Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D1CFB4

Protein Details
Accession A0A0D1CFB4    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
128-155VADDLPNKKKRKRVVRAKSTNNQNNKSEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
135-143KKKRKRVVR
Subcellular Location(s) nucl 18, mito 6, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR022042  snRNA-activating_su3  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0019185  C:snRNA-activating protein complex  
GO:0003681  F:bent DNA binding  
GO:0001006  F:RNA polymerase III type 3 promoter sequence-specific DNA binding  
GO:0042795  P:snRNA transcription by RNA polymerase II  
GO:0042796  P:snRNA transcription by RNA polymerase III  
KEGG uma:UMAG_00137  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF12251  SNAPC3  
Amino Acid Sequences MSRARRGTEASIPIASEPIVLPQLTFDRRNSKINQLQALRQTLNQAAGPSTIDYEVEQIRDAIQAKTLDEHFSTAVRERWQTWSRNANPFRSDLASSAASELRSAEEVVSNSSSPSEDSTTEEPDEQVADDLPNKKKRKRVVRAKSTNNQNNKSEADFVETWDSIRSEREALLGEMDAALPSAFRFSERQLKVYAHRLKSKYINSLDRPFQVRDVHRLLHQTKLPDSPSDSKASQSGLFASFDATSTQRQPCVLTISFFSSSIDGTKEDFVAQKDADPYVPADDMHGDNTRDDYVKRICGDGLGGMKRAQTVELLSTQTLSDLQSSLCCWSDQQPERYGWHERLQRHLHSKNDKAGAQASRGSDDAQEFHDVRHARFTGRCRQTDAALIIENKLYTKGTRHGDAPYESDYAMLLEQWKEATGHADVQVGWTSNGGDLSLRLDRLEFIRTGQPYWLLHQGDCVHCFVFEQVRALRPGEEMALRKRPPAETNVENASVRTTFVPFPRITWLSTPTMLRFAADHNHNYGLGHHILRWEGMLDLPQASQSVTDKAAGETGSSQGENDHQNRWQIANLRTRRKDEGMLRKKQGKCLACLLRKAQVGILGGESVRLPLAAIKPEMQDSTQDEPAVNGLDDHLTSICTSCAALLGLPTRSPSTETAAETCVELDWERIATMDSHSGWTIFPLY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.24
3 0.18
4 0.12
5 0.12
6 0.13
7 0.13
8 0.12
9 0.14
10 0.21
11 0.25
12 0.28
13 0.3
14 0.37
15 0.41
16 0.48
17 0.5
18 0.53
19 0.55
20 0.59
21 0.63
22 0.59
23 0.62
24 0.62
25 0.63
26 0.54
27 0.49
28 0.46
29 0.39
30 0.38
31 0.33
32 0.27
33 0.21
34 0.2
35 0.2
36 0.17
37 0.16
38 0.13
39 0.12
40 0.12
41 0.14
42 0.15
43 0.15
44 0.15
45 0.13
46 0.13
47 0.17
48 0.18
49 0.15
50 0.18
51 0.18
52 0.19
53 0.22
54 0.23
55 0.22
56 0.21
57 0.22
58 0.19
59 0.19
60 0.21
61 0.2
62 0.23
63 0.24
64 0.26
65 0.27
66 0.35
67 0.41
68 0.44
69 0.48
70 0.54
71 0.58
72 0.65
73 0.68
74 0.65
75 0.61
76 0.58
77 0.54
78 0.47
79 0.41
80 0.31
81 0.31
82 0.25
83 0.23
84 0.23
85 0.21
86 0.17
87 0.16
88 0.16
89 0.13
90 0.13
91 0.12
92 0.11
93 0.12
94 0.13
95 0.15
96 0.17
97 0.15
98 0.14
99 0.15
100 0.14
101 0.12
102 0.14
103 0.14
104 0.13
105 0.17
106 0.2
107 0.23
108 0.24
109 0.24
110 0.21
111 0.19
112 0.19
113 0.14
114 0.12
115 0.09
116 0.09
117 0.13
118 0.2
119 0.28
120 0.36
121 0.43
122 0.48
123 0.55
124 0.64
125 0.7
126 0.75
127 0.78
128 0.8
129 0.84
130 0.89
131 0.92
132 0.91
133 0.91
134 0.89
135 0.87
136 0.82
137 0.73
138 0.67
139 0.59
140 0.52
141 0.44
142 0.36
143 0.33
144 0.27
145 0.26
146 0.26
147 0.24
148 0.22
149 0.2
150 0.2
151 0.14
152 0.15
153 0.15
154 0.13
155 0.13
156 0.14
157 0.14
158 0.13
159 0.14
160 0.12
161 0.1
162 0.09
163 0.09
164 0.07
165 0.05
166 0.05
167 0.04
168 0.04
169 0.05
170 0.05
171 0.06
172 0.08
173 0.12
174 0.23
175 0.24
176 0.26
177 0.28
178 0.31
179 0.33
180 0.42
181 0.47
182 0.42
183 0.49
184 0.49
185 0.52
186 0.57
187 0.57
188 0.56
189 0.54
190 0.56
191 0.53
192 0.58
193 0.56
194 0.53
195 0.52
196 0.45
197 0.42
198 0.41
199 0.37
200 0.38
201 0.38
202 0.35
203 0.34
204 0.4
205 0.37
206 0.36
207 0.37
208 0.33
209 0.31
210 0.34
211 0.33
212 0.27
213 0.31
214 0.3
215 0.3
216 0.32
217 0.3
218 0.27
219 0.26
220 0.27
221 0.22
222 0.18
223 0.17
224 0.14
225 0.14
226 0.13
227 0.12
228 0.1
229 0.1
230 0.11
231 0.1
232 0.11
233 0.15
234 0.16
235 0.16
236 0.17
237 0.17
238 0.17
239 0.22
240 0.2
241 0.17
242 0.17
243 0.2
244 0.2
245 0.19
246 0.18
247 0.12
248 0.12
249 0.12
250 0.12
251 0.08
252 0.09
253 0.09
254 0.09
255 0.1
256 0.12
257 0.12
258 0.13
259 0.13
260 0.13
261 0.14
262 0.14
263 0.13
264 0.12
265 0.11
266 0.1
267 0.1
268 0.08
269 0.08
270 0.09
271 0.09
272 0.11
273 0.13
274 0.12
275 0.11
276 0.13
277 0.13
278 0.12
279 0.12
280 0.14
281 0.14
282 0.17
283 0.18
284 0.17
285 0.16
286 0.15
287 0.16
288 0.13
289 0.15
290 0.12
291 0.13
292 0.13
293 0.13
294 0.13
295 0.13
296 0.11
297 0.08
298 0.07
299 0.08
300 0.09
301 0.1
302 0.09
303 0.09
304 0.09
305 0.09
306 0.08
307 0.07
308 0.06
309 0.06
310 0.06
311 0.06
312 0.06
313 0.08
314 0.08
315 0.07
316 0.07
317 0.12
318 0.21
319 0.25
320 0.28
321 0.29
322 0.31
323 0.32
324 0.35
325 0.34
326 0.27
327 0.3
328 0.32
329 0.3
330 0.36
331 0.4
332 0.41
333 0.46
334 0.47
335 0.48
336 0.49
337 0.52
338 0.5
339 0.48
340 0.44
341 0.38
342 0.38
343 0.32
344 0.26
345 0.25
346 0.2
347 0.18
348 0.17
349 0.17
350 0.13
351 0.12
352 0.12
353 0.1
354 0.13
355 0.12
356 0.11
357 0.16
358 0.16
359 0.15
360 0.2
361 0.19
362 0.18
363 0.22
364 0.26
365 0.32
366 0.37
367 0.38
368 0.38
369 0.38
370 0.38
371 0.38
372 0.34
373 0.25
374 0.21
375 0.2
376 0.16
377 0.15
378 0.14
379 0.1
380 0.1
381 0.09
382 0.07
383 0.1
384 0.16
385 0.18
386 0.2
387 0.21
388 0.23
389 0.25
390 0.26
391 0.26
392 0.22
393 0.2
394 0.18
395 0.17
396 0.15
397 0.12
398 0.1
399 0.08
400 0.06
401 0.06
402 0.06
403 0.06
404 0.07
405 0.07
406 0.07
407 0.09
408 0.08
409 0.09
410 0.1
411 0.11
412 0.1
413 0.11
414 0.12
415 0.1
416 0.09
417 0.08
418 0.08
419 0.07
420 0.07
421 0.06
422 0.05
423 0.05
424 0.08
425 0.09
426 0.09
427 0.08
428 0.08
429 0.09
430 0.11
431 0.13
432 0.1
433 0.11
434 0.16
435 0.17
436 0.18
437 0.18
438 0.2
439 0.18
440 0.2
441 0.25
442 0.21
443 0.2
444 0.23
445 0.26
446 0.25
447 0.26
448 0.24
449 0.18
450 0.16
451 0.17
452 0.14
453 0.14
454 0.13
455 0.15
456 0.15
457 0.18
458 0.2
459 0.2
460 0.19
461 0.16
462 0.16
463 0.14
464 0.16
465 0.17
466 0.21
467 0.29
468 0.28
469 0.3
470 0.32
471 0.33
472 0.33
473 0.35
474 0.36
475 0.31
476 0.35
477 0.36
478 0.36
479 0.33
480 0.3
481 0.26
482 0.2
483 0.17
484 0.14
485 0.13
486 0.14
487 0.16
488 0.21
489 0.19
490 0.2
491 0.26
492 0.27
493 0.26
494 0.26
495 0.28
496 0.26
497 0.28
498 0.29
499 0.23
500 0.25
501 0.23
502 0.2
503 0.17
504 0.16
505 0.21
506 0.23
507 0.24
508 0.23
509 0.25
510 0.24
511 0.24
512 0.23
513 0.19
514 0.18
515 0.17
516 0.15
517 0.15
518 0.16
519 0.15
520 0.15
521 0.11
522 0.09
523 0.08
524 0.09
525 0.09
526 0.09
527 0.09
528 0.09
529 0.09
530 0.08
531 0.1
532 0.1
533 0.11
534 0.11
535 0.13
536 0.13
537 0.13
538 0.15
539 0.14
540 0.13
541 0.11
542 0.12
543 0.12
544 0.11
545 0.11
546 0.1
547 0.14
548 0.2
549 0.21
550 0.23
551 0.24
552 0.28
553 0.3
554 0.3
555 0.31
556 0.32
557 0.37
558 0.43
559 0.49
560 0.56
561 0.6
562 0.64
563 0.66
564 0.62
565 0.63
566 0.63
567 0.65
568 0.65
569 0.69
570 0.72
571 0.75
572 0.75
573 0.74
574 0.74
575 0.66
576 0.61
577 0.61
578 0.64
579 0.6
580 0.63
581 0.58
582 0.56
583 0.54
584 0.5
585 0.41
586 0.35
587 0.31
588 0.25
589 0.23
590 0.17
591 0.15
592 0.15
593 0.13
594 0.09
595 0.08
596 0.07
597 0.06
598 0.09
599 0.13
600 0.16
601 0.18
602 0.2
603 0.21
604 0.24
605 0.25
606 0.22
607 0.23
608 0.25
609 0.28
610 0.28
611 0.27
612 0.25
613 0.24
614 0.25
615 0.22
616 0.17
617 0.11
618 0.1
619 0.11
620 0.1
621 0.11
622 0.1
623 0.09
624 0.1
625 0.1
626 0.09
627 0.08
628 0.08
629 0.07
630 0.08
631 0.08
632 0.08
633 0.1
634 0.14
635 0.15
636 0.15
637 0.18
638 0.18
639 0.19
640 0.22
641 0.21
642 0.24
643 0.26
644 0.29
645 0.29
646 0.29
647 0.28
648 0.26
649 0.24
650 0.17
651 0.15
652 0.12
653 0.11
654 0.11
655 0.11
656 0.11
657 0.11
658 0.11
659 0.11
660 0.13
661 0.17
662 0.16
663 0.18
664 0.19
665 0.19
666 0.18