FuNGI

A0A0D1CXM0

Protein Details

Accession

A0A0D1CXM0

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
92-113	ELDRMQRASKRKRQLNLPCSSS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 21, cyto 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR010347 Tdp1
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0017005 F:3'-tyrosyl-DNA phosphodiesterase activity GO:0003690 F:double-stranded DNA binding GO:0003697 F:single-stranded DNA binding GO:0006281 P:DNA repair
KEGG	uma:UMAG_00989 -
Pfam	View protein in Pfam PF06087 Tyr-DNA_phospho
CDD	cd09122 PLDc_Tdp1_1 cd09123 PLDc_Tdp1_2

Amino Acid Sequences

MSDKHPIVISDSESDTLSESDRPCHTHASRANAAECNNQSHHAHKHATPSNALIASQDSSQTQPSCADATSSVASTSAAGFLSLLPDRRQLELDRMQRASKRKRQLNLPCSSSDDETQSDTKQCKLNNASVASTASTASTASQPLAVLHPSANPRTSTCVGEPSSSSKPQNSSYSMAADAITASSRFWHGSVKHGYNRYAAPSVSGVSISQMLLPATPSSRSSLELAVLATYDLRIDWLYSLFPRQLPVTLVLPPPKEDYRVNEHVARPGLHPSHIFGGDFTRCPGWQICVPNKPKGGWLTQHIKFLILVHQRFLRVAILSGNLNAIDWDRIENTAYIQDFPLLGQASMINHGSGSSSGSKSSQNDFKSQLVRVLRSLSMPASHAVYAALDRYDFSLATRARIVASWPEAASLREWDQIETQGLGRLGKVVRDLGIKESVELECQGSSLANHDVKWIEHFHLLASGVEPRGLLPLKGKPNEVHPEYASAIGATSKGNALPPVKIVFPSHRYVHETTVEGAMGALSFFGKAEAWSNSPIKPLYHSPQSRRGDVMIHAKSILALTAEGKAIVDKAFIDASDSYISAKATRFSVTDGSWTGPRQAEHPIGWTYLGSSNFTRAAHGNIGGSVNKPTMSSMNWELGVVLPIYASEVQKMGVQAESLRAVVYHRPLQAYARDDAPWDNREYLS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.23
2	0.2
3	0.18
4	0.17
5	0.18
6	0.18
7	0.22
8	0.25
9	0.28
10	0.29
11	0.38
12	0.37
13	0.42
14	0.46
15	0.5
16	0.53
17	0.53
18	0.55
19	0.49
20	0.5
21	0.49
22	0.46
23	0.43
24	0.38
25	0.38
26	0.36
27	0.39
28	0.43
29	0.42
30	0.45
31	0.41
32	0.5
33	0.52
34	0.54
35	0.5
36	0.46
37	0.44
38	0.39
39	0.36
40	0.27
41	0.23
42	0.2
43	0.19
44	0.18
45	0.14
46	0.15
47	0.2
48	0.2
49	0.19
50	0.18
51	0.2
52	0.2
53	0.18
54	0.18
55	0.14
56	0.17
57	0.17
58	0.16
59	0.14
60	0.13
61	0.13
62	0.12
63	0.12
64	0.09
65	0.07
66	0.07
67	0.07
68	0.07
69	0.1
70	0.12
71	0.15
72	0.15
73	0.21
74	0.23
75	0.24
76	0.27
77	0.26
78	0.32
79	0.38
80	0.43
81	0.44
82	0.45
83	0.48
84	0.5
85	0.58
86	0.61
87	0.61
88	0.65
89	0.66
90	0.71
91	0.78
92	0.83
93	0.83
94	0.8
95	0.75
96	0.66
97	0.64
98	0.6
99	0.52
100	0.43
101	0.36
102	0.29
103	0.28
104	0.28
105	0.25
106	0.27
107	0.26
108	0.28
109	0.29
110	0.29
111	0.35
112	0.38
113	0.42
114	0.43
115	0.44
116	0.41
117	0.38
118	0.38
119	0.3
120	0.25
121	0.19
122	0.12
123	0.1
124	0.09
125	0.09
126	0.09
127	0.09
128	0.09
129	0.09
130	0.09
131	0.1
132	0.12
