Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2S6CI46

Protein Details
Accession A0A2S6CI46    Localization Confidence Medium Confidence Score 13
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
150-169GPLRRRSSAQFRRNRNEPTPHydrophilic
295-316LEVAAKRRRRENVRKLRRATAQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
300-312KRRRRENVRKLRR
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto_nucl 11.666, mito_nucl 10.166, cyto 7, cyto_mito 6.166
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039745  Vps54  
IPR012501  Vps54_C  
IPR019515  VPS54_N  
Gene Ontology GO:0005829  C:cytosol  
GO:0000938  C:GARP complex  
GO:0015031  P:protein transport  
GO:0042147  P:retrograde transport, endosome to Golgi  
Pfam View protein in Pfam  
PF07928  Vps54  
PF10475  Vps54_N  
Amino Acid Sequences MSAGSIGGALDIQSRRGSAVRETSHNAISTLLQPPIVRTGLLPHTAAQAAATGFKAPTTKDIPPVTLTNVPHVSPENFREYLNRIGPLFESFQRGRVEPEQPAWLKKDKDLEKAEALERRLSRQDGSAPPTPIITRQSSTGALSPMESPGPLRRRSSAQFRRNRNEPTPLSTIPSVYFDEDFHLENPRTFDVVSERSEIVRPPLGSQPPPATNDAAQLPRKTLANNAILQEKLSWYMDTVEVHLINSISTASSGFFAALGSLKELQTEAEQSVAKIQGLREDLKKLDQEVAVSGLEVAAKRRRRENVRKLRRATAQVQEVVENVKRADELVDSGAYDEAADQMDRVGRLVCGQQEPGQEQQELLDLRPLKALQGLDSGLQELQLRIGTGFAQRFTAILIDDLRQHVQKVPNSHTLKRWSRQRGIPPTYMETDEKFRKDLLSALTGLARVGHTAPASSKYRDDVNKEVKAIMRRFMPSSSDDDADSMVSTSTTMSRGGGKRSQQEKSLIIARNLKALDPEDAEKLLINAYTSIGEALRRVSTQTKILLDVTSSMDAPDAKSPVSPSSSSRQPILDGKLANGTASETPATVQEQLSQALDMSSLLGQAVDTAQSQITRVLKVRNEQTIRLPKALFLRYFTLNRLFADECEAISGRGGNALKGIINAQISGFVQVLGTSETERIANVLDSDNWNAKGFSDKQNELLQRILASMTKDPPEWLQSTATIWEDYTPATTQTNGISASESAFETTVNGTAGIAGKAAAAKPAYIDETRFILVSSASALLESIDIFLSLTAAIPSMTQQIATSLLDVLRTFNSRTNQLILGAGATKIAGLKNITTKHLALASQALSFVIALIPYMRECVRRHLPSGQGSILADFDKTKRLYQEHQSGIHDKLVDIMASRSTSHVKAMSNIDFDANAPEDRPNAYMETLTKETATLHRVLSRHLSEIDVSLIMRQIFTAYKEQWTKAFSDVDVKTSAGEKRLLRDAEALEARLGKLDGFEAIGKELVAVVKAKVSVEFDMEEEAKKEKEAEKVLEVSEIKINGEVKAEEKKAESADVGFEQDKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.17
3 0.19
4 0.22
5 0.22
6 0.31
7 0.34
8 0.39
9 0.44
10 0.46
11 0.47
12 0.45
13 0.39
14 0.31
15 0.28
16 0.26
17 0.25
18 0.22
19 0.2
20 0.2
21 0.21
22 0.25
23 0.24
24 0.2
25 0.16
26 0.22
27 0.25
28 0.28
29 0.27
30 0.23
31 0.25
32 0.26
33 0.25
34 0.19
35 0.15
36 0.13
37 0.14
38 0.13
39 0.12
40 0.11
41 0.13
42 0.15
43 0.13
44 0.19
45 0.23
46 0.26
47 0.32
48 0.35
49 0.36
50 0.38
51 0.4
52 0.39
53 0.39
54 0.37
55 0.36
56 0.36
57 0.34
58 0.32
59 0.34
60 0.31
61 0.31
62 0.34
63 0.33
64 0.32
65 0.32
66 0.34
67 0.35
68 0.4
69 0.39
70 0.37
71 0.31
72 0.31
73 0.32
74 0.31
75 0.31
76 0.24
77 0.28
78 0.26
79 0.31
80 0.33
81 0.32
82 0.35
83 0.37
84 0.39
85 0.36
86 0.39
87 0.42
88 0.42
89 0.45
90 0.44
91 0.45
92 0.43
93 0.43
94 0.5
95 0.47
96 0.53
97 0.55
98 0.55
99 0.52
100 0.54
101 0.55
102 0.5
103 0.47
104 0.45
105 0.4
106 0.4
107 0.41
108 0.39
109 0.35
