Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q1K767

Protein Details
Accession Q1K767    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
370-393FEDERPAKRPRSRRTKSHPSDYTAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
376-384AKRPRSRRT
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 13, cyto 5.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002815  Spo11/TopoVI_A  
IPR013049  Spo11/TopoVI_A_N  
IPR036078  Spo11/TopoVI_A_sf  
IPR034136  TOPRIM_Topo6A/Spo11  
IPR036388  WH-like_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0000228  C:nuclear chromosome  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003918  F:DNA topoisomerase type II (double strand cut, ATP-hydrolyzing) activity  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0042138  P:meiotic DNA double-strand break formation  
GO:0000706  P:meiotic DNA double-strand break processing  
GO:0007131  P:reciprocal meiotic recombination  
KEGG ncr:NCU01120  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04406  TP6A_N  
CDD cd00223  TOPRIM_TopoIIB_SPO  
Amino Acid Sequences MYFCPIRNQYLHPPSQPTATNSHERPSRPLEQLSPVRASSARVPHNIVIVPQSHSSDNALTKIEALFETIVDAISVGSPITIPYRRSTNAQVFDPTASASNPRDGRHMDSVRFPGRNPQELRRFEALFRIIEISHEALLSGTLVTKRNIYYQNMELFRSQSVVDDMVDNLAFTLGVGRNDLNIVATAKGLVAGQVELIMRGGSKIDCAESSDSGVLLPSISAVGKIDFQSVKWLLVIEKEATFRTLSASRYYTVSRAGSGILVTGKGYPDLATRKFLAAIHSVRPRLLMFALVDFDPHGISVLRTYQYGSQRLDHEERTKVFGLRWLGIRSSDVLLNTVMTQDCSANSQGSQSSQDLSSQESIAYSVDAFEDERPAKRPRSRRTKSHPSDYTASLSERDREKAVSVLRDICGTARLDATEREHKLELQRMLMLNIKAEIQAVDDFGDITNWLDERLLKHSMDVNSH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.55
2 0.56
3 0.54
4 0.47
5 0.44
6 0.44
7 0.48
8 0.43
9 0.49
10 0.49
11 0.48
12 0.51
13 0.52
14 0.54
15 0.5
16 0.53
17 0.5
18 0.53
19 0.58
20 0.56
21 0.52
22 0.45
23 0.42
24 0.38
25 0.37
26 0.35
27 0.37
28 0.38
29 0.37
30 0.42
31 0.41
32 0.44
33 0.41
34 0.35
35 0.3
36 0.26
37 0.26
38 0.24
39 0.25
40 0.21
41 0.22
42 0.23
43 0.24
44 0.23
45 0.22
46 0.22
47 0.19
48 0.2
49 0.19
50 0.18
51 0.13
52 0.13
53 0.11
54 0.09
55 0.1
56 0.09
57 0.09
58 0.07
59 0.07
60 0.05
61 0.05
62 0.05
63 0.04
64 0.04
65 0.04
66 0.05
67 0.1
68 0.13
69 0.15
70 0.18
71 0.24
72 0.26
73 0.3
74 0.38
75 0.41
76 0.43
77 0.44
78 0.43
79 0.39
80 0.38
81 0.34
82 0.27
83 0.19
84 0.15
85 0.17
86 0.15
87 0.21
88 0.24
89 0.24
90 0.28
91 0.29
92 0.34
93 0.4
94 0.43
95 0.37
96 0.39
97 0.45
98 0.47
99 0.45
100 0.4
101 0.4
102 0.41
103 0.48
104 0.47
105 0.49
106 0.53
107 0.55
108 0.62
109 0.57
110 0.53
111 0.44
112 0.47
113 0.4
114 0.31
115 0.29
116 0.24
117 0.19
118 0.18
119 0.19
120 0.14
121 0.11
122 0.11
123 0.09
124 0.08
125 0.08
126 0.07
127 0.05
128 0.06
129 0.08
130 0.1
131 0.1
132 0.13
133 0.13
134 0.19
135 0.23
136 0.25
137 0.27
138 0.3
139 0.37