133	0.11
134	0.11
135	0.1
136	0.14
137	0.18
138	0.2
139	0.21
140	0.21
141	0.21
142	0.27
143	0.29
144	0.28
145	0.26
146	0.29
147	0.29
148	0.29
149	0.29
150	0.28
151	0.32
152	0.33
153	0.34
154	0.31
155	0.33
156	0.36
157	0.4
158	0.37
159	0.35
160	0.32
161	0.32
162	0.29
163	0.26
164	0.21
165	0.16
166	0.12
167	0.09
168	0.08
169	0.06
170	0.06
171	0.06
172	0.08
173	0.08
174	0.09
175	0.14
176	0.14
177	0.22
178	0.3
179	0.35
180	0.4
181	0.44
182	0.45
183	0.42
184	0.43
185	0.38
186	0.33
187	0.27
188	0.22
189	0.19
190	0.18
191	0.15
192	0.14
193	0.1
194	0.09
195	0.1
196	0.08
197	0.08
198	0.07
199	0.07
200	0.07
201	0.08
202	0.08
203	0.08
204	0.09
205	0.09
206	0.12
207	0.13
208	0.14
209	0.15
210	0.15
211	0.15
212	0.14
213	0.13
214	0.1
215	0.09
216	0.08
217	0.06
218	0.05
219	0.04
220	0.03
221	0.04
222	0.04
223	0.04
224	0.05
225	0.06
226	0.07
227	0.08
228	0.1
229	0.11
230	0.11
231	0.12
232	0.12
233	0.13
234	0.13
235	0.15
236	0.14
237	0.16
238	0.18
239	0.21
240	0.21
241	0.21
242	0.23
243	0.22
244	0.24
245	0.22
246	0.24
247	0.29
248	0.33
249	0.35
250	0.36
251	0.36
252	0.37
253	0.37
254	0.34
255	0.27
256	0.27
257	0.25
258	0.22
259	0.21
260	0.18
261	0.19
262	0.18
263	0.17
264	0.12
265	0.14
266	0.14
267	0.14
268	0.14
269	0.12
270	0.11
271	0.13
272	0.14
273	0.13
274	0.16
275	0.22
276	0.26
277	0.34
278	0.38
279	0.41
280	0.42
281	0.39
282	0.39
283	0.35
284	0.34
285	0.28
286	0.31
287	0.34
288	0.34
289	0.37
290	0.34
291	0.31
292	0.27
293	0.25
294	0.26
295	0.25
296	0.23
297	0.21
298	0.22
299	0.22
300	0.22
301	0.22
302	0.16
303	0.09
304	0.1
305	0.09
306	0.09
307	0.08
308	0.08
309	0.08
310	0.06
311	0.06
312	0.06
313	0.05
314	0.05
315	0.05
316	0.05
317	0.05
318	0.06
319	0.07
320	0.07
321	0.07
322	0.09
323	0.09
324	0.09
325	0.09
326	0.09
327	0.08
328	0.08
329	0.09
330	0.07
331	0.06
332	0.06
333	0.06
334	0.06
335	0.08
336	0.08
337	0.06
338	0.05
339	0.05
340	0.05
341	0.05
342	0.07
343	0.07
344	0.08
345	0.08
346	0.1
347	0.12
348	0.14
349	0.17
350	0.22
351	0.21
352	0.24
353	0.27
354	0.29
355	0.29
356	0.28
357	0.29
358	0.26
359	0.25
360	0.23
361	0.22
362	0.19
363	0.17
364	0.18
365	0.13
366	0.11
367	0.11
368	0.11
369	0.1
370	0.09
371	0.09
372	0.08
373	0.07
374	0.07
375	0.06
376	0.06
377	0.04
378	0.05
379	0.06
380	0.06
381	0.06
382	0.06
383	0.13
384	0.13
385	0.14
386	0.15
387	0.14
388	0.14
389	0.14
390	0.15
391	0.11
392	0.13
393	0.13
394	0.12
395	0.13
396	0.13
397	0.13
398	0.13
399	0.12
400	0.12
401	0.14
402	0.15