110 0.34
111 0.39
112 0.39
113 0.43
114 0.45
115 0.42
116 0.4
117 0.4
118 0.37
119 0.33
120 0.31
121 0.3
122 0.24
123 0.25
124 0.28
125 0.27
126 0.28
127 0.27
128 0.24
129 0.2
130 0.2
131 0.18
132 0.17
133 0.15
134 0.14
135 0.13
136 0.2
137 0.26
138 0.3
139 0.32
140 0.34
141 0.41
142 0.47
143 0.56
144 0.58
145 0.62
146 0.67
147 0.74
148 0.79
149 0.8
150 0.82
151 0.76
152 0.75
153 0.68
154 0.66
155 0.62
156 0.54
157 0.51
158 0.44
159 0.39
160 0.31
161 0.3
162 0.25
163 0.2
164 0.2
165 0.16
166 0.18
167 0.18
168 0.19
169 0.17
170 0.21
171 0.2
172 0.21
173 0.24
174 0.22
175 0.22
176 0.2
177 0.21
178 0.2
179 0.23
180 0.24
181 0.24
182 0.23
183 0.24
184 0.25
185 0.25
186 0.22
187 0.24
188 0.22
189 0.21
190 0.28
191 0.31
192 0.32
193 0.35
194 0.37
195 0.36
196 0.38
197 0.38
198 0.33
199 0.29
200 0.3
201 0.31
202 0.31
203 0.31
204 0.29
205 0.29
206 0.29
207 0.3
208 0.27
209 0.28
210 0.28
211 0.29
212 0.31
213 0.31
214 0.32
215 0.31
216 0.3
217 0.26
218 0.2
219 0.17
220 0.15
221 0.14
222 0.11
223 0.13
224 0.14
225 0.14
226 0.15
227 0.15
228 0.14
229 0.14
230 0.14
231 0.12
232 0.1
233 0.1
234 0.08
235 0.05
236 0.05
237 0.06
238 0.05
239 0.06
240 0.06
241 0.06
242 0.06
243 0.06
244 0.06
245 0.07
246 0.07
247 0.08
248 0.09
249 0.09
250 0.1
251 0.1
252 0.1
253 0.1
254 0.12
255 0.1
256 0.11
257 0.12
258 0.11
259 0.14
260 0.15
261 0.14
262 0.14
263 0.14
264 0.16
265 0.19
266 0.22
267 0.21
268 0.24
269 0.25
270 0.27
271 0.28
272 0.25
273 0.25
274 0.23
275 0.21
276 0.18
277 0.19
278 0.15
279 0.13
280 0.12
281 0.08
282 0.08
283 0.08
284 0.11
285 0.16
286 0.22
287 0.25
288 0.32
289 0.4
290 0.5
291 0.61
292 0.69
293 0.73
294 0.79
295 0.86
296 0.84
297 0.83
298 0.79
299 0.74
300 0.68
301 0.64
302 0.58
303 0.52
304 0.48
305 0.41
306 0.34
307 0.31
308 0.26
309 0.2
310 0.14
311 0.11
312 0.1
313 0.1
314 0.11
315 0.08
316 0.09
317 0.09
318 0.09
319 0.09
320 0.09
321 0.09
322 0.08
323 0.07
324 0.06
325 0.05
326 0.05
327 0.05
328 0.04
329 0.05
330 0.07
331 0.07
332 0.07
333 0.07
334 0.07
335 0.08
336 0.1
337 0.12
338 0.12
339 0.14
340 0.17
341 0.19
342 0.21
343 0.24
344 0.24
345 0.21
346 0.2
347 0.18
348 0.19
349 0.17
350 0.15
351 0.16
352 0.15
353 0.15
354 0.17
355 0.17
356 0.13
357 0.15
358 0.15
359 0.12
360 0.13
361 0.13
362 0.12
363 0.12
364 0.12
365 0.09
366 0.1
367 0.09
368 0.07
369 0.07
370 0.06
371 0.07
372 0.06
373 0.06
374 0.06
375 0.1
376 0.11
377 0.1
378 0.11
379 0.1
380 0.1
381 0.1
382 0.1
383 0.07
384 0.07
385 0.08
386 0.08
387 0.09
388 0.11
389 0.12
390 0.12
391 0.12
392 0.16
393 0.21
394 0.23
395 0.27
396 0.31
397 0.4
398 0.44
399 0.45
400 0.46
401 0.5
402 0.54
403 0.56
404 0.6
405 0.58
406 0.61
407 0.65
408 0.69
409 0.7
410 0.69
411 0.66
412 0.59
413 0.54
414 0.49
415 0.45
416 0.36
417 0.27
418 0.28
419 0.28
420 0.26
421 0.24
422 0.22
423 0.2