140 0.36
141 0.37
142 0.32
143 0.29
144 0.26
145 0.22
146 0.18
147 0.11
148 0.11
149 0.1
150 0.1
151 0.09
152 0.09
153 0.09
154 0.08
155 0.07
156 0.06
157 0.05
158 0.04
159 0.04
160 0.07
161 0.07
162 0.07
163 0.09
164 0.09
165 0.09
166 0.09
167 0.09
168 0.06
169 0.06
170 0.07
171 0.06
172 0.06
173 0.06
174 0.05
175 0.06
176 0.05
177 0.05
178 0.04
179 0.04
180 0.04
181 0.05
182 0.05
183 0.05
184 0.05
185 0.05
186 0.04
187 0.04
188 0.05
189 0.04
190 0.05
191 0.05
192 0.06
193 0.06
194 0.08
195 0.1
196 0.09
197 0.1
198 0.1
199 0.09
200 0.08
201 0.08
202 0.06
203 0.04
204 0.04
205 0.03
206 0.03
207 0.03
208 0.03
209 0.04
210 0.04
211 0.05
212 0.06
213 0.08
214 0.08
215 0.08
216 0.13
217 0.14
218 0.13
219 0.12
220 0.12
221 0.1
222 0.11
223 0.12
224 0.08
225 0.09
226 0.1
227 0.1
228 0.11
229 0.1
230 0.1
231 0.11
232 0.13
233 0.13
234 0.15
235 0.16
236 0.16
237 0.17
238 0.18
239 0.16
240 0.16
241 0.16
242 0.13
243 0.12
244 0.12
245 0.1
246 0.09
247 0.09
248 0.06
249 0.06
250 0.06
251 0.06
252 0.06
253 0.06
254 0.06
255 0.06
256 0.09
257 0.13
258 0.15
259 0.16
260 0.17
261 0.18
262 0.19
263 0.19
264 0.18
265 0.19
266 0.2
267 0.23
268 0.27
269 0.27
270 0.26
271 0.26
272 0.24
273 0.2
274 0.18
275 0.14
276 0.1
277 0.1
278 0.11
279 0.1
280 0.1
281 0.08
282 0.08
283 0.06
284 0.06
285 0.06
286 0.05
287 0.05
288 0.06
289 0.09
290 0.09
291 0.1
292 0.11
293 0.16
294 0.21
295 0.26
296 0.27
297 0.27
298 0.29
299 0.34
300 0.37
301 0.35
302 0.34
303 0.35
304 0.34
305 0.36
306 0.35
307 0.31
308 0.28
309 0.28
310 0.27
311 0.25
312 0.27
313 0.24
314 0.23
315 0.22
316 0.22
317 0.19
318 0.18
319 0.17
320 0.13
321 0.13
322 0.12
323 0.12
324 0.11
325 0.11
326 0.09
327 0.08
328 0.09
329 0.08
330 0.08
331 0.1
332 0.11
333 0.11
334 0.11
335 0.12
336 0.12
337 0.14
338 0.16
339 0.15
340 0.15
341 0.15
342 0.17
343 0.16
344 0.18
345 0.18
346 0.15
347 0.14
348 0.12
349 0.12
350 0.1
351 0.1
352 0.07
353 0.06
354 0.06
355 0.06
356 0.07
357 0.07
358 0.13
359 0.14
360 0.17
361 0.21
362 0.26
363 0.34
364 0.42
365 0.52
366 0.57
367 0.66
368 0.72
369 0.79
370 0.84
371 0.87
372 0.87
373 0.88
374 0.83
375 0.78
376 0.75
377 0.67
378 0.61
379 0.52
380 0.44
381 0.36
382 0.32
383 0.31
384 0.3
385 0.29
386 0.27
387 0.26
388 0.26
389 0.29
390 0.31
391 0.3
392 0.3
393 0.32
394 0.3
395 0.3
396 0.29
397 0.24
398 0.23
399 0.2
400 0.17
401 0.15
402 0.15
403 0.17
404 0.2
405 0.25
406 0.31
407 0.32
408 0.35
409 0.35
410 0.37
411 0.42
412 0.46
413 0.43
414 0.36
415 0.39
416 0.35
417 0.36
418 0.39
419 0.33
420 0.26
421 0.24
422 0.22
423 0.18
424 0.17
425 0.15
426 0.12
427 0.12
428 0.11
429 0.11
430 0.1
431 0.11
432 0.1
433 0.1
434 0.08
435 0.09
436 0.1
437 0.09
438 0.1
439 0.1
440 0.13
441 0.15
442 0.2
443 0.23
444 0.21
445 0.23
446 0.3