Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2S6BTC3

Protein Details
Accession A0A2S6BTC3    Localization Confidence High Confidence Score 21
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-23MGEKSERKRKRQSNGVETPNKKVHydrophilic
51-80NAPKVPFKAYSKPRKSSKKAEKSSIKPSTHHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
8-10KRK
61-72SKPRKSSKKAEK
308-322RAGKKVPKKEILQKK
Subcellular Location(s) nucl 21, mito 3, cyto 3, cyto_mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009668  RNA_pol-assoc_fac_A49-like  
Gene Ontology GO:0000428  C:DNA-directed RNA polymerase complex  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006351  P:DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF06870  RNA_pol_I_A49  
Amino Acid Sequences MGEKSERKRKRQSNGVETPNKKVARDGNIKVIHAEEDRGLHPVLLSTSGVNAPKVPFKAYSKPRKSSKKAEKSSIKPSTHDLLLQSSQHPRLDYTAVPSPIDDQLSHYVAIYDPAKRTLQLAPAHHLHLRSTLRAEAREAEERKSKTMGQQREALGQEFGTKKAKKAIASKSTNALTGDTSKSNDVQNAILETVGETTAGLASKLTAQEQDEAALRAKPIPWPNLTAENAEKVYSFDTLIPSNDARLVKTADWKAAADDDTKIGFKHQFPVSRFSFLAKQEGDSLRFKALKYLTLLLEFRDSLSAAGRAGKKVPKKEILQKKLPPSRWPSELVDSVRRRFANDSGQELGKWQQDRLATHICALAMFVDNWVCDIWHLKDDLKADMKELMSYFNELGAKVKKPSEAERVRMGMTKAQAAATRIARLVVPLEFPKVRQGKRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.88
2 0.89
3 0.88
4 0.82
5 0.79
6 0.77
7 0.69
8 0.58
9 0.54
10 0.51
11 0.51
12 0.57
13 0.54
14 0.55
15 0.57
16 0.57
17 0.52
18 0.45
19 0.39
20 0.31
21 0.29
22 0.2
23 0.2
24 0.2
25 0.21
26 0.2
27 0.17
28 0.15
29 0.15
30 0.14
31 0.13
32 0.13
33 0.1
34 0.12
35 0.15
36 0.17
37 0.16
38 0.17
39 0.18
40 0.23
41 0.24
42 0.25
43 0.27
44 0.31
45 0.41
46 0.49
47 0.58
48 0.62
49 0.69
50 0.77
51 0.82
52 0.85
53 0.86
54 0.87
55 0.87
56 0.85
57 0.87
58 0.87
59 0.83
60 0.86
61 0.84
62 0.75
63 0.66
64 0.63
65 0.57
66 0.48
67 0.43
68 0.34
69 0.29
70 0.3
71 0.3
72 0.28
73 0.29
74 0.31
75 0.31
76 0.3
77 0.26
78 0.26
79 0.27
80 0.25
81 0.24
82 0.28
83 0.27
84 0.26
85 0.25
86 0.25
87 0.24
88 0.24
89 0.19
90 0.16
91 0.19
92 0.2
93 0.2
94 0.17
95 0.16
96 0.14
97 0.18
98 0.16
99 0.15
100 0.14
101 0.18
102 0.18
103 0.18
104 0.2
105 0.2
106 0.25
107 0.28
108 0.29
109 0.31
110 0.33
111 0.35
112 0.35
113 0.32
114 0.26
115 0.27
116 0.27
117 0.23
118 0.23
119 0.25
120 0.26
121 0.26
122 0.27
123 0.23
124 0.25
125 0.32
126 0.31
127 0.31
128 0.36
129 0.36
130 0.37
131 0.36
132 0.33
133 0.33
134 0.4
135 0.43
136 0.39
137 0.44
138 0.43
139 0.46
140 0.46
141 0.38
142 0.3
143 0.23
144 0.24
145 0.19
146 0.2
147 0.22
148 0.22
149 0.22
150 0.29
151 0.32
152 0.32
153 0.39
154 0.47
155 0.49
156 0.53
157 0.54
158 0.51
159 0.49
160 0.46
161 0.38
162 0.29
163 0.2
164 0.18
165 0.19
166 0.15
167 0.15
168 0.15
169 0.16
170 0.16
171 0.16
172 0.14
173 0.12
174 0.12
175 0.11
176 0.11
177 0.09
178 0.08
179 0.07
180 0.06
181 0.05
182 0.05
183 0.03
184 0.03
185 0.04
186 0.04
187 0.04
188 0.03
189 0.04
190 0.05
191 0.06
192 0.06
193 0.07
194 0.08
195 0.09
196 0.09
197 0.1
198 0.1
199 0.1
200 0.11
201 0.1
202 0.09
203 0.09
204 0.09
205 0.13
206 0.16
207 0.18
208 0.18
209 0.21
210 0.22
211 0.27
212 0.27
213 0.25
214 0.22
215 0.21
216 0.2
217 0.17
218 0.15
219 0.11
220 0.11
221 0.09
222 0.09
223 0.08
224 0.09
225 0.09
226 0.1
227 0.11
228 0.1
229 0.1
230 0.14
231 0.13
232 0.12
233 0.13
234 0.15
235 0.14
236 0.2
237 0.21
238 0.18
239 0.19
240 0.19
241 0.18
242 0.17
243 0.17
244 0.12
245 0.11
246 0.11
247 0.11
248 0.11
249 0.1
250 0.11
251 0.13
252 0.13
253 0.19
254 0.22
255 0.28
256 0.3
257 0.36
258 0.36
259 0.36
260 0.36
261 0.31
262 0.32
263 0.27
264 0.3
265 0.24
266 0.23
267 0.25
268 0.27
269 0.28
270 0.25
271 0.25
272 0.24
273 0.25
274 0.24
275 0.25
276 0.24
277 0.24
278 0.24
279 0.26
280 0.23
281 0.24
282 0.25
283 0.19
284 0.2
285 0.17
286 0.15
287 0.12
288 0.11
289 0.09
290 0.1
291 0.1
292 0.08
293 0.14
294 0.15
295 0.15
296 0.19
297 0.25
298 0.3
299 0.36
300 0.43
301 0.45
302 0.5
303 0.6
304 0.66
305 0.69
306 0.72
307 0.72
308 0.75
309 0.77
310 0.74
311 0.72
312 0.69
313 0.66
314 0.6
315 0.58
316 0.51
317 0.48
318 0.5
319 0.46
320 0.48
321 0.47
322 0.46
323 0.48
324 0.44
325 0.41
326 0.38
327 0.38
328 0.39
329 0.37
330 0.39
331 0.36
332 0.37
333 0.34
334 0.33
335 0.32
336 0.28
337 0.25
338 0.21
339 0.21
340 0.24
341 0.26
342 0.31
343 0.33
344 0.28
345 0.29
346 0.3
347 0.26
348 0.22
349 0.21
350 0.16
351 0.1
352 0.1
353 0.09
354 0.09
355 0.09
356 0.1
357 0.09
358 0.08
359 0.07
360 0.11
361 0.13
362 0.15
363 0.17
364 0.17
365 0.21
366 0.23
367 0.28
368 0.3
369 0.28
370 0.27
371 0.3
372 0.29
373 0.28
374 0.26
375 0.24
376 0.19
377 0.21
378 0.2
379 0.19
380 0.19
381 0.17
382 0.22
383 0.23
384 0.25
385 0.27
386 0.3
387 0.3
388 0.34
389 0.41
390 0.47
391 0.5
392 0.51
393 0.54
394 0.54
395 0.52
396 0.52
397 0.47
398 0.41
399 0.36
400 0.35
401 0.29
402 0.29
403 0.29
404 0.27
405 0.32
406 0.29
407 0.29
408 0.26
409 0.25
410 0.23
411 0.22
412 0.22
413 0.17
414 0.19
415 0.18
416 0.24
417 0.25
418 0.26
419 0.34
420 0.41