FuNGI

A0A2S6CI42

Protein Details

Accession

A0A2S6CI42

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
62-83	GASFRSYRSQKTKQRGELEREF	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
340-342	KKR

Subcellular Location(s)

nucl 16, mito 7, cyto 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007307 Ltv1
Gene Ontology	GO:0042274 P:ribosomal small subunit biogenesis
Pfam	View protein in Pfam PF04180 LTV

Amino Acid Sequences

MPRQRPFSKQNAIKLDLVHRAQNDPLIHDENAPSMVLVERGQSRRPTEDDYAYSAAGSVYSGASFRSYRSQKTKQRGELEREFGDNVRRNEGEAAQHGVFYDDTQYDYMQHMRDLGGMGSQWVEAKQPDDKKKGKQKLEDMLADSLQLDDASSVASSTTSSIARSLFPEEILPSEFVTKRTYQDQQDVPDDIAGFQPDMDPRLREVLEALEDEEYVDDDEDIFGELTRDGYEVERDEWEGAVEQSFDDDGWESDDTIKAPASPRELPRELRLPDGVELGDGELALPPEDPQAQPTADPAAGGWDFMKEHKATKKAAKAEVAEPSFNNASLISSLASGRHKKRKGAMTNPSTYSMSSSALVRKDALRTLDERFDKMENDYSLAEFPEDEEDAYNADTQSMASGMTGMTGMSSASRVSKAYSTASGMSGVSGISSYSRANDEEAPKLVRSDFDGMMDDFLSSHNKAGKYGQRVRRGAPKNGMEQLDEIRSGLGPARFGSKTKPKSHVPVKIG

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.62
2	0.58
3	0.56
4	0.51
5	0.47
6	0.4
7	0.38
8	0.37
9	0.39
10	0.34
11	0.29
12	0.32
13	0.31
14	0.3
15	0.29
16	0.29
17	0.24
18	0.24
19	0.21
20	0.15
21	0.12
22	0.12
23	0.11
24	0.1
25	0.13
26	0.19
27	0.22
28	0.28
29	0.33
30	0.36
31	0.4
32	0.44
33	0.47
34	0.45
35	0.48
36	0.46
37	0.45
38	0.43
39	0.38
40	0.33
41	0.27
42	0.21
43	0.15
44	0.12
45	0.07
46	0.05
47	0.06
48	0.06
49	0.06
50	0.09
51	0.1
52	0.12
53	0.21
54	0.25
55	0.33
56	0.43
57	0.53
58	0.59
59	0.7
60	0.78
61	0.77
62	0.83
63	0.82
64	0.82
65	0.8
66	0.76
67	0.68
68	0.6
69	0.52
70	0.44
71	0.45
72	0.43
73	0.36
74	0.36
75	0.34
76	0.34
77	0.35
78	0.35
79	0.3
80	0.26
81	0.29
82	0.23
83	0.23
84	0.22
85	0.2
86	0.17
87	0.14
88	0.14
89	0.09
90	0.1
91	0.11
92	0.11
93	0.11
94	0.14
95	0.16
96	0.14
97	0.14
98	0.14
99	0.13
100	0.14
101	0.14
102	0.12
103	0.09
104	0.08
105	0.09
106	0.08
107	0.08
108	0.07
109	0.07
110	0.08
111	0.08
112	0.11
113	0.17
114	0.25
115	0.33
116	0.42
117	0.47
118	0.56
119	0.66
120	0.74
121	0.75
122	0.75
123	0.75
124	0.75
125	0.76
126	0.69
127	0.61
128	0.53
129	0.45
130	0.37
131	0.28
132	0.19
133	0.13
134	0.09
135	0.06
136	0.04
137	0.04
138	0.04
139	0.04
140	0.04
141	0.04
142	0.04
143	0.04
144	0.05
145	0.07
146	0.07
147	0.07
148	0.09
149	0.1
150	0.11
151	0.12
152	0.14
153	0.13
154	0.13
155	0.13
156	0.12
157	0.13
158	0.14
159	0.13
160	0.1
161	0.14
162	0.14
163	0.15
164	0.18
165	0.18
166	0.19
167	0.23
168	0.28
169	0.27
170	0.33
171	0.35
172	0.35
173	0.37
174	0.36
175	0.31
176	0.26
177	0.23
178	0.17
179	0.14
180	0.11
181	0.07
182	0.06
183	0.07
184	0.07
185	0.09
186	0.09
187	0.09
188	0.1
189	0.14
190	0.14
191	0.12
192	0.13
193	0.12
194	0.12
195	0.11
196	0.11
197	0.08
198	0.08
199	0.08
200	0.07
201	0.06
202	0.05
203	0.05
204	0.04
205	0.04
206	0.04
207	0.04
208	0.04
209	0.04
210	0.04
211	0.04
212	0.04
213	0.04
214	0.05
215	0.05
216	0.05
217	0.05
218	0.07
219	0.07
220	0.08
221	0.09
222	0.09
223	0.09
224	0.08
225	0.08
226	0.07
227	0.07
228	0.06
229	0.05
230	0.05
231	0.05
232	0.05
233	0.04
234	0.04
235	0.04
236	0.04
237	0.06
238	0.06
239	0.06
240	0.06
241	0.07
242	0.07
243	0.08
244	0.08
245	0.07
246	0.08
247	0.1
248	0.14
249	0.18
250	0.2
251	0.26
252	0.29
253	0.3
254	0.31
255	0.36
256	0.33
257	0.31
258	0.29
259	0.23
260	0.21
261	0.2
262	0.17
263	0.1
264	0.09
265	0.07
266	0.06
267	0.05
268	0.04
269	0.04
270	0.04
271	0.04
272	0.04
273	0.04
274	0.05
275	0.07
276	0.07
277	0.07
278	0.09
279	0.09
280	0.09
281	0.1
282	0.11
283	0.09
284	0.09
285	0.08
286	0.09
287	0.09
288	0.09
289	0.08
290	0.07
291	0.08
292	0.08
293	0.12
294	0.09
295	0.14
296	0.19
297	0.23
298	0.26
299	0.33
300	0.39
301	0.42
302	0.45
303	0.44
304	0.42
305	0.41
306	0.44
307	0.39
308	0.33
309	0.27
310	0.27
311	0.24
312	0.21
313	0.18
314	0.11
315	0.1
316	0.09
317	0.09
318	0.06
319	0.06
320	0.07
321	0.09
322	0.14
323	0.2
324	0.28
325	0.37
326	0.41
327	0.45
328	0.52
329	0.6
330	0.64
331	0.67
332	0.7
333	0.68
334	0.7
335	0.67
336	0.62
337	0.53
338	0.44
339	0.36
340	0.27
341	0.21
342	0.16
343	0.16
344	0.17
345	0.17
346	0.18
347	0.17
348	0.18
349	0.19
350	0.21
351	0.21
352	0.2
353	0.21
354	0.23
355	0.3
356	0.29
357	0.28
358	0.28
359	0.27
360	0.26
361	0.26
362	0.28
363	0.21
364	0.22
365	0.21
366	0.2
367	0.19
368	0.18
369	0.15
370	0.09
371	0.1
372	0.1
373	0.1
374	0.09
375	0.09
376	0.09
377	0.09
378	0.1
379	0.11
380	0.08
381	0.08
382	0.07
383	0.07
384	0.07
385	0.06
386	0.06
387	0.04
388	0.05
389	0.04
390	0.05
391	0.05
392	0.04
393	0.04
394	0.04
395	0.04
396	0.04
397	0.05
398	0.05
399	0.07
400	0.08
401	0.09
402	0.11
403	0.13
404	0.15
405	0.17
406	0.19
407	0.2
408	0.2
409	0.2
410	0.19
411	0.17
412	0.15
413	0.12
414	0.1
415	0.07
416	0.06
417	0.05
418	0.05
419	0.07
420	0.07
421	0.09
422	0.11
423	0.12
424	0.15
425	0.21
426	0.24
427	0.26
428	0.29
429	0.3
430	0.29
431	0.3
432	0.28
433	0.22
434	0.23
435	0.24
436	0.21
437	0.2
438	0.22
439	0.21
440	0.21
441	0.2
442	0.16
443	0.11
444	0.12
445	0.14
446	0.12
447	0.15
448	0.19
449	0.2
450	0.21
451	0.29
452	0.36
453	0.42
454	0.52
455	0.57
456	0.62
457	0.65
458	0.69
459	0.71
460	0.71
461	0.7
462	0.69
463	0.67
464	0.63
465	0.67
466	0.64
467	0.55
468	0.5
469	0.45
470	0.39
471	0.32
472	0.26
473	0.19
474	0.18
475	0.17
476	0.19
477	0.16
478	0.15
479	0.15
480	0.21
481	0.22
482	0.24
483	0.32
484	0.38
485	0.46
486	0.53
487	0.59
488	0.61
489	0.7
490	0.78

A0A2S6CI42

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer