Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2S6C4W1

Protein Details
Accession A0A2S6C4W1    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
238-268LPSHNDRNTQPKRPVRKRRRLDPAKARKSSIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
248-265PKRPVRKRRRLDPAKARK
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 10, mito 7, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR014144  LigD_PE_domain  
Pfam View protein in Pfam  
PF13298  LigD_N  
Amino Acid Sequences MSTKAQPATLVRDVSPPPLRKHSTALAGSEQNVRPDHHPIKSEAARIEAHEVAIRDHLTYFVQHLSSALRPSSGPRITIEHFRNLYLRNQHAKGAHFVIHQHDHPISGVHYDLRLQLSETSSVSWAIPYGLPGNANSLRPNRMAIETRVHNLWNNLIESASHATGSLLIWDTGEYEVLDRPQQEPTQTTDDELSEVEQEPAKSEPQNERLIKAFQSRHIHLRLHGSRLPQNYTIALRLPSHNDRNTQPKRPVRKRRRLDPAKARKSSIATSSEDEPDTDAKVSSKQEEALEDDHLDAANASEDDGDAAIRANNAYTGATNTIGSVYQRHWFLTLDRPNSGFRKAKSGPDAGRWVGPWETFYVLGRENERSIVTGRLADEVMADEGVKKFIGRKMWRPITE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.41
2 0.46
3 0.45
4 0.45
5 0.53
6 0.57
7 0.54
8 0.58
9 0.56
10 0.56
11 0.53
12 0.5
13 0.46
14 0.43
15 0.43
16 0.45
17 0.4
18 0.36
19 0.35
20 0.34
21 0.32
22 0.39
23 0.43
24 0.4
25 0.42
26 0.41
27 0.48
28 0.5
29 0.52
30 0.44
31 0.41
32 0.37
33 0.36
34 0.37
35 0.28
36 0.24
37 0.22
38 0.21
39 0.18
40 0.2
41 0.19
42 0.15
43 0.14
44 0.14
45 0.13
46 0.13
47 0.14
48 0.14
49 0.14
50 0.13
51 0.13
52 0.15
53 0.17
54 0.19
55 0.17
56 0.15
57 0.15
58 0.19
59 0.28
60 0.26
61 0.25
62 0.24
63 0.29
64 0.31
65 0.4
66 0.39
67 0.38
68 0.38
69 0.38
70 0.39
71 0.36
72 0.4
73 0.39
74 0.43
75 0.42
76 0.43
77 0.45
78 0.45
79 0.45
80 0.43
81 0.38
82 0.34
83 0.27
84 0.28
85 0.29
86 0.3
87 0.28
88 0.27
89 0.24
90 0.22
91 0.21
92 0.2
93 0.15
94 0.12
95 0.13
96 0.1
97 0.1
98 0.1
99 0.12
100 0.12
101 0.12
102 0.12
103 0.13
104 0.14
105 0.15
106 0.15
107 0.13
108 0.13
109 0.13
110 0.12
111 0.1
112 0.08
113 0.08
114 0.08
115 0.08
116 0.08
117 0.09
118 0.09
119 0.09
120 0.14
121 0.15
122 0.16
123 0.19
124 0.21
125 0.23
126 0.23
127 0.24
128 0.21
129 0.22
130 0.24
131 0.24
132 0.27
133 0.26
134 0.28
135 0.27
136 0.26
137 0.24
138 0.21
139 0.21
140 0.17
141 0.15
142 0.13
143 0.12
144 0.12
145 0.12
146 0.14
147 0.11
148 0.09
149 0.08
150 0.08
151 0.08
152 0.08
153 0.07
154 0.06
155 0.05
156 0.05
157 0.05
158 0.06
159 0.06
160 0.06
161 0.05
162 0.05
163 0.06
164 0.07
165 0.08
166 0.08
167 0.09
168 0.12
169 0.13
170 0.13
171 0.14
172 0.17
173 0.21
174 0.2
175 0.2
176 0.18
177 0.17
178 0.16
179 0.15
180 0.11
181 0.07
182 0.08
183 0.08
184 0.08
185 0.08
186 0.08
187 0.09
188 0.1
189 0.1
190 0.13
191 0.17
192 0.21
193 0.29
194 0.29
195 0.29
196 0.3
197 0.31
198 0.29
199 0.31
200 0.28
201 0.27
202 0.32
203 0.33
204 0.36
205 0.38
206 0.37
207 0.33
208 0.41
209 0.36
210 0.36
211 0.36
212 0.34
213 0.35
214 0.36
215 0.38
216 0.29
217 0.28
218 0.25
219 0.23
220 0.21
221 0.18
222 0.17
223 0.15
224 0.15
225 0.2
226 0.24
227 0.29
228 0.31
229 0.32
230 0.34
231 0.43
232 0.48
233 0.51
234 0.54
235 0.56
236 0.65
237 0.73
238 0.81
239 0.81
240 0.86
241 0.87
242 0.88
243 0.91
244 0.89
245 0.89
246 0.89
247 0.89
248 0.89
249 0.83
250 0.75
251 0.66
252 0.6
253 0.52
254 0.46
255 0.39
256 0.31
257 0.31
258 0.31
259 0.3
260 0.27
261 0.24
262 0.2
263 0.17
264 0.16
265 0.14
266 0.11
267 0.1
268 0.14
269 0.16
270 0.16
271 0.16
272 0.17
273 0.18
274 0.19
275 0.21
276 0.19
277 0.19
278 0.17
279 0.16
280 0.14
281 0.13
282 0.11
283 0.08
284 0.07
285 0.06
286 0.05
287 0.05
288 0.05
289 0.05
290 0.05
291 0.05
292 0.05
293 0.04
294 0.05
295 0.05
296 0.05
297 0.06
298 0.06
299 0.06
300 0.07
301 0.07
302 0.07
303 0.09
304 0.1
305 0.11
306 0.11
307 0.11
308 0.11
309 0.11
310 0.11
311 0.11
312 0.12
313 0.15
314 0.17
315 0.17
316 0.18
317 0.18
318 0.2
319 0.28
320 0.35
321 0.34
322 0.35
323 0.36
324 0.4
325 0.42
326 0.47
327 0.43
328 0.36
329 0.42
330 0.43
331 0.49
332 0.5
333 0.55
334 0.52
335 0.52
336 0.57
337 0.49
338 0.48
339 0.41
340 0.38
341 0.32
342 0.29
343 0.23
344 0.19
345 0.19
346 0.18
347 0.18
348 0.18
349 0.19
350 0.22
351 0.24
352 0.25
353 0.24
354 0.25
355 0.25
356 0.24
357 0.22
358 0.23
359 0.21
360 0.2
361 0.2
362 0.2
363 0.2
364 0.18
365 0.16
366 0.14
367 0.14
368 0.11
369 0.1
370 0.1
371 0.11
372 0.12
373 0.12
374 0.11
375 0.15
376 0.19
377 0.3
378 0.35
379 0.43
380 0.53