403	0.15
404	0.15
405	0.16
406	0.16
407	0.14
408	0.13
409	0.11
410	0.12
411	0.11
412	0.1
413	0.12
414	0.11
415	0.11
416	0.12
417	0.1
418	0.11
419	0.13
420	0.14
421	0.13
422	0.17
423	0.16
424	0.15
425	0.17
426	0.15
427	0.14
428	0.14
429	0.12
430	0.08
431	0.08
432	0.08
433	0.06
434	0.06
435	0.08
436	0.12
437	0.12
438	0.12
439	0.14
440	0.15
441	0.15
442	0.18
443	0.18
444	0.15
445	0.15
446	0.15
447	0.13
448	0.14
449	0.14
450	0.12
451	0.1
452	0.11
453	0.09
454	0.1
455	0.09
456	0.08
457	0.11
458	0.11
459	0.11
460	0.12
461	0.19
462	0.27
463	0.29
464	0.31
465	0.28
466	0.35
467	0.43
468	0.42
469	0.39
470	0.32
471	0.33
472	0.31
473	0.31
474	0.23
475	0.15
476	0.13
477	0.1
478	0.1
479	0.07
480	0.06
481	0.06
482	0.07
483	0.08
484	0.11
485	0.12
486	0.12
487	0.15
488	0.16
489	0.16
490	0.17
491	0.19
492	0.21
493	0.24
494	0.28
495	0.29
496	0.3
497	0.35
498	0.36
499	0.37
500	0.33
501	0.31
502	0.27
503	0.26
504	0.22
505	0.17
506	0.15
507	0.1
508	0.07
509	0.06
510	0.04
511	0.03
512	0.03
513	0.03
514	0.04
515	0.04
516	0.05
517	0.08
518	0.1
519	0.13
520	0.17
521	0.2
522	0.2
523	0.23
524	0.24
525	0.21
526	0.23
527	0.28
528	0.3
529	0.38
530	0.44
531	0.47
532	0.56
533	0.6
534	0.58
535	0.54
536	0.48
537	0.41
538	0.39
539	0.43
540	0.34
541	0.31
542	0.29
543	0.26
544	0.25
545	0.23
546	0.18
547	0.08
548	0.07
549	0.07
550	0.09
551	0.09
552	0.09
553	0.08
554	0.08
555	0.09
556	0.08
557	0.08
558	0.06
559	0.08
560	0.09
561	0.08
562	0.11
563	0.1
564	0.12
565	0.13
566	0.13
567	0.12
568	0.13
569	0.14
570	0.13
571	0.14
572	0.14
573	0.15
574	0.16
575	0.16
576	0.17
577	0.21
578	0.19
579	0.22
580	0.21
581	0.22
582	0.23
583	0.24
584	0.25
585	0.24
586	0.24
587	0.22
588	0.27
589	0.29
590	0.27
591	0.3
592	0.27
593	0.25
594	0.25
595	0.24
596	0.2
597	0.2
598	0.21
599	0.19
600	0.18
601	0.21
602	0.23
603	0.23
604	0.23
605	0.2
606	0.23
607	0.23
608	0.23
609	0.21
610	0.2
611	0.22
612	0.2
613	0.2
614	0.19
615	0.17
616	0.16
617	0.15
618	0.16
619	0.16
620	0.16
621	0.21
622	0.22
623	0.25
624	0.25
625	0.24
626	0.23
627	0.21
628	0.21
629	0.15
630	0.11
631	0.07
632	0.07
633	0.1
634	0.12
635	0.11
636	0.11
637	0.11
638	0.12
639	0.15
640	0.16
641	0.14
642	0.13
643	0.13
644	0.13
645	0.16
646	0.17
647	0.14
648	0.14
649	0.13
650	0.14
651	0.19
652	0.24
653	0.27
654	0.29
655	0.31
656	0.32
657	0.37
658	0.41
659	0.4
660	0.36
661	0.33
662	0.3
663	0.3
664	0.34
665	0.35
666	0.32
667	0.32

A0A0D1CXM0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer