Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q7SD05

Protein Details
Accession Q7SD05    Localization Confidence High Confidence Score 15.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
105-124SQFAKRRGIKPKTREQRRNLHydrophilic
166-200GKSVRGDKRREIRERVKRNERKMRANERRESGRKKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
108-119AKRRGIKPKTRE
159-200EEKRMAEGKSVRGDKRREIRERVKRNERKMRANERRESGRKK
Subcellular Location(s) nucl 16, mito_nucl 11.833, cyto_nucl 10.833, mito 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007023  Ribosom_reg  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0030687  C:preribosome, large subunit precursor  
GO:0000447  P:endonucleolytic cleavage in ITS1 to separate SSU-rRNA from 5.8S rRNA and LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0042273  P:ribosomal large subunit biogenesis  
KEGG ncr:NCU08121  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04939  RRS1  
Amino Acid Sequences MSDATTTTTTTKLPVTVDKPTPYTFDLGLLLANDPNPLLLDRSSALEPQLASIARDGCQSLINQLLTACPISSTPAGVLLSLPPPQTPLPREKPVPTPKAETKWSQFAKRRGIKPKTREQRRNLQYDETTGEFGRKWGYKGANKAGEDAPIIEVKKSQEEKRMAEGKSVRGDKRREIRERVKRNERKMRANERRESGRKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.26
3 0.32
4 0.37
5 0.39
6 0.41
7 0.4
8 0.41
9 0.36
10 0.35
11 0.27
12 0.23
13 0.2
14 0.17
15 0.16
16 0.13
17 0.12
18 0.1
19 0.1
20 0.08
21 0.07
22 0.07
23 0.07
24 0.07
25 0.08
26 0.08
27 0.1
28 0.1
29 0.13
30 0.14
31 0.14
32 0.14
33 0.14
34 0.13
35 0.12
36 0.14
37 0.12
38 0.11
39 0.13
40 0.13
41 0.12
42 0.13
43 0.12
44 0.1
45 0.11
46 0.11
47 0.11
48 0.13
49 0.13
50 0.12
51 0.12
52 0.11
53 0.11
54 0.11
55 0.09
56 0.05
57 0.06
58 0.08
59 0.08
60 0.08
61 0.07
62 0.09
63 0.09
64 0.09
65 0.09
66 0.07
67 0.09
68 0.1
69 0.1
70 0.08
71 0.1
72 0.11
73 0.14
74 0.16
75 0.23
76 0.28
77 0.32
78 0.34
79 0.35
80 0.43
81 0.48
82 0.5
83 0.45
84 0.44
85 0.44
86 0.46
87 0.46
88 0.41
89 0.35
90 0.4
91 0.4
92 0.42
93 0.45
94 0.47
95 0.54
96 0.58
97 0.62
98 0.64
99 0.7
100 0.71
101 0.71
102 0.75
103 0.76
104 0.79
105 0.81
106 0.76
107 0.78
108 0.77
109 0.77
110 0.69
111 0.63
112 0.53
113 0.46
114 0.43
115 0.34
116 0.28
117 0.21
118 0.19
119 0.14
120 0.14
121 0.16
122 0.14
123 0.14
124 0.18
125 0.26
126 0.29
127 0.36
128 0.44
129 0.46
130 0.45
131 0.47
132 0.42
133 0.36
134 0.32
135 0.26
136 0.19
137 0.16
138 0.16
139 0.13
140 0.14
141 0.14
142 0.22
143 0.26
144 0.29
145 0.34
146 0.39
147 0.42
148 0.49
149 0.55
150 0.47
151 0.5
152 0.5
153 0.46
154 0.5
155 0.53
156 0.5
157 0.5
158 0.54
159 0.56
160 0.62
161 0.67
162 0.66
163 0.69
164 0.75
165 0.78
166 0.85
167 0.86
168 0.88
169 0.87
170 0.9
171 0.91
172 0.89
173 0.89
174 0.89
175 0.89
176 0.89
177 0.89
178 0.87
179 0.84
180 0.86