
76	0.27
77	0.29
78	0.32
79	0.34
80	0.37
81	0.36
82	0.37
83	0.36
84	0.34
85	0.37
86	0.37
87	0.34
88	0.32
89	0.29
90	0.28
91	0.25
92	0.27
93	0.22
94	0.2
95	0.21
96	0.21
97	0.24
98	0.21
99	0.22
100	0.2
101	0.2
102	0.21
103	0.18
104	0.17
105	0.16
106	0.17
107	0.15
108	0.15
109	0.14
110	0.19
111	0.23
112	0.23
113	0.26
114	0.28
115	0.32
116	0.34
117	0.36
118	0.34
119	0.37
120	0.43
121	0.41
122	0.44
123	0.45
124	0.45
125	0.5
126	0.48
127	0.48
128	0.45
129	0.47
130	0.43
131	0.41
132	0.4
133	0.36
134	0.36
135	0.3
136	0.26
137	0.24
138	0.21
139	0.18
140	0.16
141	0.14
142	0.1
143	0.1
144	0.12
145	0.12
146	0.12
147	0.12
148	0.12
149	0.11
150	0.12
151	0.17
152	0.17
153	0.16
154	0.18
155	0.18
156	0.18
157	0.22
158	0.22
159	0.17
160	0.17
161	0.17
162	0.22
163	0.27
164	0.3
165	0.33
166	0.37
167	0.37
168	0.37
169	0.38
170	0.35
171	0.33
172	0.32
173	0.29
174	0.32
175	0.4
176	0.49
177	0.51
178	0.53
179	0.55
180	0.52
181	0.5
182	0.4
183	0.36
184	0.26
185	0.2
186	0.18
187	0.15
188	0.15
189	0.15
190	0.15
191	0.11
192	0.1
193	0.1
194	0.09
195	0.12
196	0.13
197	0.13
198	0.13
199	0.14
200	0.16
201	0.19
202	0.23
203	0.21
204	0.22
205	0.26
206	0.3
207	0.3
208	0.32
209	0.33
210	0.29
211	0.33
212	0.37
213	0.37
214	0.4
215	0.41
216	0.38
217	0.36
218	0.34
219	0.28
220	0.22
221	0.19
222	0.12
223	0.12
224	0.12
225	0.1
226	0.1
227	0.1
228	0.1
229	0.1
230	0.1
231	0.1
232	0.14
233	0.16
234	0.17
235	0.18
236	0.2
237	0.19
238	0.25
239	0.26
240	0.23
241	0.22
242	0.22
243	0.2
244	0.19
245	0.19
246	0.14
247	0.12
248	0.14
249	0.14
250	0.17
251	0.22
252	0.21
253	0.22
254	0.27
255	0.3
256	0.34
257	0.38
258	0.35
259	0.33
260	0.34
261	0.35
262	0.37
263	0.38
264	0.34
265	0.36
266	0.42
267	0.42
268	0.44
269	0.48
270	0.44
271	0.41
272	0.39
273	0.4
274	0.34
275	0.35
276	0.34
277	0.27
278	0.24
279	0.23
280	0.22
281	0.15
282	0.12
283	0.09
284	0.07
285	0.08
286	0.1
287	0.13
288	0.15
289	0.19
290	0.21
291	0.23
292	0.22
293	0.22
294	0.22
295	0.21
296	0.23
297	0.19
298	0.17
299	0.16
300	0.15
301	0.14
302	0.12
303	0.09
304	0.04
305	0.04
306	0.04
307	0.05
308	0.05
309	0.05
310	0.05
311	0.07
312	0.08
313	0.09
314	0.09
315	0.08
316	0.08
317	0.09
318	0.1
319	0.08
320	0.11
321	0.1
322	0.11
323	0.12
324	0.13
325	0.14
326	0.14
327	0.13
328	0.09
329	0.09
330	0.1
331	0.1
332	0.1
333	0.08
334	0.08
335	0.11
336	0.12
337	0.15
338	0.12
339	0.15
340	0.17
341	0.18
342	0.17
343	0.16
344	0.16
345	0.14
346	0.14
347	0.12
348	0.1
349	0.12
350	0.13
351	0.14
352	0.19
353	0.2
354	0.22
355	0.26
356	0.27
357	0.25
358	0.26
359	0.29
360	0.26
361	0.28
362	0.25
363	0.24
364	0.25
365	0.3
366	0.33
367	0.29
368	0.27
369	0.26
370	0.31
371	0.33
372	0.36
373	0.31
374	0.27
375	0.3
376	0.3
377	0.32
378	0.29
379	0.3
380	0.29
381	0.29
382	0.29
383	0.29
384	0.28
385	0.29
386	0.27
387	0.22
388	0.19
389	0.18
390	0.18
391	0.16
392	0.17
393	0.12
394	0.13
395	0.12
396	0.12
397	0.13
398	0.13
399	0.14
400	0.15
401	0.18
402	0.19
403	0.23
404	0.25
405	0.27
406	0.3
407	0.29
408	0.29
409	0.29
410	0.28
411	0.25
412	0.26
413	0.28
414	0.29
415	0.29
416	0.3
417	0.31
418	0.33
419	0.35
420	0.35
421	0.34
422	0.34
423	0.35
424	0.41
425	0.43
426	0.41
427	0.41
428	0.37
429	0.32
430	0.29
431	0.25
432	0.18
433	0.13
434	0.12
435	0.09
436	0.08
437	0.11
438	0.12
439	0.12
440	0.1
441	0.11
442	0.12
443	0.11
444	0.13
445	0.11
446	0.16
447	0.18
448	0.23
449	0.23
450	0.23
451	0.24
452	0.23
453	0.27
454	0.27
455	0.26
456	0.21
457	0.2
458	0.19
459	0.22
460	0.24
461	0.19
462	0.14
463	0.14
464	0.19
465	0.18
466	0.17
467	0.14
468	0.14
469	0.13
470	0.13
471	0.13
472	0.1
473	0.1
474	0.1
475	0.11
476	0.1
477	0.11
478	0.12
479	0.13
480	0.15
481	0.16
482	0.16
483	0.17
484	0.21
485	0.21
486	0.19
487	0.17
488	0.15
489	0.14
490	0.15
491	0.14
492	0.1
493	0.1
494	0.11
495	0.13
496	0.16
497	0.17
498	0.19
499	0.2
500	0.2
501	0.25
502	0.27
503	0.28
504	0.28
505	0.29
506	0.31
507	0.31
508	0.32
509	0.3
510	0.29
511	0.27
512	0.25
513	0.26
514	0.22
515	0.24
516	0.22
517	0.22
518	0.22
519	0.22
520	0.23
521	0.22
522	0.23
523	0.21
524	0.25
525	0.25
526	0.23
527	0.23
528	0.24
529	0.24
530	0.23
531	0.25
532	0.26
533	0.3
534	0.33
535	0.38
536	0.42
537	0.46
538	0.49
539	0.48
540	0.45
541	0.42
542	0.4
543	0.39
544	0.33
545	0.31
546	0.34
547	0.35
548	0.37
549	0.38
550	0.42
551	0.43
552	0.49
553	0.47
554	0.46
555	0.44
556	0.47
557	0.54
558	0.54
559	0.51
560	0.45
561	0.49
562	0.45
563	0.47
564	0.42
565	0.34
566	0.31
567	0.36
568	0.38
569	0.4
570	0.4
571	0.38
572	0.39
573	0.37
574	0.37
575	0.29
576	0.28
577	0.21
578	0.24
579	0.25
580	0.24
581	0.22
582	0.22
583	0.24
584	0.22
585	0.23
586	0.17
587	0.18
588	0.18
589	0.19
590	0.17
591	0.14
592	0.15
593	0.17
594	0.18
595	0.19
596	0.21
597	0.27
598	0.31
599	0.35
600	0.36
601	0.36
602	0.38
603	0.39
604	0.41
605	0.37
606	0.41
607	0.45
608	0.46
609	0.46
610	0.46
611	0.42
612	0.38
613	0.35
614	0.33
615	0.27
616	0.28
617	0.29
618	0.35
619	0.4
620	0.4
621	0.44
622	0.46
623	0.5
624	0.49
625	0.49
626	0.44
627	0.43
628	0.43

V5IRK1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer