Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2S6BW16

Protein Details
Accession A0A2S6BW16    Localization Confidence High Confidence Score 16.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
251-275ESSAPPVKPKTKKEKKSKASTLAVPHydrophilic
369-396LVVTKGKGFTKEKNKKKRGSYRGGAIDLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
258-268KPKTKKEKKSK
375-388KGFTKEKNKKKRGS
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 13, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007718  Srp40_C  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
Pfam View protein in Pfam  
PF05022  SRP40_C  
Amino Acid Sequences MATESVIPAALWPHDSPAPRTHQVLSQIGGLLKDLGYTKTVASLEKEAVKNGLVKPNASEGSSRLLALYSLDASTVTKLPSSDSDSDADSESSDSEEDSERDEAEGVLVDVEAEETSDDDSDEANGSSDRDSSSDSSSGSAVNTTGTKRKRAVTPPSSDDSSSDTSMDSGSDSSSSSDSDKEASRPSKKAKTEDVKAGASDSDSSTSSSDSESSDSSSSSDSDSDSADSDSSDSDSSSSSSSSDSSSSDSESSAPPVKPKTKKEKKSKASTLAVPETEPKDNGSQSSSTLQGDSPAPKPEQEDEPEMSGMHPDRLKQSNFAPATRRESAAASKKSQVPFSRIPSDQKVDPRFSNKYVSYDYADKAYQDLVVTKGKGFTKEKNKKKRGSYRGGAIDLAPKGIKFED
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.24
3 0.27
4 0.32
5 0.39
6 0.39
7 0.42
8 0.4
9 0.41
10 0.45
11 0.44
12 0.39
13 0.33
14 0.32
15 0.3
16 0.28
17 0.23
18 0.17
19 0.13
20 0.14
21 0.13
22 0.11
23 0.12
24 0.12
25 0.12
26 0.16
27 0.17
28 0.17
29 0.19
30 0.21
31 0.24
32 0.3
33 0.31
34 0.27
35 0.28
36 0.28
37 0.29
38 0.3
39 0.34
40 0.28
41 0.28
42 0.29
43 0.34
44 0.34
45 0.3
46 0.27
47 0.21
48 0.25
49 0.25
50 0.23
51 0.17
52 0.16
53 0.14
54 0.14
55 0.14
56 0.09
57 0.08
58 0.08
59 0.08
60 0.09
61 0.11
62 0.11
63 0.11
64 0.11
65 0.11
66 0.13
67 0.16
68 0.21
69 0.22
70 0.22
71 0.23
72 0.23
73 0.24
74 0.23
75 0.2
76 0.14
77 0.12
78 0.1
79 0.1
80 0.09
81 0.07
82 0.08
83 0.09
84 0.09
85 0.12
86 0.12
87 0.12
88 0.12
89 0.12
90 0.1
91 0.09
92 0.09
93 0.06
94 0.05
95 0.05
96 0.04
97 0.04
98 0.04
99 0.04
100 0.03
101 0.03
102 0.04
103 0.04
104 0.05
105 0.05
106 0.05
107 0.05
108 0.05
109 0.06
110 0.06
111 0.06
112 0.06
113 0.07
114 0.07
115 0.08
116 0.08
117 0.08
118 0.1
119 0.11
120 0.14
121 0.14
122 0.14
123 0.14
124 0.14
125 0.14
126 0.11
127 0.1
128 0.07
129 0.07
130 0.09
131 0.1
132 0.17
133 0.19
134 0.23
135 0.26
136 0.3
137 0.36
138 0.43
139 0.51
140 0.52
141 0.56
142 0.56
143 0.58
144 0.55
145 0.48
146 0.4
147 0.34
148 0.29
149 0.23
150 0.19
151 0.15
152 0.13
153 0.13
154 0.12
155 0.08
156 0.05
157 0.05
158 0.05
159 0.05
160 0.06
161 0.07
162 0.07
163 0.08
164 0.08
165 0.08
166 0.1
167 0.11
168 0.11
169 0.17
170 0.22
171 0.26
172 0.31
173 0.37
174 0.43
175 0.46
176 0.49
177 0.52
178 0.54
179 0.53
180 0.55
181 0.52
182 0.45
183 0.4
184 0.36
185 0.27
186 0.2
187 0.16
188 0.1
189 0.07
190 0.07
191 0.08
192 0.08
193 0.08
194 0.08
195 0.08
196 0.08
197 0.07
198 0.08
199 0.08
200 0.09
201 0.09
202 0.09
203 0.09
204 0.09
205 0.09
206 0.08
207 0.08
208 0.07
209 0.08
210 0.08
211 0.08
212 0.08
213 0.08
214 0.07
215 0.07
216 0.07
217 0.06
218 0.07
219 0.06
220 0.06
221 0.06
222 0.06
223 0.07
224 0.07
225 0.07
226 0.07
227 0.07
228 0.08
229 0.08
230 0.09
231 0.09
232 0.1
233 0.11
234 0.12
235 0.11
236 0.11
237 0.11
238 0.11
239 0.14
240 0.16
241 0.16
242 0.18
243 0.24
244 0.32
245 0.39
246 0.47
247 0.56
248 0.62
249 0.71
250 0.8
251 0.85
252 0.86
253 0.89
254 0.89
255 0.86
256 0.81
257 0.75
258 0.7
259 0.63
260 0.54
261 0.44
262 0.39
263 0.34
264 0.3
265 0.25
266 0.21
267 0.2
268 0.2
269 0.2
270 0.19
271 0.16
272 0.17
273 0.19
274 0.19
275 0.16
276 0.16
277 0.15
278 0.14
279 0.17
280 0.18
281 0.18
282 0.2
283 0.21
284 0.21
285 0.24
286 0.25
287 0.27
288 0.28
289 0.3
290 0.28
291 0.3
292 0.29
293 0.26
294 0.23
295 0.21
296 0.18
297 0.18
298 0.17
299 0.16
300 0.22
301 0.28
302 0.29
303 0.29
304 0.31
305 0.36
306 0.38
307 0.4
308 0.39
309 0.38
310 0.44
311 0.44
312 0.42
313 0.34
314 0.34
315 0.4
316 0.44
317 0.44
318 0.4
319 0.43
320 0.48
321 0.49
322 0.54
323 0.49
324 0.47
325 0.49
326 0.53
327 0.54
328 0.52
329 0.55
330 0.55
331 0.56
332 0.53
333 0.55
334 0.55
335 0.53
336 0.55
337 0.56
338 0.55
339 0.53
340 0.56
341 0.49
342 0.48
343 0.47
344 0.45
345 0.42
346 0.41
347 0.39
348 0.35
349 0.33
350 0.28
351 0.25
352 0.22
353 0.18
354 0.15
355 0.16
356 0.15
357 0.2
358 0.21
359 0.21
360 0.26
361 0.27
362 0.34
363 0.37
364 0.43
365 0.49
366 0.59
367 0.69
368 0.74
369 0.82
370 0.83
371 0.9
372 0.91
373 0.9
374 0.9
375 0.88
376 0.86
377 0.84
378 0.77
379 0.67
380 0.58
381 0.54
382 0.43
383 0.38
384 0.29
385 0.2