FuNGI

A0A2S6BUR1

Protein Details

Accession

A0A2S6BUR1

Localization Confidence

High

Confidence Score

22.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
34-57	NIFNNGSKKKPVRRPAPTGQKPAA	Hydrophilic
200-223	GGDSNKPTKKKPLKKVEEGRDESN	Basic
410-438	QIMRLEEKKKSKKLRKQLRKREHQGQYSD	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
40-48	SKKKPVRRP
202-215	DSNKPTKKKPLKKV
416-430	EKKKSKKLRKQLRKR

Subcellular Location(s)

nucl 20, cyto_nucl 13, cyto 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter

Amino Acid Sequences

MSNSPAQPPSGPSSVTPNTGGPAAPIVRKRPAVNIFNNGSKKKPVRRPAPTGQKPAATTTATHATNGPHPSSYHQPMNGIIRTGQTTAPANDEPDPSTYAEYPITITKSQLTQGLRYHAMKLQSKLDATGKPIEVDPYDSDQFPRPARLHRRFARDKMESFEQSEVGSGVDDKERELMSIRRAERQAEREENQKLIAPRGGDSNKPTKKKPLKKVEEGRDESNPVRQKRSQLRYEEARPWHLEDYEGKNVWVGTYEQALSERSIMLVVSNEGTFEMVPVEKWYRFQQANKANAMDSEQVEKFMTAKHMPGRWALGTQAATEELKKEALKKRIEAIRSAGGDFDAERDTLDMDYKDEFQDDDEGMLFQADDGEDAGEIERRIYLEMRNAGLGGTGVKNENLDVEAEQHREQIMRLEEKKKSKKLRKQLRKREHQGQYSDDSDDDPYASSSDSMDSEEEAEEEKRKAEEAKKAVANGDKSGASTKGTNTPTGRPEKRDPARLGANLKRPGSPDNSDLSGNESSRKKVKSINGRAVSAAPSAARASSADASRAKVPRAGGSGSGSDTDTSRTGRIKLKLKNSPPGSPSTATPGGSRAGSPAASGMATPNGSTPFPTLEEVRASIPTTGIAMKALVAKFKSRVGTRTADFIQLVKKAGQLSKDPTKAGLIELKPGA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.34
2	0.35
3	0.33
4	0.28
5	0.27
6	0.27
7	0.25
8	0.17
9	0.2
10	0.2
11	0.24
12	0.28
13	0.31
14	0.37
15	0.42
16	0.43
17	0.47
18	0.53
19	0.56
20	0.57
21	0.6
22	0.58
23	0.62
24	0.68
25	0.62
26	0.56
27	0.57
28	0.6
29	0.62
30	0.67
31	0.69
32	0.72
33	0.79
34	0.85
35	0.86
36	0.88
37	0.87
38	0.86
39	0.8
40	0.74
41	0.66
42	0.61
43	0.55
44	0.44
45	0.36
46	0.32
47	0.36
48	0.31
49	0.3
50	0.28
51	0.26
52	0.31
53	0.35
54	0.31
55	0.25
56	0.26
57	0.3
58	0.37
59	0.41
60	0.4
61	0.37
62	0.37
63	0.39
64	0.45
65	0.42
66	0.35
67	0.29
68	0.26
69	0.27
70	0.27
71	0.23
72	0.19
73	0.21
74	0.2
75	0.24
76	0.23
77	0.23
78	0.24
79	0.26
80	0.24
81	0.23
82	0.24
83	0.2
84	0.22
85	0.2
86	0.19
87	0.18
88	0.17
89	0.16
90	0.18
91	0.2
92	0.18
93	0.18
94	0.19
95	0.2
96	0.21
97	0.25
98	0.24
99	0.25
100	0.28
101	0.32
102	0.35
103	0.34
104	0.36
105	0.34
106	0.39
107	0.39
108	0.39
109	0.38
110	0.37
111	0.36
112	0.36
113	0.38
114	0.32
115	0.31
116	0.33
117	0.29
118	0.27
119	0.27
120	0.26
121	0.22
122	0.23
123	0.22
124	0.22
125	0.23
126	0.22
127	0.24
128	0.26
129	0.3
130	0.28
131	0.32
132	0.29
133	0.37
134	0.47
135	0.54
136	0.6
137	0.62
138	0.71
139	0.73
140	0.77
141	0.77
142	0.72
143	0.66
144	0.62
145	0.62
146	0.54
147	0.48
148	0.43
149	0.33
150	0.27
151	0.25
152	0.19
153	0.12
154	0.1
155	0.07
156	0.07
157	0.09
158	0.09
159	0.09
160	0.12
161	0.11
162	0.12
163	0.15
164	0.16
165	0.19
166	0.27
167	0.28
168	0.32
169	0.33
170	0.37
171	0.41
172	0.43
173	0.46
174	0.45
175	0.46
176	0.46
177	0.47
178	0.44
179	0.39
180	0.37
181	0.3
182	0.26
183	0.26
184	0.2
185	0.18
186	0.24
187	0.25
188	0.24
189	0.28
190	0.35
191	0.41
192	0.44
193	0.47
194	0.5
195	0.59
196	0.66
197	0.72
198	0.73
199	0.75
200	0.81
201	0.89
202	0.88
203	0.87
204	0.81
205	0.74
206	0.66
207	0.6
208	0.5
209	0.48
210	0.45
211	0.37
212	0.39
213	0.38
214	0.44
215	0.51
216	0.58
217	0.58
218	0.57
219	0.61
220	0.62
221	0.65
222	0.63
223	0.56
224	0.52
225	0.46
226	0.43
227	0.38
228	0.31
229	0.27
230	0.25
231	0.28
232	0.29
233	0.28
234	0.25
235	0.24
236	0.23
237	0.22
238	0.18
239	0.12
240	0.08
241	0.09
242	0.09
243	0.09
244	0.1
245	0.11
246	0.1
247	0.1
248	0.08
249	0.07
250	0.07
251	0.06
252	0.06
253	0.05
254	0.05
255	0.06
256	0.05
257	0.05
258	0.05
259	0.06
260	0.05
261	0.05
262	0.05
263	0.04
264	0.05
265	0.07
266	0.1
267	0.1
268	0.12
269	0.15
270	0.2
271	0.23
272	0.26
273	0.33
274	0.38
275	0.43
276	0.42
277	0.4
278	0.34
279	0.31
280	0.31
281	0.24
282	0.17
283	0.16
284	0.14
285	0.14
286	0.14
287	0.14
288	0.12
289	0.11
290	0.13
291	0.1
292	0.13
293	0.16
294	0.18
295	0.19
296	0.2
297	0.21
298	0.18
299	0.17
300	0.15
301	0.14
302	0.12
303	0.11
304	0.11
305	0.09
306	0.09
307	0.09
308	0.09
309	0.07
310	0.08
311	0.09
312	0.15
313	0.21
314	0.28
315	0.3
316	0.3
317	0.36
318	0.39
319	0.4
320	0.36
321	0.32
322	0.29
323	0.28
324	0.27
325	0.2
326	0.15
327	0.14
328	0.12
329	0.11
330	0.06
331	0.06
332	0.05
333	0.06
334	0.06
335	0.06
336	0.07
337	0.06
338	0.06
339	0.07
340	0.08
341	0.08
342	0.08
343	0.08
344	0.07
345	0.09
346	0.08
347	0.08
348	0.07
349	0.07
350	0.06
351	0.06
352	0.05
353	0.03
354	0.04
355	0.03
356	0.03
357	0.03
358	0.03
359	0.03
360	0.03
361	0.04
362	0.05
363	0.05
364	0.05
365	0.05
366	0.05
367	0.06
368	0.08
369	0.09
370	0.12
371	0.14
372	0.14
373	0.14
374	0.14
375	0.13
376	0.12
377	0.11
378	0.07
379	0.06
380	0.06
381	0.06
382	0.06
383	0.07
384	0.06
385	0.07
386	0.06
387	0.06
388	0.06
389	0.09
390	0.11
391	0.14
392	0.14
393	0.14
394	0.14
395	0.14
396	0.14
397	0.15
398	0.17
399	0.21
400	0.26
401	0.31
402	0.37
403	0.46
404	0.55
405	0.59
406	0.66
407	0.7
408	0.75
409	0.8
410	0.85
411	0.87
412	0.9
413	0.92
414	0.92
415	0.93
416	0.91
417	0.91
418	0.88
419	0.84
420	0.77
421	0.69
422	0.62
423	0.53
424	0.46
425	0.35
426	0.27
427	0.21
428	0.17
429	0.13
430	0.09
431	0.08
432	0.08
433	0.08
434	0.07
435	0.06
436	0.07
437	0.07
438	0.08
439	0.08
440	0.08
441	0.08
442	0.08
443	0.08
444	0.09
445	0.09
446	0.11
447	0.11
448	0.12
449	0.11
450	0.12
451	0.17
452	0.22
453	0.29
454	0.31
455	0.37
456	0.38
457	0.39
458	0.41
459	0.4
460	0.36
461	0.29
462	0.27
463	0.21
464	0.19
465	0.21
466	0.18
467	0.15
468	0.15
469	0.15
470	0.21
471	0.22
472	0.27
473	0.27
474	0.31
475	0.37
476	0.45
477	0.47
478	0.46
479	0.51
480	0.57
481	0.61
482	0.65
483	0.61
484	0.58
485	0.6
486	0.58
487	0.59
488	0.55
489	0.58
490	0.55
491	0.53
492	0.49
493	0.44
494	0.44
495	0.42
496	0.39
497	0.33
498	0.3
499	0.31
500	0.29
501	0.28
502	0.28
503	0.25
504	0.22
505	0.26
506	0.24
507	0.26
508	0.32
509	0.34
510	0.32
511	0.36
512	0.44
513	0.49
514	0.57
515	0.64
516	0.62
517	0.61
518	0.59
519	0.54
520	0.47
521	0.36
522	0.26
523	0.16
524	0.13
525	0.12
526	0.11
527	0.1
528	0.08
529	0.11
530	0.14
531	0.15
532	0.18
533	0.2
534	0.22
535	0.28
536	0.3
537	0.28
538	0.28
539	0.28
540	0.28
541	0.3
542	0.29
543	0.24
544	0.24
545	0.24
546	0.22
547	0.22
548	0.18
549	0.15
550	0.14
551	0.15
552	0.14
553	0.15
554	0.17
555	0.19
556	0.23
557	0.3
558	0.37
559	0.43
560	0.49
561	0.58
562	0.64
563	0.69
564	0.74
565	0.72
566	0.71
567	0.65
568	0.63
569	0.58
570	0.5
571	0.44
572	0.42
573	0.4
574	0.34
575	0.32
576	0.28
577	0.25
578	0.23
579	0.22
580	0.16
581	0.15
582	0.14
583	0.14
584	0.12
585	0.11
586	0.11
587	0.1
588	0.1
589	0.11
590	0.11
591	0.11
592	0.13
593	0.14
594	0.14
595	0.16
596	0.16
597	0.16
598	0.18
599	0.2
600	0.2
601	0.2
602	0.23
603	0.23
604	0.23
605	0.22
606	0.21
607	0.19
608	0.17
609	0.15
610	0.14
611	0.13
612	0.12
613	0.11
614	0.09
615	0.1
616	0.16
617	0.16
618	0.19
619	0.2
620	0.24
621	0.26
622	0.3
623	0.36
624	0.35
625	0.37
626	0.39
627	0.44
628	0.42
629	0.46
630	0.44
631	0.4
632	0.37
633	0.36
634	0.36
635	0.31
636	0.32
637	0.26
638	0.27
639	0.28
640	0.31
641	0.33
642	0.34
643	0.39
644	0.47
645	0.5
646	0.48
647	0.44
648	0.44
649	0.41
650	0.38
651	0.39
652	0.3

A0A2S6BUR1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer