FuNGI

A0A2T2NY79

Protein Details

Accession

A0A2T2NY79

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
469-492	KNSIPPVRRSHRHNGKRCQDQSCF	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
453-483	GRGKQKAKGKERNSAHKNSIPPVRRSHRHNG

Subcellular Location(s)

nucl 19.5, cyto_nucl 12, cyto 3.5, mito 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR035426 Gemin2/Brr1
Gene Ontology	GO:0000387 P:spliceosomal snRNP assembly
Pfam	View protein in Pfam PF04938 SIP1

Amino Acid Sequences

MSGDGTNRAVTQDGETYNKLRRPDDYIASLGSAAPGASADSEPPKRKLEAADLIEDSTHRAKRTRGDNGGKLLFKNIQRGNDMAGGMKAAIGMEGEDGAEVMRDALAYLNVVRDEAAALPWFFTATKLETTEDDADDDEYEDGDDELDTYNQGYEDHGVVYNDGTVIAIDPIPTTDDDAKSEASEVDIQQEYYAALLRRYNDRRLALEPTKVAKRIAANPDSFSVEPPPKNNKEWIYSIDRVYPTPYMVYQLQQSEDNLWRGIDICARQLGRFNTISRQKSCWVWTLLSIVGERGTLTFWKQGKIRELGRAAAYFNLLLRNGEVVSKTGHAEDTDSDEEVEDIAPTEVDEEESAVDGDAYGGNQADVGVHDDSDEEGELSCEPELADTKATDAPVENRDEEGEVSDDSAAMDMSEDESTAKDDKASALEQARARLLAQLGDNLVSVGIPPQEGRGKQKAKGKERNSAHKNSIPPVRRSHRHNGKRCQDQSCFGPQPRKSKHYQSNASNEEIQPQQNVSQSPPEDQKSSTAEAEKRVEKQPEVQGSSKPLTTNGSSTTTPALKPPVFGSRAEAEAYKQQQQQQQLARQVDGGTEYEPESASESGDAEMQDQVGSRVKSEPESDSEAGDAEMQNSGEQGVDANTRATLEMIITVVAECYGQRDLLKAREVW

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.25
2	0.27
3	0.3
4	0.36
5	0.39
6	0.4
7	0.37
8	0.38
9	0.41
10	0.46
11	0.48
12	0.45
13	0.43
14	0.4
15	0.39
16	0.35
17	0.27
18	0.2
19	0.14
20	0.09
21	0.07
22	0.06
23	0.06
24	0.07
25	0.07
26	0.1
27	0.17
28	0.26
29	0.31
30	0.35
31	0.39
32	0.39
33	0.42
34	0.44
35	0.45
36	0.46
37	0.45
38	0.46
39	0.43
40	0.41
41	0.38
42	0.34
43	0.29
44	0.27
45	0.26
46	0.23
47	0.26
48	0.3
49	0.38
50	0.47
51	0.53
52	0.57
53	0.62
54	0.66
55	0.7
56	0.73
57	0.67
58	0.58
59	0.52
60	0.48
61	0.42
62	0.45
63	0.42
64	0.4
65	0.4
66	0.41
67	0.4
68	0.37
69	0.35
70	0.26
71	0.22
72	0.18
73	0.15
74	0.14
75	0.1
76	0.06
77	0.06
78	0.05
79	0.05
80	0.04
81	0.05
82	0.05
83	0.04
84	0.04
85	0.04
86	0.04
87	0.04
88	0.04
89	0.04
90	0.04
91	0.04
92	0.05
93	0.05
94	0.06
95	0.06
96	0.08
97	0.08
98	0.09
99	0.09
100	0.08
101	0.09
102	0.08
103	0.09
104	0.09
105	0.09
106	0.1
107	0.1
108	0.1
109	0.09
110	0.1
111	0.11
112	0.12
113	0.14
114	0.15
115	0.17
116	0.17
117	0.22
118	0.23
119	0.21
120	0.19
121	0.17
122	0.17
123	0.16
124	0.16
125	0.1
126	0.08
127	0.07
128	0.07
129	0.06
130	0.06
131	0.05
132	0.05
133	0.06
134	0.06
135	0.06
136	0.06
137	0.06
138	0.06
139	0.07
140	0.07
141	0.08
142	0.08
143	0.1
144	0.1
145	0.1
146	0.1
147	0.1
148	0.1
149	0.08
150	0.07
151	0.06
152	0.05
153	0.05
154	0.05
155	0.05
156	0.05
157	0.05
158	0.06
159	0.07
160	0.07
161	0.1
162	0.12
163	0.13
164	0.15
165	0.16
166	0.16
167	0.15
168	0.16
169	0.13
170	0.11
171	0.12
172	0.11
173	0.13
174	0.13
175	0.13
176	0.12
177	0.13
178	0.11
179	0.09
180	0.12
181	0.08
182	0.1
183	0.12
184	0.14
185	0.23
186	0.27
187	0.32
188	0.35
189	0.37
190	0.39
191	0.4
192	0.46
193	0.4
194	0.4
195	0.37
196	0.36
197	0.37
198	0.36
199	0.33
200	0.28
201	0.29
202	0.33
203	0.38
204	0.38
205	0.35
206	0.36
207	0.37
208	0.37
209	0.33
210	0.27
211	0.24
212	0.25
213	0.25
214	0.29
215	0.36
216	0.36
217	0.39
218	0.44
219	0.42
220	0.4
221	0.41
222	0.41
223	0.4
224	0.38
225	0.37
226	0.36
227	0.34
228	0.3
229	0.29
230	0.25
231	0.18
232	0.16
233	0.15
234	0.14
235	0.14
236	0.14
237	0.15
238	0.15
239	0.16
240	0.16
241	0.16
242	0.16
243	0.18
244	0.18
245	0.16
246	0.14
247	0.13
248	0.13
249	0.14
250	0.13
251	0.11
252	0.11
253	0.14
254	0.15
255	0.15
256	0.18
257	0.19
258	0.2
259	0.22
260	0.22
261	0.26
262	0.34
263	0.39
264	0.37
265	0.38
266	0.36
267	0.37
268	0.38
269	0.35
270	0.3
271	0.25
272	0.24
273	0.23
274	0.21
275	0.19
276	0.16
277	0.11
278	0.09
279	0.08
280	0.07
281	0.06
282	0.06
283	0.05
284	0.07
285	0.13
286	0.13
287	0.17
288	0.19
289	0.22
290	0.27
291	0.31
292	0.32
293	0.32
294	0.32
295	0.31
296	0.3
297	0.27
298	0.22
299	0.18
300	0.16
301	0.1
302	0.09
303	0.09
304	0.07
305	0.07
306	0.06
307	0.07
308	0.06
309	0.07
310	0.07
311	0.06
312	0.07
313	0.08
314	0.08
315	0.08
316	0.08
317	0.07
318	0.08
319	0.08
320	0.12
321	0.11
322	0.11
323	0.11
324	0.1
325	0.1
326	0.09
327	0.09
328	0.04
329	0.04
330	0.04
331	0.03
332	0.03
333	0.04
334	0.04
335	0.04
336	0.04
337	0.04
338	0.04
339	0.04
340	0.04
341	0.04
342	0.03
343	0.03
344	0.03
345	0.03
346	0.03
347	0.03
348	0.03
349	0.03
350	0.03
351	0.03
352	0.03
353	0.03
354	0.06
355	0.06
356	0.06
357	0.06
358	0.06
359	0.06
360	0.07
361	0.06
362	0.04
363	0.04
364	0.04
365	0.04
366	0.05
367	0.05
368	0.04
369	0.04
370	0.05
371	0.06
372	0.07
373	0.07
374	0.07
375	0.09
376	0.1
377	0.1
378	0.1
379	0.09
380	0.12
381	0.14
382	0.16
383	0.15
384	0.14
385	0.14
386	0.15
387	0.14
388	0.12
389	0.1
390	0.08
391	0.08
392	0.07
393	0.07
394	0.06
395	0.06
396	0.05
397	0.03
398	0.03
399	0.03
400	0.04
401	0.04
402	0.04
403	0.05
404	0.05
405	0.07
406	0.08
407	0.08
408	0.07
409	0.08
410	0.08
411	0.11
412	0.11
413	0.13
414	0.13
415	0.18
416	0.19
417	0.2
418	0.2
419	0.18
420	0.18
421	0.16
422	0.15
423	0.12
424	0.11
425	0.11
426	0.11
427	0.11
428	0.1
429	0.08
430	0.07
431	0.05
432	0.05
433	0.05
434	0.05
435	0.05
436	0.05
437	0.08
438	0.13
439	0.15
440	0.21
441	0.29
442	0.33
443	0.38
444	0.46
445	0.52
446	0.58
447	0.67
448	0.66
449	0.66
450	0.7
451	0.76
452	0.75
453	0.72
454	0.68
455	0.63
456	0.61
457	0.57
458	0.58
459	0.53
460	0.51
461	0.53
462	0.56
463	0.57
464	0.61
465	0.66
466	0.69
467	0.73
468	0.79
469	0.8
470	0.81
471	0.85
472	0.84
473	0.8
474	0.73
475	0.66
476	0.6
477	0.59
478	0.57
479	0.5
480	0.53
481	0.51
482	0.58
483	0.61
484	0.62
485	0.58
486	0.62
487	0.68
488	0.7
489	0.74
490	0.71
491	0.73
492	0.72
493	0.69
494	0.62
495	0.52
496	0.46
497	0.4
498	0.33
499	0.24
500	0.22
501	0.21
502	0.21
503	0.22
504	0.2
505	0.24
506	0.24
507	0.27
508	0.32
509	0.32
510	0.31
511	0.3
512	0.33
513	0.3
514	0.32
515	0.3
516	0.3
517	0.3
518	0.33
519	0.38
520	0.38
521	0.38
522	0.42
523	0.43
524	0.39
525	0.43
526	0.46
527	0.49
528	0.5
529	0.48
530	0.44
531	0.46
532	0.46
533	0.41
534	0.33
535	0.27
536	0.26
537	0.25
538	0.25
539	0.23
540	0.25
541	0.23
542	0.24
543	0.27
544	0.25
545	0.24
546	0.24
547	0.28
548	0.24
549	0.26
550	0.28
551	0.31
552	0.31
553	0.31
554	0.33
555	0.28
556	0.29
557	0.29
558	0.26
559	0.21
560	0.27
561	0.3
562	0.32
563	0.34
564	0.38
565	0.42
566	0.47
567	0.53
568	0.53
569	0.57
570	0.58
571	0.56
572	0.5
573	0.47
574	0.41
575	0.34
576	0.28
577	0.21
578	0.14
579	0.13
580	0.13
581	0.13
582	0.12
583	0.12
584	0.13
585	0.12
586	0.12
587	0.11
588	0.11
589	0.1
590	0.12
591	0.12
592	0.1
593	0.1
594	0.1
595	0.1
596	0.09
597	0.11
598	0.15
599	0.16
600	0.16
601	0.19
602	0.21
603	0.24
604	0.27
605	0.28
606	0.27
607	0.34
608	0.33
609	0.3
610	0.29
611	0.26
612	0.23
613	0.21
614	0.17
615	0.1
616	0.11
617	0.11
618	0.1
619	0.1
620	0.1
621	0.08
622	0.08
623	0.08
624	0.08
625	0.1
626	0.11
627	0.11
628	0.11
629	0.12
630	0.12
631	0.12
632	0.1
633	0.09
634	0.09
635	0.08
636	0.08
637	0.08
638	0.08
639	0.07
640	0.07
641	0.06
642	0.05
643	0.08
644	0.09
645	0.11
646	0.11
647	0.15
648	0.2
649	0.26

A0A2T2NY79

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer