FuNGI

V5IQ17

Protein Details

Accession

V5IQ17

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
414-433	ELTTRNWRWHKKLQVWLTKD	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 16, cyto_nucl 11, cyto 4, mito 3, extr 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR038635 CCR4-NOT_su2/3/5_C_sf IPR040168 Not2/3/5 IPR007282 NOT2/3/5_C
Gene Ontology	GO:0030015 C:CCR4-NOT core complex GO:0000932 C:P-body GO:0000289 P:nuclear-transcribed mRNA poly(A) tail shortening GO:0006355 P:regulation of DNA-templated transcription
KEGG	ncr:NCU11372 -
Pfam	View protein in Pfam PF04153 NOT2_3_5

Amino Acid Sequences

MNRPGAVPQSLRGMSGFGGQQQQPQQSGRGVANRLPNGKLGAVSGGSGWAFGSGMPMGGSPGVPPGSARQLGGGNVSFAQSLSGSQPATPLDLSEFPTLSNTSQLSTANQASMWSTGARNLGGAVHRGPSTPLSQQGQQDDFFSSRQQSAQGAFRFGNQGNSGQTSQTPSSVTDDFPPLNRSANGELGGMPGLGFGSTPSIHPNRTNNGLLNALTGNTRTTDGRSPTAIGRPHDQRSPVNEEEGRQKPPVYREDGMASRSSVGDAVSQAIGTRNPLGAIGNDPPSAKGKEEDRGRTNEVQDPLEGMPAIEKFGLKGLRTLMNNFPDYNSLIIGIDPSSLGLELNSSELYSTQIYSILDDVPPRPAVPKFKIPECYMVKNVQPIEAKIQSFNEETLMWIFYSCPGDIKQQLAAAELTTRNWRWHKKLQVWLTKDEMGNTAQLSPAHERGYYIVWDTVNWHKERREFTLYYCDLETNLGVPMPAIGA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.2
2	0.22
3	0.21
4	0.16
5	0.23
6	0.23
7	0.28
8	0.33
9	0.37
10	0.36
11	0.37
12	0.37
13	0.34
14	0.37
15	0.36
16	0.36
17	0.35
18	0.36
19	0.43
20	0.46
21	0.46
22	0.44
23	0.41
24	0.37
25	0.35
26	0.31
27	0.23
28	0.19
29	0.16
30	0.15
31	0.12
32	0.11
33	0.1
34	0.1
35	0.09
36	0.07
37	0.06
38	0.06
39	0.08
40	0.06
41	0.07
42	0.07
43	0.07
44	0.07
45	0.08
46	0.08
47	0.06
48	0.09
49	0.09
50	0.09
51	0.1
52	0.13
53	0.19
54	0.21
55	0.2
56	0.19
57	0.21
58	0.21
59	0.24
60	0.21
61	0.15
62	0.15
63	0.15
64	0.13
65	0.11
66	0.11
67	0.08
68	0.09
69	0.09
70	0.11
71	0.11
72	0.11
73	0.13
74	0.13
75	0.15
76	0.13
77	0.12
78	0.13
79	0.14
80	0.18
81	0.19
82	0.18
83	0.16
84	0.18
85	0.19
86	0.16
87	0.18
88	0.14
89	0.13
90	0.14
91	0.15
92	0.15
93	0.18
94	0.18
95	0.15
96	0.15
97	0.14
98	0.14
99	0.14
100	0.13
101	0.1
102	0.1
103	0.12
104	0.13
105	0.12
106	0.11
107	0.11
108	0.12
109	0.12
110	0.14
111	0.12
112	0.13
113	0.14
114	0.14
115	0.15
116	0.15
117	0.17
118	0.17
119	0.21
120	0.22
121	0.25
122	0.28
123	0.32
124	0.32
125	0.3
126	0.29
127	0.26
128	0.24
129	0.21
130	0.19
131	0.17
132	0.16
133	0.16
134	0.16
135	0.16
136	0.17
137	0.24
138	0.23
139	0.23
140	0.22
141	0.23
142	0.26
143	0.24
144	0.25
145	0.19
146	0.2
147	0.18
148	0.21
149	0.2
150	0.17
151	0.17
152	0.18
153	0.17
154	0.16
155	0.16
156	0.14
157	0.17
158	0.17
159	0.17
160	0.15
161	0.18
162	0.17
163	0.18
164	0.19
165	0.16
166	0.17
167	0.17
168	0.18
169	0.17
170	0.18
171	0.18
172	0.15
173	0.15
174	0.13
175	0.13
176	0.09
177	0.07
178	0.05
179	0.04
180	0.04
181	0.03
182	0.03
183	0.05
184	0.05
185	0.06
186	0.1
187	0.12
188	0.14
189	0.17
190	0.21
191	0.23
192	0.27
193	0.29
194	0.25
195	0.25
196	0.25
197	0.22
198	0.19
199	0.16
200	0.11
201	0.1
202	0.09
203	0.07
204	0.07
205	0.08
206	0.07
207	0.1
208	0.14
209	0.16
210	0.17
211	0.18
212	0.18
213	0.19
214	0.24
215	0.25
216	0.22
217	0.25
218	0.28
219	0.3
220	0.3
221	0.31
222	0.29
223	0.31
224	0.37
225	0.32
226	0.31
227	0.29
228	0.28
229	0.33
230	0.34
231	0.31
232	0.24
233	0.25
234	0.24
235	0.28
236	0.3
237	0.28
238	0.26
239	0.25
240	0.28
241	0.28
242	0.27
243	0.23
244	0.19
245	0.14
246	0.13
247	0.12
248	0.08
249	0.07
250	0.06
251	0.06
252	0.07
253	0.06
254	0.06
255	0.06
256	0.06
257	0.06
258	0.07
259	0.07
260	0.06
261	0.06
262	0.07
263	0.07
264	0.07
265	0.09
266	0.1
267	0.11
268	0.12
269	0.12
270	0.13
271	0.16
272	0.16
273	0.15
274	0.15
275	0.16
276	0.22
277	0.28
278	0.34
279	0.35
280	0.39
281	0.42
282	0.43
283	0.43
284	0.42
285	0.38
286	0.32
287	0.28
288	0.26
289	0.21
290	0.18
291	0.15
292	0.1
293	0.09
294	0.08
295	0.09
296	0.07
297	0.07
298	0.06
299	0.1
300	0.13
301	0.12
302	0.13
303	0.15
304	0.2
305	0.21
306	0.24
307	0.26
308	0.28
309	0.29
310	0.28
311	0.26
312	0.23
313	0.23
314	0.2
315	0.14
316	0.1
317	0.09
318	0.09
319	0.08
320	0.07
321	0.06
322	0.05
323	0.05
324	0.05
325	0.05
326	0.05
327	0.04
328	0.04
329	0.04
330	0.06
331	0.06
332	0.05
333	0.05
334	0.06
335	0.08
336	0.08
337	0.08
338	0.07
339	0.09
340	0.09
341	0.1
342	0.11
343	0.1
344	0.1
345	0.11
346	0.12
347	0.13
348	0.14
349	0.13
350	0.15
351	0.18
352	0.25
353	0.29
354	0.38
355	0.39
356	0.44
357	0.5
358	0.49
359	0.55
360	0.53
361	0.53
362	0.47
363	0.47
364	0.43
365	0.43
366	0.41
367	0.37
368	0.34
369	0.3
370	0.33
371	0.34
372	0.33
373	0.29
374	0.3
375	0.28
376	0.27
377	0.26
378	0.2
379	0.15
380	0.16
381	0.15
382	0.14
383	0.11
384	0.1
385	0.1
386	0.11
387	0.14
388	0.13
389	0.14
390	0.14
391	0.2
392	0.22
393	0.24
394	0.23
395	0.23
396	0.23
397	0.23
398	0.21
399	0.16
400	0.17
401	0.16
402	0.16
403	0.2
404	0.22
405	0.27
406	0.35
407	0.43
408	0.48
409	0.57
410	0.65
411	0.68
412	0.76
413	0.79
414	0.81
415	0.77
416	0.73
417	0.69
418	0.64
419	0.55
420	0.47
421	0.39
422	0.3
423	0.27
424	0.23
425	0.19
426	0.16
427	0.16
428	0.19
429	0.21
430	0.24
431	0.24
432	0.23
433	0.23
434	0.23
435	0.25
436	0.23
437	0.21
438	0.2
439	0.19
440	0.19
441	0.22
442	0.29
443	0.33
444	0.34
445	0.36
446	0.38
447	0.45
448	0.5
449	0.54
450	0.53
451	0.48
452	0.5
453	0.55
454	0.52
455	0.48
456	0.44
457	0.37
458	0.29
459	0.29
460	0.25
461	0.15
462	0.14
463	0.11
464	0.1
465	0.09

V5IQ17

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer