FuNGI

Q7S442

Protein Details

Accession

Q7S442

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
64-88	VDDTPAARPRKRKQGPKDQVPAEGR	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
71-78	RPRKRKQG

Subcellular Location(s)

mito 9, extr 7, nucl 6, cyto_mito 6

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR045116 Clp1/Grc3 IPR032319 CLP1_P IPR027417 P-loop_NTPase
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0005524 F:ATP binding GO:0051731 F:polynucleotide 5'-hydroxyl-kinase activity GO:0000448 P:cleavage in ITS2 between 5.8S rRNA and LSU-rRNA of tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) GO:0006396 P:RNA processing
KEGG	ncr:NCU02237 -
Pfam	View protein in Pfam PF16575 CLP1_P

Amino Acid Sequences

MSAFAARQKLLAAAASAAATTPNMDDNDNDGDIIDRNTSAKSFFTRDNFRKALQAQKQEPSHHVDDTPAARPRKRKQGPKDQVPAEGRDEGRQLKSQFPNLSEPMPTGRRRIIYYSSQRLSQTNIQPKANGRMLLKLLDGERLVILGSYGIKVREGELTVAGAFLSKSDLVHWVHAPQCHALPVIRITNDATIELHPHPGAQSLRQLASLNPAFGKLWNESDDVAPGQAKKVFPTFQIIFTSDDAPKRGGIQELVSPAEWNKQLADVLDSKRKATPVVFLTGPKSSGKSTFGRLMANRLITGSGLSRQPWAPVVVLDLDPGQPEFGPPSVISLNKLSSPNLSPPFCHPALDPRTAQLRAHTVASVTPSLDPDHFVACALDLFHTCKTNPSLNKLPLIINTPGWIQGTGLDILSELIRQTVPTEVIYMSQDGPEETVDGLKAACQEKKIPFVALPSQQPQGQPSSSVDATTPATSGGGGSSRTALHLRTMQTMSYFHLLFSSLTVPVPHSQSQNQSQPHPGPTWSATPLTHLPPWRVRYRGPRPGFLGILCYDHQPAPDLLAEAINGMILALVKIEDRAGAFRDFPDLLVVSSPQKQQQQHQQSIQQFKKQSSSQKQQQPELLICKTPRESLPHLPNPQGKTLSPAHSRVLGLVLVRGIDVRRGELHLLTPLPVEMLAGNEQNLVLVAGRFDTPSWAYAEDLHRRQWEKNNAAAARNKQQGLVLGGSAKMEIDDDDDDGTGDGDQSDETESVGADEVEERPERERVQALHGGTSEAQPWVEMLHGSQGRAAGSKVWRVRRDLGRR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.12
2	0.11
3	0.1
4	0.09
5	0.08
6	0.07
7	0.07
8	0.08
9	0.1
10	0.12
11	0.13
12	0.14
13	0.17
14	0.22
15	0.21
16	0.2
17	0.16
18	0.16
19	0.17
20	0.17
21	0.15
22	0.11
23	0.12
24	0.13
25	0.14
26	0.14
27	0.16
28	0.19
29	0.22
30	0.28
31	0.35
32	0.44
33	0.49
34	0.57
35	0.57
36	0.54
37	0.58
38	0.56
39	0.59
40	0.57
41	0.62
42	0.59
43	0.64
44	0.68
45	0.65
46	0.63
47	0.6
48	0.55
49	0.47
50	0.41
51	0.34
52	0.35
53	0.34
54	0.38
55	0.38
56	0.4
57	0.44
58	0.53
59	0.59
60	0.65
61	0.71
62	0.74
63	0.77
64	0.83
65	0.88
66	0.9
67	0.91
68	0.82
69	0.82
70	0.75
71	0.68
72	0.61
73	0.56
74	0.46
75	0.39
76	0.41
77	0.36
78	0.36
79	0.39
80	0.37
81	0.4
82	0.44
83	0.49
84	0.49
85	0.48
86	0.51
87	0.47
88	0.46
89	0.38
90	0.34
91	0.33
92	0.36
93	0.35
94	0.33
95	0.35
96	0.37
97	0.39
98	0.42
99	0.41
100	0.45
101	0.52
102	0.57
103	0.54
104	0.54
105	0.53
106	0.49
107	0.5
108	0.48
109	0.48
110	0.48
111	0.52
112	0.49
113	0.51
114	0.53
115	0.55
116	0.51
117	0.46
118	0.37
119	0.37
120	0.38
121	0.36
122	0.32
123	0.27
124	0.23
125	0.22
126	0.2
127	0.16
128	0.14
129	0.12
130	0.12
131	0.08
132	0.08
133	0.06
134	0.06
135	0.06
136	0.08
137	0.08
138	0.09
139	0.1
140	0.11
141	0.13
142	0.14
143	0.14
144	0.13
145	0.14
146	0.13
147	0.12
148	0.11
149	0.08
150	0.07
151	0.06
152	0.07
153	0.06
154	0.06
155	0.07
156	0.13
157	0.14
158	0.17
159	0.18
160	0.2
161	0.23
162	0.25
163	0.26
164	0.23
165	0.22
166	0.21
167	0.21
168	0.17
169	0.16
170	0.18
171	0.21
172	0.19
173	0.19
174	0.19
175	0.2
176	0.2
177	0.18
178	0.16
179	0.12
180	0.16
181	0.16
182	0.17
183	0.14
184	0.14
185	0.13
186	0.17
187	0.18
188	0.16
189	0.21
190	0.21
191	0.22
192	0.23
193	0.24
194	0.19
195	0.26
196	0.25
197	0.21
198	0.18
199	0.18
200	0.17
201	0.18
202	0.2
203	0.14
204	0.16
205	0.17
206	0.18
207	0.17
208	0.17
209	0.18
210	0.15
211	0.14
212	0.12
213	0.11
214	0.12
215	0.15
216	0.14
217	0.15
218	0.19
219	0.19
220	0.19
221	0.26
222	0.26
223	0.25
224	0.27
225	0.27
226	0.25
227	0.25
228	0.27
229	0.22
230	0.22
231	0.21
232	0.19
233	0.18
234	0.18
235	0.17
236	0.15
237	0.14
238	0.14
239	0.15
240	0.16
241	0.17
242	0.15
243	0.14
244	0.13
245	0.17
246	0.16
247	0.14
248	0.12
249	0.12
250	0.12
251	0.12
252	0.15
253	0.15
254	0.18
255	0.25
256	0.25
257	0.26
258	0.27
259	0.27
260	0.26
261	0.22
262	0.24
263	0.2
264	0.23
265	0.23
266	0.22
267	0.24
268	0.23
269	0.24
270	0.18
271	0.17
272	0.15
273	0.16
274	0.19
275	0.19
276	0.21
277	0.25
278	0.26
279	0.28
280	0.27
281	0.3
282	0.29
283	0.27
284	0.24
285	0.19
286	0.17
287	0.14
288	0.14
289	0.09
290	0.09
291	0.1
292	0.1
293	0.12
294	0.12
295	0.13
296	0.13
297	0.14
298	0.11
299	0.1
300	0.11
301	0.1
302	0.1
303	0.1
304	0.09
305	0.08
306	0.08
307	0.08
308	0.07
309	0.05
310	0.05
311	0.06
312	0.06
313	0.07
314	0.06
315	0.09
316	0.1
317	0.11
318	0.12
319	0.13
320	0.13
321	0.15
322	0.16
323	0.14
324	0.15
325	0.17
326	0.21
327	0.25
328	0.24
329	0.22
330	0.26
331	0.31
332	0.29
333	0.28
334	0.22
335	0.26
336	0.3
337	0.33
338	0.29
339	0.25
340	0.29
341	0.3
342	0.3
343	0.22
344	0.21
345	0.19
346	0.19
347	0.17
348	0.13
349	0.13
350	0.14
351	0.12
352	0.09
353	0.08
354	0.09
355	0.1
356	0.09
357	0.1
358	0.09
359	0.09
360	0.09
361	0.08
362	0.07
363	0.06
364	0.07
365	0.05
366	0.05
367	0.05
368	0.07
369	0.08
370	0.09
371	0.09
372	0.12
373	0.15
374	0.2
375	0.21
376	0.26
377	0.32
378	0.32
379	0.34
380	0.33
381	0.3
382	0.25
383	0.28
384	0.22
385	0.15
386	0.14
387	0.13
388	0.13
389	0.12
390	0.11
391	0.07
392	0.07
393	0.08
394	0.08
395	0.07
396	0.06
397	0.06
398	0.06
399	0.06
400	0.05
401	0.04
402	0.04
403	0.04
404	0.04
405	0.05
406	0.05
407	0.06
408	0.06
409	0.07
410	0.07
411	0.08
412	0.09
413	0.09
414	0.08
415	0.08
416	0.08
417	0.07
418	0.07
419	0.06
420	0.06
421	0.05
422	0.05
423	0.05
424	0.05
425	0.05
426	0.05
427	0.08
428	0.1
429	0.11
430	0.12
431	0.16
432	0.18
433	0.23
434	0.23
435	0.21
436	0.19
437	0.21
438	0.25
439	0.24
440	0.25
441	0.23
442	0.23
443	0.24
444	0.24
445	0.23
446	0.21
447	0.17
448	0.16
449	0.15
450	0.18
451	0.16
452	0.16
453	0.14
454	0.13
455	0.14
456	0.13
457	0.12
458	0.07
459	0.07
460	0.07
461	0.07
462	0.05
463	0.05
464	0.05
465	0.06
466	0.07
467	0.07
468	0.08
469	0.09
470	0.09
471	0.1
472	0.14
473	0.15
474	0.18
475	0.19
476	0.18
477	0.18
478	0.19
479	0.18
480	0.17
481	0.15
482	0.11
483	0.11
484	0.11
485	0.1
486	0.11
487	0.1
488	0.08
489	0.08
490	0.08
491	0.1
492	0.11
493	0.15
494	0.16
495	0.17
496	0.19
497	0.25
498	0.3
499	0.36
500	0.36
501	0.35
502	0.38
503	0.38
504	0.38
505	0.34
506	0.29
507	0.24
508	0.24
509	0.25
510	0.22
511	0.21
512	0.18
513	0.2
514	0.23
515	0.23
516	0.24
517	0.23
518	0.26
519	0.3
520	0.35
521	0.37
522	0.37
523	0.39
524	0.46
525	0.54
526	0.6
527	0.57
528	0.57
529	0.56
530	0.56
531	0.52
532	0.41
533	0.35
534	0.25
535	0.24
536	0.2
537	0.17
538	0.16
539	0.15
540	0.15
541	0.14
542	0.13
543	0.12
544	0.12
545	0.12
546	0.1
547	0.1
548	0.1
549	0.08
550	0.07
551	0.05
552	0.04
553	0.03
554	0.03
555	0.03
556	0.03
557	0.03
558	0.03
559	0.03
560	0.04
561	0.04
562	0.05
563	0.05
564	0.07
565	0.09
566	0.1
567	0.11
568	0.11
569	0.15
570	0.14
571	0.14
572	0.14
573	0.12
574	0.11
575	0.11
576	0.12
577	0.11
578	0.15
579	0.17
580	0.2
581	0.26
582	0.29
583	0.35
584	0.44
585	0.51
586	0.55
587	0.58
588	0.61
589	0.62
590	0.69
591	0.67
592	0.63
593	0.57
594	0.52
595	0.53
596	0.51
597	0.54
598	0.54
599	0.6
600	0.62
601	0.67
602	0.71
603	0.69
604	0.69
605	0.63
606	0.57
607	0.53
608	0.46
609	0.42
610	0.37
611	0.37
612	0.34
613	0.33
614	0.31
615	0.32
616	0.36
617	0.41
618	0.5
619	0.54
620	0.56
621	0.59
622	0.62
623	0.58
624	0.57
625	0.5
626	0.41
627	0.37
628	0.39
629	0.4
630	0.39
631	0.39
632	0.35
633	0.36
634	0.36
635	0.31
636	0.27
637	0.21
638	0.16
639	0.14
640	0.13
641	0.09
642	0.09
643	0.1
644	0.08
645	0.11
646	0.11
647	0.12
648	0.14
649	0.16
650	0.17
651	0.17
652	0.18
653	0.18
654	0.18
655	0.17
656	0.16
657	0.13
658	0.12
659	0.11
660	0.1
661	0.06
662	0.08
663	0.1
664	0.1
665	0.1
666	0.1
667	0.1
668	0.1
669	0.09
670	0.07
671	0.06
672	0.05
673	0.05
674	0.06
675	0.07
676	0.08
677	0.08
678	0.11
679	0.11
680	0.13
681	0.14
682	0.14
683	0.14
684	0.19
685	0.26
686	0.32
687	0.34
688	0.37
689	0.42
690	0.44
691	0.5
692	0.55
693	0.58
694	0.55
695	0.57
696	0.61
697	0.57
698	0.6
699	0.61
700	0.58
701	0.56
702	0.57
703	0.52
704	0.44
705	0.42
706	0.4
707	0.37
708	0.32
709	0.24
710	0.18
711	0.18
712	0.18
713	0.16
714	0.12
715	0.08
716	0.07
717	0.07
718	0.09
719	0.09
720	0.1
721	0.1
722	0.11
723	0.11
724	0.1
725	0.1
726	0.07
727	0.07
728	0.06
729	0.05
730	0.05
731	0.06
732	0.08
733	0.08
734	0.08
735	0.08
736	0.08
737	0.08
738	0.09
739	0.08
740	0.06
741	0.08
742	0.09
743	0.13
744	0.15
745	0.15
746	0.17
747	0.22
748	0.23
749	0.26
750	0.31
751	0.29
752	0.34
753	0.39
754	0.37
755	0.36
756	0.35
757	0.34
758	0.29
759	0.28
760	0.23
761	0.18
762	0.16
763	0.13
764	0.12
765	0.1
766	0.1
767	0.09
768	0.08
769	0.16
770	0.18
771	0.18
772	0.2
773	0.21
774	0.21
775	0.22
776	0.22
777	0.19
778	0.22
779	0.3
780	0.37
781	0.45
782	0.48
783	0.53
784	0.62

Q7S442

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer