FuNGI

A0A2S6CMS6

Protein Details

Accession

A0A2S6CMS6

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
185-213	LKDKTPEAEDKPKRTRKRRWDTSGESAET	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
195-203	KPKRTRKRR

Subcellular Location(s)

plas 14, nucl 6.5, cyto_nucl 6, cyto 4.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR011989 ARM-like IPR016024 ARM-type_fold IPR015016 SF3b_su1 IPR038737 SF3b_su1-like
Gene Ontology	GO:0005681 C:spliceosomal complex GO:0003729 F:mRNA binding GO:0000245 P:spliceosomal complex assembly
Pfam	View protein in Pfam PF08920 SF3b1

Amino Acid Sequences

MSDADFDKVRQAQIERNAGKKGFKDASSQRTNNNKGVSLTENFDKDLYGNESGDKFAGYNTTIDVNDDEDMEDADDGENGRLVGQYTATAAQIGEWAHGETAEDDILQSREKQAQIASRETDYQKRRFQRGLDGDGEKTYKEVMAERELEREEQRVRKLIEDQNKETIANGDDDEMEGVEGRPTLKDKTPEAEDKPKRTRKRRWDTSGESAETNGDAQANGANGTNGTNGHATNGETAVKKSRWDSTPAPDGDSAPKKRSKWDLVSAGSGGGGQTNGAADAAPTGPVVAFGNDASGRNAPLSDEELDEMLPSEGYKILTPPPGYEPLRAPSKRVAPSATPATGGFMNQEPVDARSMGKQLPSEIPGVGDLQFFKAEDMAYFGKLVDGADENDLSVEELKQRKIMRLLLKVKNGTPPMRKTALRQLTDNARSFGAGPLFDQILPLLMEKSLEDQERHLLVKVIDRVLYKLDDLVRPYVHKILVVIEPLLIDQDYYARVEGREIISNLAKAAGLATMISTMRPDIDHVDEYVRNTTARAFAVVASALGIPTLLPFLKAVCKSKKSWQARHTGVKIIQQIPILMGCAVLPHLKGLVDCIGENLNDEQAKVRTVTSLALAALAEASNPFGIESFDDILNPLWTGARKQRGKGLAGFLKAVGYIIPLMDEEYGNYYTSQIMEILIREFQSPDEEMKKVVLKVISQCAGGAGVTATYLKEHVLNEFFKFFWVRRMALDKRNYKQVVETTVDLGQKVGVGEIVERIVGNLKDESEAYRKMTVETIEKVISAMGAADINERLEERLVDGILHSFQEQSVEDVVLLNGFGTVVNSLGTRCKPYLPQIVSTILWRLNNKSATVRQQAADLITRIAIVLKQCDEDVLLGKLGSVLYEYLGEEYPEVLGSILGAMRSIVTVVGISSMQPPIKDLLPRLTPILRNRHEKVQENTIDLVGRIADRGPESVNAREWMRICFELLDMLKAHKKGIRRAANNTFGFIAKAIGPQDVLATLLNNLRVQERQSRVCTAVAIGIVAETCAPFTVLPALMNEYRVPELNVQNGVLKSLSFLFEYIGEMAKDYVYAVTPLLEDALIDRDQVHRQTAASVVKHVALGVVGLGCEDAMLHLLNLLYPNLFETSPHVIDRVIEAIDAIRLAVGTGAVMNYVWAGLFHPARKVRVPYWRLYNDAYVQSADAMVPYYPAIEDDKLVRHELMVVL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.52
2	0.49
3	0.51
4	0.56
5	0.54
6	0.56
7	0.5
8	0.5
9	0.46
10	0.43
11	0.48
12	0.51
13	0.58
14	0.63
15	0.63
16	0.63
17	0.68
18	0.72
19	0.69
20	0.64
21	0.57
22	0.49
23	0.5
24	0.47
25	0.39
26	0.38
27	0.36
28	0.34
29	0.31
30	0.3
31	0.26
32	0.21
33	0.23
34	0.23
35	0.21
36	0.2
37	0.22
38	0.23
39	0.23
40	0.23
41	0.19
42	0.14
43	0.12
44	0.15
45	0.12
46	0.12
47	0.13
48	0.16
49	0.15
50	0.17
51	0.17
52	0.16
53	0.15
54	0.15
55	0.14
56	0.11
57	0.11
58	0.1
59	0.09
60	0.08
61	0.07
62	0.08
63	0.08
64	0.08
65	0.09
66	0.08
67	0.08
68	0.09
69	0.09
70	0.09
71	0.09
72	0.09
73	0.1
74	0.12
75	0.11
76	0.11
77	0.1
78	0.09
79	0.11
80	0.11
81	0.1
82	0.1
83	0.1
84	0.1
85	0.1
86	0.11
87	0.08
88	0.1
89	0.09
90	0.08
91	0.07
92	0.1
93	0.11
94	0.12
95	0.12
96	0.15
97	0.2
98	0.21
99	0.23
100	0.25
101	0.31
102	0.34
103	0.39
104	0.38
105	0.35
106	0.41
107	0.42
108	0.47
109	0.48
110	0.52
111	0.55
112	0.61
113	0.66
114	0.65
115	0.65
116	0.67
117	0.67
118	0.65
119	0.62
120	0.57
121	0.51
122	0.49
123	0.46
124	0.35
125	0.27
126	0.22
127	0.16
128	0.14
129	0.16
130	0.17
131	0.22
132	0.27
133	0.27
134	0.31
135	0.31
136	0.33
137	0.31
138	0.32
139	0.33
140	0.35
141	0.39
142	0.41
143	0.41
144	0.42
145	0.49
146	0.52
147	0.55
148	0.57
149	0.57
150	0.56
151	0.56
152	0.52
153	0.45
154	0.39
155	0.3
156	0.24
157	0.2
158	0.14
159	0.13
160	0.13
161	0.13
162	0.1
163	0.08
164	0.07
165	0.07
166	0.07
167	0.07
168	0.08
169	0.09
170	0.12
171	0.16
172	0.2
173	0.25
174	0.27
175	0.33
176	0.39
177	0.44
178	0.49
179	0.56
180	0.58
181	0.63
182	0.71
183	0.75
184	0.79
185	0.82
186	0.86
187	0.86
188	0.9
189	0.91
190	0.9
191	0.9
192	0.87
193	0.87
194	0.84
195	0.75
196	0.64
197	0.53
198	0.44
199	0.34
200	0.27
201	0.17
202	0.1
203	0.07
204	0.07
205	0.08
206	0.08
207	0.08
208	0.08
209	0.07
210	0.07
211	0.08
212	0.09
213	0.08
214	0.09
215	0.1
216	0.1
217	0.11
218	0.12
219	0.12
220	0.12
221	0.14
222	0.15
223	0.15
224	0.17
225	0.22
226	0.22
227	0.24
228	0.25
229	0.31
230	0.31
231	0.36
232	0.39
233	0.39
234	0.47
235	0.46
236	0.46
237	0.39
238	0.39
239	0.4
240	0.44
241	0.42
242	0.39
243	0.44
244	0.42
245	0.48
246	0.55
247	0.56
248	0.54
249	0.59
250	0.6
251	0.57
252	0.58
253	0.51
254	0.42
255	0.33
256	0.26
257	0.17
258	0.1
259	0.07
260	0.04
261	0.04
262	0.04
263	0.04
264	0.04
265	0.04
266	0.03
267	0.05
268	0.05
269	0.05
270	0.05
271	0.05
272	0.05
273	0.06
274	0.07
275	0.06
276	0.06
277	0.06
278	0.09
279	0.09
280	0.1
281	0.12
282	0.12
283	0.12
284	0.12
285	0.12
286	0.1
287	0.11
288	0.13
289	0.12
290	0.12
291	0.12
292	0.12
293	0.12
294	0.11
295	0.1
296	0.08
297	0.06
298	0.05
299	0.06
300	0.07
301	0.08
302	0.08
303	0.09
304	0.12
305	0.16
306	0.17
307	0.18
308	0.2
309	0.27
310	0.29
311	0.3
312	0.3
313	0.3
314	0.4
315	0.38
316	0.37
317	0.36
318	0.42
319	0.44
320	0.43
321	0.42
322	0.34
323	0.4
324	0.42
325	0.36
326	0.29
327	0.25
328	0.24
329	0.21
330	0.19
331	0.15
332	0.11
333	0.12
334	0.1
335	0.11
336	0.1
337	0.11
338	0.13
339	0.11
340	0.11
341	0.12
342	0.15
343	0.15
344	0.17
345	0.16
346	0.17
347	0.19
348	0.2
349	0.19
350	0.16
351	0.15
352	0.14
353	0.14
354	0.12
355	0.11
356	0.09
357	0.09
358	0.09
359	0.09
360	0.09
361	0.08
362	0.08
363	0.07
364	0.1
365	0.1
366	0.1
367	0.1
368	0.1
369	0.09
