FuNGI

A0A2S6CEQ6

Protein Details

Accession

A0A2S6CEQ6

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
108-128	DGVAPRAKMNQQRSRRFRSAQ	Hydrophilic
420-446	VKAAQRQKQREDRERRQSNKRPRYSNN	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
414-440	RRRETEVKAAQRQKQREDRERRQSNKR

Subcellular Location(s)

nucl 9, cyto 9, cyto_nucl 9

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR027073 5_3_exoribonuclease IPR041412 Xrn1_helical IPR004859 Xrn1_N IPR017151 Xrn2/3/4 IPR001878 Znf_CCHC
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0004534 F:5'-3' RNA exonuclease activity GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0008270 F:zinc ion binding GO:0006353 P:DNA-templated transcription termination GO:0006397 P:mRNA processing
Pfam	View protein in Pfam PF17846 XRN_M PF03159 XRN_N
PROSITE	View protein in PROSITE PS50158 ZF_CCHC
CDD	cd18673 PIN_XRN1-2-like

Amino Acid Sequences

MGVPALFRWLSKKYPKIISPVVEEHAQKVQNADGSETVIPIDARGPNPNGEEMDNLYLDMNGIVHPCSHPEDRPPPANEEEMMIAIFEYTERVVNMVRPRKLLMIAVDGVAPRAKMNQQRSRRFRSAQEAAEKDAEAAEFHARMVANGERSADGEGADKPKKTWDSNSITPGTPFMDLLAQSLRYWISYKLSTDPAWEKLKVIISDATVPGEGEHKIMNFVRSQRSSPEHDPNTRHVMYGLDADLIMLGLATHEPHFRILREDVFANDTKPGHCRKCNQPGHIAANCQGLTAKNDRSAEEKVEKPLKPFIWLHVGILREYLAIEMSVPNQGFRFDLERALDDWVFMCFFVGNDFLPHLPSLDIREDGIDTLIAIWRDNLPVMGGYVTKDGHVDLARAQLILEGLAKQENAIFKRRRETEVKAAQRQKQREDRERRQSNKRPRYSNNGEPTGFDETVIRRGARGGIIRGEAAPDPNALPTFAPSLAQTMNDPRYQKNLTHADIVGGASGQENKSAAAALKEKLMGSKNGSDNQRADIEALMASTTGGQDLTPKLGKRTRDMIDDAAADDASSDPSTPGRNTPDKEIANPTNRGTSGQLGGNKDASDGMPEDTVKLWEDGYEERYYEQKFHVSPDDIEFRHKVARSYVEGLCWVLLYYFQGCPSWTWYYPYHYAPFAANFKDMDKQVVHFEKGKPFHPYEQLMGVMPAASNHTLPAVFHPLMTDDDSPIKQFYPEDFEVDLNGKKFAWQGVALLPFIDEKKLLEAMHTKYPLLTEDEKRRNGFGEEVLIFSTKHPLYNEVVSNFYGKKADKDKFKINSKTSEGLAGKASKDASYIPNSELTYPLPPGGQDQFTSLDVDESVKVSYHMPVIGQVHKSMLLPGVKFNAPVLDYQDVEHTRQKAERSGRSHGGVQLSHNGDRSDGRRINYAARDNGNSGYDNRNGGGYGGGNGYGANGGYGRNGPPAPDPYASQAAAAFQNLPPHLAAQAAQRGYAPPPGAGPPRDYAPPQPQYGYPPAHNGYGGARGGGGGGGGYGGGRGGYDNRGRGGHGYDNRSGGYNSGGGYQGYQGGGRGNGRRY

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.58
2	0.62
3	0.66
4	0.68
5	0.65
6	0.62
7	0.59
8	0.54
9	0.51
10	0.47
11	0.42
12	0.41
13	0.38
14	0.31
15	0.28
16	0.28
17	0.26
18	0.27
19	0.26
20	0.2
21	0.21
22	0.21
23	0.2
24	0.17
25	0.14
26	0.13
27	0.11
28	0.15
29	0.15
30	0.17
31	0.23
32	0.25
33	0.27
34	0.3
35	0.32
36	0.3
37	0.27
38	0.27
39	0.25
40	0.26
41	0.22
42	0.2
43	0.17
44	0.15
45	0.14
46	0.12
47	0.09
48	0.07
49	0.08
50	0.08
51	0.09
52	0.1
53	0.12
54	0.18
55	0.21
56	0.23
57	0.31
58	0.39
59	0.45
60	0.53
61	0.53
62	0.53
63	0.53
64	0.53
65	0.44
66	0.38
67	0.32
68	0.24
69	0.21
70	0.15
71	0.11
72	0.09
73	0.08
74	0.06
75	0.06
76	0.06
77	0.07
78	0.07
79	0.09
80	0.1
81	0.16
82	0.26
83	0.33
84	0.36
85	0.37
86	0.39
87	0.41
88	0.41
89	0.39
90	0.32
91	0.29
92	0.26
93	0.25
94	0.24
95	0.21
96	0.2
97	0.18
98	0.15
99	0.1
100	0.13
101	0.19
102	0.26
103	0.37
104	0.45
105	0.55
106	0.66
107	0.74
108	0.8
109	0.82
110	0.79
111	0.76
112	0.76
113	0.73
114	0.7
115	0.71
116	0.63
117	0.59
118	0.56
119	0.48
120	0.38
121	0.31
122	0.24
123	0.14
124	0.14
125	0.13
126	0.11
127	0.11
128	0.13
129	0.12
130	0.12
131	0.16
132	0.17
133	0.17
134	0.18
135	0.2
136	0.17
137	0.18
138	0.2
139	0.16
140	0.13
141	0.12
142	0.15
143	0.21
144	0.24
145	0.24
146	0.23
147	0.3
148	0.35
149	0.38
150	0.41
151	0.44
152	0.49
153	0.54
154	0.6
155	0.55
156	0.5
157	0.47
158	0.41
159	0.33
160	0.25
161	0.19
162	0.13
163	0.13
164	0.12
165	0.13
166	0.14
167	0.14
168	0.13
169	0.14
170	0.14
171	0.12
172	0.14
173	0.14
174	0.16
175	0.18
176	0.2
177	0.23
178	0.27
179	0.26
180	0.3
181	0.32
182	0.34
183	0.36
184	0.34
185	0.31
186	0.31
187	0.36
188	0.3
189	0.29
190	0.25
191	0.21
192	0.24
193	0.24
194	0.21
195	0.16
196	0.15
197	0.13
198	0.13
199	0.12
200	0.1
201	0.1
202	0.09
203	0.13
204	0.15
205	0.16
206	0.18
207	0.22
208	0.3
209	0.31
210	0.33
211	0.35
212	0.39
213	0.45
214	0.48
215	0.53
216	0.52
217	0.56
218	0.58
219	0.57
220	0.61
221	0.53
222	0.47
223	0.37
224	0.31
225	0.25
226	0.24
227	0.19
228	0.11
229	0.11
230	0.1
231	0.09
232	0.08
233	0.06
234	0.03
235	0.03
236	0.03
237	0.03
238	0.04
239	0.05
240	0.07
241	0.08
242	0.11
243	0.13
244	0.14
245	0.18
246	0.2
247	0.21
248	0.23
249	0.23
250	0.21
251	0.23
252	0.23
253	0.2
254	0.2
255	0.19
256	0.18
257	0.22
258	0.29
259	0.32
260	0.37
261	0.43
262	0.5
263	0.6
264	0.67
265	0.66
266	0.66
267	0.66
268	0.68
269	0.63
270	0.55
271	0.46
272	0.44
