Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2S6C6X8

Protein Details
Accession A0A2S6C6X8    Localization Confidence High Confidence Score 22.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
18-37GKIEKKQKTGEYKYEKPAKPBasic
107-128VHRSKQLWEKLRRKSHVPKEERBasic
658-679EEETGKNKKRKVENKGNAGARIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
10-25RKEAPSTAGKIEKKQK
95-102KERKAAKP
116-120KLRRK
626-630KKVRK
664-669NKKRKV
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 13.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011989  ARM-like  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR012959  CPL_dom  
IPR040059  PUM3  
IPR001313  Pumilio_RNA-bd_rpt  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF08144  CPL  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50302  PUM  
Amino Acid Sequences MSNKMGGIKRKEAPSTAGKIEKKQKTGEYKYEKPAKPSRLEQAANDDGEDDDVDTGAMNSERADMVKKPMSNTSAKFKLDSSSAEAHAKQRQLAKERKAAKPNADVVHRSKQLWEKLRRKSHVPKEEREELLTELFSIIDGRVRDFVFKHDSVRVVQCAIKYARPAQLKGIVKELQNDVRDLVESRYGKFLVAKMVVQGDRADKDTIIPQFYGNIKRLINHPEASWILDDIYRQVATPKQKAMILREWYGAEYAIEGKQYTKKAPPADVTADLVKILEANPEKRKPILGYLKQLINNLIQKKMTGFTMLHDAMLQYFLALQPGSEEQSEFLEILRNDIDAEENDGGGDLYRNLAFTKSGSRLVCLALAHGSAKARKQILKCFKDHIETMAFDVNARMVLVAGLDVTDDTKLTSQTVLTELLGLKNEDIKSKHDRLEAMLTNLHSRLPILFPLAGTAKWLCQAGEKKAIEEIHAIRATTSKKAPSQRRDELLKTVSEPLLELVADRASNLITSSFGTQAISEILLSCNASDRAAAAEAVAALAEGDPHSDDHIARDPAVGRMLKTLVTGGAFDPATKSVVLSEPRLGFGATLYPQIKEHIVSWATSDSSFVVVALLESEDLDEGIKKKVRKALDKGKDEIEKAAEASSEARAEKTSDEEEETGKNKKRKVENKGNAGARILLEKLG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.54
2 0.53
3 0.53
4 0.55
5 0.52
6 0.57
7 0.65
8 0.67
9 0.64
10 0.64
11 0.66
12 0.68
13 0.73
14 0.75
15 0.74
16 0.74
17 0.79
18 0.83
19 0.77
20 0.75
21 0.76
22 0.74
23 0.71
24 0.7
25 0.69
26 0.68
27 0.67
28 0.61
29 0.61
30 0.57
31 0.5
32 0.43
33 0.35
34 0.25
35 0.24
36 0.21
37 0.13
38 0.08
39 0.07
40 0.07
41 0.06
42 0.06
43 0.07
44 0.07
45 0.07
46 0.07
47 0.08
48 0.09
49 0.1
50 0.13
51 0.13
52 0.21
53 0.27
54 0.28
55 0.3
56 0.35
57 0.39
58 0.43
59 0.45
60 0.47
61 0.48
62 0.48
63 0.46
64 0.41
65 0.4
66 0.35
67 0.34
68 0.31
69 0.28
70 0.29
71 0.32
72 0.33
73 0.34
74 0.38
75 0.37
76 0.35
77 0.37
78 0.42
79 0.48
80 0.55
81 0.58
82 0.61
83 0.67
84 0.71
85 0.74
86 0.72
87 0.7
88 0.69
89 0.69
90 0.65
91 0.62
92 0.58
93 0.55
94 0.58
95 0.54
96 0.47
97 0.45
98 0.48
99 0.52
100 0.57
101 0.62
102 0.62
103 0.69
104 0.78
105 0.77
106 0.79
107 0.8
108 0.81
109 0.81
110 0.79
111 0.77
112 0.76
113 0.79
114 0.72
115 0.63
116 0.54
117 0.45
118 0.39
119 0.3
120 0.22
121 0.14
122 0.12
123 0.1
124 0.09
125 0.07
126 0.09
127 0.09
128 0.1
129 0.13
130 0.14
131 0.16
132 0.16
133 0.21
134 0.24
135 0.25
136 0.27
137 0.27
138 0.29
139 0.3
140 0.33
141 0.3
142 0.25
143 0.26
144 0.23
145 0.26
146 0.27
147 0.25
148 0.25
149 0.28
150 0.33
151 0.35
152 0.36
153 0.33
154 0.4
155 0.43
156 0.4
157 0.42
158 0.38
159 0.35
160 0.38
161 0.38
162 0.35
163 0.31
164 0.31
165 0.25
166 0.22
167 0.22
168 0.2
169 0.17
170 0.18
171 0.18
172 0.19
173 0.21
174 0.21
175 0.21
176 0.21
177 0.21
178 0.19
179 0.19
180 0.18
181 0.16
182 0.21
183 0.2
184 0.19
185 0.2
186 0.17
187 0.17
188 0.19
189 0.18
190 0.14
191 0.15
192 0.19
193 0.2
194 0.19
195 0.18
196 0.16
197 0.19
198 0.23
199 0.26
200 0.23
201 0.25
202 0.23
203 0.24
204 0.28
205 0.3
206 0.31
207 0.27
208 0.26
209 0.26
210 0.26
211 0.26
212 0.22
213 0.16
214 0.13
215 0.12
216 0.12
217 0.09
218 0.1
219 0.09
220 0.09
221 0.1
222 0.14
223 0.2
224 0.24
225 0.25
226 0.24
227 0.27
228 0.3
229 0.33
230 0.36
231 0.34
232 0.32
233 0.32
234 0.3
235 0.28
236 0.26
237 0.21
238 0.13
239 0.09
240 0.09
241 0.08
242 0.08
243 0.07
244 0.09
245 0.13
246 0.15
247 0.18
248 0.21
249 0.26
250 0.28
251 0.31
252 0.32
253 0.32
254 0.33
255 0.32
256 0.29
257 0.24
258 0.22
259 0.18
260 0.15
261 0.11
262 0.08
263 0.06
264 0.09
265 0.11
266 0.16
267 0.22
268 0.25
269 0.26
270 0.27
271 0.28
272 0.25
273 0.32
274 0.37
275 0.35
276 0.39
277 0.41
278 0.45
279 0.44
280 0.44
281 0.36
282 0.3
283 0.3
284 0.26
285 0.25
286 0.21
287 0.19
288 0.2
289 0.19
290 0.15
291 0.12
292 0.11
293 0.09
294 0.16
295 0.15
296 0.14
297 0.13
298 0.13
299 0.11
300 0.11
301 0.1
302 0.04
303 0.04
304 0.04
305 0.04
306 0.04
307 0.04
308 0.05
309 0.05
310 0.07
311 0.06
312 0.07
313 0.06
314 0.07
315 0.08
316 0.07
317 0.06
318 0.09
319 0.09
320 0.1
321 0.1
322 0.09
323 0.09
324 0.09
325 0.09
326 0.05
327 0.08
328 0.07
329 0.07
330 0.07
331 0.07
332 0.06
333 0.06
334 0.06
335 0.03
336 0.04
337 0.04
338 0.05
339 0.05
340 0.05
341 0.06
342 0.06
343 0.1
344 0.11
345 0.16
346 0.16
347 0.17
348 0.17
349 0.18
350 0.18
351 0.14
352 0.12
353 0.08
354 0.08
355 0.08
356 0.08
357 0.09
358 0.09
359 0.11
360 0.14
361 0.16
362 0.2
363 0.23
364 0.32
365 0.41
366 0.44
367 0.45
368 0.46
369 0.46
370 0.45
371 0.42
372 0.35
373 0.27
374 0.22
375 0.22
376 0.19
377 0.17
378 0.14
379 0.13
380 0.1
381 0.08
382 0.07
383 0.06
384 0.03
385 0.03
386 0.03
387 0.03
388 0.03
389 0.02
390 0.02
391 0.03
392 0.03
393 0.03
394 0.03
395 0.04
396 0.05
397 0.05
398 0.06
399 0.06
400 0.06
401 0.07
402 0.08
403 0.09
404 0.08
405 0.09
406 0.09
407 0.1
408 0.1
409 0.1
410 0.08
411 0.12
412 0.13
413 0.15
414 0.16
415 0.2
416 0.26
417 0.31
418 0.34
419 0.32
420 0.33
421 0.32
422 0.38
423 0.35
424 0.3
425 0.27
426 0.24
427 0.23
428 0.23
429 0.2
430 0.12
431 0.11
432 0.1
433 0.09
434 0.09
435 0.1
436 0.1
437 0.1
438 0.12
439 0.13
440 0.11
441 0.12
442 0.11
443 0.1
444 0.11
445 0.11
446 0.09
447 0.15
448 0.19
449 0.22
450 0.31
451 0.31
452 0.3
453 0.33
454 0.33
455 0.28
456 0.28
457 0.25
458 0.23
459 0.24
460 0.23
461 0.19
462 0.23
463 0.24
464 0.23
465 0.25
466 0.22
467 0.28
468 0.37
469 0.47
470 0.52
471 0.59
472 0.62
473 0.66
474 0.67
475 0.64
476 0.61
477 0.54
478 0.46
479 0.39
480 0.36
481 0.29
482 0.24
483 0.21
484 0.15
485 0.13
486 0.11
487 0.09
488 0.07
489 0.07
490 0.07
491 0.07
492 0.06
493 0.06
494 0.06
495 0.06
496 0.06
497 0.06
498 0.07
499 0.09
500 0.09
501 0.09
502 0.09
503 0.09
504 0.09
505 0.09
506 0.08
507 0.07
508 0.07
509 0.07
510 0.08
511 0.08
512 0.07
513 0.09
514 0.1
515 0.1
516 0.09
517 0.09
518 0.1
519 0.11
520 0.1
521 0.07
522 0.07
523 0.07
524 0.07
525 0.06
526 0.04
527 0.03
528 0.03
529 0.04
530 0.03
531 0.04
532 0.05
533 0.06
534 0.07
535 0.08
536 0.09
537 0.12
538 0.19
539 0.19
540 0.19
541 0.21
542 0.21
543 0.21
544 0.26
545 0.23
546 0.17
547 0.19
548 0.2
549 0.18
550 0.17
551 0.16
552 0.12
553 0.11
554 0.12
555 0.09
556 0.12
557 0.12
558 0.12
559 0.12
560 0.12
561 0.13
562 0.12
563 0.12
564 0.1
565 0.16
566 0.18
567 0.19
568 0.24
569 0.24
570 0.25
571 0.25
572 0.23
573 0.18
574 0.16
575 0.18
576 0.13
577 0.19
578 0.18
579 0.19
580 0.19
581 0.22
582 0.22
583 0.19
584 0.19
585 0.2
586 0.2
587 0.19
588 0.21
589 0.21
590 0.21
591 0.19
592 0.19
593 0.12
594 0.12
595 0.12
596 0.1
597 0.08
598 0.07
599 0.07
600 0.07
601 0.06
602 0.05
603 0.05
604 0.06
605 0.05
606 0.06
607 0.06
608 0.08
609 0.1
610 0.16
611 0.21
612 0.23
613 0.29
614 0.35
615 0.44
616 0.51
617 0.6
618 0.64
619 0.7
620 0.74
621 0.73
622 0.74
623 0.7
624 0.62
625 0.55
626 0.47
627 0.38
628 0.32
629 0.29
630 0.21
631 0.17
632 0.17
633 0.16
634 0.16
635 0.15
636 0.16
637 0.16
638 0.17
639 0.18
640 0.21
641 0.21
642 0.21
643 0.24
644 0.25
645 0.26
646 0.3
647 0.32
648 0.36
649 0.41
650 0.45
651 0.45
652 0.53
653 0.62
654 0.66
655 0.74
656 0.77
657 0.78
658 0.83
659 0.88
660 0.84
661 0.75
662 0.67
663 0.58
664 0.48
665 0.4