370	0.1
371	0.09
372	0.07
373	0.07
374	0.07
375	0.08
376	0.08
377	0.08
378	0.08
379	0.08
380	0.07
381	0.07
382	0.06
383	0.11
384	0.14
385	0.14
386	0.19
387	0.2
388	0.23
389	0.27
390	0.33
391	0.35
392	0.41
393	0.5
394	0.52
395	0.56
396	0.55
397	0.53
398	0.53
399	0.5
400	0.47
401	0.45
402	0.43
403	0.42
404	0.45
405	0.44
406	0.42
407	0.48
408	0.5
409	0.45
410	0.43
411	0.41
412	0.45
413	0.5
414	0.48
415	0.38
416	0.3
417	0.28
418	0.27
419	0.25
420	0.18
421	0.12
422	0.1
423	0.1
424	0.11
425	0.11
426	0.1
427	0.07
428	0.07
429	0.07
430	0.07
431	0.06
432	0.05
433	0.06
434	0.06
435	0.09
436	0.11
437	0.12
438	0.12
439	0.13
440	0.16
441	0.18
442	0.18
443	0.16
444	0.15
445	0.14
446	0.18
447	0.2
448	0.18
449	0.18
450	0.18
451	0.18
452	0.18
453	0.18
454	0.13
455	0.13
456	0.14
457	0.14
458	0.15
459	0.17
460	0.16
461	0.17
462	0.18
463	0.19
464	0.16
465	0.15
466	0.13
467	0.14
468	0.14
469	0.13
470	0.12
471	0.09
472	0.09
473	0.09
474	0.09
475	0.06
476	0.04
477	0.03
478	0.04
479	0.05
480	0.05
481	0.06
482	0.06
483	0.06
484	0.07
485	0.09
486	0.1
487	0.12
488	0.12
489	0.14
490	0.14
491	0.14
492	0.14
493	0.12
494	0.1
495	0.07
496	0.07
497	0.05
498	0.04
499	0.03
500	0.03
501	0.04
502	0.04
503	0.04
504	0.04
505	0.04
506	0.05
507	0.05
508	0.06
509	0.07
510	0.1
511	0.1
512	0.11
513	0.13
514	0.14
515	0.15
516	0.16
517	0.14
518	0.11
519	0.11
520	0.11
521	0.11
522	0.1
523	0.1
524	0.09
525	0.08
526	0.09
527	0.08
528	0.07
529	0.06
530	0.06
531	0.04
532	0.04
533	0.04
534	0.03
535	0.03
536	0.04
537	0.03
538	0.04
539	0.04
540	0.05
541	0.09
542	0.12
543	0.18
544	0.23
545	0.26
546	0.29
547	0.37
548	0.47
549	0.51
550	0.58
551	0.59
552	0.62
553	0.65
554	0.7
555	0.64
556	0.58
557	0.51
558	0.47
559	0.45
560	0.38
561	0.33
562	0.26
563	0.24
564	0.19
565	0.17
566	0.13
567	0.08
568	0.06
569	0.04
570	0.04
571	0.04
572	0.05
573	0.05
574	0.04
575	0.05
576	0.05
577	0.05
578	0.06
579	0.07
580	0.07
581	0.07
582	0.08
583	0.08
584	0.08
585	0.09
586	0.08
587	0.08
588	0.07
589	0.07
590	0.08
591	0.08
592	0.09
593	0.09
594	0.09
595	0.07
596	0.08
597	0.08
598	0.07
599	0.07
600	0.07
601	0.06
602	0.06
603	0.05
604	0.05
605	0.04
606	0.04
607	0.03
608	0.03
609	0.03
610	0.03
611	0.03
612	0.03
613	0.03
614	0.04
615	0.05
616	0.06
617	0.06
618	0.06
619	0.07
620	0.07
621	0.07
622	0.07
623	0.06
624	0.05
625	0.06
626	0.08
627	0.13
628	0.22
629	0.24
630	0.25
631	0.31
632	0.34
633	0.36
634	0.36
635	0.37
636	0.31
637	0.3
638	0.29
639	0.24
640	0.2
641	0.18
642	0.15
643	0.08
644	0.05
645	0.04
646	0.03
647	0.04
648	0.03
649	0.04
650	0.05
651	0.05
652	0.04
653	0.07
654	0.08
655	0.08
656	0.08
657	0.08
658	0.08
659	0.08
660	0.08
661	0.06
662	0.06
663	0.06
664	0.06
665	0.06
666	0.07
667	0.07
668	0.07
669	0.07
670	0.07
671	0.09
672	0.09
673	0.11
674	0.13
675	0.13
676	0.13
677	0.14
678	0.16
679	0.14
680	0.16
681	0.14
682	0.13
683	0.16
684	0.19
685	0.19
686	0.17
687	0.16
688	0.14
689	0.13
690	0.11
691	0.08
692	0.04
693	0.03
694	0.03
695	0.04
696	0.03
697	0.04
698	0.04
699	0.04
700	0.06
701	0.07
702	0.09
703	0.12
704	0.13
705	0.14
706	0.15
707	0.15
708	0.14
709	0.15
710	0.14
711	0.17
712	0.19
713	0.19
714	0.2
715	0.28
716	0.32
717	0.38
718	0.46
719	0.47
720	0.47
721	0.55
722	0.53
723	0.46
724	0.45
725	0.4
726	0.36
727	0.31
728	0.29
729	0.22
730	0.24
731	0.24
732	0.2
733	0.17
734	0.12
735	0.11
736	0.1
737	0.08
738	0.05
739	0.04
740	0.05
741	0.05
742	0.05
743	0.05
744	0.05
745	0.05
746	0.08
747	0.08
748	0.09
749	0.09
750	0.09
751	0.1
752	0.1
753	0.13
754	0.14
755	0.15
756	0.16
757	0.18
758	0.18
759	0.18
760	0.2
761	0.19
762	0.19
763	0.19
764	0.19
765	0.17
766	0.17
767	0.16
768	0.14
769	0.11
770	0.08
771	0.06
772	0.04
773	0.04
774	0.04
775	0.05
776	0.05
777	0.05
778	0.06
779	0.06
780	0.06
781	0.06
782	0.06
783	0.06
784	0.07
785	0.07
786	0.07
787	0.07
788	0.08
789	0.08
790	0.08
791	0.07
792	0.06
793	0.06
794	0.08
795	0.08
796	0.08
797	0.09
798	0.08
799	0.08
800	0.08
801	0.08
802	0.06
803	0.06
804	0.04
805	0.03
806	0.03
807	0.03
808	0.03
809	0.03
810	0.04
811	0.04
812	0.04
813	0.05
814	0.09
815	0.1
816	0.13
817	0.14
818	0.16
819	0.18
820	0.24
821	0.33
822	0.32
823	0.34
824	0.34
825	0.35
826	0.34
827	0.32
828	0.29
829	0.21
830	0.22
831	0.21
832	0.21
833	0.25
834	0.26
835	0.27
836	0.29
837	0.32
838	0.37
839	0.4
840	0.39
841	0.33
842	0.33
843	0.32
844	0.29
845	0.26
846	0.19
847	0.14
848	0.12
849	0.12
850	0.1
851	0.1
852	0.09
853	0.08
854	0.1
855	0.1
856	0.11
857	0.11
858	0.11
859	0.11
860	0.11
861	0.12
862	0.1
863	0.09
864	0.08
865	0.08
866	0.09
867	0.08
868	0.07
869	0.06
870	0.05
871	0.05
872	0.06
873	0.06
874	0.07
875	0.07
876	0.08
877	0.07
878	0.07
879	0.07
880	0.06
881	0.06
882	0.05
883	0.04
884	0.04
885	0.04
886	0.05
887	0.04
888	0.04
889	0.04
890	0.04
891	0.04
892	0.04
893	0.04
894	0.03
895	0.04
896	0.04
897	0.05
898	0.05
899	0.05
900	0.07
901	0.1
902	0.1
903	0.1
904	0.12
905	0.13
906	0.16
907	0.18
908	0.18
909	0.22
910	0.24
911	0.25
912	0.28
913	0.3
914	0.32
915	0.37
916	0.45
917	0.45
918	0.5
919	0.53
920	0.59
921	0.62
922	0.64
923	0.61
924	0.61
925	0.57
926	0.53
927	0.5
928	0.42
929	0.35
930	0.28
931	0.23
932	0.14
933	0.11
934	0.08
935	0.08
936	0.08
937	0.09
938	0.1
939	0.11
940	0.14
941	0.17
942	0.19
943	0.22
944	0.23
945	0.23
946	0.25
947	0.25
948	0.24
949	0.24
950	0.22
951	0.21
952	0.19
953	0.18
954	0.19
955	0.18
956	0.19
957	0.15
958	0.18
959	0.22
960	0.22
961	0.24
962	0.22
963	0.27
964	0.33
965	0.43
966	0.49
967	0.5
968	0.59
969	0.65
970	0.72
971	0.67
972	0.6
973	0.51
974	0.41
975	0.36
976	0.28
977	0.2
978	0.11
979	0.13
980	0.13
981	0.12
982	0.11
983	0.11
984	0.11
985	0.1
986	0.1
987	0.07
988	0.07
989	0.08
990	0.1
991	0.12
992	0.12
993	0.13
994	0.14
995	0.16
996	0.19
997	0.26
998	0.31
999	0.35
1000	0.38
1001	0.41
1002	0.42
1003	0.41
1004	0.38
1005	0.29
1006	0.25
1007	0.19
1008	0.15
1009	0.11
1010	0.09
1011	0.08
1012	0.07
1013	0.06
1014	0.04
1015	0.04
1016	0.04
1017	0.05
1018	0.05
1019	0.06
1020	0.09
1021	0.1
1022	0.1
1023	0.11
1024	0.16
1025	0.16
1026	0.18
1027	0.18
1028	0.17
1029	0.18
1030	0.18
1031	0.19
1032	0.2
1033	0.23
1034	0.25
1035	0.26
1036	0.25
1037	0.28
1038	0.27
1039	0.26
1040	0.2
1041	0.17
1042	0.14
1043	0.14
1044	0.15
1045	0.11
1046	0.11
1047	0.11
1048	0.11
1049	0.13
1050	0.12
1051	0.12
1052	0.11
1053	0.11
1054	0.11
1055	0.1
1056	0.1
1057	0.09
1058	0.08
1059	0.07
1060	0.08
1061	0.08
1062	0.08
1063	0.08
1064	0.08
1065	0.08
1066	0.07
1067	0.06
1068	0.07
1069	0.1
1070	0.1
1071	0.1
1072	0.11
1073	0.14
1074	0.19
1075	0.21
1076	0.23
1077	0.2
1078	0.2
1079	0.22
1080	0.27
1081	0.3
1082	0.27
1083	0.27
1084	0.26
1085	0.26
1086	0.25
1087	0.23
1088	0.18
1089	0.11
1090	0.1
1091	0.08
1092	0.06
1093	0.05
1094	0.05
1095	0.05
1096	0.04
1097	0.04
1098	0.04
1099	0.03
1100	0.04
1101	0.05
1102	0.05
1103	0.06
1104	0.06
1105	0.07
1106	0.09
1107	0.09
1108	0.08
1109	0.08
1110	0.1
1111	0.11
1112	0.11
1113	0.1
1114	0.14
1115	0.21
1116	0.23
1117	0.24
1118	0.23
1119	0.21
1120	0.22
1121	0.23
1122	0.21
1123	0.14
1124	0.11
1125	0.11
1126	0.11
1127	0.11
1128	0.1
1129	0.08
1130	0.06
1131	0.05
1132	0.05
1133	0.05
1134	0.05
1135	0.04
1136	0.05
1137	0.05
1138	0.05
1139	0.05
1140	0.05
1141	0.05
1142	0.05
1143	0.05
1144	0.04
1145	0.06
1146	0.11
1147	0.15
1148	0.17
1149	0.25
1150	0.3
1151	0.34
1152	0.4
1153	0.45
1154	0.47
1155	0.54
1156	0.57
1157	0.57
1158	0.63
1159	0.63
1160	0.61
1161	0.58
1162	0.57
1163	0.52
1164	0.5
1165	0.44
1166	0.34
1167	0.3
1168	0.26
1169	0.23
1170	0.17
1171	0.12
1172	0.1
1173	0.08
1174	0.08
1175	0.08
1176	0.08
1177	0.08
1178	0.09
1179	0.13
1180	0.12
1181	0.14
1182	0.17
1183	0.23
1184	0.25
1185	0.27
1186	0.26
1187	0.22

A0A2S6CMS6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer