Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q7S8Q6

Protein Details
Accession Q7S8Q6    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
200-219SDNKAGKPHNRSPRERRERGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
146-175GTRRRQSTRGRGRAGRGRGGRARGDRGEKK
205-220GKPHNRSPRERRERGP
Subcellular Location(s) cyto_nucl 13.5, cyto 12.5, nucl 11.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0003729  F:mRNA binding  
KEGG ncr:NCU07735  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MSAVVEKITDAAAAAVNDVTNALANTSLTGNKSADEKPAANDAVLASAAEGRRLYIGNLAYATTEGELKEFFKGYLVESVSIPKNPRTDRPVGYAFVDLSTPSEAERAIAELSGKEILERKVSVQLARKPESNEKAEGANGEGHEGTRRRQSTRGRGRAGRGRGGRARGDRGEKKEEGAEGSTSPATEALKDITNETHNSDNKAGKPHNRSPRERRERGPPADGIPSKTKVMVANLPYDLTEEKLKELFAAYQPSSAKIALRPIPRFMIKKLQARGEPRKGRGFGFVTLASEELQQKAVAEMNGKEIEGREIAVKVAIDSPDKTDEEANEPEGEAQAPTNGTTEQAGAAVTASA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.09
2 0.09
3 0.08
4 0.08
5 0.08
6 0.07
7 0.06
8 0.06
9 0.06
10 0.06
11 0.06
12 0.08
13 0.1
14 0.12
15 0.12
16 0.15
17 0.15
18 0.16
19 0.2
20 0.2
21 0.24
22 0.26
23 0.26
24 0.26
25 0.31
26 0.31
27 0.27
28 0.26
29 0.21
30 0.17
31 0.16
32 0.13
33 0.07
34 0.1
35 0.11
36 0.12
37 0.11
38 0.1
39 0.12
40 0.13
41 0.13
42 0.14
43 0.15
44 0.15
45 0.15
46 0.15
47 0.14
48 0.13
49 0.13
50 0.09
51 0.09
52 0.08
53 0.08
54 0.09
55 0.09
56 0.11
57 0.11
58 0.11
59 0.11
60 0.12
61 0.13
62 0.17
63 0.17
64 0.17
65 0.16
66 0.21
67 0.21
68 0.24
69 0.25
70 0.23
71 0.29
72 0.31
73 0.38
74 0.4
75 0.45
76 0.45
77 0.49
78 0.48
79 0.43
80 0.41
81 0.36
82 0.29
83 0.23
84 0.2
85 0.13
86 0.11
87 0.1
88 0.08
89 0.07
90 0.08
91 0.07
92 0.07
93 0.07
94 0.07
95 0.07
96 0.07
97 0.07
98 0.06
99 0.08
100 0.08
101 0.08
102 0.08
103 0.11
104 0.12
105 0.14
106 0.14
107 0.14
108 0.19
109 0.21
110 0.24
111 0.28
112 0.33
113 0.38
114 0.4
115 0.42
116 0.4
117 0.46
118 0.48
119 0.44
120 0.4
121 0.34
122 0.32
123 0.3
124 0.26
125 0.19
126 0.15
127 0.12
128 0.11
129 0.1
130 0.09
131 0.12
132 0.13
133 0.14
134 0.19
135 0.21
136 0.23
137 0.3
138 0.38
139 0.45
140 0.55
141 0.62
142 0.6
143 0.62
144 0.65
145 0.66
146 0.61
147 0.58
148 0.49
149 0.46
150 0.44
151 0.43
152 0.42
153 0.38
154 0.38
155 0.34
156 0.4
157 0.4
158 0.41
159 0.44
160 0.39
161 0.38
162 0.34
163 0.31
164 0.25
165 0.2
166 0.16
167 0.1
168 0.11
169 0.1
170 0.08
171 0.08
172 0.07
173 0.06
174 0.06
175 0.06
176 0.06
177 0.08
178 0.09
179 0.09
180 0.1
181 0.12
182 0.13
183 0.14
184 0.19
185 0.18
186 0.21
187 0.23
188 0.25
189 0.25
190 0.31
191 0.32
192 0.34
193 0.41
194 0.47
195 0.54
196 0.59
197 0.65
198 0.69
199 0.77
200 0.8
201 0.78
202 0.72
203 0.73
204 0.74
205 0.71
206 0.65
207 0.55
208 0.47
209 0.49
210 0.47
211 0.4
212 0.35
213 0.32
214 0.29
215 0.27
216 0.26
217 0.2
218 0.22
219 0.23
220 0.21
221 0.22
222 0.21
223 0.21
224 0.19
225 0.19
226 0.16
227 0.13
228 0.14
229 0.11
230 0.13
231 0.13
232 0.13
233 0.12
234 0.13
235 0.13
236 0.13
237 0.18
238 0.17
239 0.2
240 0.21
241 0.22
242 0.22
243 0.21
244 0.19
245 0.15
246 0.22
247 0.24
248 0.31
249 0.32
250 0.33
251 0.37
252 0.42
253 0.43
254 0.4
255 0.44
256 0.45
257 0.5
258 0.52
259 0.54
260 0.55
261 0.62
262 0.68
263 0.68
264 0.69
265 0.66
266 0.7
267 0.65
268 0.6
269 0.57
270 0.5
271 0.41
272 0.38
273 0.33
274 0.26
275 0.24
276 0.24
277 0.17
278 0.17
279 0.16
280 0.13
281 0.13
282 0.12
283 0.12
284 0.12
285 0.14
286 0.13
287 0.14
288 0.14
289 0.18
290 0.19
291 0.19
292 0.18
293 0.17
294 0.18
295 0.15
296 0.15
297 0.12
298 0.12
299 0.12
300 0.13
301 0.12
302 0.11
303 0.14
304 0.15
305 0.16
306 0.16
307 0.2
308 0.23
309 0.23
310 0.24
311 0.23
312 0.24
313 0.27
314 0.28
315 0.27
316 0.23
317 0.23
318 0.22
319 0.2
320 0.18
321 0.13
322 0.11
323 0.11
324 0.11
325 0.11
326 0.12
327 0.11
328 0.12
329 0.12
330 0.12
331 0.11
332 0.1
333 0.09
334 0.08