424 0.2
425 0.21
426 0.17
427 0.15
428 0.15
429 0.14
430 0.14
431 0.14
432 0.13
433 0.1
434 0.08
435 0.06
436 0.06
437 0.07
438 0.06
439 0.07
440 0.08
441 0.12
442 0.15
443 0.15
444 0.16
445 0.16
446 0.21
447 0.24
448 0.28
449 0.31
450 0.36
451 0.37
452 0.37
453 0.37
454 0.35
455 0.39
456 0.35
457 0.3
458 0.25
459 0.24
460 0.25
461 0.24
462 0.24
463 0.19
464 0.23
465 0.22
466 0.2
467 0.18
468 0.17
469 0.17
470 0.14
471 0.12
472 0.07
473 0.05
474 0.04
475 0.04
476 0.04
477 0.05
478 0.05
479 0.06
480 0.06
481 0.11
482 0.13
483 0.17
484 0.21
485 0.24
486 0.31
487 0.36
488 0.38
489 0.36
490 0.37
491 0.35
492 0.33
493 0.37
494 0.31
495 0.29
496 0.33
497 0.3
498 0.3
499 0.29
500 0.26
501 0.2
502 0.19
503 0.18
504 0.13
505 0.14
506 0.11
507 0.11
508 0.11
509 0.1
510 0.09
511 0.07
512 0.06
513 0.05
514 0.04
515 0.04
516 0.05
517 0.05
518 0.05
519 0.05
520 0.05
521 0.05
522 0.06
523 0.06
524 0.06
525 0.08
526 0.1
527 0.11
528 0.13
529 0.16
530 0.15
531 0.16
532 0.16
533 0.15
534 0.13
535 0.13
536 0.11
537 0.09
538 0.09
539 0.07
540 0.07
541 0.07
542 0.08
543 0.08
544 0.08
545 0.07
546 0.08
547 0.09
548 0.1
549 0.12
550 0.12
551 0.13
552 0.17
553 0.22
554 0.23
555 0.23
556 0.22
557 0.22
558 0.24
559 0.25
560 0.24
561 0.19
562 0.19
563 0.2
564 0.19
565 0.17
566 0.13
567 0.11
568 0.08
569 0.08
570 0.08
571 0.06
572 0.06
573 0.07
574 0.08
575 0.08
576 0.08
577 0.09
578 0.1
579 0.11
580 0.1
581 0.1
582 0.09
583 0.07
584 0.07
585 0.05
586 0.05
587 0.04
588 0.04
589 0.04
590 0.03
591 0.03
592 0.03
593 0.04
594 0.04
595 0.04
596 0.04
597 0.05
598 0.05
599 0.06
600 0.09
601 0.1
602 0.11
603 0.13
604 0.17
605 0.19
606 0.24
607 0.28
608 0.32
609 0.33
610 0.33
611 0.4
612 0.45
613 0.45
614 0.43
615 0.39
616 0.33
617 0.37
618 0.4
619 0.32
620 0.25
621 0.26
622 0.26
623 0.28
624 0.27
625 0.26
626 0.23
627 0.23
628 0.24
629 0.21
630 0.17
631 0.22
632 0.19
633 0.15
634 0.15
635 0.15
636 0.11
637 0.11
638 0.11
639 0.06
640 0.1
641 0.1
642 0.08
643 0.09
644 0.09
645 0.09
646 0.09
647 0.1
648 0.08
649 0.08
650 0.08
651 0.07
652 0.08
653 0.08
654 0.09
655 0.08
656 0.06
657 0.06
658 0.06
659 0.06
660 0.06
661 0.06
662 0.06
663 0.06
664 0.07
665 0.07
666 0.07
667 0.06
668 0.06
669 0.06
670 0.06
671 0.07
672 0.08
673 0.09
674 0.12
675 0.14
676 0.14
677 0.15
678 0.14
679 0.13
680 0.17
681 0.19
682 0.26
683 0.3
684 0.3
685 0.33
686 0.39
687 0.4
688 0.36
689 0.33
690 0.25
691 0.19
692 0.19
693 0.16
694 0.11
695 0.12
696 0.13
697 0.15
698 0.16
699 0.16
700 0.16
701 0.17
702 0.19
703 0.19
704 0.18
705 0.16
706 0.16
707 0.16
708 0.17
709 0.16
710 0.13
711 0.11
712 0.1
713 0.1
714 0.09
715 0.1
716 0.09
717 0.09
718 0.09
719 0.1
720 0.1
721 0.1
722 0.12
723 0.1
724 0.1
725 0.1
726 0.1
727 0.1
728 0.1
729 0.09
730 0.08
731 0.08
732 0.07
733 0.07
734 0.07
735 0.08
736 0.07
737 0.07
738 0.06
739 0.07
740 0.08
741 0.07
742 0.07
743 0.06
744 0.06
745 0.07
746 0.07
747 0.08
748 0.07
749 0.07
750 0.08
751 0.09
752 0.12
753 0.12
754 0.13
755 0.12
756 0.14
757 0.15
758 0.14
759 0.13
760 0.1
761 0.1
762 0.09
763 0.08
764 0.07
765 0.06
766 0.06
767 0.06
768 0.06
769 0.06
770 0.06
771 0.05
772 0.04
773 0.04
774 0.04
775 0.04
776 0.04
777 0.04
778 0.04
779 0.04
780 0.04
781 0.04
782 0.04
783 0.05
784 0.07
785 0.07
786 0.07
787 0.07
788 0.08
789 0.1
790 0.1
791 0.1
792 0.08
793 0.09
794 0.09
795 0.1
796 0.1
797 0.1
798 0.12
799 0.13
800 0.18
801 0.21
802 0.23
803 0.25
804 0.26
805 0.25
806 0.24
807 0.23
808 0.18
809 0.16
810 0.13
811 0.11
812 0.08
813 0.07
814 0.06
815 0.07
816 0.07
817 0.08
818 0.08
819 0.11
820 0.17
821 0.2
822 0.22
823 0.24
824 0.24
825 0.24
826 0.25
827 0.23
828 0.18
829 0.19
830 0.18
831 0.15
832 0.15
833 0.13
834 0.1
835 0.1
836 0.09
837 0.06
838 0.04
839 0.04
840 0.05
841 0.06
842 0.06
843 0.08
844 0.1
845 0.14
846 0.16
847 0.25
848 0.34
849 0.36
850 0.4
851 0.44
852 0.49
853 0.5
854 0.53
855 0.45
856 0.37
857 0.34
858 0.31
859 0.26
860 0.19
861 0.14
862 0.12
863 0.12
864 0.17
865 0.18
866 0.21
867 0.26
868 0.3
869 0.36
870 0.44
871 0.52
872 0.51
873 0.53
874 0.55
875 0.53
876 0.5
877 0.46
878 0.38
879 0.28
880 0.25
881 0.21
882 0.17
883 0.14
884 0.13
885 0.13
886 0.13
887 0.14
888 0.14
889 0.16
890 0.17
891 0.19
892 0.22
893 0.2
894 0.24
895 0.3
896 0.31
897 0.29
898 0.29
899 0.27
900 0.23
901 0.22
902 0.21
903 0.17
904 0.14
905 0.13
906 0.14
907 0.15
908 0.16
909 0.17
910 0.15
911 0.15
912 0.15
913 0.17
914 0.17
915 0.22
916 0.23
917 0.22
918 0.2
919 0.19
920 0.2
921 0.22
922 0.24
923 0.2
924 0.2
925 0.24
926 0.25
927 0.28
928 0.33
929 0.31
930 0.31
931 0.3
932 0.29
933 0.25
934 0.26
935 0.24
936 0.17
937 0.15
938 0.12
939 0.14
940 0.12
941 0.12
942 0.1
943 0.11
944 0.12
945 0.15
946 0.21
947 0.2
948 0.28
949 0.32
950 0.34
951 0.36
952 0.36
953 0.35
954 0.32
955 0.33
956 0.26
957 0.3
958 0.29
959 0.29
960 0.28
961 0.26
962 0.23
963 0.25
964 0.27
965 0.21
966 0.26
967 0.25
968 0.29
969 0.37
970 0.37
971 0.34
972 0.37
973 0.35
974 0.36
975 0.37
976 0.33
977 0.26
978 0.27
979 0.25
980 0.22
981 0.21
982 0.13
983 0.11
984 0.11
985 0.1
986 0.1
987 0.12
988 0.11
989 0.12
990 0.12
991 0.11
992 0.11
993 0.11
994 0.1
995 0.1
996 0.1
997 0.1
998 0.12
999 0.13
1000 0.13
1001 0.14
1002 0.17
1003 0.16
1004 0.18
1005 0.18
1006 0.16
1007 0.2
1008 0.21
1009 0.2
1010 0.19
1011 0.2
1012 0.19
1013 0.18
1014 0.22
1015 0.22
1016 0.29
1017 0.34
1018 0.36
1019 0.39
1020 0.41
1021 0.41
1022 0.43
1023 0.39
1024 0.34
1025 0.32
1026 0.28
1027 0.23
1028 0.24
1029 0.25
1030 0.19
1031 0.22
1032 0.2
1033 0.19
1034 0.27
1035 0.28
1036 0.27
1037 0.28
1038 0.31
1039 0.29
1040 0.3
1041 0.28
1042 0.21
1043 0.24
1044 0.23
1045 0.25