273	0.39
274	0.31
275	0.25
276	0.19
277	0.2
278	0.23
279	0.23
280	0.23
281	0.24
282	0.25
283	0.28
284	0.29
285	0.31
286	0.32
287	0.32
288	0.34
289	0.41
290	0.41
291	0.4
292	0.45
293	0.4
294	0.39
295	0.37
296	0.33
297	0.34
298	0.33
299	0.31
300	0.27
301	0.27
302	0.22
303	0.22
304	0.18
305	0.1
306	0.1
307	0.09
308	0.06
309	0.05
310	0.05
311	0.05
312	0.06
313	0.09
314	0.09
315	0.09
316	0.09
317	0.1
318	0.1
319	0.11
320	0.14
321	0.12
322	0.15
323	0.15
324	0.16
325	0.17
326	0.2
327	0.18
328	0.14
329	0.13
330	0.11
331	0.1
332	0.08
333	0.08
334	0.05
335	0.05
336	0.06
337	0.06
338	0.06
339	0.06
340	0.08
341	0.07
342	0.08
343	0.08
344	0.08
345	0.07
346	0.08
347	0.11
348	0.12
349	0.12
350	0.11
351	0.12
352	0.11
353	0.11
354	0.11
355	0.07
356	0.05
357	0.05
358	0.07
359	0.06
360	0.06
361	0.07
362	0.07
363	0.08
364	0.08
365	0.07
366	0.06
367	0.06
368	0.06
369	0.06
370	0.06
371	0.06
372	0.08
373	0.08
374	0.08
375	0.08
376	0.07
377	0.09
378	0.09
379	0.09
380	0.09
381	0.12
382	0.12
383	0.11
384	0.11
385	0.09
386	0.09
387	0.08
388	0.08
389	0.05
390	0.06
391	0.06
392	0.06
393	0.06
394	0.08
395	0.11
396	0.13
397	0.21
398	0.25
399	0.27
400	0.35
401	0.38
402	0.42
403	0.43
404	0.47
405	0.49
406	0.55
407	0.6
408	0.61
409	0.65
410	0.66
411	0.68
412	0.67
413	0.65
414	0.64
415	0.66
416	0.67
417	0.71
418	0.74
419	0.78
420	0.83
421	0.82
422	0.84
423	0.84
424	0.85
425	0.85
426	0.83
427	0.8
428	0.75
429	0.78
430	0.75
431	0.74
432	0.7
433	0.65
434	0.57
435	0.5
436	0.48
437	0.43
438	0.35
439	0.26
440	0.2
441	0.15
442	0.19
443	0.2
444	0.17
445	0.11
446	0.12
447	0.13
448	0.14
449	0.15
450	0.13
451	0.13
452	0.14
453	0.14
454	0.13
455	0.13
456	0.11
457	0.1
458	0.09
459	0.08
460	0.07
461	0.08
462	0.08
463	0.07
464	0.07
465	0.07
466	0.08
467	0.08
468	0.08
469	0.07
470	0.09
471	0.09
472	0.09
473	0.09
474	0.12
475	0.14
476	0.17
477	0.18
478	0.18
479	0.23
480	0.24
481	0.24
482	0.28
483	0.31
484	0.29
485	0.3
486	0.29
487	0.24
488	0.23
489	0.22
490	0.14
491	0.08
492	0.07
493	0.05
494	0.06
495	0.05
496	0.05
497	0.05
498	0.05
499	0.06
500	0.06
501	0.06
502	0.07
503	0.09
504	0.09
505	0.1
506	0.1
507	0.1
508	0.12
509	0.13
510	0.13
511	0.13
512	0.18
513	0.2
514	0.24
515	0.26
516	0.26
517	0.26
518	0.26
519	0.24
520	0.19
521	0.17
522	0.12
523	0.11
524	0.08
525	0.07
526	0.05
527	0.04
528	0.04
529	0.04
530	0.03
531	0.03
532	0.03
533	0.03
534	0.05
535	0.05
536	0.08
537	0.1
538	0.1
539	0.14
540	0.18
541	0.2
542	0.22
543	0.28
544	0.28
545	0.29
546	0.31
547	0.28
548	0.26
549	0.25
550	0.21
551	0.15
552	0.12
553	0.09
554	0.07
555	0.06
556	0.05
557	0.05
558	0.04
559	0.04
560	0.06
561	0.07
562	0.08
563	0.11
564	0.15
565	0.2
566	0.22
567	0.26
568	0.33
569	0.32
570	0.33
571	0.37
572	0.37
573	0.37
574	0.38
575	0.34
576	0.29
577	0.28
578	0.27
579	0.22
580	0.18
581	0.16
582	0.16
583	0.19
584	0.18
585	0.19
586	0.18
587	0.17
588	0.15
589	0.14
590	0.11
591	0.08
592	0.08
593	0.08
594	0.08
595	0.08
596	0.08
597	0.08
598	0.09
599	0.08
600	0.08
601	0.07
602	0.06
603	0.08
604	0.09
605	0.12
606	0.12
607	0.11
608	0.11
609	0.15
610	0.15
611	0.15
612	0.15
613	0.16
614	0.16
615	0.18
616	0.21
617	0.2
618	0.2
619	0.22
620	0.26
621	0.23
622	0.25
623	0.24
624	0.21
625	0.24
626	0.24
627	0.21
628	0.19
629	0.22
630	0.22
631	0.26
632	0.26
633	0.22
634	0.21
635	0.2
636	0.17
637	0.13
638	0.1
639	0.05
640	0.05
641	0.05
642	0.06
643	0.07
644	0.07
645	0.08
646	0.08
647	0.09
648	0.14
649	0.17
650	0.16
651	0.19
652	0.21
653	0.25
654	0.28
655	0.3
656	0.28
657	0.24
658	0.24
659	0.21
660	0.23
661	0.21
662	0.19
663	0.17
664	0.16
665	0.17
666	0.19
667	0.19
668	0.18
669	0.16
670	0.16
671	0.21
672	0.24
673	0.24
674	0.25
675	0.28
676	0.32
677	0.34
678	0.35
679	0.34
680	0.34
681	0.37
682	0.38
683	0.37
684	0.31
685	0.3
686	0.28
687	0.23
688	0.2
689	0.16
690	0.11
691	0.08
692	0.07
693	0.07
694	0.07
695	0.06
696	0.06
697	0.07
698	0.07
699	0.07
700	0.1
701	0.14
702	0.14
703	0.13
704	0.14
705	0.15
706	0.16
707	0.18
708	0.16
709	0.11
710	0.14
711	0.15
712	0.16
713	0.15
714	0.14
715	0.12
716	0.13
717	0.13
718	0.18
719	0.18
720	0.2
721	0.2
722	0.2
723	0.2
724	0.21
725	0.22
726	0.15
727	0.15
728	0.12
729	0.12
730	0.13
731	0.13
732	0.12
733	0.11
734	0.11
735	0.14
736	0.16
737	0.15
738	0.14
739	0.13
740	0.12
741	0.12
742	0.12
743	0.08
744	0.07
745	0.09
746	0.12
747	0.11
748	0.13
749	0.18
750	0.21
751	0.27
752	0.28
753	0.25
754	0.23
755	0.24
756	0.23
757	0.23
758	0.25
759	0.25
760	0.35
761	0.43
762	0.47
763	0.48
764	0.47
765	0.44
766	0.4
767	0.35
768	0.26
769	0.24
770	0.2
771	0.19
772	0.19
773	0.17
774	0.16
775	0.14
776	0.2
777	0.14
778	0.16
779	0.16
780	0.19
781	0.21
782	0.26
783	0.29
784	0.24
785	0.25
786	0.24
787	0.26
788	0.23
789	0.21
790	0.2
791	0.17
792	0.22
793	0.29
794	0.34
795	0.4
796	0.46
797	0.54
798	0.59
799	0.69
800	0.71
801	0.68
802	0.69
803	0.65
804	0.62
805	0.53
806	0.52
807	0.43
808	0.35
809	0.34
810	0.29
811	0.24
812	0.23
813	0.24
814	0.15
815	0.16
816	0.17
817	0.17
818	0.19
819	0.21
820	0.2
821	0.24
822	0.24
823	0.24
824	0.23
825	0.21
826	0.19
827	0.18
828	0.17
829	0.13
830	0.13
831	0.15
832	0.18
833	0.17
834	0.15
835	0.17
836	0.18
837	0.19
838	0.2
839	0.16
840	0.13
841	0.12
842	0.13
843	0.11
844	0.1
845	0.1
846	0.09
847	0.09
848	0.1
849	0.11
850	0.11
851	0.11
852	0.1
853	0.14
854	0.17
855	0.21
856	0.21
857	0.2
858	0.2
859	0.21
860	0.21
861	0.18
862	0.19
863	0.18
864	0.17
865	0.19
866	0.22
867	0.21
868	0.21
869	0.21
870	0.19
871	0.16
872	0.17
873	0.19
874	0.17
875	0.17
876	0.17
877	0.24
878	0.23
879	0.26
880	0.3
881	0.27
882	0.28
883	0.31
884	0.34
885	0.35
886	0.42
887	0.47
888	0.47
889	0.53
890	0.55
891	0.54
892	0.55
893	0.5
894	0.46
895	0.39
896	0.35
897	0.36
898	0.35
899	0.33
900	0.32
901	0.29
902	0.25
903	0.29
904	0.29
905	0.31
906	0.31
907	0.31
908	0.35
909	0.37
910	0.43
911	0.45
912	0.49
913	0.45
914	0.45
915	0.46
916	0.42
917	0.42
918	0.37
919	0.31
920	0.28
921	0.27
922	0.26
923	0.24
924	0.23
925	0.21
926	0.19
927	0.18
928	0.17
929	0.12
930	0.11
931	0.1
932	0.1
933	0.09
934	0.09
935	0.09
936	0.08
937	0.07
938	0.05
939	0.05
940	0.05
941	0.07
942	0.09
943	0.1
944	0.14
945	0.15
946	0.16
947	0.2
948	0.25
949	0.27
950	0.27
951	0.28
952	0.29
953	0.33
954	0.32
955	0.28
956	0.24
957	0.21
958	0.21
959	0.2
960	0.16
961	0.13
962	0.19
963	0.18
964	0.2
965	0.17
966	0.17
967	0.17
968	0.16
969	0.16
970	0.16
971	0.23
972	0.22
973	0.22
974	0.22
975	0.23
976	0.24
977	0.28
978	0.23
979	0.16
980	0.19
981	0.24
982	0.29
983	0.3
984	0.31
985	0.29
986	0.31
987	0.34
988	0.35
989	0.37
990	0.41
991	0.44
992	0.44
993	0.44
994	0.42
995	0.45
996	0.5
997	0.48
998	0.4
999	0.42
1000	0.41
1001	0.4
1002	0.38
1003	0.33
1004	0.27
1005	0.28
1006	0.26
1007	0.19
1008	0.16
1009	0.14
1010	0.14
1011	0.13
1012	0.1
1013	0.04
1014	0.04
1015	0.03
1016	0.03
1017	0.03
1018	0.03
1019	0.03
1020	0.03
1021	0.03
1022	0.05
1023	0.08
1024	0.15
1025	0.2
1026	0.22
1027	0.25
1028	0.26
1029	0.27
1030	0.29
1031	0.31
1032	0.34
1033	0.37
1034	0.4
1035	0.41
1036	0.43
1037	0.42
1038	0.42
1039	0.37
1040	0.29
1041	0.24
1042	0.2
1043	0.17
1044	0.17
1045	0.17
1046	0.15
1047	0.16
1048	0.16
1049	0.15
1050	0.14
1051	0.14
1052	0.13
1053	0.14
1054	0.17
1055	0.22

A0A2S6CEQ6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer